<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX120004.8	1	ACTTGTCTGCAGTCCTGTCTACTCTGAAGACTGAGGCAGGAGGATTCCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	90666	ACTTGTCTGCAGTCCTGTCTACTCTGAAGACTGAGGCAGGAGGATTCCTT	90715

BX120004.8	51	GAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATCATGTGACTGCACTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	90716	GAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATCATGTGACTGCACTT	90765

BX120004.8	101	CACGCTGGATGACAGTTTTTAGAGACTCTGTCTCTAAAAACAAATAAATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	90766	CACGCTGGATGACAGTTTTTAGAGACTCTGTCTCTAAAAACAAATAAATG	90815

BX120004.8	151	AATACAATAAATAAAAACAAATAAATAAATACAATAAATGGGTGTTGTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	90816	AATACAATAAATAAAAACAAATAAATAAATACAATAAATGGGTGTTGTTT	90865

BX120004.8	201	AAAGCCAATGTTTGTGATAATTTTTTACACAGTCTTATAAAATTCATACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	90866	AAAGCCAATGTTTGTGATAATTTTTTACACAGTCTTATAAAATTCATACA	90915

BX120004.8	251	CAGGCTCAACAGACTAATGGAATGAACTGATGAATTGATATATACACTAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	90916	CAGGCTCAACAGACTAATGGAATGAACTGATGAATTGATATATACACTAG	90965

BX120004.8	301	TTACATAAAATAAAATCTTTCTGAACTTTTTCAGTGTTTTGCATTTTATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	90966	TTACATAAAATAAAATCTTTCTGAACTTTTTCAGTGTTTTGCATTTTATA	91015

BX120004.8	351	ATTATCTGTGATGCAATTTAATATACTCATATTTCATTCATTCAGTCAAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91016	ATTATCTGTGATGCAATTTAATATACTCATATTTCATTCATTCAGTCAAC	91065

BX120004.8	401	AAAAATTAATTTAGTCCCTACAATGAACCAGGTATCCCCTCATATGCTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91066	AAAAATTAATTTAGTCCCTACAATGAACCAGGTATCCCCTCATATGCTCA	91115

BX120004.8	451	CGTGCCTGACATTCTAGAAGCTTCACAAGACCAAGGTGGAGCCACTGGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91116	CGTGCCTGACATTCTAGAAGCTTCACAAGACCAAGGTGGAGCCACTGGAG	91165

BX120004.8	501	TGTTTTAGGTGGAGAAATGACACACTTTGACTCACATTAGCAGGACCACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91166	TGTTTTAGGTGGAGAAATGACACACTTTGACTCACATTAGCAGGACCACT	91215

BX120004.8	551	ATGGAGAGAACAGTCACGTAGCAGGTAACGGGAGAGTGCCAGTGTCACAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91216	ATGGAGAGAACAGTCACGTAGCAGGTAACGGGAGAGTGCCAGTGTCACAA	91265

BX120004.8	601	TTCAGGAGTGACAGTGTGATGGGGACTAAGGGGAGAGGAGGGGCTGAGTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91266	TTCAGGAGTGACAGTGTGATGGGGACTAAGGGGAGAGGAGGGGCTGAGTG	91315

BX120004.8	651	ATAAGAGGGACGGAGGGAAGGGCTGGAGAAGCAGTAGGTGAGGAAAAGGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91316	ATAAGAGGGACGGAGGGAAGGGCTGGAGAAGCAGTAGGTGAGGAAAAGGA	91365

BX120004.8	701	GTAGAGGGATAGAATTCAAAAGCAGCACAACTCTTAGGTTTGAACACTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91366	GTAGAGGGATAGAATTCAAAAGCAGCACAACTCTTAGGTTTGAACACTTT	91415

BX120004.8	751	TTTTAATGGTATTTCAATAGATCCATCTACAGAGCCTCGCAGGGTGTTAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91416	TTTTAATGGTATTTCAATAGATCCATCTACAGAGCCTCGCAGGGTGTTAC	91465

BX120004.8	801	TTGCAGTTGGCCTTTAATACCTTAAGTGGGTCTGCTTAAAAACTAATTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91466	TTGCAGTTGGCCTTTAATACCTTAAGTGGGTCTGCTTAAAAACTAATTGT	91515

BX120004.8	851	TTTTATGTTAATCAGGTTTTAAAAATACTAAGTGTTCCTAAGAAATATAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91516	TTTTATGTTAATCAGGTTTTAAAAATACTAAGTGTTCCTAAGAAATATAC	91565

BX120004.8	901	ACACCACTTAGATGTGGATACTTCCTAAAAACAGGCAGTGCATGAGCACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91566	ACACCACTTAGATGTGGATACTTCCTAAAAACAGGCAGTGCATGAGCACT	91615

BX120004.8	951	GGTGATGGACATTGTGACTGCATCGAGCGCTTGCAACTTTGAGGTGAATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91616	GGTGATGGACATTGTGACTGCATCGAGCGCTTGCAACTTTGAGGTGAATG	91665

BX120004.8	1001	AAGTCTGTACTGACTCCTGGTTGCAACACATAGGAACACAGTGGCTACTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91666	AAGTCTGTACTGACTCCTGGTTGCAACACATAGGAACACAGTGGCTACTT	91715

BX120004.8	1051	TGTATTGAGGAGATGTCCTGGACTCACAGAAACTCAGGGCTATGGAATAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91716	TGTATTGAGGAGATGTCCTGGACTCACAGAAACTCAGGGCTATGGAATAA	91765

BX120004.8	1101	AGGTAAATTTAAAACACCACAAGCGGGAGTCACAGATACCTTGTTTGCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91766	AGGTAAATTTAAAACACCACAAGCGGGAGTCACAGATACCTTGTTTGCAA	91815

BX120004.8	1151	AAGTGAAACTTAGGAGCTTTGTGAGTCCTGTTGTAATGCTTTTAGACACT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91816	AAGTGAAACTTAGGAGCTTTGTGAGTCCTGTTGTAATGCTTTTAGACACT	91865

BX120004.8	1201	TTATATATCAAGGGGCCAAAGTCACATGTTTTTACCGATTAGATTCCTGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91866	TTATATATCAAGGGGCCAAAGTCACATGTTTTTACCGATTAGATTCCTGA	91915

BX120004.8	1251	TCATTCAGGGGTTACCAAGATTCTGCTACCCACTGTAGTTAATACACAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91916	TCATTCAGGGGTTACCAAGATTCTGCTACCCACTGTAGTTAATACACAAA	91965

BX120004.8	1301	AAGCAAACTGGTCTCTATACTATCTCATGCACCCAGGCACAACTTTTCCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	91966	AAGCAAACTGGTCTCTATACTATCTCATGCACCCAGGCACAACTTTTCCA	92015

BX120004.8	1351	GATTTAAAGAAAAAGAAAAAAGAAATAAAAGAAAAAAACCTCTGTCTCTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92016	GATTTAAAGAAAAAGAAAAAAGAAATAAAAGAAAAAAACCTCTGTCTCTA	92065

BX120004.8	1401	CACCTCCATTCCCAGGGAGAGCTCCCTCTCTGGCACCAAGCTCCCTGGGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92066	CACCTCCATTCCCAGGGAGAGCTCCCTCTCTGGCACCAAGCTCCCTGGGG	92115

BX120004.8	1451	TGAGTTTTCTTTTTGAAGAGTCCAGGGGAACAGGTAAGCAGTGGGGAAGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92116	TGAGTTTTCTTTTTGAAGAGTCCAGGGGAACAGGTAAGCAGTGGGGAAGC	92165

BX120004.8	1501	AGGGAGTCCATTTCAGGGACAGGAATTCCCGGATGAAAAGTGAAAGGAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92166	AGGGAGTCCATTTCAGGGACAGGAATTCCCGGATGAAAAGTGAAAGGAGA	92215

BX120004.8	1551	GGGACGGGGCCCAAGCTGAGGGTTTCTTCCTGGTTTCTCGGACAGCTCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92216	GGGACGGGGCCCAAGCTGAGGGTTTCTTCCTGGTTTCTCGGACAGCTCCT	92265

BX120004.8	1601	GGACCAAGACTCAGGGAACATTGAGACAGAGCGTTTGTCACAGGAGGAGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92266	GGACCAAGACTCAGGGAACATTGAGACAGAGCGTTTGTCACAGGAGGAGC	92315

BX120004.8	1651	GGGGTCAGGGCGAAGTCCCAGAGCCCCAGGCATGGCTCTCAGGGTCTCAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92316	GGGGTCAGGGCGAAGTCCCAGAGCCCCAGGCATGGCTCTCAGGGTCTCAG	92365

BX120004.8	1701	GCCCCGAAGGCGGTGCATGGGCTGGGGAGGTGCAGCATTGGGGATTCCCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92366	GCCCCGAAGGCGGTGCATGGGCTGGGGAGGTGCAGCATTGGGGATTCCCC	92415

BX120004.8	1751	ATCTCCGCAGAGTTTCTCTTCTCCCTCTCCCAGCCTGCGACGGGTCCTTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92416	ATCTCCGCAGAGTTTCTCTTCTCCCTCTCCCAGCCTGCGACGGGTCCTTC	92465

BX120004.8	1801	TTCCTGGACACTCACGACGCGGACCCAGTTCTCACTCCCACTGAGTGTCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92466	TTCCTGGACACTCACGACGCGGACCCAGTTCTCACTCCCACTGAGTGTCG	92515

BX120004.8	1851	GGTTTCTAGGGAAGCCAATCAGCGTCGCGCGGCCCCGGTTCTAAAGTCCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92516	GGTTTCTAGGGAAGCCAATCAGCGTCGCGCGGCCCCGGTTCTAAAGTCCC	92565

BX120004.8	1901	CACGCACCCACCGGGACTCGGAGTCTCCCCAGACGCCGACGATGGGGTCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92566	CACGCACCCACCGGGACTCGGAGTCTCCCCAGACGCCGACGATGGGGTCA	92615

BX120004.8	1951	TGGCGCCCCGAACCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGGACCCTGGCCCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005091.7	92616	TGGCGCCCCGAACCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGGACCCTGGCCCTGGCC	92665

Overview

Query
BX120004.8 - 4836 bps
Hit
BX005091.7 - 92665 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link