<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX640455.19	73726	GAATTCTCTATGTGCACAATTACAATTGAATTTTAACTTAAAATGATCAT	73775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1	GAATTCTCTATGTGCACAATTACAATTGAATTTTAACTTAAAATGATCAT	50

BX640455.19	73776	AGCTCAACATATTACCATCATCATCCATTAAATGAATTACATTCCAAATT	73825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	51	AGCTCAACATATTACCATCATCATCCATTAAATGAATTACATTCCAAATT	100

BX640455.19	73826	CCTTTGTCAAACCAGTCTTTAAAAAATAAAGATTTCCTCTCATGTAGAAA	73875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	101	CCTTTGTCAAACCAGTCTTTAAAAAATAAAGATTTCCTCTCATGTAGAAA	150

BX640455.19	73876	AACACACCTGTTATTCCAAATGATAACATTATGTGGAGTAAAATTGTGCT	73925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	151	AACACACCTGTTATTCCAAATGATAACATTATGTGGAGTAAAATTGTGCT	200

BX640455.19	73926	TGTACAACATCTTCCAATATAGTTACACTTCTGCATGAAAACCAGACAAT	73975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	201	TGTACAACATCTTCCAATATAGTTACACTTCTGCATGAAAACCAGACAAT	250

BX640455.19	73976	TTAAATGGCAATTTTAGTAAGTCAAAATCACATTTTAGAAAAAAAGAAAT	74025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	251	TTAAATGGCAATTTTAGTAAGTCAAAATCACATTTTAGAAAAAAAGAAAT	300

BX640455.19	74026	TCCTCCCATCCTTTGAAAAATATGAAAAGGGATGCTAAACCATAAAGACG	74075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	301	TCCTCCCATCCTTTGAAAAATATGAAAAGGGATGCTAAACCATAAAGACG	350

BX640455.19	74076	GTTCATCTTTAACAAAGCTTTGTAACCATTTTAACTTCATTACTCCATTT	74125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	351	GTTCATCTTTAACAAAGCTTTGTAACCATTTTAACTTCATTACTCCATTT	400

BX640455.19	74126	ATAACGCCAAAATCAATAACATTCAACCCCCCTTCCTCTGATAACTTCAC	74175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	401	ATAACGCCAAAATCAATAACATTCAACCCCCCTTCCTCTGATAACTTCAC	450

BX640455.19	74176	CAAATCATTTTTCAAAATAAATGTTGCTTATTGTTCCAAAATAAACTCAT	74225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	451	CAAATCATTTTTCAAAATAAATGTTGCTTATTGTTCCAAAATAAACTCAT	500

BX640455.19	74226	AATGAACTCTGTTAATTTGTTTAATACATCTTTCTGTTACACCTAAGCAA	74275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	501	AATGAACTCTGTTAATTTGTTTAATACATCTTTCTGTTACACCTAAGCAA	550

BX640455.19	74276	TATGCTGGATAGATTAATCTTGATATTGCTTCCATTTTTGTTAATAATAT	74325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	551	TATGCTGGATAGATTAATCTTGATATTGCTTCCATTTTTGTTAATAATAT	600

BX640455.19	74326	TCTCCCAAAAAATTAAATATTTCTTTGTAACCAGCTACTTAATGTTTTTT	74375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	601	TCTCCCAAAAAATTAAATATTTCTTTGTAACCAGCTACTTAATGTTTTTT	650

BX640455.19	74376	TTTTTATTTTTCTGTACAACAGTATGAATATTATTATTTTCCCTGTCCCT	74425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	651	TTTTTATTTTTCTGTACAACAGTATGAATATTATTATTTTCCCTGTCCCT	700

BX640455.19	74426	AAATTTTTTTGTAATAGTTATTTCCAAGTATGTTATTTAGCTTTTAATTG	74475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	701	AAATTTTTTTGTAATAGTTATTTCCAAGTATGTTATTTAGCTTTTAATTG	750

BX640455.19	74476	GGATATTATACAATGAATTTTATGTATTATTGTGAAGAATTAGAATCTCA	74525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	751	GGATATTATACAATGAATTTTATGTATTATTGTGAAGAATTAGAATCTCA	800

BX640455.19	74526	CATTTTTTCAAATTTAAATGTAACCCTGAAGCATTAGAAAACAATGATAT	74575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	801	CATTTTTTCAAATTTAAATGTAACCCTGAAGCATTAGAAAACAATGATAT	850

BX640455.19	74576	AGACTTTAAGGCAATCGGTATTTGATTAGAGTCCTTCAGAAATCAAGTTG	74625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	851	AGACTTTAAGGCAATCGGTATTTGATTAGAGTCCTTCAGAAATCAAGTTG	900

BX640455.19	74626	TATCATCAGCTAGTTGTGTAATTAACAAGGATCTACTCAGAACATTTAAT	74675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	901	TATCATCAGCTAGTTGTGTAATTAACAAGGATCTACTCAGAACATTTAAT	950

BX640455.19	74676	GGCTTAATATTGTCGTTATTTTTAATATACAGTGCTAATAATTCAGCAGC	74725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	951	GGCTTAATATTGTCGTTATTTTTAATATACAGTGCTAATAATTCAGCAGC	1000

BX640455.19	74726	AAGTAAGAAAGAAGGGGGCTGACTGGATCTCCCTGTCGTATTTCCCTTCT	74775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1001	AAGTAAGAAAGAAGGGGGCTGACTGGATCTCCCTGTCGTATTTCCCTTCT	1050

BX640455.19	74776	GATATCAAATCTCTTTGTAGTACCCGATTGAAGTAAAACAGCACTTGTTA	74825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1051	GATATCAAATCTCTTTGTAGTACCCGATTGAAGTAAAACAGCACTTGTTA	1100

BX640455.19	74826	TTTGTTATATTGTCAACATTGAAAGAATATTAATAAATTTTGTCCCAAAC	74875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1101	TTTGTTATATTGTCAACATTGAAAGAATATTAATAAATTTTGTCCCAAAC	1150

BX640455.19	74876	CCAAAATATTGTTGAGACTGAAAAACAAAAGGGTGTTCAAGTTTATCAAA	74925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1151	CCAAAATATTGTTGAGACTGAAAAACAAAAGGGTGTTCAAGTTTATCAAA	1200

BX640455.19	74926	AGCTTTTAGAAAATCCAGAAATAGTATTATACCATCATCCTCTATCAAAT	74975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1201	AGCTTTTAGAAAATCCAGAAATAGTATTATACCATCATCCTCTATCAAAT	1250

BX640455.19	74976	GTGAATAGTCTAATAAATCTAACACCATGCGAATGTTATTATGTATTAGT	75025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1251	GTGAATAGTCTAATAAATCTAACACCATGCGAATGTTATTATGTATTAGT	1300

BX640455.19	75026	CGATTTAGAAGAAACCCAGATTGTGTATCACTAATAATTTTACCTATACC	75075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1301	CGATTTAGAAGAAACCCAGATTGTGTATCACTAATAATTTTACCTATACC	1350

BX640455.19	75076	ACCTTTAAGTCTACTAGCTAATGCATGAGTGAATATTTTGTAATCAATGT	75125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1351	ACCTTTAAGTCTACTAGCTAATGCATGAGTGAATATTTTGTAATCAATGT	1400

BX640455.19	75126	TAAGTAAAGTAATTGGTCTTAAATTATCAATAAGAGAGTTGTCTTTTTTT	75175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1401	TAAGTAAAGTAATTGGTCTTAAATTATCAATAAGAGAGTTGTCTTTTTTT	1450

BX640455.19	75176	GTTTAGGTATTAAAACAATTATAGCCTGTTTCATTGTAGTTAGTAGTGTA	75225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1451	GTTTAGGTATTAAAACAATTATAGCCTGTTTCATTGTAGTTAGTAGTGTA	1500

BX640455.19	75226	TGACTTTCTAAACATTCTATTAGTGCTTTAAAGAGCATTTCTCTCATATC	75275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1501	TGACTTTCTAAACATTCTATTAGTGCTTTAAAGAGCATTTCTCTCATATC	1550

BX640455.19	75276	ATTCCAGAAAAAAGATAAAAGTTAGTTGCAAGTCCATCTTGACCTGGTGA	75325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1551	ATTCCAGAAAAAAGATAAAAGTTAGTTGCAAGTCCATCTTGACCTGGTGA	1600

BX640455.19	75326	TTTACCTAAAGCCATTTTTTTAATAGCAGCATCAAGTTCTTCAATTTTTA	75375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1601	TTTACCTAAAGCCATTTTTTTAATAGCAGCATCAAGTTCTTCAATTTTTA	1650

BX640455.19	75376	AATCAGAGTCACATATCATTTTAAAATCTTCATCAATTTTAGGAATAAAA	75425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1651	AATCAGAGTCACATATCATTTTAAAATCTTCATCAATTTTAGGAATAAAA	1700

BX640455.19	75426	TTATAGAATTTTTGAAGAAATTCTCAGAATCTTTCATGGAAAATGATGAT	75475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1701	TTATAGAATTTTTGAAGAAATTCTCAGAATCTTTCATGGAAAATGATGAT	1750

BX640455.19	75476	GAATATAGGCTTTGATAAAATTTAAAAATCTCATTACTTATTTATTTTGG	75525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1751	GAATATAGGCTTTGATAAAATTTAAAAATCTCATTACTTATTTATTTTGG	1800

BX640455.19	75526	ATCAGTTACAATTTTATTAATTGGATTTAAGGTGGTAATTGCATTTCTGT	75575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1801	ATCAGTTACAATTTTATTAATTGGATTTAAGGTGGTAATTGCATTTCTGT	1850

BX640455.19	75576	CTACTTTTTTCTAATCTACTAAAATAAGAGCTGTTTTTTACACCAACTTC	75625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1851	CTACTTTTTTCTAATCTACTAAAATAAGAGCTGTTTTTTACACCAACTTC	1900

BX640455.19	75626	CATCCATTTTGCTCTAGATCGTATAAATGCCCCTTGTGCCCTATTTAAGT	75675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1901	CATCCATTTTGCTCTAGATCGTATAAATGCCCCTTGTGCCCTATTTAAGT	1950

BX640455.19	75676	AGAAATCGTCTAATTTAGTTTGTAATCTAATCATTTCCTCTTTATTAGGT	75725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005078.32	1951	AGAAATCGTCTAATTTAGTTTGTAATCTAATCATTTCCTCTTTATTAGGT	2000

Overview

Query
BX640455.19 - 75725 bps
Hit
BX005078.32 - 135288 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001853200073726757251120001
299.131338214264614627572516769210551
398.2817887196325119670827111556312011
498.07836493562679036145112450218481
598.0413964155045119666699126633421491
698.18681776292997737605130746384251
799.47448949007082675725131248361411
899.5310842112093792749135138424496251
997.88676474642395431417151771592971
1096.48401446385208856725154636592971
1194.98362748055674061544159516643181
1299.6321711226112441747027166378889821
1397.319428108805208862967168761795711
1497.26741185736715375725168761773211
1597.069179104364629056725187921983471
1695.39374745676626170827192797973571
1797.61197613652239543760511053841190081
1897.241461216630551367176511111911278131
1997.8548415534701927572511111911167531
2092.4940625530511965672511222991278131
2197.7141944628267903141711231861278131
Short-link