<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX276112.19	144066	GAATTCACCCAGGAATTCAAGGCGGTGAAAGAGCAGTCGGATGCGATGGG	144115
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1	GAATTCACCCAGGAATTCAAGGCGGTGAAAGAGCAGTCGGATGCGATGGG	50

BX276112.19	144116	CAATGTCATCTATCGGCGTGGCCGTAAGCCCGCTCCGCCCGCCGAGCCAT	144165
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	51	CAATGTCATCTATCGGCGTGGCCGTAAGCCCGCTCCGCCCGCCGAGCCAT	100

BX276112.19	144166	CCACCTCCACTGTTCCTCGCCGAGGGCGCCCGCCAACGAGTGCTGCCCCG	144215
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	101	CCACCTCCACTGTTCCTCGCCGAGGGCGCCCGCCAACGAGTGCTGCCCCG	150

BX276112.19	144216	CCCCCGCCTGCGCCTCCGGCCAAGCGGGCGCGGCGTTCACCTCGAAAGCA	144265
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	151	CCCCCGCCTGCGCCTCCGGCCAAGCGGGCGCGGCGTTCACCTCGAAAGCA	200

BX276112.19	144266	GGCAGCCCCTCCTGCCCAGGGCGCCGTTAAGTCCGGTAAACGGACCGCGA	144315
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	201	GGCAGCCCCTCCTGCCCAGGGCGCCGTTAAGTCCGGTAAACGGACCGCGA	250

BX276112.19	144316	AGCGTCCCTGAGACAGGCCATCCGGAGAAGAGGAAACTTGCTCTTTCCCC	144365
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	251	AGCGTCCCTGAGACAGGCCATCCGGAGAAGAGGAAACTTGCTCTTTCCCC	300

BX276112.19	144366	GCTGGAGGGCGGGGCCCCGATAACAACGGTACTTTTCAGTGCCACCAAAA	144415
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	301	GCTGGAGGGCGGGGCCCCGATAACAACGGTACTTTTCAGTGCCACCAAAA	350

BX276112.19	144416	CATCAGTAAAAGAGCACTTTTTCCCTTCCCCGGATGTGACTGCACGAGTT	144465
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	351	CATCAGTAAAAGAGCACTTTTTCCCTTCCCCGGATGTGACTGCACGAGTT	400

BX276112.19	144466	CTGCCAGTCCGGGACGCGCTGCCTTCCGGCTCGCAGACTCTACGTGCTTC	144515
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	401	CTGCCAGTCCGGGACGCGCTGCCTTCCGGCTCGCAGACTCTACGTGCTTC	450

BX276112.19	144516	GCCAGTGGCTCACGAGCGCTGGGGGGACGGTCTCCCTTTCCTCAGCCCTC	144565
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	451	GCCAGTGGCTCACGAGCGCTGGGGGGACGGTCTCCCTTTCCTCAGCCCTC	500

BX276112.19	144566	CAGCCCCCTCTCCGGAGTCAGGGTGCGGAGCCAGAGCGAATCGCTCTCCT	144615
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	501	CAGCCCCCTCTCCGGAGTCAGGGTGCGGAGCCAGAGCGAATCGCTCTCCT	550

BX276112.19	144616	CCAGCTCTTCCGCGGGACCCTCGTGCTTCCCGGATCAGCACACCCACTCC	144665
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	551	CCAGCTCTTCCGCGGGACCCTCGTGCTTCCCGGATCAGCACACCCACTCC	600

BX276112.19	144666	GCGCTGCCCCACCGCTGGTACGTCAGCGATTGTAGCGATGACTCCATTAG	144715
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	601	GCGCTGCCCCACCGCTGGTACGTCAGCGATTGTAGCGATGACTCCATTAG	650

BX276112.19	144716	CGAGGGCTCTGCCTGCCTGGTTAGCGCGGGCCAGCCCCTCGCGGTGGCTC	144765
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	651	CGAGGGCTCTGCCTGCCTGGTTAGCGCGGGCCAGCCCCTCGCGGTGGCTC	700

BX276112.19	144766	ATACGCACAATCAGACTCGGTTACGCGATTCAGTTCGCGAAACGGCCCCC	144815
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	701	ATACGCACAATCAGACTCGGTTACGCGATTCAGTTCGCGAAACGGCCCCC	750

BX276112.19	144816	CAAGTTTACGGGCGTGTATTTCTCCAGGGTCAACCCCCTGTCCGCCCCTG	144865
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	751	CAAGTTTACGGGCGTGTATTTCTCCAGGGTCAACCCCCTGTCCGCCCCTG	800

BX276112.19	144866	TCTTGCGAGAGGAGATTGCTGCCCTCCTGGCGAAGGGTGCAATCGAGCCG	144915
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	801	TCTTGCGAGAGGAGATTGCTGCCCTCCTGGCGAAGGGTGCAATCGAGCCG	850

BX276112.19	144916	GTTCCTCCAGCCGAGATGGAGAGTGGGTTTTACAGCCCATACTTCATCGT	144965
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	851	GTTCCTCCAGCCGAGATGGAGAGTGGGTTTTACAGCCCATACTTCATCGT	900

BX276112.19	144966	ACCCAAAAAGAGCGGTGGGTCACGGCCAATCTTAGATCTGCGCGTTTTGA	145015
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	901	ACCCAAAAAGAGCGGTGGGTCACGGCCAATCTTAGATCTGCGCGTTTTGA	950

BX276112.19	145016	ACCGCTGTCTGCACAAGCTGCCGTTCAGAATGCTCACGCAGAGGCGCATT	145065
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	951	ACCGCTGTCTGCACAAGCTGCCGTTCAGAATGCTCACGCAGAGGCGCATT	1000

BX276112.19	145066	CTCCAATGCGTTCGTCCTCGGGATTGGTTTGCAGCCATAGACCTGAAGGA	145115
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1001	CTCCAATGCGTTCGTCCTCGGGATTGGTTTGCAGCCATAGACCTGAAGGA	1050

BX276112.19	145116	CGCGTATTTCCATGTCTCCATTCTTCCACGCCACCGCCAATTTCTGCGGT	145165
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1051	CGCGTATTTCCATGTCTCCATTCTTCCACGCCACCGCCAATTTCTGCGGT	1100

BX276112.19	145166	TTGCGTTCGAGGGTCGAGCGTGGCAGTACAAGGTCCTCCCCTTCGGGCTC	145215
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1101	TTGCGTTCGAGGGTCGAGCGTGGCAGTACAAGGTCCTCCCCTTCGGGCTC	1150

BX276112.19	145216	TCTCTGTCTCCGCGGGTCTTCACCAAACTCGCGGAGGGTGCCCTAGCGCC	145265
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1151	TCTCTGTCTCCGCGGGTCTTCACCAAACTCGCGGAGGGTGCCCTAGCGCC	1200

BX276112.19	145266	CCTTCGGCTCGCGGGCATTCGCATACTCAATTATCTCGACGACTGGCTGA	145315
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1201	CCTTCGGCTCGCGGGCATTCGCATACTCAATTATCTCGACGACTGGCTGA	1250

BX276112.19	145316	TTTTAGCCCACTCGCGGGAGCAATTGATTATGCACAGGGACAAGGTGCTT	145365
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1251	TTTTAGCCCACTCGCGGGAGCAATTGATTATGCACAGGGACAAGGTGCTT	1300

BX276112.19	145366	CGGCATCTCCGCCTACTGGGGCTTCAGGTCAACCGAGAAAAGAGCAAACT	145415
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1301	CGGCATCTCCGCCTACTGGGGCTTCAGGTCAACCGAGAAAAGAGCAAACT	1350

BX276112.19	145416	CGCCCCCGTGCAGAGGATTTCTTTTCTCGGGATGGAGCTGGACTCGATCA	145465
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1351	CGCCCCCGTGCAGAGGATTTCTTTTCTCGGGATGGAGCTGGACTCGATCA	1400

BX276112.19	145466	CCATGGTAGCGCACCTCTCCGAGGAACGCGCTCGCCTGTTGCTGAACTGT	145515
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1401	CCATGGTAGCGCACCTCTCCGAGGAACGCGCTCGCCTGTTGCTGAACTGT	1450

BX276112.19	145516	CTGAGGGAGCTCGACAGCAAACTAGTGGTCCCACTGAAGTTCTTTCAGAG	145565
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1451	CTGAGGGAGCTCGACAGCAAACTAGTGGTCCCACTGAAGTTCTTTCAGAG	1500

BX276112.19	145566	GCTCCTGGGGCATATGGCATCCGCAGCCGCCGTCACGCCGCTCGGGTTGC	145615
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1501	GCTCCTGGGGCATATGGCATCCGCAGCCGCCGTCACGCCGCTCGGGTTGC	1550

BX276112.19	145616	TCCATATGAGACCACTTCAGCACTGGCTTCACGATCGGGTCCCCAGACGC	145665
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1551	TCCATATGAGACCACTTCAGCACTGGCTTCACGATCGGGTCCCCAGACGC	1600

BX276112.19	145666	GCATGGCACGCGGGCACACACCGGGTCTCGGTTACTGCGCTGTGTCGCCG	145715
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1601	GCATGGCACGCGGGCACACACCGGGTCTCGGTTACTGCGCTGTGTCGCCG	1650

BX276112.19	145716	CGCCCTCAGCCCTTGGAACGACCCCTCGTTCCTACAGGCCGGTGTGCCTC	145765
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1651	CGCCCTCAGCCCTTGGAACGACCCCTCGTTCCTACAGGCCGGTGTGCCTC	1700

BX276112.19	145766	TAGGACAGGCGTCCAGCCATGTTGTTGTTTCAACAGACGCTTCCAACACG	145815
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1701	TAGGACAGGCGTCCAGCCATGTTGTTGTTTCAACAGACGCTTCCAACACG	1750

BX276112.19	145816	GGTTGGGGGGCCGTGTGTCGCGGGCATGCGGCTGCGGGCCTCTGGAAGGG	145865
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1751	GGTTGGGGGGCCGTGTGTCGCGGGCATGCGGCTGCGGGCCTCTGGAAGGG	1800

BX276112.19	145866	TGCCCAGCTGCATTGGCATATCAATCGCCTAGAGCTGTTGGCAGTGTTCC	145915
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1801	TGCCCAGCTGCATTGGCATATCAATCGCCTAGAGCTGTTGGCAGTGTTCC	1850

BX276112.19	145916	TCGCTCTCCACCGCTTTTTACCGGTGCTGGAGCGGCAACACGTGCTGGTC	145965
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1851	TCGCTCTCCACCGCTTTTTACCGGTGCTGGAGCGGCAACACGTGCTGGTC	1900

BX276112.19	145966	AGGACGGACAGTATGGCGGCGGCGGCGTATATCAACCGCATGGGGGGTAT	146015
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1901	AGGACGGACAGTATGGCGGCGGCGGCGTATATCAACCGCATGGGGGGTAT	1950

BX276112.19	146016	GCGCTCTCGCCGCATGTCTCAGCTCGCCCGCCGTCTGCTCCTCTGGAGTC	146065
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005067.6	1951	GCGCTCTCGCCGCATGTCTCAGCTCGCCCGCCGTCTGCTCCTCTGGAGTC	2000

Overview

Query
BX276112.19 - 146065 bps
Hit
BX005067.6 - 162692 bps
Total alignments
25
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100195420001440661460651120001
298.27163173142488142660-1432744991
398.25675745137266138010-1473154721
498.2368113955696681714072521
581.56621461011510260-116394165341
688.53191302108038108339-126990272941
788.46155253141707141959127033272921
890.011542308069580924127065272941
984.51681504905449203-130741308951
1086.491011844211242295130776309601
1189.2971111141708141818130848309591
1289.6555878069580781130879309651
1386.6165112108035108146-130969310801
1498.32821194199642114135215353331
1592.72791514196442114-135674358241
1697.065310295619662140792408931
1792.31581312954529675147300474291
1895.866814576067750158265584091
1998.2653115115301115415158266583801
2098.27163173142488142660191818919901
2199.8134993592142474146065-194315979061
2290.552436355714250914606511088501124031
2386.02124233942069443811162351164631
2492.895125805678069111479231480471
2591.9879160419554211411570791572401
Short-link