<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929596.11	1	ACTTCATAAATGCACAATGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGAGATATGGGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	135478	ACTTCATAAATGCACAATGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGAGATATGGGG	135527

AL929596.11	51	TGATTGATGCAAATGTGCAAAAACTGGTGCAAGTGTCAGTTAAAGTGACA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	135528	TGATTGATGCAAATGTGCAAAAACTGGTGCAAGTGTCAGTTAAAGTGACA	135577

AL929596.11	101	GAAAGATAAAAGTGTTTGTTTTCTACAGGTGGTTTGTCAAGCCCACTCAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	135578	GAAAGATAAAAGTGTTTGTTTTCTACAGGTGGTTTGTCAAGCCCACTCAC	135627

AL929596.11	151	CTGTGTGTTTCACTCTTCATAAATGCACAATGTTTTTTTTTTTTTTTTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	135628	CTGTGTGTTTCACTCTTCATAAATGCACAATGTTTTTTTTTTTTTTTTTT	135677

AL929596.11	201	AGAGATATGGGGTGATTGATGCAAATGTGCAAGAACTGGTGCAAGTGTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	135678	AGAGATATGGGGTGATTGATGCAAATGTGCAAGAACTGGTGCAAGTGTCA	135727

AL929596.11	251	GTTAAAGTGACAGAAAGATAAAAGTGTGTTTTTTCTACAGGTGGTTTGTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	135728	GTTAAAGTGACAGAAAGATAAAAGTGTGTTTTTTCTACAGGTGGTTTGTC	135777

AL929596.11	301	AAGCCCACTCACCTGTGTGAGCCACACTTAATTACATAAATGTTTTGAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	135778	AAGCCCACTCACCTGTGTGAGCCACACTTAATTACATAAATGTTTTGAGG	135827

AL929596.11	351	TTGTCATGTGGTGTGCTGAGGGGCAGAGAAAAGGCGGTCCTGGTCTTGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	135828	TTGTCATGTGGTGTGCTGAGGGGCAGAGAAAAGGCGGTCCTGGTCTTGTT	135877

AL929596.11	401	TACAGGGGTTCAGGTGATCGTGGAAGAGATGGGTTTTAGTTGTCATTTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	135878	TACAGGGGTTCAGGTGATCGTGGAAGAGATGGGTTTTAGTTGTCATTTGA	135927

AL929596.11	451	ATGATACTAAATGTTATTCAGTGTAACAATAGAAGTCACAAAAATCATTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	135928	ATGATACTAAATGTTATTCAGTGTAACAATAGAAGTCACAAAAATCATTT	135977

AL929596.11	501	GATAACAATAAAAAAAATCTATTTACAGATTTGCACTAAAATAGTATCAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	135978	GATAACAATAAAAAAAATCTATTTACAGATTTGCACTAAAATAGTATCAT	136027

AL929596.11	551	CATGTTTCCCCTAAATTTTATCCTTCAAACCACAAGGTTTTAACCATATC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136028	CATGTTTCCCCTAAATTTTATCCTTCAAACCACAAGGTTTTAACCATATC	136077

AL929596.11	601	CCTGCAATACGTTTTTGTAACATAAAATACAATACAATTAAATATGATCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136078	CCTGCAATACGTTTTTGTAACATAAAATACAATACAATTAAATATGATCA	136127

AL929596.11	651	CTTATTCTTTTAGATATTTTAAGAAGTGTGGGTCAGAATAAGAATGCTAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136128	CTTATTCTTTTAGATATTTTAAGAAGTGTGGGTCAGAATAAGAATGCTAT	136177

AL929596.11	701	TGAATTTTTCCATGAAAATTGAGCATTATTTCAACCATATTTTGAAATTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136178	TGAATTTTTCCATGAAAATTGAGCATTATTTCAACCATATTTTGAAATTT	136227

AL929596.11	751	TCACTGATGTATTTTGAAATATTTGCATTTAACATGCTTGCTATAAAATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136228	TCACTGATGTATTTTGAAATATTTGCATTTAACATGCTTGCTATAAAATA	136277

AL929596.11	801	AAATCATGTTTGTAAACCTAAATTAACGTGAACACCAAAATAGGAAGTCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136278	AAATCATGTTTGTAAACCTAAATTAACGTGAACACCAAAATAGGAAGTCT	136327

AL929596.11	851	AATTTTTGACTCTCAATTAGAAAATCCCGTTTTACATTTAACCTCTGAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136328	AATTTTTGACTCTCAATTAGAAAATCCCGTTTTACATTTAACCTCTGAGC	136377

AL929596.11	901	AATAAATCCTCCTGCATGTTAAATAAGCACCAAAATAACCAAATACTGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136378	AATAAATCCTCCTGCATGTTAAATAAGCACCAAAATAACCAAATACTGCT	136427

AL929596.11	951	CCTTTTACAACAAACGTTTCTACACTTTTAAGAGAGAAAAGCTGTGATAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136428	CCTTTTACAACAAACGTTTCTACACTTTTAAGAGAGAAAAGCTGTGATAG	136477

AL929596.11	1001	CAGTGAACTTATCATCTGCCAATGTTAAACTCTGGTCAATTTCAGGTCTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136478	CAGTGAACTTATCATCTGCCAATGTTAAACTCTGGTCAATTTCAGGTCTA	136527

AL929596.11	1051	TTGACGACTTCGTCCATTTGATTCTCTTCCAAGCGTCTGACTTGAGACGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136528	TTGACGACTTCGTCCATTTGATTCTCTTCCAAGCGTCTGACTTGAGACGG	136577

AL929596.11	1101	CTAATGTTGATGACTCTGGTAACTGGCAGGCTGTTTTTTTTCCATTAGGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136578	CTAATGTTGATGACTCTGGTAACTGGCAGGCTGTTTTTTTTCCATTAGGC	136627

AL929596.11	1151	TGCAGTGCCTTAGATGCATTGCAGCAGCGAGCGGTATAGATCAATACGTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136628	TGCAGTGCCTTAGATGCATTGCAGCAGCGAGCGGTATAGATCAATACGTA	136677

AL929596.11	1201	GAAAGAGTGCTTATCTTTAGAGCCATTCCCACTGGTGCACAGCAATTACA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136678	GAAAGAGTGCTTATCTTTAGAGCCATTCCCACTGGTGCACAGCAATTACA	136727

AL929596.11	1251	GGCCTGACACTGACTAGCTAAATCAATTCTAGCATCTTGTCAGCACATAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136728	GGCCTGACACTGACTAGCTAAATCAATTCTAGCATCTTGTCAGCACATAA	136777

AL929596.11	1301	AGATAGTGAGAAAGCACGGCGGGCACTGCTAACGTAAAGTTCGAGAAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136778	AGATAGTGAGAAAGCACGGCGGGCACTGCTAACGTAAAGTTCGAGAAAAA	136827

AL929596.11	1351	GCGAAAGGTAAACATAAGACAACAAATCTACAAATAGCAGCAATAAGCAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136828	GCGAAAGGTAAACATAAGACAACAAATCTACAAATAGCAGCAATAAGCAC	136877

AL929596.11	1401	TAGTTGAAGAGTTCGAGCGTTGCAGCTTCCAATGGGTGGGTTTTAATGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136878	TAGTTGAAGAGTTCGAGCGTTGCAGCTTCCAATGGGTGGGTTTTAATGCC	136927

AL929596.11	1451	CGCTTCTTTTTCCTTGAGCCTTTGGCAGTGCAGGGGCCACTTTTAAAAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136928	CGCTTCTTTTTCCTTGAGCCTTTGGCAGTGCAGGGGCCACTTTTAAAAAA	136977

AL929596.11	1501	AGGACAAACATCAATTGGGAGCTGGCGCTCAGCCACTTTGTGTTCGGTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	136978	AGGACAAACATCAATTGGGAGCTGGCGCTCAGCCACTTTGTGTTCGGTTC	137027

AL929596.11	1551	CCTTTGACTGAACCTCCTCTACTCTGTCTATCTCCCTCCCCCAGTACGAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	137028	CCTTTGACTGAACCTCCTCTACTCTGTCTATCTCCCTCCCCCAGTACGAT	137077

AL929596.11	1601	GTTGTCTTCAGGGGAACAGCGTAGTCCTGGCCAGTGCTTCCATGTGCCTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	137078	GTTGTCTTCAGGGGAACAGCGTAGTCCTGGCCAGTGCTTCCATGTGCCTC	137127

AL929596.11	1651	CATGGGTTCTGCGAATTTGACGCACAGCAGTGCAGGCATGCAACCGGAGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	137128	CATGGGTTCTGCGAATTTGACGCACAGCAGTGCAGGCATGCAACCGGAGG	137177

AL929596.11	1701	GGGGTCTCGGATTGCAGGATTGTGTAATGTTGGCTGGCAACGCTCCTCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	137178	GGGGTCTCGGATTGCAGGATTGTGTAATGTTGGCTGGCAACGCTCCTCAG	137227

AL929596.11	1751	TTCCAGCACCTTGGTCTCCAAGGCACAGCGTATAAGGTCACAGAGGAATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	137228	TTCCAGCACCTTGGTCTCCAAGGCACAGCGTATAAGGTCACAGAGGAATT	137277

AL929596.11	1801	CTGAAGACACTCTACAGACCTGGGTTGTGTTTAACACCGGTGAACCTGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	137278	CTGAAGACACTCTACAGACCTGGGTTGTGTTTAACACCGGTGAACCTGCA	137327

AL929596.11	1851	GTCATTTATGTGCATGCTTAAATATGCCTTATATTGCTGCAAGTATACAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	137328	GTCATTTATGTGCATGCTTAAATATGCCTTATATTGCTGCAAGTATACAA	137377

AL929596.11	1901	TATTACAGTTTTAAAAATAAGGCATAACATGTTAAAAAGTTTACAAATAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	137378	TATTACAGTTTTAAAAATAAGGCATAACATGTTAAAAAGTTTACAAATAG	137427

AL929596.11	1951	AGTAGTGGGGTTGCCCCAATGTAAAAGAAGAACCTTTTAGCAGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004882.10	137428	AGTAGTGGGGTTGCCCCAATGTAAAAGAAGAACCTTTTAGCAGAGAATTC	137477

Overview

Query
AL929596.11 - 191874 bps
Hit
BX004882.10 - 137477 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196320001200011354781374771
293.2289411609358694745-117004181541
384.84346679102619103297-121132217911
486.312624803098031459-123592240661
583.163339218917690096129820307511
692.2811631572158294159865142222438141
781.064361133145880147012151892530261
888.74381583106521107103-152411529961
991.232603625759557956174520748841
1090.2225637616519516557011029081032751
1188.3254394216550516644611031831040891
1297.134555228480985330-11035061040271
1390.93284413994469985811152741156811
1487.34318528146483147010-11212971218331
1590.22251359125207125565-11213441217011
1689.5538957310653810711011213441219171
1787.55464793306693146111319721327501
1895.61258319131911349851353031
1994.91263328232911351481354811
2094.14245318231911353111356341
Short-link