<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX000531.11	1	GGCCAGGCTGGTCTCGAACTTCTGACCTCATGATCCACCTGCCTTGGCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	30574	GGCCAGGCTGGTCTCGAACTTCTGACCTCATGATCCACCTGCCTTGGCCT	30623

BX000531.11	51	CCCAAAGAGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAGTATCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	30624	CCCAAAGAGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAGTATCC	30673

BX000531.11	101	TCATTCTTTAGCTTTGCAGAACTGAAGTAAGAAGTGACTGTGGCATCAGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	30674	TCATTCTTTAGCTTTGCAGAACTGAAGTAAGAAGTGACTGTGGCATCAGG	30723

BX000531.11	151	GAGGGAGGGTAGAAGTCAGATGGAAGGGAAGGGAGAAGGAGAGAAAGAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	30724	GAGGGAGGGTAGAAGTCAGATGGAAGGGAAGGGAGAAGGAGAGAAAGAAG	30773

BX000531.11	201	AAACAGAGGCAGGCTGAAGAACTGAGCAGAGAAAAGAGAAAGAACAAAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	30774	AAACAGAGGCAGGCTGAAGAACTGAGCAGAGAAAAGAGAAAGAACAAAAA	30823

BX000531.11	251	AGACCTCAGAGGAAGACTCACCGGCTCACAAGGAAAGCCATCTCTGTGCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	30824	AGACCTCAGAGGAAGACTCACCGGCTCACAAGGAAAGCCATCTCTGTGCA	30873

BX000531.11	301	TCCCAGGCCAATCTCTTCACAGGGCTTGGAGAAACCTCCCAACCAGAGCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	30874	TCCCAGGCCAATCTCTTCACAGGGCTTGGAGAAACCTCCCAACCAGAGCT	30923

BX000531.11	351	CACTCCCACAGTCTATGCTCACTGCTTCCCTGCATCAGCTCCTCCTGTGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	30924	CACTCCCACAGTCTATGCTCACTGCTTCCCTGCATCAGCTCCTCCTGTGG	30973

BX000531.11	401	CAGCATGGTCCCCCTGCGTTTCTGCTCCCCACTGAGCTCTCTGGGATTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	30974	CAGCATGGTCCCCCTGCGTTTCTGCTCCCCACTGAGCTCTCTGGGATTCA	31023

BX000531.11	451	CAAATCAGTGCCCTAGGGAGGGCTTGGAGAGCCTAGCACGTGGGGATCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31024	CAAATCAGTGCCCTAGGGAGGGCTTGGAGAGCCTAGCACGTGGGGATCTT	31073

BX000531.11	501	ACACAGGGGCCAGGAAAGGGATGTAGGACTCAGGAAGAGACACTGAACAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31074	ACACAGGGGCCAGGAAAGGGATGTAGGACTCAGGAAGAGACACTGAACAA	31123

BX000531.11	551	AGGCTGTGGCTCAGTCCTGGAAATGGGAGCGTGTGCTTGTCCATTGCCAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31124	AGGCTGTGGCTCAGTCCTGGAAATGGGAGCGTGTGCTTGTCCATTGCCAG	31173

BX000531.11	601	CCTCTCTGCCTCTCTAGGTTGTGTGCCCTCACTGGCCTTAACTCTTTCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31174	CCTCTCTGCCTCTCTAGGTTGTGTGCCCTCACTGGCCTTAACTCTTTCCA	31223

BX000531.11	651	GTCAGGGAAGACTAGGAAAGAGTTGGAAGAGGAAATATTGTAGAAGAAAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31224	GTCAGGGAAGACTAGGAAAGAGTTGGAAGAGGAAATATTGTAGAAGAAAG	31273

BX000531.11	701	AAGAGAACTCAGGTACATCAGGGCCACCAAGAAACAGGGGCTCTGGGTCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31274	AAGAGAACTCAGGTACATCAGGGCCACCAAGAAACAGGGGCTCTGGGTCT	31323

BX000531.11	751	CCCAGGGACATAAGGAGAAGGATTAGGAGCTGACCAGGCTTGCTACACAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31324	CCCAGGGACATAAGGAGAAGGATTAGGAGCTGACCAGGCTTGCTACACAA	31373

BX000531.11	801	AAGATTCCAGGGTTGATCCTCTGAGAGTTGAGAAAAACAGAAAGTGGGAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31374	AAGATTCCAGGGTTGATCCTCTGAGAGTTGAGAAAAACAGAAAGTGGGAT	31423

BX000531.11	851	CTCAGTGCAAACTTCAAGCTTCAAAGATGCCACCCATCATCTATTCAACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31424	CTCAGTGCAAACTTCAAGCTTCAAAGATGCCACCCATCATCTATTCAACT	31473

BX000531.11	901	TTTTTTTTCTTTTGGCTAACCCTTTACACTTCTTTCAAGTCTGCGAATAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31474	TTTTTTTTCTTTTGGCTAACCCTTTACACTTCTTTCAAGTCTGCGAATAA	31523

BX000531.11	951	TTATCAAGTTCCCACAGTGTGCCTTATTCTACATAGTGCTGGCAATCTGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31524	TTATCAAGTTCCCACAGTGTGCCTTATTCTACATAGTGCTGGCAATCTGG	31573

BX000531.11	1001	TCAACTTCCTTTGTATTTCTCCTCTGCTCAGCTTTTCAGTGGATCCTCTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31574	TCAACTTCCTTTGTATTTCTCCTCTGCTCAGCTTTTCAGTGGATCCTCTT	31623

BX000531.11	1051	CATTCTCCTTCATTCTCACTGCAGCCCAGACCCACTTCCTCCCTTCCCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31624	CATTCTCCTTCATTCTCACTGCAGCCCAGACCCACTTCCTCCCTTCCCTG	31673

BX000531.11	1101	AGCTTCCCTTGCCTATCTCCCTCCTCATCACCCAATCCCATTTCCTGCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31674	AGCTTCCCTTGCCTATCTCCCTCCTCATCACCCAATCCCATTTCCTGCAA	31723

BX000531.11	1151	GAAGAGGCAATATTATTAATCTGTCTCATCTACCATAACCACCACCTGGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31724	GAAGAGGCAATATTATTAATCTGTCTCATCTACCATAACCACCACCTGGT	31773

BX000531.11	1201	TTGTGCAATAGCATTTTCTGGATGTTTCCTCTCCTGGCAGCCAGGACTGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31774	TTGTGCAATAGCATTTTCTGGATGTTTCCTCTCCTGGCAGCCAGGACTGA	31823

BX000531.11	1251	CAATGTCACCTGCCAGGGGCCTGGAAAGCCAAGCCACAACCTTCTTAACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31824	CAATGTCACCTGCCAGGGGCCTGGAAAGCCAAGCCACAACCTTCTTAACC	31873

BX000531.11	1301	AATTAGAGGCACTGCAGAGAAGCAGCAGGAGTCAGGGCACTTGCACCCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31874	AATTAGAGGCACTGCAGAGAAGCAGCAGGAGTCAGGGCACTTGCACCCAA	31923

BX000531.11	1351	GAATGATAGATATATTTATTCACCACATATGTATGGATATAGTTAGAGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31924	GAATGATAGATATATTTATTCACCACATATGTATGGATATAGTTAGAGAA	31973

BX000531.11	1401	ACAAGCCTCAAGGCACAACGATTGACTGAGGTTAGACATTCGGCCACTTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	31974	ACAAGCCTCAAGGCACAACGATTGACTGAGGTTAGACATTCGGCCACTTG	32023

BX000531.11	1451	AGAGAATGAGGAGGTGGAAGCACAGAAGTTAAAAGTCATCTCTCTCCCAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	32024	AGAGAATGAGGAGGTGGAAGCACAGAAGTTAAAAGTCATCTCTCTCCCAT	32073

BX000531.11	1501	TTGCTTCAACCTCAGCATGCCTGAAAAAAACATGGTTGATAATATACCAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	32074	TTGCTTCAACCTCAGCATGCCTGAAAAAAACATGGTTGATAATATACCAG	32123

BX000531.11	1551	TCAGTGACCAAGCCCTAATGAAATGACTGACTTACCAATACTGACTTCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	32124	TCAGTGACCAAGCCCTAATGAAATGACTGACTTACCAATACTGACTTCTC	32173

BX000531.11	1601	AGGAGGCTGATTTAGAGCCAAAGTAACTGCTGAGTTCTGAATAAGCAGCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	32174	AGGAGGCTGATTTAGAGCCAAAGTAACTGCTGAGTTCTGAATAAGCAGCA	32223

BX000531.11	1651	CACCTGGTCTGCATAATAAGATCCATTTTGCAATCACCCTCTTCAGAAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	32224	CACCTGGTCTGCATAATAAGATCCATTTTGCAATCACCCTCTTCAGAAAG	32273

BX000531.11	1701	CCAAATAATAGGTCAAAAGGTGGTTTAGAACCCAAGCAGCGGAAATAACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	32274	CCAAATAATAGGTCAAAAGGTGGTTTAGAACCCAAGCAGCGGAAATAACA	32323

BX000531.11	1751	CAGTTGAGGACTCTGTCGACCATAGGCACCCTGATGGACCTAAATAAATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	32324	CAGTTGAGGACTCTGTCGACCATAGGCACCCTGATGGACCTAAATAAATT	32373

BX000531.11	1801	ACTCAACTTTTCACGAGAATATTTTACCTAATAACTGGAACTTATCATCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	32374	ACTCAACTTTTCACGAGAATATTTTACCTAATAACTGGAACTTATCATCC	32423

BX000531.11	1851	AGAACAATGTTTTCTGCCTCTTTGTTTTTCAGTTCATGATATTCCTGTGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	32424	AGAACAATGTTTTCTGCCTCTTTGTTTTTCAGTTCATGATATTCCTGTGG	32473

BX000531.11	1901	ACTGGCTTTACTCCTAATTTCCGACCCCAATAAGATCCTGGTCTAGTTCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	32474	ACTGGCTTTACTCCTAATTTCCGACCCCAATAAGATCCTGGTCTAGTTCT	32523

BX000531.11	1951	TGGTATCTAGACCTAATTCCCCATTTGCATAAAAGAATACAAATGATAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004810.8	32524	TGGTATCTAGACCTAATTCCCCATTTGCATAAAAGAATACAAATGATAAA	32573

Overview

Query
BX000531.11 - 89139 bps
Hit
BX004810.8 - 32573 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link