<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX511312.6	1	TACTGAATAACGAAGCACCACGTAAACGTAATTACTGCCAAGCTGCTCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94058	TACTGAATAACGAAGCACCACGTAAACGTAATTACTGCCAAGCTGCTCTT	94107

BX511312.6	51	ACCATGGAACATATTCTGTTGGAATTTGGAAGTCTGAATACCATTAGCCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94108	ACCATGGAACATATTCTGTTGGAATTTGGAAGTCTGAATACCATTAGCCA	94157

BX511312.6	101	AAAAATTTATAAGGAGAGTACTTTTAATGGACATTTTTAAAAATGCACCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94158	AAAAATTTATAAGGAGAGTACTTTTAATGGACATTTTTAAAAATGCACCA	94207

BX511312.6	151	CCAGGAAGAATCTTAAAATAAAAATATCTTATTTAGTATTTTAAATATAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94208	CCAGGAAGAATCTTAAAATAAAAATATCTTATTTAGTATTTTAAATATAT	94257

BX511312.6	201	ATATTTTTTAATTTAACTGAAAAATCATATTTAACTTTGAATATATTTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94258	ATATTTTTTAATTTAACTGAAAAATCATATTTAACTTTGAATATATTTTT	94307

BX511312.6	251	GTGTGAATTTTATTTATTTATTTCTATTTATATGTTTGTCCAAGTAAAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94308	GTGTGAATTTTATTTATTTATTTCTATTTATATGTTTGTCCAAGTAAAAT	94357

BX511312.6	301	TTTGTTTTTAATCATGTGATTTGTTTTTTATCATGTGATATTCTTATGTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94358	TTTGTTTTTAATCATGTGATTTGTTTTTTATCATGTGATATTCTTATGTA	94407

BX511312.6	351	TCTCTATTTTGCCATGAGATAGTCATAAGTTGCTGATTTAGCAATAAATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94408	TCTCTATTTTGCCATGAGATAGTCATAAGTTGCTGATTTAGCAATAAATA	94457

BX511312.6	401	AATGCCAGGATAATATAAATTTTAAGAGCTTTGACTTCACACTGGCCACT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94458	AATGCCAGGATAATATAAATTTTAAGAGCTTTGACTTCACACTGGCCACT	94507

BX511312.6	451	TCAGAAAGTAGGTGACAGATAAGATAAATGTAAAGTTTGTAAAAACTAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94508	TCAGAAAGTAGGTGACAGATAAGATAAATGTAAAGTTTGTAAAAACTAAT	94557

BX511312.6	501	GGGAGAGCACTTAGCAGCTACACAATCAGTACAAACATCTGACCTTTTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94558	GGGAGAGCACTTAGCAGCTACACAATCAGTACAAACATCTGACCTTTTTT	94607

BX511312.6	551	TCTAAATCTGAGGTAAAGGATTCATAATTCTCATAATCTTTATAAAATAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94608	TCTAAATCTGAGGTAAAGGATTCATAATTCTCATAATCTTTATAAAATAC	94657

BX511312.6	601	ATGCAAATTGATAATCAAGCTAAAACTGTTTTATTAGTTATATTATTCAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94658	ATGCAAATTGATAATCAAGCTAAAACTGTTTTATTAGTTATATTATTCAT	94707

BX511312.6	651	TTTCTTTTCGGCTTAGTCTCTTTATTAATCTGGGGTTGCAACAATGGAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94708	TTTCTTTTCGGCTTAGTCTCTTTATTAATCTGGGGTTGCAACAATGGAAT	94757

BX511312.6	701	GAACCACCAACTTATCCTGCATATGTTTTACGCAGCTGATGCCCTTCCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94758	GAACCACCAACTTATCCTGCATATGTTTTACGCAGCTGATGCCCTTCCAG	94807

BX511312.6	751	CTGCAACCCATCACTGGGAAACATCCATACACACTCATTCAATCACATAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94808	CTGCAACCCATCACTGGGAAACATCCATACACACTCATTCAATCACATAT	94857

BX511312.6	801	GCTACGGTCAGTTTTAGCATACCTAATACACCTATACCACATGTCTTTGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94858	GCTACGGTCAGTTTTAGCATACCTAATACACCTATACCACATGTCTTTGG	94907

BX511312.6	851	ACTTGGAGAAACCGGAGCACCCGGAGGAAACCTACGTAAACACATGGAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94908	ACTTGGAGAAACCGGAGCACCCGGAGGAAACCTACGTAAACACATGGAGA	94957

BX511312.6	901	ACATGGAAACTCTACACAGAAACGCCAACTAACCCAGCCGAGGCTCAAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	94958	ACATGGAAACTCTACACAGAAACGCCAACTAACCCAGCCGAGGCTCAAAC	95007

BX511312.6	951	CAGCCACCTTCTGGCTGTAAGATGACAGCGCTACCTACTGCGCCACTGCG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95008	CAGCCACCTTCTGGCTGTAAGATGACAGCGCTACCTACTGCGCCACTGCG	95057

BX511312.6	1001	TTTCTTATTTGTAATATTTTAATATTATATTACTAAACATGTAAATTGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95058	TTTCTTATTTGTAATATTTTAATATTATATTACTAAACATGTAAATTGCA	95107

BX511312.6	1051	TGAGCTAAAAAACGCAATATCAGAAAGATCTGAATAATATTGTGTCTATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95108	TGAGCTAAAAAACGCAATATCAGAAAGATCTGAATAATATTGTGTCTATG	95157

BX511312.6	1101	CCCGTTAAAACTTTTTAATATTTGTAAGATTCTTGTGGAGTAAGGGGAAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95158	CCCGTTAAAACTTTTTAATATTTGTAAGATTCTTGTGGAGTAAGGGGAAC	95207

BX511312.6	1151	TGAAATACATTTAAAATGGTTTTTAAACATTTAATCTCGGTCAGTTGGCG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95208	TGAAATACATTTAAAATGGTTTTTAAACATTTAATCTCGGTCAGTTGGCG	95257

BX511312.6	1201	TTTCTGTGTGGAGTTTGCATGTTCTCTCCGTATTCGCGTAGGTTTCCTCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95258	TTTCTGTGTGGAGTTTGCATGTTCTCTCCGTATTCGCGTAGGTTTCCTCT	95307

BX511312.6	1251	GGGTGCTCCGGTGCTCCCTCAAGTCCAAAGACATGCGGTACAGGTGAATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95308	GGGTGCTCCGGTGCTCCCTCAAGTCCAAAGACATGCGGTACAGGTGAATT	95357

BX511312.6	1301	GGGTAGGCTAAATTGTCTCTAGTGAATGAGTGTGTTTGGATGTTTCCCAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95358	GGGTAGGCTAAATTGTCTCTAGTGAATGAGTGTGTTTGGATGTTTCCCAG	95407

BX511312.6	1351	AGATAGGTTGCAGCTGGAAGGGCATCCGCTGCGTAAAACATGTGCTGGAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95408	AGATAGGTTGCAGCTGGAAGGGCATCCGCTGCGTAAAACATGTGCTGGAT	95457

BX511312.6	1401	AAGTTGGCGGTTCATTCCGCTGTGGTGACCCCAGATTGATAAAGGGACTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95458	AAGTTGGCGGTTCATTCCGCTGTGGTGACCCCAGATTGATAAAGGGACTA	95507

BX511312.6	1451	AGCCGAAAAGAAAATGAATGAATGTCACTGAGTTATTTTGTTGCAAAGAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95508	AGCCGAAAAGAAAATGAATGAATGTCACTGAGTTATTTTGTTGCAAAGAT	95557

BX511312.6	1501	GACGCATGCATGTCATGTTTTGTTTCCTTTAGGGGGACGTTCTGCTTTGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95558	GACGCATGCATGTCATGTTTTGTTTCCTTTAGGGGGACGTTCTGCTTTGA	95607

BX511312.6	1551	GAGGACAGATGGCTCACACTTTGACGTGCGCATTCCACCTTTTTCATTAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95608	GAGGACAGATGGCTCACACTTTGACGTGCGCATTCCACCTTTTTCATTAG	95657

BX511312.6	1601	AAAGCAATAAGTATGACAAAGCTCCCCCTACTGGCTATCCCTTGTAGTAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95658	AAAGCAATAAGTATGACAAAGCTCCCCCTACTGGCTATCCCTTGTAGTAA	95707

BX511312.6	1651	GCCTACCGTCACGGATTGGTTCAGCATCCCTACAGGCTGTTCCCTTGGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95708	GCCTACCGTCACGGATTGGTTCAGCATCCCTACAGGCTGTTCCCTTGGAG	95757

BX511312.6	1701	ATCCATGTTTTACCTTCCTTATCACTGTTCCTTAAATATACAATGGTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95758	ATCCATGTTTTACCTTCCTTATCACTGTTCCTTAAATATACAATGGTTTT	95807

BX511312.6	1751	TAGCTAAGCGTCCTCCAGACTCTGACTGCAGCACGGGGGATTTGAAACAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95808	TAGCTAAGCGTCCTCCAGACTCTGACTGCAGCACGGGGGATTTGAAACAA	95857

BX511312.6	1801	CCGCATATCTTAAAAAGAAAAGGCATAGCAAGTTGCAATGAGGGTTGATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95858	CCGCATATCTTAAAAAGAAAAGGCATAGCAAGTTGCAATGAGGGTTGATC	95907

BX511312.6	1851	GTATTAAGTAGCGTGATGCAAGAGTGTGAAGGGAACATGGACAGATCCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95908	GTATTAAGTAGCGTGATGCAAGAGTGTGAAGGGAACATGGACAGATCCTC	95957

BX511312.6	1901	TCAAACCCTTGCACCGGGAAAGGCCGTGCTGAAAGAGTTTGAATATGATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	95958	TCAAACCCTTGCACCGGGAAAGGCCGTGCTGAAAGAGTTTGAATATGATT	96007

BX511312.6	1951	TGTTGTTTTCTATTTATTGGGACGGCTGTGTTGAACAACTGAATAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004802.12	96008	TGTTGTTTTCTATTTATTGGGACGGCTGTGTTGAACAACTGAATAAGCTT	96057

Overview

Query
BX511312.6 - 40687 bps
Hit
BX004802.12 - 96057 bps
Total alignments
10
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001954200012000194058960571
287.2315026312111473119639199121
387.331132011897119171119697199091
486.5150872984429930-131181312691
586.9115126912031471-131286315601
680.53461131046710579149964500761
791.261341833485635038-150535507171
881.141814812437224852168132686031
977.94993632969930061-168855692121
1092.971511981897419171195329955271
Short-link