<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX000526.8	1	GATCATCTTCAAGACATGACTTTGTGTGTGAAAATTGTACAGATTTACAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	31987	GATCATCTTCAAGACATGACTTTGTGTGTGAAAATTGTACAGATTTACAC	32036

BX000526.8	51	TACAATCAAACACAGTAGGAGTACAGCAGGTGTGTAAAAAAGCTGTTATC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32037	TACAATCAAACACAGTAGGAGTACAGCAGGTGTGTAAAAAAGCTGTTATC	32086

BX000526.8	101	AAACATTGTTTACTTCACTGAGAAAGGTATGATCTAAAAGAACTATTGAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32087	AAACATTGTTTACTTCACTGAGAAAGGTATGATCTAAAAGAACTATTGAT	32136

BX000526.8	151	GGAAGGTTTGCGAATAAATTTTACACTTAAAATTGAGGTATTTGGTATTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32137	GGAAGGTTTGCGAATAAATTTTACACTTAAAATTGAGGTATTTGGTATTT	32186

BX000526.8	201	TATTTTAACATTTAAGTATATTTTTTGTATTTTTGCTCTAGATACACTAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32187	TATTTTAACATTTAAGTATATTTTTTGTATTTTTGCTCTAGATACACTAT	32236

BX000526.8	251	TTTGTTAAATAATAAGCATAGTTTTATAATCATCGGCTAAAAACGGTCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32237	TTTGTTAAATAATAAGCATAGTTTTATAATCATCGGCTAAAAACGGTCTG	32286

BX000526.8	301	ATGTTGTTCACCTCAAATCAGTTCCCAAAAACTCCAGCAGACATATTGTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32287	ATGTTGTTCACCTCAAATCAGTTCCCAAAAACTCCAGCAGACATATTGTT	32336

BX000526.8	351	ACACTATTCCACTGATCTTGTAGGCTAGAAGAGGCTTATTCATAGCTGGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32337	ACACTATTCCACTGATCTTGTAGGCTAGAAGAGGCTTATTCATAGCTGGA	32386

BX000526.8	401	CTAGTTTTGTAGATCATCACCTTAGAATTATAAGGTTCTATCTGCGTTCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32387	CTAGTTTTGTAGATCATCACCTTAGAATTATAAGGTTCTATCTGCGTTCT	32436

BX000526.8	451	GAATGATTTTGAGCTTCAAAATTTTTGCATTTCATATCAAGCAGTATGTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32437	GAATGATTTTGAGCTTCAAAATTTTTGCATTTCATATCAAGCAGTATGTG	32486

BX000526.8	501	TGTAACATTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAAAAAGTCTTAAAATGTAAACA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32487	TGTAACATTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAAAAAGTCTTAAAATGTAAACA	32536

BX000526.8	551	ACTTAAAGACATTCCATAATGTAAAAATGCTGTCATTTAATAAGAATATG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32537	ACTTAAAGACATTCCATAATGTAAAAATGCTGTCATTTAATAAGAATATG	32586

BX000526.8	601	TCAATAACTCATTTTTGACAAAAATGTTAGATAGAACCATATAATTCTAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32587	TCAATAACTCATTTTTGACAAAAATGTTAGATAGAACCATATAATTCTAA	32636

BX000526.8	651	GGTGACGAGATTATGCAGTCGCTTGCTGGATAATGTCTTCTTTTGAGTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32637	GGTGACGAGATTATGCAGTCGCTTGCTGGATAATGTCTTCTTTTGAGTCA	32686

BX000526.8	701	CATATTGATTAGTTTCTGGAAGTGCATAGTCAAAATCAGGGGTGATTCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32687	CATATTGATTAGTTTCTGGAAGTGCATAGTCAAAATCAGGGGTGATTCTG	32736

BX000526.8	751	CTACTGTACTGGGGTGCATTTCTGAAAACCATGGTTAGCCAACTAAGGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32737	CTACTGTACTGGGGTGCATTTCTGAAAACCATGGTTAGCCAACTAAGGTC	32786

BX000526.8	801	ACAAGTTGCGTCAATAAAAACTTAGTTTGTTGATTTGTCTTTCCCAAATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32787	ACAAGTTGCGTCAATAAAAACTTAGTTTGTTGATTTGTCTTTCCCAAATC	32836

BX000526.8	851	CACTGTTCCAACGAACATTCGCAAACTGTGTCGCAAATTTGTATGCTTGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32837	CACTGTTCCAACGAACATTCGCAAACTGTGTCGCAAATTTGTATGCTTGC	32886

BX000526.8	901	AACCACACCTCTGGAGCTGTAGTTAGAAACATAGTTTCTGACTGTGTTCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32887	AACCACACCTCTGGAGCTGTAGTTAGAAACATAGTTTCTGACTGTGTTCT	32936

BX000526.8	951	ATTCCCAGTTATCCCCCCTATGCCCTATTCGTTTAGAACATTCTAAAATT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32937	ATTCCCAGTTATCCCCCCTATGCCCTATTCGTTTAGAACATTCTAAAATT	32986

BX000526.8	1001	TAAACTTGGAATTATTTAATAAAAAAGCATGAAAGTCATTACTCTTAGGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	32987	TAAACTTGGAATTATTTAATAAAAAAGCATGAAAGTCATTACTCTTAGGT	33036

BX000526.8	1051	GTAATTTGCTATTAAAGTATTTTACACTTCAGTTTTAGCGATCTTCATGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33037	GTAATTTGCTATTAAAGTATTTTACACTTCAGTTTTAGCGATCTTCATGT	33086

BX000526.8	1101	TTACAATTGTGCTCCCTTCGCAGTGCACTTCGAAAACATTAATGTCATTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33087	TTACAATTGTGCTCCCTTCGCAGTGCACTTCGAAAACATTAATGTCATTT	33136

BX000526.8	1151	TGAACACAGCCGTGGCTCATGATGAAAGCTGTTGGTGACCTATTATTTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33137	TGAACACAGCCGTGGCTCATGATGAAAGCTGTTGGTGACCTATTATTTAA	33186

BX000526.8	1201	AAGCTGAGTTTATGTTATGTCTCCAAAGCTTGTAAAAATAAAAGACACAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33187	AAGCTGAGTTTATGTTATGTCTCCAAAGCTTGTAAAAATAAAAGACACAG	33236

BX000526.8	1251	CATAAGTTAATGCTTTTATTTCTATAGGTTAATTATTAAGTATGTGTACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33237	CATAAGTTAATGCTTTTATTTCTATAGGTTAATTATTAAGTATGTGTACC	33286

BX000526.8	1301	GTATATGACATGGGCCCCTACTTAATAATAATAATAATCATCATCTTCAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33287	GTATATGACATGGGCCCCTACTTAATAATAATAATAATCATCATCTTCAT	33336

BX000526.8	1351	CATTATTATTAAAGTAGGATTTTTTTCATTTCCTAAAAAATGATAAATAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33337	CATTATTATTAAAGTAGGATTTTTTTCATTTCCTAAAAAATGATAAATAT	33386

BX000526.8	1401	TAATTTTAAAATCTTCCTTACATTTCCTTAAATTTATATAGCGCTTTTCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33387	TAATTTTAAAATCTTCCTTACATTTCCTTAAATTTATATAGCGCTTTTCT	33436

BX000526.8	1451	GGGCACTCAAAGCGCTTTACACAATGGGGGGGAATCTCCTCATCCACCAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33437	GGGCACTCAAAGCGCTTTACACAATGGGGGGGAATCTCCTCATCCACCAC	33486

BX000526.8	1501	CAGTGTGTAGCATCCACCTGGATGACGCGACGGCAGCCATTTTGCGCCAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33487	CAGTGTGTAGCATCCACCTGGATGACGCGACGGCAGCCATTTTGCGCCAG	33536

BX000526.8	1551	ACCGCACACCACACACCAGCTGATTGGTGGAGAGGAGACAGTGATGAAGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33537	ACCGCACACCACACACCAGCTGATTGGTGGAGAGGAGACAGTGATGAAGC	33586

BX000526.8	1601	CAATTGAATATGGGGATGGTTAGGAGGCCATGATGGACAGAGGCCAGTGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33587	CAATTGAATATGGGGATGGTTAGGAGGCCATGATGGACAGAGGCCAGTGG	33636

BX000526.8	1651	GCAAATTTCTACTCTTTTCGAAGGACATCCTGGGATTTGTAACGACCACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33637	GCAAATTTCTACTCTTTTCGAAGGACATCCTGGGATTTGTAACGACCACA	33686

BX000526.8	1701	GAGAGTCAGGACCCTAAATAGCCTCAAGAAATAGCCTGTAAGTAATATTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33687	GAGAGTCAGGACCCTAAATAGCCTCAAGAAATAGCCTGTAAGTAATATTA	33736

BX000526.8	1751	TGTTTTAGAATAGAATATTGAATATTCTCAATACTATTTGTAAAGGAAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33737	TGTTTTAGAATAGAATATTGAATATTCTCAATACTATTTGTAAAGGAAAT	33786

BX000526.8	1801	ACAGGCCTTTATGTGCCATTTACATATATTTCAATTAATATGAAAAGCGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33787	ACAGGCCTTTATGTGCCATTTACATATATTTCAATTAATATGAAAAGCGA	33836

BX000526.8	1851	GTGCTTGTTTTTTTACCAAAACTAATATTGCATTTTTTCTTAATGCGCAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33837	GTGCTTGTTTTTTTACCAAAACTAATATTGCATTTTTTCTTAATGCGCAT	33886

BX000526.8	1901	GCATGTAATACAATATACTATAATAGTTATGTCGTTGTGTGGAAAATGCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33887	GCATGTAATACAATATACTATAATAGTTATGTCGTTGTGTGGAAAATGCA	33936

BX000526.8	1951	CCCCTGAATAATTTAGCTCATACCCTAATTAAACATACCTGGATCAGTTA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004755.7	33937	CCCCTGAATAATTTAGCTCATACCCTAATTAAACATACCTGGATCAGTTA	33986

Overview

Query
BX000526.8 - 94928 bps
Hit
BX004755.7 - 33986 bps
Total alignments
13
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001923200012000131987339861
287.621232101158511794114032142361
387.64568914212143001564957371
494.6734755350153575124601246751
594.673475535015357512460224676-1
696.9732665350953574119889199541
798.413163535135357511989019952-1
885.7147915997860068131073311611
992.16395167122671721207921291
1089.2831248567175676591214726291
1181.821042427910579346122892530-1
1286.91322527993980190113521137681
1380.16331268029880423113863139901
Short-link