<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929587.5	1	GGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	81521	GGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGC	81570

AL929587.5	51	CTCCCAAAATGTTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGTGCCCATCCCACAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	81571	CTCCCAAAATGTTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGTGCCCATCCCACAG	81620

AL929587.5	101	AATGTCTTTTGGTTTTGTTTTTGTTTTCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	81621	AATGTCTTTTGGTTTTGTTTTTGTTTTCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTGA	81670

AL929587.5	151	AAAGGAGTCTCATTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	81671	AAAGGAGTCTCATTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCG	81720

AL929587.5	201	GCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	81721	GCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGC	81770

AL929587.5	251	CTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCGTAGGGACTGTAGGCGTATGCCACC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	81771	CTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCGTAGGGACTGTAGGCGTATGCCACC	81820

AL929587.5	301	ACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGACACGGGGTTTCACCATGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	81821	ACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGACACGGGGTTTCACCATGT	81870

AL929587.5	351	TAGCCAGGATGGTCTCGATCTCTTGACCTTGTGATCTGCTCACCTCAGCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	81871	TAGCCAGGATGGTCTCGATCTCTTGACCTTGTGATCTGCTCACCTCAGCC	81920

AL929587.5	401	TCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACAGCGCCTGGCCAAAATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	81921	TCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACAGCGCCTGGCCAAAATG	81970

AL929587.5	451	TTTTTATGTTTATTTTTCTTAGTATGAAACTCCAGCGTATTAAAGAGCAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	81971	TTTTTATGTTTATTTTTCTTAGTATGAAACTCCAGCGTATTAAAGAGCAT	82020

AL929587.5	501	TGAGAACGGTTGATCTGGTAAATCGCTATAAAGGCGGCATTTCTTTTTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82021	TGAGAACGGTTGATCTGGTAAATCGCTATAAAGGCGGCATTTCTTTTTTT	82070

AL929587.5	551	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCGAAGTGGGGGATGGAGTCTCATTCTGTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82071	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCGAAGTGGGGGATGGAGTCTCATTCTGTC	82120

AL929587.5	601	GCCCAAGCTGGAGTGCAGTAGTGTGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82121	GCCCAAGCTGGAGTGCAGTAGTGTGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCT	82170

AL929587.5	651	TCCCAGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82171	TCCCAGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATT	82220

AL929587.5	701	ACAGGCGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82221	ACAGGCGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGA	82270

AL929587.5	751	CAGGGTTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCATGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82271	CAGGGTTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCATGA	82320

AL929587.5	801	TCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTAGAGGCGTGAGCCACC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82321	TCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTAGAGGCGTGAGCCACC	82370

AL929587.5	851	GCGCCAGGCCTAAAGGGGGCATTTCTAATACTGGAGAAAGGTGAACTTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82371	GCGCCAGGCCTAAAGGGGGCATTTCTAATACTGGAGAAAGGTGAACTTTT	82420

AL929587.5	901	TTTTTTTTTTTTTTCCGAGACAGAGTCTCGCTGTGTCACCCAGGCTGGAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82421	TTTTTTTTTTTTTTCCGAGACAGAGTCTCGCTGTGTCACCCAGGCTGGAG	82470

AL929587.5	951	TGCAATGGCGCAATCTCAGCTTGCTACAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82471	TGCAATGGCGCAATCTCAGCTTGCTACAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAG	82520

AL929587.5	1001	CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGCACCTGCCATCATGCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82521	CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGCACCTGCCATCATGCC	82570

AL929587.5	1051	CAGCTAATTTTTGTATTTTTGTAGAGATGGGGGTTTCACCGTGTTGGCCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82571	CAGCTAATTTTTGTATTTTTGTAGAGATGGGGGTTTCACCGTGTTGGCCA	82620

AL929587.5	1101	GGCTGGTCTTAAACTCCTGTCCTGACCTGAGGTGATCCACCCACCTCAGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82621	GGCTGGTCTTAAACTCCTGTCCTGACCTGAGGTGATCCACCCACCTCAGC	82670

AL929587.5	1151	TTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGACCAGGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82671	TTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGACCAGGTG	82720

AL929587.5	1201	AACTATTTTATAAATAATATTGGAACATTTGGCTCATCTAGGGAAAAACA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82721	AACTATTTTATAAATAATATTGGAACATTTGGCTCATCTAGGGAAAAACA	82770

AL929587.5	1251	AGAGTCCCACCTCACACCTAATCAAAAAGTAAATTCCAGCAGATTAAATA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82771	AGAGTCCCACCTCACACCTAATCAAAAAGTAAATTCCAGCAGATTAAATA	82820

AL929587.5	1301	CCTGAATATGACAGGAAGGTACACACCAAATTCATGGGACAGATGGCCTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82821	CCTGAATATGACAGGAAGGTACACACCAAATTCATGGGACAGATGGCCTG	82870

AL929587.5	1351	GGGAGGAATGAAACTTGGAAGGCGGTATCACGGTAAACTACCTTTATCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82871	GGGAGGAATGAAACTTGGAAGGCGGTATCACGGTAAACTACCTTTATCTG	82920

AL929587.5	1401	TGATGATTTTATTTCCTTAAAATAAATTATACTACAAACATGACAGTACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82921	TGATGATTTTATTTCCTTAAAATAAATTATACTACAAACATGACAGTACA	82970

AL929587.5	1451	TTAACAAACCCTGTGGTAGGAATGGGGTTGTGTATTGTATTATACTTTGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	82971	TTAACAAACCCTGTGGTAGGAATGGGGTTGTGTATTGTATTATACTTTGT	83020

AL929587.5	1501	ATTTTTGAGAGTTTTTTAATTTCTTTTTTGTTGTTGTTGAGACAGAGTCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	83021	ATTTTTGAGAGTTTTTTAATTTCTTTTTTGTTGTTGTTGAGACAGAGTCT	83070

AL929587.5	1551	CACTCTGTCATCCAGGCTGGAGTCCAGTCGCGCAATCTTGGCTCACTGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	83071	CACTCTGTCATCCAGGCTGGAGTCCAGTCGCGCAATCTTGGCTCACTGCA	83120

AL929587.5	1601	ACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAGTTCTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	83121	ACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAGTTCTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAG	83170

AL929587.5	1651	CTGGGATTACAGGCATCCGCCACCACGTCAGGCTAATTTTTGTATTTTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	83171	CTGGGATTACAGGCATCCGCCACCACGTCAGGCTAATTTTTGTATTTTTA	83220

AL929587.5	1701	GTGGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGACTGGTCTTGAACTCCTGAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	83221	GTGGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGACTGGTCTTGAACTCCTGAC	83270

AL929587.5	1751	CTCATGATCCACCCACCTTGGGCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	83271	CTCATGATCCACCCACCTTGGGCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCATG	83320

AL929587.5	1801	AGCCACCGCGCCTGGCCGAGTTTTTTAATTTCTAAAAATAAAAATGAGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	83321	AGCCACCGCGCCTGGCCGAGTTTTTTAATTTCTAAAAATAAAAATGAGTA	83370

AL929587.5	1851	TACATCTAAAGTAGTAGAAGAAAATGCAGAGAATGTTTTATAATCTTAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	83371	TACATCTAAAGTAGTAGAAGAAAATGCAGAGAATGTTTTATAATCTTAAA	83420

AL929587.5	1901	ATAGAGCCTTCCTAAGAGTGAAGTGAAATAAAAAGTCAGAAAATAATATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	83421	ATAGAGCCTTCCTAAGAGTGAAGTGAAATAAAAAGTCAGAAAATAATATA	83470

AL929587.5	1951	TTGATATAGATTTAACTACATGAAAATTTTAGGCCGGGTGCGGTAGCTCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001040.14	83471	TTGATATAGATTTAACTACATGAAAATTTTAGGCCGGGTGCGGTAGCTCA	83520

Overview

Query
AL929587.5 - 61358 bps
Hit
BX001040.14 - 83520 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link