<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL935032.13	1	GGCCAGGGCAGTTGGAGGGGAACCCAGCTGCTGAGCAGCCTGACTCCAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56429	GGCCAGGGCAGTTGGAGGGGAACCCAGCTGCTGAGCAGCCTGACTCCAGG	56478

AL935032.13	51	GGAAAACCACCTTCCCACTCCATCTCCCTTCTGGCTCCCCCATCTGCTGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56479	GGAAAACCACCTTCCCACTCCATCTCCCTTCTGGCTCCCCCATCTGCTGA	56528

AL935032.13	101	GAGCCACTTCCACTCAATAAGACCTTGCTCTCATTCTTCAAGCCCACATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56529	GAGCCACTTCCACTCAATAAGACCTTGCTCTCATTCTTCAAGCCCACATG	56578

AL935032.13	151	TGATCTGATTTTTCTGGTACACCAAGGTAAGAACCTGGGATACAGAAAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56579	TGATCTGATTTTTCTGGTACACCAAGGTAAGAACCTGGGATACAGAAAGC	56628

AL935032.13	201	CCTCTGTCCTTGCAATAAGGCAGAGGGTCTAATTGAGCTAGTTAACACTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56629	CCTCTGTCCTTGCAATAAGGCAGAGGGTCTAATTGAGCTAGTTAACACTA	56678

AL935032.13	251	GCTGCCTATACATGGCAAAACTAAAAGAGCACACAGTAACACATGCCCAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56679	GCTGCCTATACATGGCAAAACTAAAAGAGCACACAGTAACACATGCCCAC	56728

AL935032.13	301	TGGGGCTTCAGGAACTGTAAACATACACCCCTAGATGCTGCCGTGAGGCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56729	TGGGGCTTCAGGAACTGTAAACATACACCCCTAGATGCTGCCGTGAGGCC	56778

AL935032.13	351	AGAGCCCCACATCCTGTCCGTCTGTATGCTCTCCCTAGAGGTTTGAGCAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56779	AGAGCCCCACATCCTGTCCGTCTGTATGCTCTCCCTAGAGGTTTGAGCAG	56828

AL935032.13	401	CAGGGCACTGAAGAAGTGAGCCACTCCCGCTGTTGCAAGCCCTGTGAGGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56829	CAGGGCACTGAAGAAGTGAGCCACTCCCGCTGTTGCAAGCCCTGTGAGGG	56878

AL935032.13	451	GGACAAGAAGACCTTTCCCATTTCAGTATCTTAGAAGGTGGTAACTGCTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56879	GGACAAGAAGACCTTTCCCATTTCAGTATCTTAGAAGGTGGTAACTGCTG	56928

AL935032.13	501	TGAAAAGTGAAAAAGCAAGTCAGTGAAAGAGAACTACTGGCAGCTGCAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56929	TGAAAAGTGAAAAAGCAAGTCAGTGAAAGAGAACTACTGGCAGCTGCAGT	56978

AL935032.13	551	GGGATTTCGATTTAAATAGATTATCCTGGATATACCTCTGTGAGAAGGCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	56979	GGGATTTCGATTTAAATAGATTATCCTGGATATACCTCTGTGAGAAGGCA	57028

AL935032.13	601	ATACTTGGGGGAAGTAGGGTAGACATCTAAGTGGATTTCTGAGTGAAGAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57029	ATACTTGGGGGAAGTAGGGTAGACATCTAAGTGGATTTCTGAGTGAAGAG	57078

AL935032.13	651	TTTTCCAGGCAGAGAAGACAACTACAGCAAAGACCGTAAGATAGGAATGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57079	TTTTCCAGGCAGAGAAGACAACTACAGCAAAGACCGTAAGATAGGAATGT	57128

AL935032.13	701	GTCTGGTGTTTTCAAGGAATATGAAGTGGCCAGTGTCACTGGTATGAACT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57129	GTCTGGTGTTTTCAAGGAATATGAAGTGGCCAGTGTCACTGGTATGAACT	57178

AL935032.13	751	GATCCAGGAAAACAACAGTAGGAAAATAAGTTAGAAAGATAATGGATCAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57179	GATCCAGGAAAACAACAGTAGGAAAATAAGTTAGAAAGATAATGGATCAG	57228

AL935032.13	801	CCAGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57229	CCAGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGG	57278

AL935032.13	851	TGGGAAGACCCCTTGAACCTAGGAATTCAAGACCAGCTGGGGAAAGATGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57279	TGGGAAGACCCCTTGAACCTAGGAATTCAAGACCAGCTGGGGAAAGATGG	57328

AL935032.13	901	CAAGACCCCGTCTCTACAAAATAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57329	CAAGACCCCGTCTCTACAAAATAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGC	57378

AL935032.13	951	ATGCACCTGTAGTCCAGTTACTCAGAAGACTGAGGCAGGGGAAGACCCTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57379	ATGCACCTGTAGTCCAGTTACTCAGAAGACTGAGGCAGGGGAAGACCCTT	57428

AL935032.13	1001	TGATCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATTGTTCCACTGTACT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57429	TGATCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATTGTTCCACTGTACT	57478

AL935032.13	1051	CCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACCCCGCCTCAAAAAAAATTGTAACATC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57479	CCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACCCCGCCTCAAAAAAAATTGTAACATC	57528

AL935032.13	1101	TAGTGAGCTACTGACAGGACTTTGATTTTAACTTGAATGAAATAAAGAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57529	TAGTGAGCTACTGACAGGACTTTGATTTTAACTTGAATGAAATAAAGAGA	57578

AL935032.13	1151	TAAGATGGGTCATTATGTAGGCAAATGACACGTTTTTACCTATGTCTGCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57579	TAAGATGGGTCATTATGTAGGCAAATGACACGTTTTTACCTATGTCTGCA	57628

AL935032.13	1201	TAAAGACATAAAACAATTTTGCTGCTGTGTTAAGAAAAGACAGTAGTGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57629	TAAAGACATAAAACAATTTTGCTGCTGTGTTAAGAAAAGACAGTAGTGGG	57678

AL935032.13	1251	AGGAAAAGAAGAAGCAAGGAGACTACTGTTAAGAGTTATCCAGGCAATCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57679	AGGAAAAGAAGAAGCAAGGAGACTACTGTTAAGAGTTATCCAGGCAATCA	57728

AL935032.13	1301	TTGACAGTACCTTTGTCTAGTTTGTGAACTACTAAAGTGGTGAAATGCAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57729	TTGACAGTACCTTTGTCTAGTTTGTGAACTACTAAAGTGGTGAAATGCAT	57778

AL935032.13	1351	TTAAATTTGTAGCAGTATTTTCCCCACTGGGGATAAGGGAATGACTGCCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57779	TTAAATTTGTAGCAGTATTTTCCCCACTGGGGATAAGGGAATGACTGCCA	57828

AL935032.13	1401	AAGATTGCCAATACCTAGGCATTAAGGAGAACATAAATATAAGTATGGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57829	AAGATTGCCAATACCTAGGCATTAAGGAGAACATAAATATAAGTATGGAA	57878

AL935032.13	1451	TTTCATGCAGACCAGGGTTAAAGGGTCTAAGGATACACCTGAGACAATGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57879	TTTCATGCAGACCAGGGTTAAAGGGTCTAAGGATACACCTGAGACAATGT	57928

AL935032.13	1501	CTGAAAACTAAGGAAGGGAAGAAAAGTGAACAGAAATAGAGTTAAGTGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57929	CTGAAAACTAAGGAAGGGAAGAAAAGTGAACAGAAATAGAGTTAAGTGGG	57978

AL935032.13	1551	AGTAGTTGTCAGAAAAGAAAGTAATGTCTAATTATACAGCTGTTTATTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	57979	AGTAGTTGTCAGAAAAGAAAGTAATGTCTAATTATACAGCTGTTTATTGA	58028

AL935032.13	1601	TTAACAGAGGGCTTCTAAAGGGCAGTTATTTAGATAAGAACTTCTTAGAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	58029	TTAACAGAGGGCTTCTAAAGGGCAGTTATTTAGATAAGAACTTCTTAGAT	58078

AL935032.13	1651	GAGAGTGCAACTTCGCTGAGCGTAGTCGATTCTAATCTTAGGCCCTTTGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	58079	GAGAGTGCAACTTCGCTGAGCGTAGTCGATTCTAATCTTAGGCCCTTTGC	58128

AL935032.13	1701	CATAGACATTTTCTTTCCCTGATGATTTTTTTAAATCCATATTTTATATC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	58129	CATAGACATTTTCTTTCCCTGATGATTTTTTTAAATCCATATTTTATATC	58178

AL935032.13	1751	TGCAAACACATTTTTCTTTCCCTCAGGTTCCAGAATCTGTGTCTCAAGCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	58179	TGCAAACACATTTTTCTTTCCCTCAGGTTCCAGAATCTGTGTCTCAAGCC	58228

AL935032.13	1801	TACGTGGCTTAGATGGGATCTAACAAGAAAAGTCTGTCCCCTCTCTGGGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	58229	TACGTGGCTTAGATGGGATCTAACAAGAAAAGTCTGTCCCCTCTCTGGGT	58278

AL935032.13	1851	TACTGGGTCCAACCAGTTGGCAAGTTTTAGCTCTGATTTTGTTTCTTAAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	58279	TACTGGGTCCAACCAGTTGGCAAGTTTTAGCTCTGATTTTGTTTCTTAAC	58328

AL935032.13	1901	TTCTAGAATAACAGAAATATAGGGTATCTTAGTATTTCAATGACAAACTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	58329	TTCTAGAATAACAGAAATATAGGGTATCTTAGTATTTCAATGACAAACTC	58378

AL935032.13	1951	TGACAAAAGGATATATATCAGAGGTGGGGACTTTCAACAAATATTGGACT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001039.5	58379	TGACAAAAGGATATATATCAGAGGTGGGGACTTTCAACAAATATTGGACT	58428

Overview

Query
AL935032.13 - 95263 bps
Hit
BX001039.5 - 58428 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link