<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845454.6	1	GGCCACCACAGAAAAATGAAGATGTTCCCATTCCCTTTCAGTTTCACACA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48175	GGCCACCACAGAAAAATGAAGATGTTCCCATTCCCTTTCAGTTTCACACA	48224

AL845454.6	51	AAGCAAAAGTTGTAGACCTAAACTGACACAGAATTGCCAACTGCATTAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48225	AAGCAAAAGTTGTAGACCTAAACTGACACAGAATTGCCAACTGCATTAAT	48274

AL845454.6	101	TTATTTGAGATAATGAGGCAGCTAGTTTTGCCCAAATTTCACAGAAAGAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48275	TTATTTGAGATAATGAGGCAGCTAGTTTTGCCCAAATTTCACAGAAAGAC	48324

AL845454.6	151	GATGAACAAGTAGTAAGCTAAAGAGGCTTCTTTTGCAGGGGATTGCAGGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48325	GATGAACAAGTAGTAAGCTAAAGAGGCTTCTTTTGCAGGGGATTGCAGGT	48374

AL845454.6	201	ATTATATGTTTTTCTCCTACTTTTAAGATACATTTTCCTAAAAAGTTTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48375	ATTATATGTTTTTCTCCTACTTTTAAGATACATTTTCCTAAAAAGTTTTG	48424

AL845454.6	251	TCTAGGAGTAAATGTCATCACTTTGCTTTTTTTCCTCCCAATTGAATCAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48425	TCTAGGAGTAAATGTCATCACTTTGCTTTTTTTCCTCCCAATTGAATCAC	48474

AL845454.6	301	TTGTTCCTCCCTGCATTTCAGTAATGTTGCTAGCATGGAGGTGTTTGTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48475	TTGTTCCTCCCTGCATTTCAGTAATGTTGCTAGCATGGAGGTGTTTGTCC	48524

AL845454.6	351	ATGATTCACAGATGATTCAAAGAGCAGAGAGCTTCTCCTGAGGTCACACA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48525	ATGATTCACAGATGATTCAAAGAGCAGAGAGCTTCTCCTGAGGTCACACA	48574

AL845454.6	401	GCACGTAAGCGGTGGAACAATGGCAGGCACATGACTCTCTAGGCCCCTAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48575	GCACGTAAGCGGTGGAACAATGGCAGGCACATGACTCTCTAGGCCCCTAG	48624

AL845454.6	451	TCCAGTTTTCTGGGTTCTATGAGAATTGTAGCCCTTGGTTTCTGTTACAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48625	TCCAGTTTTCTGGGTTCTATGAGAATTGTAGCCCTTGGTTTCTGTTACAT	48674

AL845454.6	501	GTGGTTCTCTTTTGAGCCAGAGAAGGAGGACGCACAGTGAGAAGAAAGTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48675	GTGGTTCTCTTTTGAGCCAGAGAAGGAGGACGCACAGTGAGAAGAAAGTG	48724

AL845454.6	551	CCAGAGCCCCAAGTCCTGGCTTAGATTTACTGGGCTGGGGCATGGAGACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48725	CCAGAGCCCCAAGTCCTGGCTTAGATTTACTGGGCTGGGGCATGGAGACA	48774

AL845454.6	601	GAGGCTGCCACTGATTCTCTTAACTCCAGCTTCTATTACCAGTCACTAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48775	GAGGCTGCCACTGATTCTCTTAACTCCAGCTTCTATTACCAGTCACTAAG	48824

AL845454.6	651	CTGAAAGCAGGAAAGTTTATCTTCTGCACTTGGTCCATCAGAACTAAGAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48825	CTGAAAGCAGGAAAGTTTATCTTCTGCACTTGGTCCATCAGAACTAAGAT	48874

AL845454.6	701	GGCAGAAAGCCCCACTATCTACCACGGAAAAGACAAGGGTCCCTCTTACC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48875	GGCAGAAAGCCCCACTATCTACCACGGAAAAGACAAGGGTCCCTCTTACC	48924

AL845454.6	751	TTGAACCATGACCCAGCTTTCTAACTACATATGTTTTTCTGCACATGTAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48925	TTGAACCATGACCCAGCTTTCTAACTACATATGTTTTTCTGCACATGTAG	48974

AL845454.6	801	CTATTTTTCTTCTCATCAAGCTCCAGTACTCACAGTGCAAACACAGGAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	48975	CTATTTTTCTTCTCATCAAGCTCCAGTACTCACAGTGCAAACACAGGAGA	49024

AL845454.6	851	TACTGAGCCTGATGCTCTGATGGAAGCTCTGAGTTGAGATTTTATTTTAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49025	TACTGAGCCTGATGCTCTGATGGAAGCTCTGAGTTGAGATTTTATTTTAT	49074

AL845454.6	901	ACTTAGGTGCCTCTGAGTCATTAGAGTTTTTTGCCTGACTCCACTCTGGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49075	ACTTAGGTGCCTCTGAGTCATTAGAGTTTTTTGCCTGACTCCACTCTGGC	49124

AL845454.6	951	CCCATTTCAATCAAGGTCTATATGCTCTGGGACCTCTCCAGGTTCTCATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49125	CCCATTTCAATCAAGGTCTATATGCTCTGGGACCTCTCCAGGTTCTCATC	49174

AL845454.6	1001	AGAAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCATGTCCAGCTCCTGGGTCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49175	AGAAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCATGTCCAGCTCCTGGGTCC	49224

AL845454.6	1051	TCCCTGATAGCAGTGAGAGGCAGCTCCTAATGGGAGAGAGCCTTGGGGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49225	TCCCTGATAGCAGTGAGAGGCAGCTCCTAATGGGAGAGAGCCTTGGGGTG	49274

AL845454.6	1101	ACCAAGGCCTCACAGACTTCATTATTCCTGGACCACATGGCTCCAGCCTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49275	ACCAAGGCCTCACAGACTTCATTATTCCTGGACCACATGGCTCCAGCCTC	49324

AL845454.6	1151	CTGATCACAATGGATCAGTGGTCTTAGATTCCGCTCCAATATTTGAAGTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49325	CTGATCACAATGGATCAGTGGTCTTAGATTCCGCTCCAATATTTGAAGTT	49374

AL845454.6	1201	TTTTGTTCTTCGGCCTCGGCAAATGCTCTCTGGTTGAGATGAAGGGAAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49375	TTTTGTTCTTCGGCCTCGGCAAATGCTCTCTGGTTGAGATGAAGGGAAAA	49424

AL845454.6	1251	GACACAGAGACGCAAAAGCTGTGATTGCATGGAACTCTGTCCAAGGTACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49425	GACACAGAGACGCAAAAGCTGTGATTGCATGGAACTCTGTCCAAGGTACC	49474

AL845454.6	1301	TCCCGGTGTTCTCTTACTTATGTTGGCCATGTCCTCATGAATTTAGTGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49475	TCCCGGTGTTCTCTTACTTATGTTGGCCATGTCCTCATGAATTTAGTGAA	49524

AL845454.6	1351	ATGGGCATGTTGTCTCTGAGTGGAAGTGAGGGGACACTACTGGGCAGAGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49525	ATGGGCATGTTGTCTCTGAGTGGAAGTGAGGGGACACTACTGGGCAGAGC	49574

AL845454.6	1401	TCCATCAAAGGGTGGCTGGTGTCCTCTATACCATTTATCTACACATGTTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49575	TCCATCAAAGGGTGGCTGGTGTCCTCTATACCATTTATCTACACATGTTG	49624

AL845454.6	1451	GGGTTTTTCTAGCATGAAATGTCCCAGAGGCAGCCAAACCCGAAGCTTGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49625	GGGTTTTTCTAGCATGAAATGTCCCAGAGGCAGCCAAACCCGAAGCTTGG	49674

AL845454.6	1501	CTCCTCCAAGGAATGAGTGTGAGTATCATAGCCCTGGCCAATGAGCACTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49675	CTCCTCCAAGGAATGAGTGTGAGTATCATAGCCCTGGCCAATGAGCACTG	49724

AL845454.6	1551	AACTCTAGAGAGACCAAGAGACCTTCTAAATATTGGGACACTTTAGTTCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49725	AACTCTAGAGAGACCAAGAGACCTTCTAAATATTGGGACACTTTAGTTCT	49774

AL845454.6	1601	GAATCCCAGAAGTTGGCTTCTTGCCTGGGAGGCAGGTGTCACTGCATCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49775	GAATCCCAGAAGTTGGCTTCTTGCCTGGGAGGCAGGTGTCACTGCATCTG	49824

AL845454.6	1651	ATCCAAAAAAGCAGCCCCATAGCTCAAGATGCTCTTCTGGATTTCTGCCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49825	ATCCAAAAAAGCAGCCCCATAGCTCAAGATGCTCTTCTGGATTTCTGCCT	49874

AL845454.6	1701	CTTCCTGGTTCCTGGCCAAGCAAATCTTCACTGCTTTGCTAGCCCATCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49875	CTTCCTGGTTCCTGGCCAAGCAAATCTTCACTGCTTTGCTAGCCCATCTA	49924

AL845454.6	1751	TAAATTCAACCAGACTTTTCAAATATGTATTTTCCTCCCATTTTTCTAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49925	TAAATTCAACCAGACTTTTCAAATATGTATTTTCCTCCCATTTTTCTAGT	49974

AL845454.6	1801	TGTACTCAATGGGAGAAGTGGTCCAAATGACCTAATCAGCAATTGCTGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	49975	TGTACTCAATGGGAGAAGTGGTCCAAATGACCTAATCAGCAATTGCTGGA	50024

AL845454.6	1851	AACCAAAGTAACAGTATACAATTCTATGTGTTAATATCATATACCAAGAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	50025	AACCAAAGTAACAGTATACAATTCTATGTGTTAATATCATATACCAAGAG	50074

AL845454.6	1901	AGAAAATGTATAGATATCAGTAGTAGCCATTTAAGCACTGTAATAATATC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	50075	AGAAAATGTATAGATATCAGTAGTAGCCATTTAAGCACTGTAATAATATC	50124

AL845454.6	1951	TATCTATATCCCATGAGTATAATATATATAAATAAATGATAACAAGAAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX001005.6	50125	TATCTATATCCCATGAGTATAATATATATAAATAAATGATAACAAGAAAA	50174

Overview

Query
AL845454.6 - 159427 bps
Hit
BX001005.6 - 50174 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link