<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL929591.8 1 GGCCAGGGTCTCTCCCCTCCTCTCTCGCTTCCCCCAAACCCCACCCCTGT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 100685 GGCCAGGGTCTCTCCCCTCCTCTCTCGCTTCCCCCAAACCCCACCCCTGT 100734 AL929591.8 51 CTCTTCTTCCCCGGGGCGGCGGCAGCCACGGGAGCGGGGAGCGGGGAGCC 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 100735 CTCTTCTTCCCCGGGGCGGCGGCAGCCACGGGAGCGGGGAGCGGGGAGCC 100784 AL929591.8 101 GGGAGGGAAGGAGGCGGCGCCGGGGACCAGGGAGAGCTCCCGGGCGGAGG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 100785 GGGAGGGAAGGAGGCGGCGCCGGGGACCAGGGAGAGCTCCCGGGCGGAGG 100834 AL929591.8 151 GAAGAAGGAGGGTGCAAGGGAAGGCAGGGCGGGGGGAAGAGAGGGGAAGA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 100835 GAAGAAGGAGGGTGCAAGGGAAGGCAGGGCGGGGGGAAGAGAGGGGAAGA 100884 AL929591.8 201 CCGGGGAGAGGGCGCCTCCCACAACCCGAGCCCCGGGAGCCGCCCCGGAT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 100885 CCGGGGAGAGGGCGCCTCCCACAACCCGAGCCCCGGGAGCCGCCCCGGAT 100934 AL929591.8 251 CCCAGCCCCGCCCTGGACCGCCCACAGCGCGGTGGGGCGGGCGGTGGAGA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 100935 CCCAGCCCCGCCCTGGACCGCCCACAGCGCGGTGGGGCGGGCGGTGGAGA 100984 AL929591.8 301 GGCGCGGGGCTGAGAGGTGGGGGAGAGGGAGGTGCCCTGGTGCACACGCA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 100985 GGCGCGGGGCTGAGAGGTGGGGGAGAGGGAGGTGCCCTGGTGCACACGCA 101034 AL929591.8 351 CTCGTCGGGGGGCGCCGGTCACTGCCGAGGGACCTGCGGGCCAAACAACT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101035 CTCGTCGGGGGGCGCCGGTCACTGCCGAGGGACCTGCGGGCCAAACAACT 101084 AL929591.8 401 GGAAGCTGGGGTGGGGGAGAGGGAACCCGAGCCAAAGGCAGAGGAGCTGG 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101085 GGAAGCTGGGGTGGGGGAGAGGGAACCCGAGCCAAAGGCAGAGGAGCTGG 101134 AL929591.8 451 CGCTGAGACAGGGAGTCTGGGATGAAGGTGGAGAAAGACGGCTGCACAAA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101135 CGCTGAGACAGGGAGTCTGGGATGAAGGTGGAGAAAGACGGCTGCACAAA 101184 AL929591.8 501 GAGAAGGCAGCCCTAGATCCGGGTGAGAGGAGAGAGGCAGAGGCAGATGC 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101185 GAGAAGGCAGCCCTAGATCCGGGTGAGAGGAGAGAGGCAGAGGCAGATGC 101234 AL929591.8 551 CCAGGAGAACTGCGACCGGAGGGCGAGAAAGAAGCCTGGGTCAGAAGGAG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101235 CCAGGAGAACTGCGACCGGAGGGCGAGAAAGAAGCCTGGGTCAGAAGGAG 101284 AL929591.8 601 GTGGGGGAGGGGGACTGAGGACCACCTAAGCGCAAGAAGGGTTGGGTGTA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101285 GTGGGGGAGGGGGACTGAGGACCACCTAAGCGCAAGAAGGGTTGGGTGTA 101334 AL929591.8 651 GAAGAGATTTCTGGGAGACTAGAGCAGCTCCATGGTCCAGCAGCATTGCT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101335 GAAGAGATTTCTGGGAGACTAGAGCAGCTCCATGGTCCAGCAGCATTGCT 101384 AL929591.8 701 ACTCGCCTGCTCTGCAGGGAACGCGCAGAACGGATTGGAGGCAAAAAACA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101385 ACTCGCCTGCTCTGCAGGGAACGCGCAGAACGGATTGGAGGCAAAAAACA 101434 AL929591.8 751 AAACAGGGAGGGGGACATCAAGGAGAGAAATTGAAGTACGAAGGGAGTAA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101435 AAACAGGGAGGGGGACATCAAGGAGAGAAATTGAAGTACGAAGGGAGTAA 101484 AL929591.8 801 AAGGACAAGAGAAAAGAACCTCAGGGTGGTTTAGAAGCCAGTATTACCTG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101485 AAGGACAAGAGAAAAGAACCTCAGGGTGGTTTAGAAGCCAGTATTACCTG 101534 AL929591.8 851 ATGTACTCCAGCAGAGCCTAGCAAACAGTATTTCTTGACCAAGGGCAAAC 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101535 ATGTACTCCAGCAGAGCCTAGCAAACAGTATTTCTTGACCAAGGGCAAAC 101584 AL929591.8 901 TGGAAGCTCTAAAGACAGCAGGTACAGACCTTTTTGACGGCTCCAGAAGC 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101585 TGGAAGCTCTAAAGACAGCAGGTACAGACCTTTTTGACGGCTCCAGAAGC 101634 AL929591.8 951 TCTTGGCTATACCTTGAAGTGGAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101635 TCTTGGCTATACCTTGAAGTGGAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 101684 AL929591.8 1001 GTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCTGTTGTTGTTCGTAGGCCTGAGTTTGGGC 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101685 GTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCTGTTGTTGTTCGTAGGCCTGAGTTTGGGC 101734 AL929591.8 1051 TGGGAGAGGAAACAGTGGGCTCCTTGTTGGGGGGGACAAAAAAAAAGCTG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101735 TGGGAGAGGAAACAGTGGGCTCCTTGTTGGGGGGGACAAAAAAAAAGCTG 101784 AL929591.8 1101 CTTTCTGGCTGGTCCTAGGGGGAAAAATGGTAGGAAGAAACCAAACACTG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101785 CTTTCTGGCTGGTCCTAGGGGGAAAAATGGTAGGAAGAAACCAAACACTG 101834 AL929591.8 1151 AGAGACTGACTAGAATTGAGATTCTCAACCTCCAACCCTTTTTTACAATA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101835 AGAGACTGACTAGAATTGAGATTCTCAACCTCCAACCCTTTTTTACAATA 101884 AL929591.8 1201 AATATTTTGTAATGACACTTTTACTGTCCTAAATTGAGATTCATAGATGA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101885 AATATTTTGTAATGACACTTTTACTGTCCTAAATTGAGATTCATAGATGA 101934 AL929591.8 1251 GGCTCACGCCTGAAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACTGATCA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101935 GGCTCACGCCTGAAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACTGATCA 101984 AL929591.8 1301 CTTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCTGGCCAGCATGGCGAAAC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 101985 CTTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCTGGCCAGCATGGCGAAAC 102034 AL929591.8 1351 CCCATCTCTACTAAAAATAGAAAAATTAGCGTGGTGTGATGGTGTGCGCC 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102035 CCCATCTCTACTAAAAATAGAAAAATTAGCGTGGTGTGATGGTGTGCGCC 102084 AL929591.8 1401 TGTAATCCCAGCTGAGACACCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102085 TGTAATCCCAGCTGAGACACCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGT 102134 AL929591.8 1451 TGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102135 TGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCA 102184 AL929591.8 1501 AGACTCCATCTCAAACAAAAAGAAAGGGAAGGAGGGAGAGAAAGTCATAG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102185 AGACTCCATCTCAAACAAAAAGAAAGGGAAGGAGGGAGAGAAAGTCATAG 102234 AL929591.8 1551 ATGATATAACCTACCTACATACACAACTTTAAACAGAAAGCAAAATGCTT 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102235 ATGATATAACCTACCTACATACACAACTTTAAACAGAAAGCAAAATGCTT 102284 AL929591.8 1601 CCCTTTCTGTAACGTAAAGGGGAAATGAAAGAAAAGTAACTTGCAATAAA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102285 CCCTTTCTGTAACGTAAAGGGGAAATGAAAGAAAAGTAACTTGCAATAAA 102334 AL929591.8 1651 ATAACATAAACAGTATTTTAATGTGTGAGTGCCAAGGCCCGACTACCCTA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102335 ATAACATAAACAGTATTTTAATGTGTGAGTGCCAAGGCCCGACTACCCTA 102384 AL929591.8 1701 GAAGTCCTGATGGAGTAAGCAGATGCTTCCACCTATTCACAGAACCACGG 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102385 GAAGTCCTGATGGAGTAAGCAGATGCTTCCACCTATTCACAGAACCACGG 102434 AL929591.8 1751 GGATGAAACTGCTACCAACACAGGCTGATCCAGGTGCTGAGTTGGTGACT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102435 GGATGAAACTGCTACCAACACAGGCTGATCCAGGTGCTGAGTTGGTGACT 102484 AL929591.8 1801 CAACTACCTCCAGCATGTTGCCATCAATGAAGTGATTTAACAAAATGTTG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102485 CAACTACCTCCAGCATGTTGCCATCAATGAAGTGATTTAACAAAATGTTG 102534 AL929591.8 1851 AACAACTCTTGGTAGCAAAGTTAATTTTCCCTAATTTTACACACAACTAT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102535 AACAACTCTTGGTAGCAAAGTTAATTTTCCCTAATTTTACACACAACTAT 102584 AL929591.8 1901 AATTGCATTCCTAGAAAGTTCACTGTATATTTAAAAAAAAATTTTAAAAC 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102585 AATTGCATTCCTAGAAAGTTCACTGTATATTTAAAAAAAAATTTTAAAAC 102634 AL929591.8 1951 TGTATTAAGTTATAGGCTCAGATAATTAAACACAGGTTTTCACTACGTGA 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000688.11 102635 TGTATTAAGTTATAGGCTCAGATAATTAAACACAGGTTTTCACTACGTGA 102684