<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929591.8	1	GGCCAGGGTCTCTCCCCTCCTCTCTCGCTTCCCCCAAACCCCACCCCTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	100685	GGCCAGGGTCTCTCCCCTCCTCTCTCGCTTCCCCCAAACCCCACCCCTGT	100734

AL929591.8	51	CTCTTCTTCCCCGGGGCGGCGGCAGCCACGGGAGCGGGGAGCGGGGAGCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	100735	CTCTTCTTCCCCGGGGCGGCGGCAGCCACGGGAGCGGGGAGCGGGGAGCC	100784

AL929591.8	101	GGGAGGGAAGGAGGCGGCGCCGGGGACCAGGGAGAGCTCCCGGGCGGAGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	100785	GGGAGGGAAGGAGGCGGCGCCGGGGACCAGGGAGAGCTCCCGGGCGGAGG	100834

AL929591.8	151	GAAGAAGGAGGGTGCAAGGGAAGGCAGGGCGGGGGGAAGAGAGGGGAAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	100835	GAAGAAGGAGGGTGCAAGGGAAGGCAGGGCGGGGGGAAGAGAGGGGAAGA	100884

AL929591.8	201	CCGGGGAGAGGGCGCCTCCCACAACCCGAGCCCCGGGAGCCGCCCCGGAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	100885	CCGGGGAGAGGGCGCCTCCCACAACCCGAGCCCCGGGAGCCGCCCCGGAT	100934

AL929591.8	251	CCCAGCCCCGCCCTGGACCGCCCACAGCGCGGTGGGGCGGGCGGTGGAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	100935	CCCAGCCCCGCCCTGGACCGCCCACAGCGCGGTGGGGCGGGCGGTGGAGA	100984

AL929591.8	301	GGCGCGGGGCTGAGAGGTGGGGGAGAGGGAGGTGCCCTGGTGCACACGCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	100985	GGCGCGGGGCTGAGAGGTGGGGGAGAGGGAGGTGCCCTGGTGCACACGCA	101034

AL929591.8	351	CTCGTCGGGGGGCGCCGGTCACTGCCGAGGGACCTGCGGGCCAAACAACT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101035	CTCGTCGGGGGGCGCCGGTCACTGCCGAGGGACCTGCGGGCCAAACAACT	101084

AL929591.8	401	GGAAGCTGGGGTGGGGGAGAGGGAACCCGAGCCAAAGGCAGAGGAGCTGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101085	GGAAGCTGGGGTGGGGGAGAGGGAACCCGAGCCAAAGGCAGAGGAGCTGG	101134

AL929591.8	451	CGCTGAGACAGGGAGTCTGGGATGAAGGTGGAGAAAGACGGCTGCACAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101135	CGCTGAGACAGGGAGTCTGGGATGAAGGTGGAGAAAGACGGCTGCACAAA	101184

AL929591.8	501	GAGAAGGCAGCCCTAGATCCGGGTGAGAGGAGAGAGGCAGAGGCAGATGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101185	GAGAAGGCAGCCCTAGATCCGGGTGAGAGGAGAGAGGCAGAGGCAGATGC	101234

AL929591.8	551	CCAGGAGAACTGCGACCGGAGGGCGAGAAAGAAGCCTGGGTCAGAAGGAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101235	CCAGGAGAACTGCGACCGGAGGGCGAGAAAGAAGCCTGGGTCAGAAGGAG	101284

AL929591.8	601	GTGGGGGAGGGGGACTGAGGACCACCTAAGCGCAAGAAGGGTTGGGTGTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101285	GTGGGGGAGGGGGACTGAGGACCACCTAAGCGCAAGAAGGGTTGGGTGTA	101334

AL929591.8	651	GAAGAGATTTCTGGGAGACTAGAGCAGCTCCATGGTCCAGCAGCATTGCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101335	GAAGAGATTTCTGGGAGACTAGAGCAGCTCCATGGTCCAGCAGCATTGCT	101384

AL929591.8	701	ACTCGCCTGCTCTGCAGGGAACGCGCAGAACGGATTGGAGGCAAAAAACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101385	ACTCGCCTGCTCTGCAGGGAACGCGCAGAACGGATTGGAGGCAAAAAACA	101434

AL929591.8	751	AAACAGGGAGGGGGACATCAAGGAGAGAAATTGAAGTACGAAGGGAGTAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101435	AAACAGGGAGGGGGACATCAAGGAGAGAAATTGAAGTACGAAGGGAGTAA	101484

AL929591.8	801	AAGGACAAGAGAAAAGAACCTCAGGGTGGTTTAGAAGCCAGTATTACCTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101485	AAGGACAAGAGAAAAGAACCTCAGGGTGGTTTAGAAGCCAGTATTACCTG	101534

AL929591.8	851	ATGTACTCCAGCAGAGCCTAGCAAACAGTATTTCTTGACCAAGGGCAAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101535	ATGTACTCCAGCAGAGCCTAGCAAACAGTATTTCTTGACCAAGGGCAAAC	101584

AL929591.8	901	TGGAAGCTCTAAAGACAGCAGGTACAGACCTTTTTGACGGCTCCAGAAGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101585	TGGAAGCTCTAAAGACAGCAGGTACAGACCTTTTTGACGGCTCCAGAAGC	101634

AL929591.8	951	TCTTGGCTATACCTTGAAGTGGAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101635	TCTTGGCTATACCTTGAAGTGGAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	101684

AL929591.8	1001	GTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCTGTTGTTGTTCGTAGGCCTGAGTTTGGGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101685	GTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCTGTTGTTGTTCGTAGGCCTGAGTTTGGGC	101734

AL929591.8	1051	TGGGAGAGGAAACAGTGGGCTCCTTGTTGGGGGGGACAAAAAAAAAGCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101735	TGGGAGAGGAAACAGTGGGCTCCTTGTTGGGGGGGACAAAAAAAAAGCTG	101784

AL929591.8	1101	CTTTCTGGCTGGTCCTAGGGGGAAAAATGGTAGGAAGAAACCAAACACTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101785	CTTTCTGGCTGGTCCTAGGGGGAAAAATGGTAGGAAGAAACCAAACACTG	101834

AL929591.8	1151	AGAGACTGACTAGAATTGAGATTCTCAACCTCCAACCCTTTTTTACAATA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101835	AGAGACTGACTAGAATTGAGATTCTCAACCTCCAACCCTTTTTTACAATA	101884

AL929591.8	1201	AATATTTTGTAATGACACTTTTACTGTCCTAAATTGAGATTCATAGATGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101885	AATATTTTGTAATGACACTTTTACTGTCCTAAATTGAGATTCATAGATGA	101934

AL929591.8	1251	GGCTCACGCCTGAAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACTGATCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101935	GGCTCACGCCTGAAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACTGATCA	101984

AL929591.8	1301	CTTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCTGGCCAGCATGGCGAAAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	101985	CTTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCTGGCCAGCATGGCGAAAC	102034

AL929591.8	1351	CCCATCTCTACTAAAAATAGAAAAATTAGCGTGGTGTGATGGTGTGCGCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102035	CCCATCTCTACTAAAAATAGAAAAATTAGCGTGGTGTGATGGTGTGCGCC	102084

AL929591.8	1401	TGTAATCCCAGCTGAGACACCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102085	TGTAATCCCAGCTGAGACACCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGT	102134

AL929591.8	1451	TGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102135	TGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCA	102184

AL929591.8	1501	AGACTCCATCTCAAACAAAAAGAAAGGGAAGGAGGGAGAGAAAGTCATAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102185	AGACTCCATCTCAAACAAAAAGAAAGGGAAGGAGGGAGAGAAAGTCATAG	102234

AL929591.8	1551	ATGATATAACCTACCTACATACACAACTTTAAACAGAAAGCAAAATGCTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102235	ATGATATAACCTACCTACATACACAACTTTAAACAGAAAGCAAAATGCTT	102284

AL929591.8	1601	CCCTTTCTGTAACGTAAAGGGGAAATGAAAGAAAAGTAACTTGCAATAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102285	CCCTTTCTGTAACGTAAAGGGGAAATGAAAGAAAAGTAACTTGCAATAAA	102334

AL929591.8	1651	ATAACATAAACAGTATTTTAATGTGTGAGTGCCAAGGCCCGACTACCCTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102335	ATAACATAAACAGTATTTTAATGTGTGAGTGCCAAGGCCCGACTACCCTA	102384

AL929591.8	1701	GAAGTCCTGATGGAGTAAGCAGATGCTTCCACCTATTCACAGAACCACGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102385	GAAGTCCTGATGGAGTAAGCAGATGCTTCCACCTATTCACAGAACCACGG	102434

AL929591.8	1751	GGATGAAACTGCTACCAACACAGGCTGATCCAGGTGCTGAGTTGGTGACT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102435	GGATGAAACTGCTACCAACACAGGCTGATCCAGGTGCTGAGTTGGTGACT	102484

AL929591.8	1801	CAACTACCTCCAGCATGTTGCCATCAATGAAGTGATTTAACAAAATGTTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102485	CAACTACCTCCAGCATGTTGCCATCAATGAAGTGATTTAACAAAATGTTG	102534

AL929591.8	1851	AACAACTCTTGGTAGCAAAGTTAATTTTCCCTAATTTTACACACAACTAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102535	AACAACTCTTGGTAGCAAAGTTAATTTTCCCTAATTTTACACACAACTAT	102584

AL929591.8	1901	AATTGCATTCCTAGAAAGTTCACTGTATATTTAAAAAAAAATTTTAAAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102585	AATTGCATTCCTAGAAAGTTCACTGTATATTTAAAAAAAAATTTTAAAAC	102634

AL929591.8	1951	TGTATTAAGTTATAGGCTCAGATAATTAAACACAGGTTTTCACTACGTGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000688.11	102635	TGTATTAAGTTATAGGCTCAGATAATTAAACACAGGTTTTCACTACGTGA	102684

Overview

Query
AL929591.8 - 61243 bps
Hit
BX000688.11 - 102684 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link