<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

AL732314.18	1	GAATTCTTGCAAAGTCACACAATTCAAGCATTTACCTTAGCGTCTGGCTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31341	GAATTCTTGCAAAGTCACACAATTCAAGCATTTACCTTAGCGTCTGGCTG	31390

AL732314.18	51	TCATTCAACACGTTTAAGGACAAAATGGCAGCTCATTAGCGATCCCACTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31391	TCATTCAACACGTTTAAGGACAAAATGGCAGCTCATTAGCGATCCCACTG	31440

AL732314.18	101	AGAAAGCAAGTCATGGAGGGGAACCATCATTACTAGCACATGCTTCTTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31441	AGAAAGCAAGTCATGGAGGGGAACCATCATTACTAGCACATGCTTCTTGA	31490

AL732314.18	151	GTCCTGGCCCTCCTCTCAACCTCCTCAGTAAATGAGGGATTTGGGCAAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31491	GTCCTGGCCCTCCTCTCAACCTCCTCAGTAAATGAGGGATTTGGGCAAGA	31540

AL732314.18	201	GTTCCTAAGGTGCTTCAGGTTTTGCAGCTCACTGGGAAAGTGCACTGGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31541	GTTCCTAAGGTGCTTCAGGTTTTGCAGCTCACTGGGAAAGTGCACTGGGC	31590

AL732314.18	251	CGGAGCTCAAGAGATGCGTCCTGGGGCCCTGAGTCCCCTCCTGGATCGGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31591	CGGAGCTCAAGAGATGCGTCCTGGGGCCCTGAGTCCCCTCCTGGATCGGG	31640

AL732314.18	301	ATCTGGAGGGCCTGAGCCAGACGGTCTCCAAGCTGCCTCTAGCTCTAGTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31641	ATCTGGAGGGCCTGAGCCAGACGGTCTCCAAGCTGCCTCTAGCTCTAGTT	31690

AL732314.18	351	CACATTTTCATCGACACGTACTTTTGGAAAATGTTCTAGATCCATCAGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31691	CACATTTTCATCGACACGTACTTTTGGAAAATGTTCTAGATCCATCAGAA	31740

AL732314.18	401	GACATCGGACAACCACCGGTAATTTAGAACGCAAGGAGCTCACCTCAGAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31741	GACATCGGACAACCACCGGTAATTTAGAACGCAAGGAGCTCACCTCAGAT	31790

AL732314.18	451	TGCCACCCACCTCTCACTCAGCAAGTAGAGAGGCTGGTCCATTTTGGCTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31791	TGCCACCCACCTCTCACTCAGCAAGTAGAGAGGCTGGTCCATTTTGGCTG	31840

AL732314.18	501	GAAAACTGTGGTGCTACGTAAATATCACTTTGTGACATGCTTATTAGTGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31841	GAAAACTGTGGTGCTACGTAAATATCACTTTGTGACATGCTTATTAGTGC	31890

AL732314.18	551	TGCTGATGGAAAGCTGGTGTTCAGCTGAAAATTTTCAAATGGTATAAACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31891	TGCTGATGGAAAGCTGGTGTTCAGCTGAAAATTTTCAAATGGTATAAACA	31940

AL732314.18	601	AGTTCCGACGGAACATTCTGAATATTTCAGGCTTCCGTAGTATTCTCGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31941	AGTTCCGACGGAACATTCTGAATATTTCAGGCTTCCGTAGTATTCTCGGG	31990

AL732314.18	651	ACACCAGACGCACCAGCCATACGTGTTTCTATAACATCTGGAAGCAATGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	31991	ACACCAGACGCACCAGCCATACGTGTTTCTATAACATCTGGAAGCAATGT	32040

AL732314.18	701	TTTATCGCTTTAAACTGCATAGTATAAAACGACAGAAAGCATTTTTAAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32041	TTTATCGCTTTAAACTGCATAGTATAAAACGACAGAAAGCATTTTTAAAA	32090

AL732314.18	751	ATACACGGCTGTCGGCGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAAAACT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32091	ATACACGGCTGTCGGCGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAAAACT	32140

AL732314.18	801	TTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32141	TTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC	32190

AL732314.18	851	CGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32191	CGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGC	32240

AL732314.18	901	CGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32241	CGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGC	32290

AL732314.18	951	AGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32291	AGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCG	32340

AL732314.18	1001	CGCCACTGCACTCCAGCCTGGGGGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32341	CGCCACTGCACTCCAGCCTGGGGGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAA	32390

AL732314.18	1051	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAACAAAAAAACAACTAAGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32391	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAACAAAAAAACAACTAAGT	32440

AL732314.18	1101	TCCCAGTCATGACTGGATGGGAGTTTGGACACACCTTATTATACCCCTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32441	TCCCAGTCATGACTGGATGGGAGTTTGGACACACCTTATTATACCCCTCC	32490

AL732314.18	1151	TGCTTTGGCAGTTTAAACACAACCAACCAGCAAAAAGGTTAAAATCAACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32491	TGCTTTGGCAGTTTAAACACAACCAACCAGCAAAAAGGTTAAAATCAACA	32540

AL732314.18	1201	TCGTAAGACTGACAGAACAGACTCTGTGGCAAACAAGACCAAGGGCCACC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32541	TCGTAAGACTGACAGAACAGACTCTGTGGCAAACAAGACCAAGGGCCACC	32590

AL732314.18	1251	TGAGGTGAGGGTTAAGTCACACACCGCCTACACTTAAAGAATAAACTACA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32591	TGAGGTGAGGGTTAAGTCACACACCGCCTACACTTAAAGAATAAACTACA	32640

AL732314.18	1301	GTTCCAACTGCCAAAGCATTTCTTTTTCTCCAGCAGCTAAATGTCCTTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32641	GTTCCAACTGCCAAAGCATTTCTTTTTCTCCAGCAGCTAAATGTCCTTTT	32690

AL732314.18	1351	AGGTTATTCACTAGAGACCTCTGCAGAAACTCGTTTTTGAGATTCAAGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32691	AGGTTATTCACTAGAGACCTCTGCAGAAACTCGTTTTTGAGATTCAAGAA	32740

AL732314.18	1401	GTAAATAAAGGATGTTTTTCTTTTTCTCTATTGCTTATCTTGGCCTCAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32741	GTAAATAAAGGATGTTTTTCTTTTTCTCTATTGCTTATCTTGGCCTCAAG	32790

AL732314.18	1451	CTCGCGCACGCAAGAAGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATAT	1500
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
BX000476.5	32791	CTCGCGCACGCAAGAAGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATAT	32840

AL732314.18	1501	ATATACTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGCCTTCCTCTGTTGCTCAGGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32841	ATATACTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGCCTTCCTCTGTTGCTCAGGC	32890

AL732314.18	1551	TGGTGAGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACAGTAATCTCCGACTCCCAGCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32891	TGGTGAGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACAGTAATCTCCGACTCCCAGCT	32940

AL732314.18	1601	TCAAGCATTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTTCAGGTGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32941	TCAAGCATTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTTCAGGTGC	32990

AL732314.18	1651	GCCACCACGCCTGGCTAATTTGTGTATTTTTAGCAGAGATGGGGTTTCGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	32991	GCCACCACGCCTGGCTAATTTGTGTATTTTTAGCAGAGATGGGGTTTCGC	33040

AL732314.18	1701	CATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGAACTCAAGTGATCTGCCTGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	33041	CATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGAACTCAAGTGATCTGCCTGC	33090

AL732314.18	1751	CTCCAACTCCCAAATGCTGGAATCACAGGCGTGAGTCACCATGCCTGACC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	33091	CTCCAACTCCCAAATGCTGGAATCACAGGCGTGAGTCACCATGCCTGACC	33140

AL732314.18	1801	AATATAAACAATATTAAAACACCTGCAGCTTCCTGTCAGATCCTGATGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	33141	AATATAAACAATATTAAAACACCTGCAGCTTCCTGTCAGATCCTGATGAA	33190

AL732314.18	1851	CAGACCCCTCTGTTCCACCAGCCGTAACTACAGCTTTGACTGGGAAAAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	33191	CAGACCCCTCTGTTCCACCAGCCGTAACTACAGCTTTGACTGGGAAAAGA	33240

AL732314.18	1901	CTGATTCCAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTCATCCCAGCACTTTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	33241	CTGATTCCAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTCATCCCAGCACTTTG	33290

AL732314.18	1951	AGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000476.5	33291	AGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGTCT	33340

Compact alignment

skip 1450 bps 100% identity alignment

AL732314.18	1451	CTCGCGCACGCAAGAAGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATAT	1500
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
BX000476.5	32791	CTCGCGCACGCAAGAAGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATAT	32840

skip 500 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AL732314.18 - 218723 bps
Hit
BX000476.5 - 33340 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link