<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX004802.12	1	AAAGCCAACACCAGTGGCGCTCTGAAGCCTGTGGGATTTTGAAGTATTCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198162	AAAGCCAACACCAGTGGCGCTCTGAAGCCTGTGGGATTTTGAAGTATTCT	198211

BX004802.12	51	TGGCTAAATGCTCATCTCTAGACCACACGAAGCCCCCCTGTGAGGCATCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198212	TGGCTAAATGCTCATCTCTAGACCACACGAAGCCCCCCTGTGAGGCATCT	198261

BX004802.12	101	CCCTGACTCCCTGTTAGCTACACTATAAACACTTCACTCAGGAATGGCAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198262	CCCTGACTCCCTGTTAGCTACACTATAAACACTTCACTCAGGAATGGCAG	198311

BX004802.12	151	CTGTTCCCAAATGGCACTTGGTACATTCCCCTTCTCCTGCAGTACCCTCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198312	CTGTTCCCAAATGGCACTTGGTACATTCCCCTTCTCCTGCAGTACCCTCC	198361

BX004802.12	201	TCATCTCTGCCACTCAATCAAGGCCTCAGTATTCTTAAACTCGCAATATA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198362	TCATCTCTGCCACTCAATCAAGGCCTCAGTATTCTTAAACTCGCAATATA	198411

BX004802.12	251	CTCTGTTTTTCATTTACGGGTAAAAAGAAGTTTGAATTACCTAAGCAGCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198412	CTCTGTTTTTCATTTACGGGTAAAAAGAAGTTTGAATTACCTAAGCAGCA	198461

BX004802.12	301	ATATATATGCACATTCAGCGATCATCTTCACTATGCCCATAATGCTGAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198462	ATATATATGCACATTCAGCGATCATCTTCACTATGCCCATAATGCTGAAA	198511

BX004802.12	351	GCGATGTTTCCAATTTCCTCTCTGTAACAAGATAAACAATAGTGAAAAAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198512	GCGATGTTTCCAATTTCCTCTCTGTAACAAGATAAACAATAGTGAAAAAC	198561

BX004802.12	401	AGTAGTTAAGAATGCATCTGATAATACCACTTAGGATGTTTGCATATCAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198562	AGTAGTTAAGAATGCATCTGATAATACCACTTAGGATGTTTGCATATCAC	198611

BX004802.12	451	TTCACATCACATTTATTTATATTGTCTTTTATACTAGATGGCTTGAAAGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198612	TTCACATCACATTTATTTATATTGTCTTTTATACTAGATGGCTTGAAAGC	198661

BX004802.12	501	AAGTGATTATTCAGTTACAGTGTTCAGCATAATTGAGTACACCCCATTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198662	AAGTGATTATTCAGTTACAGTGTTCAGCATAATTGAGTACACCCCATTTT	198711

BX004802.12	551	GAAAATTATTATTTTTGTTCACTTCTCAGTAAATATAGGCAATGTATTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198712	GAAAATTATTATTTTTGTTCACTTCTCAGTAAATATAGGCAATGTATTTT	198761

BX004802.12	601	GTTGCATTTAAACAAAACAGATTTATTAGATATATTTATTTAAATAATAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198762	GTTGCATTTAAACAAAACAGATTTATTAGATATATTTATTTAAATAATAT	198811

BX004802.12	651	TTTAGTCACTGGACATCTTTAGACATTAAAAGACAAAACAATTAAATTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198812	TTTAGTCACTGGACATCTTTAGACATTAAAAGACAAAACAATTAAATTCA	198861

BX004802.12	701	AGCAAAATATTGCAAAATTAAAAATAAAAATAATTTAAAACTATTTTTTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198862	AGCAAAATATTGCAAAATTAAAAATAAAAATAATTTAAAACTATTTTTTG	198911

BX004802.12	751	CTTCTCTTGATTTTTCCTTTTTTTAAAGTTGTATTTAATATTTTTCTATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198912	CTTCTCTTGATTTTTCCTTTTTTTAAAGTTGTATTTAATATTTTTCTATA	198961

BX004802.12	801	GCATACATTTGGGTGTACTAGTTTTCGGATCGTTATCTTAAGCTATTTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	198962	GCATACATTTGGGTGTACTAGTTTTCGGATCGTTATCTTAAGCTATTTTG	199011

BX004802.12	851	TTACATTAGCTGCAGATTTGGCTTCAGTACTGACTAATGTATATGCACAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199012	TTACATTAGCTGCAGATTTGGCTTCAGTACTGACTAATGTATATGCACAA	199061

BX004802.12	901	ATATAATATTGTATAACTTCCTATTAAAAATATGAGTTTAAAAGATTTGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199062	ATATAATATTGTATAACTTCCTATTAAAAATATGAGTTTAAAAGATTTGT	199111

BX004802.12	951	GAGGGATGTACTTATGTATGCTGAGCACTGTATATAAACAAAAACAATAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199112	GAGGGATGTACTTATGTATGCTGAGCACTGTATATAAACAAAAACAATAA	199161

BX004802.12	1001	GTACTAAACAAGTATTCAGTATTAAACAAATCACATCTAAGTATTCACTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199162	GTACTAAACAAGTATTCAGTATTAAACAAATCACATCTAAGTATTCACTG	199211

BX004802.12	1051	TTAAACAAACTAAGGTGTCAGTGTTGCTTTCAATTAGAATTACGCTTCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199212	TTAAACAAACTAAGGTGTCAGTGTTGCTTTCAATTAGAATTACGCTTCAT	199261

BX004802.12	1101	TTTCTACTATAAAGCAGATCTTTGATGTTTATTTTACCTGTGGACATCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199262	TTTCTACTATAAAGCAGATCTTTGATGTTTATTTTACCTGTGGACATCTG	199311

BX004802.12	1151	ATTTAAAAGACTGAACAAAGCAGATAAACTAGAAAAGCGCAAAAACATAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199312	ATTTAAAAGACTGAACAAAGCAGATAAACTAGAAAAGCGCAAAAACATAC	199361

BX004802.12	1201	AGATGTAGTACAGGGGTAAACTGTGTATTGGTGCTCCTTGGATATGAGAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199362	AGATGTAGTACAGGGGTAAACTGTGTATTGGTGCTCCTTGGATATGAGAG	199411

BX004802.12	1251	TCTTTTAAAATCAAGTCATCACTCCAAGGCACTTAAAAACTGTGAAAAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199412	TCTTTTAAAATCAAGTCATCACTCCAAGGCACTTAAAAACTGTGAAAAAA	199461

BX004802.12	1301	AAGTGTGTAAGACTTATTAACATGGCTAATGTATTAAGAACAGCACACAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199462	AAGTGTGTAAGACTTATTAACATGGCTAATGTATTAAGAACAGCACACAT	199511

BX004802.12	1351	GCACCAATGCATTGTGGCATTCACATGTCATAATCACCTGATTAGATCTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199512	GCACCAATGCATTGTGGCATTCACATGTCATAATCACCTGATTAGATCTC	199561

BX004802.12	1401	CAAGCAGTAAATAGAAAATGAACTCAAACAGTAGTTTCAAATTAATTTAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199562	CAAGCAGTAAATAGAAAATGAACTCAAACAGTAGTTTCAAATTAATTTAA	199611

BX004802.12	1451	ACAAAAAATAAGAACTTTAGGCTATTGGAGTATAGGTTATTTGATTAATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199612	ACAAAAAATAAGAACTTTAGGCTATTGGAGTATAGGTTATTTGATTAATT	199661

BX004802.12	1501	GTGAAGGAAAACTATTGCAAAATATAAAAACTATTCCATTAACCGATCTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199662	GTGAAGGAAAACTATTGCAAAATATAAAAACTATTCCATTAACCGATCTT	199711

BX004802.12	1551	TACTGAATCTCTCTGATTTTAAGAACTGGACAGTAGAAATGAACCAGAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199712	TACTGAATCTCTCTGATTTTAAGAACTGGACAGTAGAAATGAACCAGAAA	199761

BX004802.12	1601	AGATTTCCATGCCAAAGAAGGCGGAGCTTCAAAGCCTCAGCTATCTTCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199762	AGATTTCCATGCCAAAGAAGGCGGAGCTTCAAAGCCTCAGCTATCTTCTA	199811

BX004802.12	1651	TGTAATCACCATAGGCCTCTGATTATTTAAAAGTCTTTTCTAAATGGGAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199812	TGTAATCACCATAGGCCTCTGATTATTTAAAAGTCTTTTCTAAATGGGAA	199861

BX004802.12	1701	ACTTTTTTAAATTGTACAATGGCCTAATTTTTTTACCTGATTTGGTTCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199862	ACTTTTTTAAATTGTACAATGGCCTAATTTTTTTACCTGATTTGGTTCAG	199911

BX004802.12	1751	AATGATGTCACAGCAGTTCATTCTTTGACTTTACTTGAAGTTGCACAGCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199912	AATGATGTCACAGCAGTTCATTCTTTGACTTTACTTGAAGTTGCACAGCT	199961

BX004802.12	1801	TCAGCATCTCCAGAATGAAGCCATCTATATGTAAATTCAGAATCCTTAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	199962	TCAGCATCTCCAGAATGAAGCCATCTATATGTAAATTCAGAATCCTTAAT	200011

BX004802.12	1851	TTCATTAGTTGCATTCTTGAGCATGCACTGATCAAGAGAAACTACAGCTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	200012	TTCATTAGTTGCATTCTTGAGCATGCACTGATCAAGAGAAACTACAGCTT	200061

BX004802.12	1901	TACCTTGATTTCTAGGTTTTTAGCGGTGATGCTCATTGGAAACTCGTTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	200062	TACCTTGATTTCTAGGTTTTTAGCGGTGATGCTCATTGGAAACTCGTTGG	200111

BX004802.12	1951	CGTGCCTGGTGTGTCAACAGCCAGAGTAAGGTCAGCGTTCAGCCAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000431.10	200112	CGTGCCTGGTGTGTCAACAGCCAGAGTAAGGTCAGCGTTCAGCCAAGCTT	200161

Overview

Query
BX004802.12 - 96057 bps
Hit
BX000431.10 - 200161 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100191920001200011981622001611
2100336711245113111187119371
310037691124311311-1189819661
490.321512181963919856-134911351271
580.43611916896669156-134911350991
681.43581443114331286-134985351241
781.3902289530495531-153485537141
898.5132681124511312154452545181
910030611124611306-154457545171
1010037681124411311173701737681
1110033671124511311-173711737771
1282.36771859476694950-175169753551
1392.7761835939859480-191360914421
1491.2163914456444654-191363914531
151003367112451131111152721153381
1610033671124511311-11152831153491
1790.9135559775982911160261160801
1898.04691021124811349-11445871446881
191003164112461130911446251446881
2010037681124511312-11699021699691
211003367112451131111699041699701
Short-link