<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX537153.6	1	ATCTCTCATCTCTCCTCCCTCTACCCTTCCTAGAAAAATTGTTAATTCTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42402	ATCTCTCATCTCTCCTCCCTCTACCCTTCCTAGAAAAATTGTTAATTCTA	42451

BX537153.6	51	ACTGTGTGTATACATACACACACACACATACAGTTTTGTTAAATATTGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42452	ACTGTGTGTATACATACACACACACACATACAGTTTTGTTAAATATTGAG	42501

BX537153.6	101	AAATTCTCCTCCAAAAGGGTCATGATTTTGCATTCCTACCAGCCCACTGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42502	AAATTCTCCTCCAAAAGGGTCATGATTTTGCATTCCTACCAGCCCACTGG	42551

BX537153.6	151	CATATGAGTGTCTCTCCGACACTTCGTCAAAAGTGTATTAAGTTGAAAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42552	CATATGAGTGTCTCTCCGACACTTCGTCAAAAGTGTATTAAGTTGAAAAT	42601

BX537153.6	201	TTTTGCTATTGTAACGAGTAAGAAATGGTATTTTAGTGTGGTTTTAGTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42602	TTTTGCTATTGTAACGAGTAAGAAATGGTATTTTAGTGTGGTTTTAGTTT	42651

BX537153.6	251	GCATTTCTCTTATTATAAGTACAGCTGAGCATTTTTTCACATGTTCACAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42652	GCATTTCTCTTATTATAAGTACAGCTGAGCATTTTTTCACATGTTCACAA	42701

BX537153.6	301	AGCAATTTATGTCTTTTGCAGCTTGTCTATTTGTGCCTTCAACCCATTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42702	AGCAATTTATGTCTTTTGCAGCTTGTCTATTTGTGCCTTCAACCCATTTT	42751

BX537153.6	351	TCTCTAGAATTTTGGTCTTTTCTCTCGCAATACTTAAAAGGTCTTTTTAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42752	TCTCTAGAATTTTGGTCTTTTCTCTCGCAATACTTAAAAGGTCTTTTTAT	42801

BX537153.6	401	ATTAGAACTATCACTTGTATTTGTGATATTTGTGGCAAATATTCAATTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42802	ATTAGAACTATCACTTGTATTTGTGATATTTGTGGCAAATATTCAATTTT	42851

BX537153.6	451	AATACTATCTTTTGACTGGTTACAATGTGTGTGCGCTTTTTTCTTGTACT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42852	AATACTATCTTTTGACTGGTTACAATGTGTGTGCGCTTTTTTCTTGTACT	42901

BX537153.6	501	AATACCAACAGCTTTAATTATATGGGCTTTAAAATATGGTGTAGTATCTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42902	AATACCAACAGCTTTAATTATATGGGCTTTAAAATATGGTGTAGTATCTA	42951

BX537153.6	551	GTAGGGCCAGTTCTCCCTCAGAGCTCTTCTTTCACAGTGTAGCCTACCTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	42952	GTAGGGCCAGTTCTCCCTCAGAGCTCTTCTTTCACAGTGTAGCCTACCTA	43001

BX537153.6	601	TGTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTCTTGCTCTGTTACCCAGGCTGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43002	TGTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTCTTGCTCTGTTACCCAGGCTGG	43051

BX537153.6	651	AGTGCAGTGGTGCAATCATAGCTCACTGCAGGCTCAACCTCTTGGGCTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43052	AGTGCAGTGGTGCAATCATAGCTCACTGCAGGCTCAACCTCTTGGGCTCT	43101

BX537153.6	701	AGTGATCTATCCCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGATCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43102	AGTGATCTATCCCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGATCT	43151

BX537153.6	751	GCCTCCCAGGCTGGAGTGAAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACTTCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43152	GCCTCCCAGGCTGGAGTGAAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACTTCC	43201

BX537153.6	801	ACCTCCGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43202	ACCTCCGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGAGA	43251

BX537153.6	851	TTACAGGCATGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGCG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43252	TTACAGGCATGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGCG	43301

BX537153.6	901	ACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTAATG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43302	ACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTAATG	43351

BX537153.6	951	TGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43352	TGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGTC	43401

BX537153.6	1001	ACTGCACCCGGCCTATCCCATAAAAATAAGCACATAATAATATGTGCTTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43402	ACTGCACCCGGCCTATCCCATAAAAATAAGCACATAATAATATGTGCTTA	43451

BX537153.6	1051	TTTTATATGTGCATATTATTATGTGCTTATTTTTCTATCTGAAGTTGACT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43452	TTTTATATGTGCATATTATTATGTGCTTATTTTTCTATCTGAAGTTGACT	43501

BX537153.6	1101	GTCAATTTGTCTAGATCCAGAAAAAGAGCTTGTTGGTATTTTTATTGAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43502	GTCAATTTGTCTAGATCCAGAAAAAGAGCTTGTTGGTATTTTTATTGAAA	43551

BX537153.6	1151	TTGCAAGGGTGGGGGGGGGGGGATGAGGGATAACAGATTACTTAATGGGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43552	TTGCAAGGGTGGGGGGGGGGGGATGAGGGATAACAGATTACTTAATGGGT	43601

BX537153.6	1201	ACAACGTACACTGGGTACCTGGGTGATGGTTACACTGAAATCCGAGACTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43602	ACAACGTACACTGGGTACCTGGGTGATGGTTACACTGAAATCCGAGACTT	43651

BX537153.6	1251	CACTACATAATATATCCGAGTAACAGAAAAAAAAAAGAAACTGCATTTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43652	CACTACATAATATATCCGAGTAACAGAAAAAAAAAAGAAACTGCATTTAT	43701

BX537153.6	1301	GAATGTGAAGGACAACTTGCTTTCCCTGTCTTATCAAACAATAAGTGATA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43702	GAATGTGAAGGACAACTTGCTTTCCCTGTCTTATCAAACAATAAGTGATA	43751

BX537153.6	1351	TCTCTTTATTTGTTCAAGTTTATTTTGTGTCTTTCAGGAATCTTTGAATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43752	TCTCTTTATTTGTTCAAGTTTATTTTGTGTCTTTCAGGAATCTTTGAATG	43801

BX537153.6	1401	TTTTATAATTTTCTCCACATAGGTTTTTGTATATTTCTTATAAATTTATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43802	TTTTATAATTTTCTCCACATAGGTTTTTGTATATTTCTTATAAATTTATT	43851

BX537153.6	1451	CCCAGATATTTTATCACTTGTTTTTTTTTTGCAAATGGAAACAGCATGTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43852	CCCAGATATTTTATCACTTGTTTTTTTTTTGCAAATGGAAACAGCATGTT	43901

BX537153.6	1501	CTCTTCTAATATGTCTTCTAGTGGCTGCTATCTGGCATATGAAGGCTGCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43902	CTCTTCTAATATGTCTTCTAGTGGCTGCTATCTGGCATATGAAGGCTGCT	43951

BX537153.6	1551	GATTTCTGTATGTTAACTTCTTTCCCAATTTGTATACCTATAATTATTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	43952	GATTTCTGTATGTTAACTTCTTTCCCAATTTGTATACCTATAATTATTTT	44001

BX537153.6	1601	ATTTAACTGAACTGGTTAGAACCTTTAATGCAGTGTTAAATAGAGATAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	44002	ATTTAACTGAACTGGTTAGAACCTTTAATGCAGTGTTAAATAGAGATAAA	44051

BX537153.6	1651	TGATACTGGGCATCCGGCCTGTTTCTGACCTCAATGGGAATGCCTCCAGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	44052	TGATACTGGGCATCCGGCCTGTTTCTGACCTCAATGGGAATGCCTCCAGT	44101

BX537153.6	1701	ATTGCCCCATTAAGTAATATTTATCCTGCTTTTCCAGTGACTTCCAACAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	44102	ATTGCCCCATTAAGTAATATTTATCCTGCTTTTCCAGTGACTTCCAACAT	44151

BX537153.6	1751	AAACACTTTTTGATATTCATGGAGCCCCTCCTCCCTTACTGAGTCCATGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	44152	AAACACTTTTTGATATTCATGGAGCCCCTCCTCCCTTACTGAGTCCATGA	44201

BX537153.6	1801	CTTCTTTCTTTCTCTCCTTTCCTCATCATCCACCTTCAGTTTCATGCTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	44202	CTTCTTTCTTTCTCTCCTTTCCTCATCATCCACCTTCAGTTTCATGCTCC	44251

BX537153.6	1851	ATCTGTTTAAAAAAATATTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	44252	ATCTGTTTAAAAAAATATTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAG	44301

BX537153.6	1901	CTTTAGACCAGGCGCAGTAGCTCACGTCTATTATACCAGCACTTTGGGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	44302	CTTTAGACCAGGCGCAGTAGCTCACGTCTATTATACCAGCACTTTGGGAG	44351

BX537153.6	1951	GCCAAGGTAGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGAAGACCAGCCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX000360.7	44352	GCCAAGGTAGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGAAGACCAGCCTGGCC	44401

Overview

Query
BX537153.6 - 12533 bps
Hit
BX000360.7 - 44401 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link