<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR450810.5	1	TCTAGATTCACAAAACTGACTAGATCAATGTTCTACTGATTAATCCACAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175222	TCTAGATTCACAAAACTGACTAGATCAATGTTCTACTGATTAATCCACAC	175271

CR450810.5	51	AAGCTACACAGAAAAAAAAAAGTTTAAGTATAAAGTTTAATCAAAATGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175272	AAGCTACACAGAAAAAAAAAAGTTTAAGTATAAAGTTTAATCAAAATGTG	175321

CR450810.5	101	AAGACCAACACTGGACTGACTGCCCACTATTCAATGTTCAGTTTAAGCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175322	AAGACCAACACTGGACTGACTGCCCACTATTCAATGTTCAGTTTAAGCTG	175371

CR450810.5	151	GAACTATGTCACACAAGTAAACACAATAGGAACTTCCTGTTAATGTGGTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175372	GAACTATGTCACACAAGTAAACACAATAGGAACTTCCTGTTAATGTGGTC	175421

CR450810.5	201	TAGAAACCAAACACAGGACATTTGATAAGGTCAGCATTCGTCAATGTGTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175422	TAGAAACCAAACACAGGACATTTGATAAGGTCAGCATTCGTCAATGTGTC	175471

CR450810.5	251	AGCAAGCACAACAGCCAATCAAACTGCTGCAGTTGTATTTGCAAACATAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175472	AGCAAGCACAACAGCCAATCAAACTGCTGCAGTTGTATTTGCAAACATAC	175521

CR450810.5	301	AGTTGCAAGTCCAAACATACAAGTCAATACAAACATCAGACATCATGTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175522	AGTTGCAAGTCCAAACATACAAGTCAATACAAACATCAGACATCATGTTT	175571

CR450810.5	351	TTTAATTGGAGGATTTTCTAATGGTCATTTTGTGTTCTAGACTCTTTGGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175572	TTTAATTGGAGGATTTTCTAATGGTCATTTTGTGTTCTAGACTCTTTGGG	175621

CR450810.5	401	AAGGACTCAGGAGGCTTGTACAAACTGAAAATGCACTTCTAGAATGTGAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175622	AAGGACTCAGGAGGCTTGTACAAACTGAAAATGCACTTCTAGAATGTGAT	175671

CR450810.5	451	CCCTTCATCACCACATATAAATATATGTTCTCTCATCTAAAAAAGATGCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175672	CCCTTCATCACCACATATAAATATATGTTCTCTCATCTAAAAAAGATGCC	175721

CR450810.5	501	ATAGCCTGCATATAAGGTGCTTAATAATGTCCTTGCCACCACACTTTATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175722	ATAGCCTGCATATAAGGTGCTTAATAATGTCCTTGCCACCACACTTTATT	175771

CR450810.5	551	AAGAGATCCTATTTGTAGAAATCTATTTAATTCTATTTATACTTCCTGTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175772	AAGAGATCCTATTTGTAGAAATCTATTTAATTCTATTTATACTTCCTGTA	175821

CR450810.5	601	AAGTTGTTCACCAGCACTTGAAGGTGGCTAAAACAAAGAGAAACCTATCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175822	AAGTTGTTCACCAGCACTTGAAGGTGGCTAAAACAAAGAGAAACCTATCC	175871

CR450810.5	651	AATGCAAACCTGCTTCGAAACTTCCATGTTTGTTTTCTATTAAGACGGGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175872	AATGCAAACCTGCTTCGAAACTTCCATGTTTGTTTTCTATTAAGACGGGT	175921

CR450810.5	701	TTGAGCTTCTTCCACCCAAACAGCGATCCTTCAGGTAGAGCATGTCTGTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175922	TTGAGCTTCTTCCACCCAAACAGCGATCCTTCAGGTAGAGCATGTCTGTC	175971

CR450810.5	751	CATACAGGATGAAGAGAAGGATTGGAAAGCAGCCATTACCTTTAAACGAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	175972	CATACAGGATGAAGAGAAGGATTGGAAAGCAGCCATTACCTTTAAACGAG	176021

CR450810.5	801	TAAGCAAAAACAAACAAACGCATTCAAATTTGTGCAGTTCTACACAACGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176022	TAAGCAAAAACAAACAAACGCATTCAAATTTGTGCAGTTCTACACAACGG	176071

CR450810.5	851	TTAAAAAATGTAGGATCTTTTATAATAAAATGTTTTAATCTGATTTAAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176072	TTAAAAAATGTAGGATCTTTTATAATAAAATGTTTTAATCTGATTTAAAA	176121

CR450810.5	901	AAAAAACAGTAAAAATGGCAATTTTGTATTTAAAGCCAATGTAAAATCGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176122	AAAAAACAGTAAAAATGGCAATTTTGTATTTAAAGCCAATGTAAAATCGA	176171

CR450810.5	951	AATAAAGTTTTTTTTAGATATTAGTATCAGTAAACCAGTCTTAGGGATAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176172	AATAAAGTTTTTTTTAGATATTAGTATCAGTAAACCAGTCTTAGGGATAA	176221

CR450810.5	1001	GCTAGAGTACTCCAAAACAGTGACAAAATTCACATTAAGAAGATAAAAAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176222	GCTAGAGTACTCCAAAACAGTGACAAAATTCACATTAAGAAGATAAAAAC	176271

CR450810.5	1051	ATCCAAAGCTTGCAGTTAATCGCTTCCGCCTAAATGAAACAACATTTTTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176272	ATCCAAAGCTTGCAGTTAATCGCTTCCGCCTAAATGAAACAACATTTTTG	176321

CR450810.5	1101	TTTTTTTGACATCACCTCATACTTTAGTTTCGCATCAAATCTCCTGACCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176322	TTTTTTTGACATCACCTCATACTTTAGTTTCGCATCAAATCTCCTGACCA	176371

CR450810.5	1151	ATCAAATGCTCTCTAGTATCTGGCACGCCCGCCTCTCTCCATACGCTATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176372	ATCAAATGCTCTCTAGTATCTGGCACGCCCGCCTCTCTCCATACGCTATT	176421

CR450810.5	1201	TCTATATTGAGCTTAACCACTCTCACTAGCAGAGCTGTAATAAAAAGCAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176422	TCTATATTGAGCTTAACCACTCTCACTAGCAGAGCTGTAATAAAAAGCAA	176471

CR450810.5	1251	ATGTTATTGGCTGTTTTTAAAAAAGGGAGGAGCTACCATGTATCATCTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176472	ATGTTATTGGCTGTTTTTAAAAAAGGGAGGAGCTACCATGTATCATCTTG	176521

CR450810.5	1301	TCTTAATAGATATAGTTGACTTCGTGCAGCGCATCGCAGATCGATCGAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176522	TCTTAATAGATATAGTTGACTTCGTGCAGCGCATCGCAGATCGATCGAAA	176571

CR450810.5	1351	TCTGTCTTAAAGCGGTGCATGCCGGTTAGAAATTTCGTCTAGCTTGACGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176572	TCTGTCTTAAAGCGGTGCATGCCGGTTAGAAATTTCGTCTAGCTTGACGC	176621

CR450810.5	1401	TGCACTGACACCACATGACTGTCACATGTGGCATCAAAGTACCGTGACAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176622	TGCACTGACACCACATGACTGTCACATGTGGCATCAAAGTACCGTGACAG	176671

CR450810.5	1451	CGCTCAGATCAGACAATGGATTCAGCCGGTGCAGCATCTGAAGAGGGACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176672	CGCTCAGATCAGACAATGGATTCAGCCGGTGCAGCATCTGAAGAGGGACT	176721

CR450810.5	1501	GCAGTAACTGCGATTAAGACACTGATATTACACGAGTGGCCGAGTTCACC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176722	GCAGTAACTGCGATTAAGACACTGATATTACACGAGTGGCCGAGTTCACC	176771

CR450810.5	1551	GCATGACAACAACCTTGTGCGTTTCGATTTTATTATTGGACAACTTCCGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176772	GCATGACAACAACCTTGTGCGTTTCGATTTTATTATTGGACAACTTCCGC	176821

CR450810.5	1601	CTCACAAACTTCCAAACAAACAACTTTTTATGGCATCTCTATCTTGTACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176822	CTCACAAACTTCCAAACAAACAACTTTTTATGGCATCTCTATCTTGTACA	176871

CR450810.5	1651	CATCATGCTTATTAAAAGCCTTCCAATATACTGCAGTAGGCCAAATCCTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176872	CATCATGCTTATTAAAAGCCTTCCAATATACTGCAGTAGGCCAAATCCTC	176921

CR450810.5	1701	TTTTTTTGTTGAATAATTGGTTTATAAAGGCTAGATTGTTTGCAGGTTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176922	TTTTTTTGTTGAATAATTGGTTTATAAAGGCTAGATTGTTTGCAGGTTTA	176971

CR450810.5	1751	TTTTCGACCATTTTCATTCAGACTTTTTACTTTATACAGTTCCACATACG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	176972	TTTTCGACCATTTTCATTCAGACTTTTTACTTTATACAGTTCCACATACG	177021

CR450810.5	1801	ATTTAACGGGTTAAAACAATTTTTTTGAGATGTGGACAGTAATTTATGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	177022	ATTTAACGGGTTAAAACAATTTTTTTGAGATGTGGACAGTAATTTATGTG	177071

CR450810.5	1851	TCCCAAGTTGCTAAAACATTTTTAGGACACATATATTTCACAAAAAAGTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	177072	TCCCAAGTTGCTAAAACATTTTTAGGACACATATATTTCACAAAAAAGTG	177121

CR450810.5	1901	AAAGTTGGTTGTTTTTGAGTTATTTAGAGCAAATGCGTTCTTCCGGTTTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	177122	AAAGTTGGTTGTTTTTGAGTTATTTAGAGCAAATGCGTTCTTCCGGTTTG	177171

CR450810.5	1951	AAAAGAAATTTTGAAGCTACGTTAAAATGATTAGATTCTTGTGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954851.5	177172	AAAAGAAATTTTGAAGCTACGTTAAAATGATTAGATTCTTGTGTGAATTC	177221

Overview

Query
CR450810.5 - 45749 bps
Hit
AL954851.5 - 177221 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194320001200011752221772211
290.29311041207212175139966400681
384.832245131768718199-140066405861
484.632215153322333737-140083406091
583.7134279982110099141723419981
680.861263421025910600142212425611
788.34751191063910757142569426881
880.1582192648826706181643818681
986.47412539074031-11101421102661
1096.2352106120721217711117881118931
1196.19491051207412178-11117891118931
1285.111320887808987-11197791199861
1310041853443634520-11211701212541
1410035643085830921-11211921212551
1582.311904291043510863-11424381428611
1610036751207412148-11471371472111
171003776121111218611471371472121
1810036741207312146-11586711587441
191003674120731214611586711587441
2096.393484120681215111631661632481
2197.5636831211212194-11631671632481
Short-link