<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX897737.7	1	ATAAAATAAATTAGTTATTAGAATTGAGTTATTAAAACTATTATATTTAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	113596	ATAAAATAAATTAGTTATTAGAATTGAGTTATTAAAACTATTATATTTAG	113645

BX897737.7	51	AAATGTGTTGGAAAAAAATTATTTTGTTAAACAGAAATTGAGAAAAAAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	113646	AAATGTGTTGGAAAAAAATTATTTTGTTAAACAGAAATTGAGAAAAAAAT	113695

BX897737.7	101	AAATAAACAGGGGGGGTTAATAATTCTGACTTCAACTGTATATATTATAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	113696	AAATAAACAGGGGGGGTTAATAATTCTGACTTCAACTGTATATATTATAT	113745

BX897737.7	151	AAATATATAAAGTTTATTGTGGTAAAAAATATTATAGTAATTTTAACTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	113746	AAATATATAAAGTTTATTGTGGTAAAAAATATTATAGTAATTTTAACTCT	113795

BX897737.7	201	TTTAGCACTATAATAGCATTATAATGCAAGTCCCCTCTTCCAAAAAACAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	113796	TTTAGCACTATAATAGCATTATAATGCAAGTCCCCTCTTCCAAAAAACAC	113845

BX897737.7	251	ATATTTTATTCTTGAGAATATATAGTTTGTAGTAATTCTAACAATTTAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	113846	ATATTTTATTCTTGAGAATATATAGTTTGTAGTAATTCTAACAATTTAAT	113895

BX897737.7	301	AATTTGGCATTGGAATCAGAATGTGAAAACTTATATTCTAAACAAAAAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	113896	AATTTGGCATTGGAATCAGAATGTGAAAACTTATATTCTAAACAAAAAAA	113945

BX897737.7	351	ATAAAAAAATAAATAAAACAACTGTTTAAAAAAACTGAGGCAAAAAGAAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	113946	ATAAAAAAATAAATAAAACAACTGTTTAAAAAAACTGAGGCAAAAAGAAC	113995

BX897737.7	401	TAGTGAAACCCTAACCATTCTGATACGGAACTATACGGAGATAGAGAGGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	113996	TAGTGAAACCCTAACCATTCTGATACGGAACTATACGGAGATAGAGAGGC	114045

BX897737.7	451	TTCGCATTCAGCTAAAATGTGGCTGGAATTGGTTATGTATAGGCAATATA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114046	TTCGCATTCAGCTAAAATGTGGCTGGAATTGGTTATGTATAGGCAATATA	114095

BX897737.7	501	TATTGCATTACCAAAAATGATGACATGAGAACATGTCCATGTGTTGTGGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114096	TATTGCATTACCAAAAATGATGACATGAGAACATGTCCATGTGTTGTGGG	114145

BX897737.7	551	ATATGTCGATATACTGATTATTGTGACAGACCTATAAAGAGGACATTTAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114146	ATATGTCGATATACTGATTATTGTGACAGACCTATAAAGAGGACATTTAT	114195

BX897737.7	601	GAGTCCTCACAGGGTCTTCAAGTGAACTGTACCTTTTTATGCCTTTAACG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114196	GAGTCCTCACAGGGTCTTCAAGTGAACTGTACCTTTTTATGCCTTTAACG	114245

BX897737.7	651	AGCAGTGAAGCCCATGGCTGATGCATGCTGAGACACCAGCCGCCGTCTGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114246	AGCAGTGAAGCCCATGGCTGATGCATGCTGAGACACCAGCCGCCGTCTGC	114295

BX897737.7	701	AATCTCCTGCAGCTCTTTGTCCTGCAGTCTGAGTCGGCTGCGCTCACTTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114296	AATCTCCTGCAGCTCTTTGTCCTGCAGTCTGAGTCGGCTGCGCTCACTTG	114345

BX897737.7	751	TCTCTTTACCGCTCGCTGCCTTTGATGAAGACTTACGGGAGGGATTGCTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114346	TCTCTTTACCGCTCGCTGCCTTTGATGAAGACTTACGGGAGGGATTGCTA	114395

BX897737.7	801	CTGGCCACGTCAACCCACTGACACAACACAAACACACATGAATCAACAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114396	CTGGCCACGTCAACCCACTGACACAACACAAACACACATGAATCAACAGA	114445

BX897737.7	851	CATAAACACTTCTCGAATATGAATGGCACTGATCTTACATGCACTTGAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114446	CATAAACACTTCTCGAATATGAATGGCACTGATCTTACATGCACTTGAGA	114495

BX897737.7	901	GTTTGCATGTACCTCTGGTGCAGACTGTAGAATATTGGGGTTGACGAGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114496	GTTTGCATGTACCTCTGGTGCAGACTGTAGAATATTGGGGTTGACGAGCT	114545

BX897737.7	951	CTCTGAAGTGCTGTCGATCAGCAGGAGCTGAATGTTTTGCCTTCTGGCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114546	CTCTGAAGTGCTGTCGATCAGCAGGAGCTGAATGTTTTGCCTTCTGGCCA	114595

BX897737.7	1001	AAAGAACCAGTGTTGATGGCCTTGACAGTCTCGTCAAACCTTTAATACAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114596	AAAGAACCAGTGTTGATGGCCTTGACAGTCTCGTCAAACCTTTAATACAC	114645

BX897737.7	1051	ACACACATACACAAAGTTATTGTCATGCTACACAGATTGTGCATTTTAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114646	ACACACATACACAAAGTTATTGTCATGCTACACAGATTGTGCATTTTAAT	114695

BX897737.7	1101	TAACACCTTCAAGTCATATTTAAATAATTTCAACAGCAACAGTGGGAGAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114696	TAACACCTTCAAGTCATATTTAAATAATTTCAACAGCAACAGTGGGAGAC	114745

BX897737.7	1151	ACTTCAAATTGACCATTACCGCGGTGTATGTGGCGCTGCAGCATGACTAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114746	ACTTCAAATTGACCATTACCGCGGTGTATGTGGCGCTGCAGCATGACTAC	114795

BX897737.7	1201	AGGATTAAAAACATGTTTTTAGGTGGAACAGCAGTTTCCGACTAAACCGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114796	AGGATTAAAAACATGTTTTTAGGTGGAACAGCAGTTTCCGACTAAACCGC	114845

BX897737.7	1251	CATGGGGCACAAAGGGACGGGATGCAAACAGACAGAGATATACAGTGGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114846	CATGGGGCACAAAGGGACGGGATGCAAACAGACAGAGATATACAGTGGCT	114895

BX897737.7	1301	ATAAATACCCTGCTTATTGTAAATGAAGATAAAATAACAAAATAAAACAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114896	ATAAATACCCTGCTTATTGTAAATGAAGATAAAATAACAAAATAAAACAT	114945

BX897737.7	1351	TATAATTATTTCACTAATAATTAAAACTTAACAAGCTTTATGATCATTGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114946	TATAATTATTTCACTAATAATTAAAACTTAACAAGCTTTATGATCATTGT	114995

BX897737.7	1401	AAACATGTTAAGTGCAATGATGGTTCATTTTGGATATTAAAACTAAAGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	114996	AAACATGTTAAGTGCAATGATGGTTCATTTTGGATATTAAAACTAAAGAA	115045

BX897737.7	1451	ATTAGAGGCAACTTAAATGAAAATACAAACATACATACATACATACATAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	115046	ATTAGAGGCAACTTAAATGAAAATACAAACATACATACATACATACATAC	115095

BX897737.7	1501	ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACACAAATAAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	115096	ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACACAAATAAAC	115145

BX897737.7	1551	AAATAAATAAAACAGTTTTTTAGCCTAAATATAGAGACATGTATCAGTGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	115146	AAATAAATAAAACAGTTTTTTAGCCTAAATATAGAGACATGTATCAGTGG	115195

BX897737.7	1601	TTGTTATTTTAAAGTGATAGGACTAAGTAAGTCAATAAATAAGCTTTTTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	115196	TTGTTATTTTAAAGTGATAGGACTAAGTAAGTCAATAAATAAGCTTTTTC	115245

BX897737.7	1651	ATTTACATTTGCTTTGTTGATAATATTTGACTTTCTCATTTTATGTCTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	115246	ATTTACATTTGCTTTGTTGATAATATTTGACTTTCTCATTTTATGTCTTA	115295

BX897737.7	1701	ATTATTGTACATAATTAGGGTTTCTGCAGGTTTCATCAAGTCAAAAGACT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	115296	ATTATTGTACATAATTAGGGTTTCTGCAGGTTTCATCAAGTCAAAAGACT	115345

BX897737.7	1751	TTTTTTAGACCCTTTTAAGACCATTATGAATGAAATTTTAGACTCATACA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	115346	TTTTTTAGACCCTTTTAAGACCATTATGAATGAAATTTTAGACTCATACA	115395

BX897737.7	1801	GAGCTAAACACTAAGGATTTTCTATAATGGCCTGGTTGGGCCAATGGATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	115396	GAGCTAAACACTAAGGATTTTCTATAATGGCCTGGTTGGGCCAATGGATT	115445

BX897737.7	1851	TTTTTTTGCTTGCCACAAAAAAAAATCTAATGTAATTATTTTTTAGCGAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	115446	TTTTTTTGCTTGCCACAAAAAAAAATCTAATGTAATTATTTTTTAGCGAC	115495

BX897737.7	1901	ATACTTTAATGTGTCAAAACAAGAAAACTCTAGTTGTATACACTATTTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	115496	ATACTTTAATGTGTCAAAACAAGAAAACTCTAGTTGTATACACTATTTTT	115545

BX897737.7	1951	AACATAATAATACTTTCCTTTTTTTAAATTATAACTCAAATTTAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954318.5	115546	AACATAATAATACTTTCCTTTTTTTAAATTATAACTCAAATTTAGAATTC	115595

Overview

Query
BX897737.7 - 64259 bps
Hit
AL954318.5 - 115595 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100190720001200011135961155951
291.34931275682856954115235153611
385.081092671599116257-116796170631
489.871312214016140381116838170641
590.451191962093321128116866170641
689.74401173239432510117133172491
793.08511303237932508117154172831
898.4131631579815860-124229242911
994.4371083694237049-124231243371
1094.4381083696237069124231243371
1110033675673456800-124242243081
1297.435775673456810124243243191
1382.3923256887479314135584361281
1493.23561333237832510146944470761
1594.93571383237332510146993471301
1689.1430547589669440165233657111
1710034353997140005181292813261
1886.0888163330783324011073251074821
1985.41791812094621126-11078891080731
2080.97953251605416378-11132551135851
Short-link