<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1999 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX119920.7	2	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGATTGAAAAATTGTTGATATGTC	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	150708	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGATTGAAAAATTGTTGATATGTC	150757

BX119920.7	52	TGTTGCTCCCTTTACCCTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTATTCTGT	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	150758	TGTTGCTCCCTTTACCCTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTATTCTGT	150807

BX119920.7	102	TAATCTTAAGACAATAAAACGTTGATCACAAAAAAGGGGAGATAAAGAAA	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	150808	TAATCTTAAGACAATAAAACGTTGATCACAAAAAAGGGGAGATAAAGAAA	150857

BX119920.7	152	TGCAAAAAAAAGTCCCCTTTCCAGATTTGGGTCTCCCCTTCATTGCAAGT	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	150858	TGCAAAAAAAAGTCCCCTTTCCAGATTTGGGTCTCCCCTTCATTGCAAGT	150907

BX119920.7	202	CCATGGCAGCTTTATCCAAGACCACCAGGAGGGGAAATGTACGGAAAGTG	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	150908	CCATGGCAGCTTTATCCAAGACCACCAGGAGGGGAAATGTACGGAAAGTG	150957

BX119920.7	252	TCCACAACCAAAAAGAACATCTTTCAAGTTCACAGCAAAAATAGTATACA	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	150958	TCCACAACCAAAAAGAACATCTTTCAAGTTCACAGCAAAAATAGTATACA	151007

BX119920.7	302	TCAAGCCACTTGCTAAAATGTAAACTTAAAGGTTAGTGGTTGGGTTCAAC	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151008	TCAAGCCACTTGCTAAAATGTAAACTTAAAGGTTAGTGGTTGGGTTCAAC	151057

BX119920.7	352	AGAGAGTATGAGCAACAGCAGCAGTGACGCTTGCCTTAGCTAATAATGAA	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151058	AGAGAGTATGAGCAACAGCAGCAGTGACGCTTGCCTTAGCTAATAATGAA	151107

BX119920.7	402	ATGCAGCGAGGCCCAAAGGAGGCGTCCTGGCTGTAGAGCGAGGTGTCAGA	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151108	ATGCAGCGAGGCCCAAAGGAGGCGTCCTGGCTGTAGAGCGAGGTGTCAGA	151157

BX119920.7	452	ATAGAGAGTACAAGCGCTCCAGGTCTGATATGAAGGCGTTATATTCGCTT	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151158	ATAGAGAGTACAAGCGCTCCAGGTCTGATATGAAGGCGTTATATTCGCTT	151207

BX119920.7	502	GGACAGGAAAGCTCGCCACCTTTGGATTGGCTTGTCACAAATCTCCCACC	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151208	GGACAGGAAAGCTCGCCACCTTTGGATTGGCTTGTCACAAATCTCCCACC	151257

BX119920.7	552	ACCGACAGCATTAAAACAGTTAGTGCTGCTGCCATGATAATCGCGTTCTC	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151258	ACCGACAGCATTAAAACAGTTAGTGCTGCTGCCATGATAATCGCGTTCTC	151307

BX119920.7	602	TCTTTCCATCCCACCACACAACTTTCCGACACGTACAATCGACCGGGTCA	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151308	TCTTTCCATCCCACCACACAACTTTCCGACACGTACAATCGACCGGGTCA	151357

BX119920.7	652	CCGCAGACACACGTACACCCTGACACCTCAGCCACAGCACATCTGAGCAG	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151358	CCGCAGACACACGTACACCCTGACACCTCAGCCACAGCACATCTGAGCAG	151407

BX119920.7	702	AGCTTGTTTTGCTCGTCTCAGGAGGGTTAAAATTGTGTGTCTGTGTCTGC	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151408	AGCTTGTTTTGCTCGTCTCAGGAGGGTTAAAATTGTGTGTCTGTGTCTGC	151457

BX119920.7	752	GCCGTCTCCTCCCTTTCCCCTCCTGCTCATCTGCCACAAACTAAATGATC	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151458	GCCGTCTCCTCCCTTTCCCCTCCTGCTCATCTGCCACAAACTAAATGATC	151507

BX119920.7	802	CTTTCATTTCCTGCCGGGCCGCTGGGCCCTGAGGTGGCGGCCACGGTCGG	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151508	CTTTCATTTCCTGCCGGGCCGCTGGGCCCTGAGGTGGCGGCCACGGTCGG	151557

BX119920.7	852	ACTCGGCGGCTCTGCTCCCATGTGAAGTTCACAGCTCTTCCTCTTAGCTG	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151558	ACTCGGCGGCTCTGCTCCCATGTGAAGTTCACAGCTCTTCCTCTTAGCTG	151607

BX119920.7	902	CTGATCCACTATCATAACAGAGCTTAGCATGGCACTTCCTGTCTGGGACA	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151608	CTGATCCACTATCATAACAGAGCTTAGCATGGCACTTCCTGTCTGGGACA	151657

BX119920.7	952	GAATCGCGTGAGCTTTGCCACGTCTCGGGCATATCTTCACCTGTGTGAGA	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151658	GAATCGCGTGAGCTTTGCCACGTCTCGGGCATATCTTCACCTGTGTGAGA	151707

BX119920.7	1002	AGCAGCAGTGACTGAATTCACTGCATGGGTACTTGCACACACATAGGTAA	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151708	AGCAGCAGTGACTGAATTCACTGCATGGGTACTTGCACACACATAGGTAA	151757

BX119920.7	1052	ACAAAACGAACACAAAAAAGGACACAATGGTGCTAAATGACACACATACT	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151758	ACAAAACGAACACAAAAAAGGACACAATGGTGCTAAATGACACACATACT	151807

BX119920.7	1102	CACAAACCCCATTCCTCTGAGGCCTGACTCCAGAACTGACTTAGGAAGTA	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151808	CACAAACCCCATTCCTCTGAGGCCTGACTCCAGAACTGACTTAGGAAGTA	151857

BX119920.7	1152	ACTTAATGGTTACCAAACCTTTAGGGGGACTGGGTGAGCGGCGTTGGGCT	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151858	ACTTAATGGTTACCAAACCTTTAGGGGGACTGGGTGAGCGGCGTTGGGCT	151907

BX119920.7	1202	AAACATGTGTTTAGAGCAGACAACATCAGCAATCACCACTTGACCCCTCA	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151908	AAACATGTGTTTAGAGCAGACAACATCAGCAATCACCACTTGACCCCTCA	151957

BX119920.7	1252	GCAGAAAAAGGGTCACATACCACTCCCCCTTTCTTCAAGTGCTCAAAGAA	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	151958	GCAGAAAAAGGGTCACATACCACTCCCCCTTTCTTCAAGTGCTCAAAGAA	152007

BX119920.7	1302	AAAACGAGAGGAAAAAATGTTTAACAGATAATATAATCAAGTGAAAGCGC	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152008	AAAACGAGAGGAAAAAATGTTTAACAGATAATATAATCAAGTGAAAGCGC	152057

BX119920.7	1352	TCGCCTGTAGTGAAGGGACTGCAACCATGCTGATTCCCATATGTTGGAAA	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152058	TCGCCTGTAGTGAAGGGACTGCAACCATGCTGATTCCCATATGTTGGAAA	152107

BX119920.7	1402	TACACAGAGCAAGGTCCAGAGGCTCCATCAGGGATTTCTCAGGCCTCAAA	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152108	TACACAGAGCAAGGTCCAGAGGCTCCATCAGGGATTTCTCAGGCCTCAAA	152157

BX119920.7	1452	GGGACGAAAACACACACACATACACGTATACACACATATAGCCATGCTTT	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152158	GGGACGAAAACACACACACATACACGTATACACACATATAGCCATGCTTT	152207

BX119920.7	1502	ACATAGGAGAAATGCTATTTTTGTATCTGTAAATAGCAAATAGAAGGTAA	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152208	ACATAGGAGAAATGCTATTTTTGTATCTGTAAATAGCAAATAGAAGGTAA	152257

BX119920.7	1552	GATGAAAAAAATCTATATAAAATTAAATCTATATAAATTTAAATTAAGAG	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152258	GATGAAAAAAATCTATATAAAATTAAATCTATATAAATTTAAATTAAGAG	152307

BX119920.7	1602	TGTCGCGGTGGGGCAGTGGGTACCACGATCGCCTCACAGCAAGAAGGTTG	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152308	TGTCGCGGTGGGGCAGTGGGTACCACGATCGCCTCACAGCAAGAAGGTTG	152357

BX119920.7	1652	CTGGTTCGAGCCTCGGCTGAGTTGGTGGTCATTTCTGTGTGGAGTTTGCA	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152358	CTGGTTCGAGCCTCGGCTGAGTTGGTGGTCATTTCTGTGTGGAGTTTGCA	152407

BX119920.7	1702	TCTGTGGGTTTCCTCTGGATGCTTTGGTTTCCCCCACAAGTCTGTGGTAC	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152408	TCTGTGGGTTTCCTCTGGATGCTTTGGTTTCCCCCACAAGTCTGTGGTAC	152457

BX119920.7	1752	AGGTAAATTGGGTAAGCTAAATTGTTTGTGGTGTTTGTGTGTGAACAAGT	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152458	AGGTAAATTGGGTAAGCTAAATTGTTTGTGGTGTTTGTGTGTGAACAAGT	152507

BX119920.7	1802	GTGTATGGATGTCTCCCAGTGTTGGGTTGCAGCTGAAAGGACATTCGCTG	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152508	GTGTATGGATGTCTCCCAGTGTTGGGTTGCAGCTGAAAGGACATTCGCTG	152557

BX119920.7	1852	TGTAAAACATATGCTGGATATGTTGGCGGTTTATTCCGTTGTGGCGACCT	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152558	TGTAAAACATATGCTGGATATGTTGGCGGTTTATTCCGTTGTGGCGACCT	152607

BX119920.7	1902	TAGATTAATGAAGGGACTAAGCCGAAAAGAAATGAATGAATGCATTTTAA	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152608	TAGATTAATGAAGGGACTAAGCCGAAAAGAAATGAATGAATGCATTTTAA	152657

BX119920.7	1952	ATTAAAATGGTTAGTCACTGGTGAATAATTGTATTTACATGGCAAGCTT	2000
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935302.7	152658	ATTAAAATGGTTAGTCACTGGTGAATAATTGTATTTACATGGCAAGCTT	152706

Overview

Query
BX119920.7 - 123713 bps
Hit
AL935302.7 - 152706 bps
Total alignments
25
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1999 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100199019992200011507081527061
295.58521138713187243-115938160501
310052108113992114099115944160511
488.27931621013010291117252174131
587.2353948897889071-117313174061
689.78111185107839108023119464196491
788.081041927706777258119465196571
882.251644382707527512-128072285161
983.651463647706777430128172285441
1082.82145417107777108193-146820472381
1184.55932147706977282-146970471761
1283.141002592720027458146970472181
1381.74672192582426042-161914621321
1485.95811854411144295161955621391
1588.1741273319833324-163514636391
1683.68932042141221615163514637091
1785.51751402155021689-166253663901
1896.6457149113970114118170063702111
1986.361282442144221685173382736231
2086.03711352507125205173489736241
2179.27611643323233395-11011731013361
2281.7553126838518397611367521368771
2380.4961168840008416711368801370431
2481.35882567250772762-11414051416561
2580.3478311202422055211462031465021
Short-link