<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929573.13	1	TGTCTGGATTAAAATAAGGGATTGTAGAGAACAAGGTTCTTATTATGTAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93361	TGTCTGGATTAAAATAAGGGATTGTAGAGAACAAGGTTCTTATTATGTAG	93410

AL929573.13	51	ATGAAGTCTCATAAGTGGTCACCCTTACAAGCAATAGATGGGAAATATTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93411	ATGAAGTCTCATAAGTGGTCACCCTTACAAGCAATAGATGGGAAATATTT	93460

AL929573.13	101	TGTATTCAGACCTTTAAAAGGTACTGGACTCTCAACTAAACTCTTCAGGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93461	TGTATTCAGACCTTTAAAAGGTACTGGACTCTCAACTAAACTCTTCAGGA	93510

AL929573.13	151	TCAGAAAAAGACCTGGAAAGCAAAGGCGATTCGCTACAGAATGTAAATTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93511	TCAGAAAAAGACCTGGAAAGCAAAGGCGATTCGCTACAGAATGTAAATTT	93560

AL929573.13	201	CCCCCACCAGAAGCAGCTTTGCAGGGACATACTCTCCTCCCTTTGGAATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93561	CCCCCACCAGAAGCAGCTTTGCAGGGACATACTCTCCTCCCTTTGGAATT	93610

AL929573.13	251	CAGGCATAACTTACCAGCATTATTAACTTTAAAACAGAGATCTTAATTAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93611	CAGGCATAACTTACCAGCATTATTAACTTTAAAACAGAGATCTTAATTAA	93660

AL929573.13	301	GACTGACAAAACAGATTCCTTATAGCAATAACATACCAAATTGCAACCTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93661	GACTGACAAAACAGATTCCTTATAGCAATAACATACCAAATTGCAACCTG	93710

AL929573.13	351	ACTCTAGTATAGCATCACATGATAGATAGCCAGTCCTGAAAGAAATCAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93711	ACTCTAGTATAGCATCACATGATAGATAGCCAGTCCTGAAAGAAATCAAA	93760

AL929573.13	401	GTATTTTACCCCAAAATAGATTTCTTTGACACCTTTTGGAATGCCTTTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93761	GTATTTTACCCCAAAATAGATTTCTTTGACACCTTTTGGAATGCCTTTGA	93810

AL929573.13	451	AAAGCTGTTGAAGTGGCATCGTTGTCTGGGGTAAATACCCAGGGTTCATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93811	AAAGCTGTTGAAGTGGCATCGTTGTCTGGGGTAAATACCCAGGGTTCATC	93860

AL929573.13	501	GTCTTGCACTAAGAAGATTAAGGACACGGACACATGTGGGTGTGTTAAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93861	GTCTTGCACTAAGAAGATTAAGGACACGGACACATGTGGGTGTGTTAAGG	93910

AL929573.13	551	AGCAGAGAGTTTAACAGGCAGAAGAAAGGAGAGAGGCAAGCAGCTCTCTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93911	AGCAGAGAGTTTAACAGGCAGAAGAAAGGAGAGAGGCAAGCAGCTCTCTC	93960

AL929573.13	601	TCTCTCTCTCCCTCGTGAGAAAGAAGTTTTTGAAAGGGAAACAACTGGCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	93961	TCTCTCTCTCCCTCGTGAGAAAGAAGTTTTTGAAAGGGAAACAACTGGCT	94010

AL929573.13	651	TGCGGCAGACCACAGCAGATTTTATAGGCAAGCTTGAGGAGGAGCCGGTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94011	TGCGGCAGACCACAGCAGATTTTATAGGCAAGCTTGAGGAGGAGCCGGTG	94060

AL929573.13	701	TCTGATTTACACAGGGTCACAGATTGGTTCTACCAGGTGTGACATTTACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94061	TCTGATTTACACAGGGTCACAGATTGGTTCTACCAGGTGTGACATTTACA	94110

AL929573.13	751	TAGCCCGCAGGGAAGTCTGGTTGACCCACCTTAATCTTATGGCCAGCACC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94111	TAGCCCGCAGGGAAGTCTGGTTGACCCACCTTAATCTTATGGCCAGCACC	94160

AL929573.13	801	ATCTTGTCTGCTCCTTATTCTACACGTGGCTGACAAAGAGAAGGGAAGAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94161	ATCTTGTCTGCTCCTTATTCTACACGTGGCTGACAAAGAGAAGGGAAGAT	94210

AL929573.13	851	GGAGCCACCATTTTGATCATGCTTAATCCCAGGTAGCCTTTTTCTATTAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94211	GGAGCCACCATTTTGATCATGCTTAATCCCAGGTAGCCTTTTTCTATTAG	94260

AL929573.13	901	CACAACTGCCAGCATTGATCAATGCAAACTTCCTGTTTGCTTGTCTATGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94261	CACAACTGCCAGCATTGATCAATGCAAACTTCCTGTTTGCTTGTCTATGT	94310

AL929573.13	951	CTGCAGCTAGATTCTATACAGGCTGCTCTTTGTTAGAAAAAATGATTTGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94311	CTGCAGCTAGATTCTATACAGGCTGCTCTTTGTTAGAAAAAATGATTTGG	94360

AL929573.13	1001	GGGCTGCTTTTTATTAAAAGGAAAACCTTACCCAGGAAGGATTTCCTTAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94361	GGGCTGCTTTTTATTAAAAGGAAAACCTTACCCAGGAAGGATTTCCTTAC	94410

AL929573.13	1051	CCTCACTATCTGCCTAAATAATTTGTTTATAACACCTATATTATTGTTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94411	CCTCACTATCTGCCTAAATAATTTGTTTATAACACCTATATTATTGTTTC	94460

AL929573.13	1101	TTGTGGGGAAAATCTACATTCTGTATAGAATTCGCTACCCTTTCCAGGTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94461	TTGTGGGGAAAATCTACATTCTGTATAGAATTCGCTACCCTTTCCAGGTC	94510

AL929573.13	1151	TTTTCCAGATCCAGGAGAGATTTAACTAATAGTCTGACACTTTTTAAGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94511	TTTTCCAGATCCAGGAGAGATTTAACTAATAGTCTGACACTTTTTAAGAT	94560

AL929573.13	1201	CTCATAAGAGACATTTACTACTTAATTTTTTCTGAAGCCTGCCACCTGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94561	CTCATAAGAGACATTTACTACTTAATTTTTTCTGAAGCCTGCCACCTGAA	94610

AL929573.13	1251	GACTTTATTTACATAACAAGAACCTTGGCTTCCACAACTCCCCCTATCTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94611	GACTTTATTTACATAACAAGAACCTTGGCTTCCACAACTCCCCCTATCTT	94660

AL929573.13	1301	AAACCCAAGCATTTCTGCTGACTTCGACTTTTTTTTTTCTAATAAAAACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94661	AAACCCAAGCATTTCTGCTGACTTCGACTTTTTTTTTTCTAATAAAAACT	94710

AL929573.13	1351	TTATTTTAGGTTCAGGGGTACGTGTGAAGGTTTGTTACAGAAGGGAAACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94711	TTATTTTAGGTTCAGGGGTACGTGTGAAGGTTTGTTACAGAAGGGAAACT	94760

AL929573.13	1401	GTGTCACAGGGGTTTGTTGTACAGATTATTTCATCACCCATGTATTATGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94761	GTGTCACAGGGGTTTGTTGTACAGATTATTTCATCACCCATGTATTATGC	94810

AL929573.13	1451	TCAGTATCCAATAGTTATCTTTTTCCCCTCCTACCCCTTCTCCCACCTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94811	TCAGTATCCAATAGTTATCTTTTTCCCCTCCTACCCCTTCTCCCACCTTC	94860

AL929573.13	1501	CACCCTCAAGAAAATCTGTTTCTGTTTTTTCCTTCTTTGTGTTTATGAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94861	CACCCTCAAGAAAATCTGTTTCTGTTTTTTCCTTCTTTGTGTTTATGAGT	94910

AL929573.13	1551	TCTCATAATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGTGGTATTTATTTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94911	TCTCATAATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGTGGTATTTATTTA	94960

AL929573.13	1601	TTTGTTCCTGCATTAGTTAGCTAAGGATAATGGCCTCTAGCTCCATCCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	94961	TTTGTTCCTGCATTAGTTAGCTAAGGATAATGGCCTCTAGCTCCATCCAT	95010

AL929573.13	1651	GCTCCCACAAAATACATGATCTTTTTTTTATAGCTGTATATACCACATTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	95011	GCTCCCACAAAATACATGATCTTTTTTTTATAGCTGTATATACCACATTT	95060

AL929573.13	1701	TTAAAATCTAATTTGTCATTGGTAGGCATTTAGGTTGATTCCATGTCTTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	95061	TTAAAATCTAATTTGTCATTGGTAGGCATTTAGGTTGATTCCATGTCTTG	95110

AL929573.13	1751	CTTTTCTGGATAGTGCTGTGATGAACATTTACCTGCACATGTGCTGTATC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	95111	CTTTTCTGGATAGTGCTGTGATGAACATTTACCTGCACATGTGCTGTATC	95160

AL929573.13	1801	CTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGATGTCACTCTCTCGCCCAGGCTGCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	95161	CTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGATGTCACTCTCTCGCCCAGGCTGCG	95210

AL929573.13	1851	GCGCAGTGGCACAATCATGGCTCACTGCAGTCTTGACCTCCCCAGTCTCG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	95211	GCGCAGTGGCACAATCATGGCTCACTGCAGTCTTGACCTCCCCAGTCTCG	95260

AL929573.13	1901	GGTGATCCTCCCATCTCAGCTTCCCTGGTAGCTGGGACCACAGGCATGCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	95261	GGTGATCCTCCCATCTCAGCTTCCCTGGTAGCTGGGACCACAGGCATGCA	95310

AL929573.13	1951	CCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAAATGCGGTTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935156.4	95311	CCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAAATGCGGTTTGGCC	95360

Overview

Query
AL929573.13 - 15171 bps
Hit
AL935156.4 - 95360 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link