<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1342 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

  BX000446.6	1	GAATTCAATGCCAAGCCACATCTTTCTTGTGCTTTAAATTCTTAATTCTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	1342	GAATTCAATGCCAAGCCACATCTTTCTTGTGCTTTAAATTCTTAATTCTC	1293

  BX000446.6	51	ATTTTTTATGCATTTCATCTTATTTTCTTTTCTTTGTTTTATGTACAGTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	1292	ATTTTTTATGCATTTCATCTTATTTTCTTTTCTTTGTTTTATGTACAGTA	1243

  BX000446.6	101	CTTTGGCGTCTAAGGATGATCCATGTGCTTTAATGTGGCAAATGAATTCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	1242	CTTTGGCGTCTAAGGATGATCCATGTGCTTTAATGTGGCAAATGAATTCA	1193

  BX000446.6	151	ATTGAATTAATCAACTGAAGAGGTCTCTGCGGTATTAAGGTATACATTAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	1192	ATTGAATTAATCAACTGAAGAGGTCTCTGCGGTATTAAGGTATACATTAG	1143

  BX000446.6	201	TATTTAATAAGTGGTAGTCTAAATGTGAGACAAAACCTTTGATCAACTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	1142	TATTTAATAAGTGGTAGTCTAAATGTGAGACAAAACCTTTGATCAACTGG	1093

  BX000446.6	251	GCATTATGCGGCTGTGCATTATACTTATAACTATATATTTCACTTTATTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	1092	GCATTATGCGGCTGTGCATTATACTTATAACTATATATTTCACTTTATTC	1043

  BX000446.6	301	ATAGAGCACTTTAAAAACACAGAAGTGAACCAACGTGCTGTACAGAAATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	1042	ATAGAGCACTTTAAAAACACAGAAGTGAACCAACGTGCTGTACAGAAATA	993

  BX000446.6	351	TACAACAAAATAATAATAATATATAAAATACAAGATAAAAAATAGCTAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	992	TACAACAAAATAATAATAATATATAAAATACAAGATAAAAAATAGCTAAA	943

  BX000446.6	401	CTACCTAAAAAGGCATATAAATTTAAACGACCAGTTAGTTAGATAGTAGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	942	CTACCTAAAAAGGCATATAAATTTAAACGACCAGTTAGTTAGATAGTAGC	893

  BX000446.6	451	TATTTATATTGTTCTGGTGTGAAGAAGGTGGAGTCTCAGAGCTACAACTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	892	TATTTATATTGTTCTGGTGTGAAGAAGGTGGAGTCTCAGAGCTACAACTA	843

  BX000446.6	501	CTCATTACGTAACTACCATGGACCAATGGCTGTTTGCAGGTGTTTTCCAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	842	CTCATTACGTAACTACCATGGACCAATGGCTGTTTGCAGGTGTTTTCCAA	793

  BX000446.6	551	ACTAAGCTAAATTTTCTGGAAAATTTGATTTGGCAAGCTGATTTGAACTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	792	ACTAAGCTAAATTTTCTGGAAAATTTGATTTGGCAAGCTGATTTGAACTA	743

  BX000446.6	601	CTAAAATGATCCTAGTTTTGGCCAGATTTTGTCTGAAATGGGCCTTAATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	742	CTAAAATGATCCTAGTTTTGGCCAGATTTTGTCTGAAATGGGCCTTAATA	693

  BX000446.6	651	TGCAGGATATCGAAAGTATGAGGAATAAGAAACATGATACTTGCCTTAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	692	TGCAGGATATCGAAAGTATGAGGAATAAGAAACATGATACTTGCCTTAAT	643

  BX000446.6	701	TCAATTTACTCACTGACATTATATAACAGGTTGCTAAACAGGTCTTCATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	642	TCAATTTACTCACTGACATTATATAACAGGTTGCTAAACAGGTCTTCATT	593

  BX000446.6	751	TACTGTATAATCCAAAAGTGCCTGTTTGTTTTCTGCACTCGTGAAATGGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	592	TACTGTATAATCCAAAAGTGCCTGTTTGTTTTCTGCACTCGTGAAATGGA	543

  BX000446.6	801	CCTTTCTTCTGAGAAAAATCATAAAGGGAGATCATACCGAAGCGTCATTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	542	CCTTTCTTCTGAGAAAAATCATAAAGGGAGATCATACCGAAGCGTCATTT	493

  BX000446.6	851	CGCAAAGCCGTCGATTCTGTCCAACAGTCAGCAGACTGGGAATTCAGGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	492	CGCAAAGCCGTCGATTCTGTCCAACAGTCAGCAGACTGGGAATTCAGGGT	443

  BX000446.6	901	AGGCCACACTAAACAGCCCAGCGCATCTGGCAACCTCATCAGTAATTCTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	442	AGGCCACACTAAACAGCCCAGCGCATCTGGCAACCTCATCAGTAATTCTA	393

  BX000446.6	951	AGAACTCATAAACTGACCAGAGATCAGTCAACACTGGGAGAAATTCCTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	392	AGAACTCATAAACTGACCAGAGATCAGTCAACACTGGGAGAAATTCCTTG	343

  BX000446.6	1001	AAATAACACCCACTAGCACCAAGCATGCAATTAATTAGGAAAACACACAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	342	AAATAACACCCACTAGCACCAAGCATGCAATTAATTAGGAAAACACACAG	293

  BX000446.6	1051	AAACTGTTTGCTGCTGATGGAACTTCCTCTCTGAAGTTCACCAGTTTGCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	292	AAACTGTTTGCTGCTGATGGAACTTCCTCTCTGAAGTTCACCAGTTTGCT	243

  BX000446.6	1101	CAAGGGAACAGACAAAGACAATGGGGTCGGGTTTATTCATTTCATAACCG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	242	CAAGGGAACAGACAAAGACAATGGGGTCGGGTTTATTCATTTCATAACCG	193

  BX000446.6	1151	AAGAATGAAAGGTTAAAAAAAGGCAGTTCAAAAATAGGAATGTAAACTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	192	AAGAATGAAAGGTTAAAAAAAGGCAGTTCAAAAATAGGAATGTAAACTGG	143

  BX000446.6	1201	CATCCAGGCAGCGTGATTTGCTAATGAGAACATTTGGATGGGAGGATTAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	142	CATCCAGGCAGCGTGATTTGCTAATGAGAACATTTGGATGGGAGGATTAT	93

  BX000446.6	1251	ATAAGCAGGTGTGAAACAGTTTAGAGTGCATTCGCCCATTCTTACCTAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	92	ATAAGCAGGTGTGAAACAGTTTAGAGTGCATTCGCCCATTCTTACCTAAG	43

  BX000446.6	1301	GTGCAGGTCCTCCGAGTATTTCAGACAGGCGTAGATGAATTC	1342
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL935122.10	42	GTGCAGGTCCTCCGAGTATTTCAGACAGGCGTAGATGAATTC	1

Overview

Query
BX000446.6 - 160002 bps
Hit
AL935122.10 - 198363 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1342 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link