<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX072574.7	1	TATTTTATGAAACTTAAAAGGACATTTTACTAATAAATGTAAATTATGTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155257	TATTTTATGAAACTTAAAAGGACATTTTACTAATAAATGTAAATTATGTC	155306

BX072574.7	51	AGCATTTACTCATCCTGGAATTGTTAGCTTACATTTCTCTATACAATAGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155307	AGCATTTACTCATCCTGGAATTGTTAGCTTACATTTCTCTATACAATAGC	155356

BX072574.7	101	ACTGATCAGTGACCAGCAGGTTTATTTTTAAGATGAAAATATATTAAAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155357	ACTGATCAGTGACCAGCAGGTTTATTTTTAAGATGAAAATATATTAAAGA	155406

BX072574.7	151	ATGGTCTTAAGTTACCCTTGGATGCTATTTCAAGTGTTCTGAAGGTATAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155407	ATGGTCTTAAGTTACCCTTGGATGCTATTTCAAGTGTTCTGAAGGTATAC	155456

BX072574.7	201	GATGGAGTTTGGTGGGAGAAAAACAATTAAAATCTAATAATTTTTAATTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155457	GATGGAGTTTGGTGGGAGAAAAACAATTAAAATCTAATAATTTTTAATTA	155506

BX072574.7	251	AATAATTTTTTATATATATTAAATGTTTATTTAGTAACAAAAGGGTATGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155507	AATAATTTTTTATATATATTAAATGTTTATTTAGTAACAAAAGGGTATGT	155556

BX072574.7	301	TTTTAATGGATAAAGGCAAGGCTTGTTTCAAATACATTGTATACCAAAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155557	TTTTAATGGATAAAGGCAAGGCTTGTTTCAAATACATTGTATACCAAAAA	155606

BX072574.7	351	GTTTGGAAGCATGTCAGTTCTGTCATTTTGTATTATTATAGTGACACCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155607	GTTTGGAAGCATGTCAGTTCTGTCATTTTGTATTATTATAGTGACACCTG	155656

BX072574.7	401	GTGTCTGGATACTGTCTTTACAGTCACCCACTGATCAATGTGAGTTTAGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155657	GTGTCTGGATACTGTCTTTACAGTCACCCACTGATCAATGTGAGTTTAGA	155706

BX072574.7	451	TCCAGGTCTTACCCAGTGTTTGTGCATTACATGCTGTGACACCCCGAGAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155707	TCCAGGTCTTACCCAGTGTTTGTGCATTACATGCTGTGACACCCCGAGAC	155756

BX072574.7	501	ATAGGGCAGAAAAATGCAAGATGAAAGAGATGAAGAAGGTCAGGAAATGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155757	ATAGGGCAGAAAAATGCAAGATGAAAGAGATGAAGAAGGTCAGGAAATGT	155806

BX072574.7	551	CAGAAATCCAGTCCACACATCCCAGTAACATAAACGGAAGTTTTATCCGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155807	CAGAAATCCAGTCCACACATCCCAGTAACATAAACGGAAGTTTTATCCGT	155856

BX072574.7	601	CTTTCAGTTTGGCATTTACTCATTTCCAGCATTGCAGTAATGCAGCTCTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155857	CTTTCAGTTTGGCATTTACTCATTTCCAGCATTGCAGTAATGCAGCTCTC	155906

BX072574.7	651	CAACCCCCAGTCCATCTGTCTCCTACCATTAACCTCAGCTTCATTTTGCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155907	CAACCCCCAGTCCATCTGTCTCCTACCATTAACCTCAGCTTCATTTTGCC	155956

BX072574.7	701	CTCGGCAACGAGTCATAATTGTACATCCTCCCCCTGGTCCAGGTCACCTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	155957	CTCGGCAACGAGTCATAATTGTACATCCTCCCCCTGGTCCAGGTCACCTA	156006

BX072574.7	751	ATCAGGACAGCACTCTAAAACCTCCCACATCTTCACATCTCACTTCCACT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156007	ATCAGGACAGCACTCTAAAACCTCCCACATCTTCACATCTCACTTCCACT	156056

BX072574.7	801	TACATTCCCTCGCTGCACAAAACCAGAGAGATGACATGATTGCATGAGTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156057	TACATTCCCTCGCTGCACAAAACCAGAGAGATGACATGATTGCATGAGTG	156106

BX072574.7	851	GCCAAATAACAGCAATCACGCTAGTGGTTTTTCCACGAAATTGAGAGAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156107	GCCAAATAACAGCAATCACGCTAGTGGTTTTTCCACGAAATTGAGAGAAT	156156

BX072574.7	901	TGTACAAATAGTACTTTGACTTTTAAGGGTCTGAATTTGTGCCCTAAGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156157	TGTACAAATAGTACTTTGACTTTTAAGGGTCTGAATTTGTGCCCTAAGAT	156206

BX072574.7	951	AGACGATCGAAAGCAGCGTTTCCTAATCACTTTGCAACCAGGATCCAGAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156207	AGACGATCGAAAGCAGCGTTTCCTAATCACTTTGCAACCAGGATCCAGAT	156256

BX072574.7	1001	TTTGTATTTTTATATATGCGGAAATAATATTTATCTTTGATGCAAATGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156257	TTTGTATTTTTATATATGCGGAAATAATATTTATCTTTGATGCAAATGAA	156306

BX072574.7	1051	CTAGTATTTATTAGGATTATGGGTGTTTGTTTACTTTTGGATTTCCTTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156307	CTAGTATTTATTAGGATTATGGGTGTTTGTTTACTTTTGGATTTCCTTTT	156356

BX072574.7	1101	TTAATCACAGTTCAGGAGGACAATTTACTAATTTCAACAGTGTGATTAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156357	TTAATCACAGTTCAGGAGGACAATTTACTAATTTCAACAGTGTGATTAAT	156406

BX072574.7	1151	CTTGCACCCATAGTTGGAATGGATACCAACAACAAAATACATACATTTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156407	CTTGCACCCATAGTTGGAATGGATACCAACAACAAAATACATACATTTCT	156456

BX072574.7	1201	CCTATATTTAAAATATTTCTTGCTCATGTACATACTGTATACATTAGCAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156457	CCTATATTTAAAATATTTCTTGCTCATGTACATACTGTATACATTAGCAT	156506

BX072574.7	1251	AAACTACATACCATTTAAAAGTTTCAATTACCTTTTCAGCAAGTAATTAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156507	AAACTACATACCATTTAAAAGTTTCAATTACCTTTTCAGCAAGTAATTAA	156556

BX072574.7	1301	AATAAATAAATAAATGAAAAAATATATATCCATCATTATACAGTGTTCAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156557	AATAAATAAATAAATGAAAAAATATATATCCATCATTATACAGTGTTCAG	156606

BX072574.7	1351	CATAATTGAGTACACTCTATTTTGAAAATGAATATTTTTATCCATTTCTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156607	CATAATTGAGTACACTCTATTTTGAAAATGAATATTTTTATCCATTTCTC	156656

BX072574.7	1401	AGTGAATTTAGCCAAGGTATTTTGGTGCATTTAATCAAAACAGATTTATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156657	AGTGAATTTAGCCAAGGTATTTTGGTGCATTTAATCAAAACAGATTTATT	156706

BX072574.7	1451	AAACAGATATATATTTATTTATTAAAATAATATTTAAGTCACCAAACATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156707	AAACAGATATATATTTATTTATTAAAATAATATTTAAGTCACCAAACATA	156756

BX072574.7	1501	TTTAGAAATGGAAGGATAATCCAATTAAAGCAAAATATTGCAAAAAATCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156757	TTTAGAAATGGAAGGATAATCCAATTAAAGCAAAATATTGCAAAAAATCA	156806

BX072574.7	1551	ATTACAACCAAAAATGTTTTAACTATTTAAAAAGAAAAATCCACTTTTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156807	ATTACAACCAAAAATGTTTTAACTATTTAAAAAGAAAAATCCACTTTTTT	156856

BX072574.7	1601	AAAAAAATTTGTATTTAATATTTTTATATAACATAAATTTGGCTGTACTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156857	AAAAAAATTTGTATTTAATATTTTTATATAACATAAATTTGGCTGTACTA	156906

BX072574.7	1651	GTTTTTGGACTGTTATTGTAAGTTATCTTGTTAGATAGGCTCCAGATTTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156907	GTTTTTGGACTGTTATTGTAAGTTATCTTGTTAGATAGGCTCCAGATTTG	156956

BX072574.7	1701	GCACAAATATGACATTGCATTGCTTCCTATATAAAAAAAGAATTTAGAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	156957	GCACAAATATGACATTGCATTGCTTCCTATATAAAAAAAGAATTTAGAAA	157006

BX072574.7	1751	TTTGTGAGGTGTTTTTTTTATATATGCTGAACACTAAAGCAGAATTTATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	157007	TTTGTGAGGTGTTTTTTTTATATATGCTGAACACTAAAGCAGAATTTATG	157056

BX072574.7	1801	TATTCTTGCCATTAACTTCTCTAACTATTCTCTTGTTAGTAACTCTGCTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	157057	TATTCTTGCCATTAACTTCTCTAACTATTCTCTTGTTAGTAACTCTGCTT	157106

BX072574.7	1851	AAAAAGGGGCTATATAGGCATGGAAGAGCATCATTCCACAGTGTTTCAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	157107	AAAAAGGGGCTATATAGGCATGGAAGAGCATCATTCCACAGTGTTTCAGA	157156

BX072574.7	1901	TGATAATCTAGTCCCTTGTTGATCAATTATAAACCTAAGTCATTGGCTCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	157157	TGATAATCTAGTCCCTTGTTGATCAATTATAAACCTAAGTCATTGGCTCA	157206

BX072574.7	1951	TCTGTCTATTAGCTTAACTTTCTGATTTTTCCCATTTTGATCTTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935064.7	157207	TCTGTCTATTAGCTTAACTTTCTGATTTTTCCCATTTTGATCTTGAATTC	157256

Overview

Query
BX072574.7 - 140410 bps
Hit
AL935064.7 - 157256 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100190120001200011552571572561
286.321493175708257398-1279631241
391.18741023876838869-154874549751
410045922855928650-164689647801
598.9651962855928654164691647861
698.94591138008138098185930860201
788.36192311104534104844188054883711
891.84108148113141113288-188224883701
991.661231683661136778191430915971
1086.1932154631846532193791940131
1191.011221895710457292-193862940501
1281.091123794280743185-193896942651
1389.32671033875838860-195476955781
1492.86139196570975729211183181185131
1587.9781514638246532-11183621185181
1683.911152387426974506-11331241333531
171005210710516510527111381351382411
1885.23169386428004318511390491394341
1978.86124610568615747011390591396591
2097.9848992855228650-11395681396661
211004592285592865011395681396591
2283.82111258118477118734-11525361527761
Short-link