<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL974314.21	1	AATATGAATTTTAAAAGATAGATTTGTGAGAGGTGTACTTATATATGGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	135663	AATATGAATTTTAAAAGATAGATTTGTGAGAGGTGTACTTATATATGGAG	135712

AL974314.21	51	AGTTCAGATGCAAAAACCTCTAATTGCCGTCTGAAATTCTCTTCTAAAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	135713	AGTTCAGATGCAAAAACCTCTAATTGCCGTCTGAAATTCTCTTCTAAAAT	135762

AL974314.21	101	AAGCATTTTTATCAGGCTCCTGTGTGAATGTTCTATAATATCACTTTTAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	135763	AAGCATTTTTATCAGGCTCCTGTGTGAATGTTCTATAATATCACTTTTAT	135812

AL974314.21	151	GGCAAAGAATAAGTTCTTTTCCTGGTCTTTAAAGTGAAATATCTCAGCAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	135813	GGCAAAGAATAAGTTCTTTTCCTGGTCTTTAAAGTGAAATATCTCAGCAA	135862

AL974314.21	201	AAACAAAGGAGGCTGAAAAAAATGGAAATTTATGATGGAAATTGCAGATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	135863	AAACAAAGGAGGCTGAAAAAAATGGAAATTTATGATGGAAATTGCAGATG	135912

AL974314.21	251	ACACTTTTGCATCTGAAGTCTTCATACGCTGAACACTCTATATGAAAAGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	135913	ACACTTTTGCATCTGAAGTCTTCATACGCTGAACACTCTATATGAAAAGT	135962

AL974314.21	301	GCACATTAATTTCACTTGTTTTTCACATGGTTTGGGCTGATTATCGAGCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	135963	GCACATTAATTTCACTTGTTTTTCACATGGTTTGGGCTGATTATCGAGCT	136012

AL974314.21	351	TAAAGTATTGTCGACTTTGCATTTAACCTAACAGAAAAAATACAAGGAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136013	TAAAGTATTGTCGACTTTGCATTTAACCTAACAGAAAAAATACAAGGAGG	136062

AL974314.21	401	AGGCTGAGAAGACCATGTCTCACTATGTGCCTGTCCTGGACACCCCAGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136063	AGGCTGAGAAGACCATGTCTCACTATGTGCCTGTCCTGGACACCCCAGAA	136112

AL974314.21	451	ATGCAAAGAGTGCGTGAGAACCAGAAGAACTTCAGCACTGTAAGTGTTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136113	ATGCAAAGAGTGCGTGAGAACCAGAAGAACTTCAGCACTGTAAGTGTTTC	136162

AL974314.21	501	TCCACAGCTTTTGAGCAAGGCCATAATATGTGTTCCGTCCATATTATGTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136163	TCCACAGCTTTTGAGCAAGGCCATAATATGTGTTCCGTCCATATTATGTT	136212

AL974314.21	551	CCTGTTTTATTCATCTTAGCCTAAATGTGGTATTCGTAGCCTTTGTTGTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136213	CCTGTTTTATTCATCTTAGCCTAAATGTGGTATTCGTAGCCTTTGTTGTC	136262

AL974314.21	601	CTTGTCTTTCATGTGTTCATGTTATATAAGAAATAAAAAAGACAGATATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136263	CTTGTCTTTCATGTGTTCATGTTATATAAGAAATAAAAAAGACAGATATA	136312

AL974314.21	651	AAAGAGTTGGCAGATTCCACAGTTCCTATGTTTTTGTTATATGCTAGTTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136313	AAAGAGTTGGCAGATTCCACAGTTCCTATGTTTTTGTTATATGCTAGTTA	136362

AL974314.21	701	GATGTACCTTTGAAAGTCTCTTGAATATTTTTTTTACATTTTTGGTTGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136363	GATGTACCTTTGAAAGTCTCTTGAATATTTTTTTTACATTTTTGGTTGCA	136412

AL974314.21	751	CTGTTTTCTCTTGTTGAATTTTTGTGTCATTTTTTGACTGCTATTGTGCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136413	CTGTTTTCTCTTGTTGAATTTTTGTGTCATTTTTTGACTGCTATTGTGCT	136462

AL974314.21	801	CTTTTCTTTTTAGCTTCAGTACCAGATTGACCTAAAAAAGAGTAAGGGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136463	CTTTTCTTTTTAGCTTCAGTACCAGATTGACCTAAAAAAGAGTAAGGGCA	136512

AL974314.21	851	AAGTTTCAGCAGTACAGAACACCCCTGAAATGCTTCGTGTTAAAGAAAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136513	AAGTTTCAGCAGTACAGAACACCCCTGAAATGCTTCGTGTTAAAGAAAAT	136562

AL974314.21	901	ACAAAGAATTTCAGCTCGGTACCTACTGCCTAATGAGTTTTTTTTTCTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136563	ACAAAGAATTTCAGCTCGGTACCTACTGCCTAATGAGTTTTTTTTTCTTT	136612

AL974314.21	951	TCTGCCTTCTAACAACAAGTCCTTTTTTCTGTTCACACTTCTTGCTTTAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136613	TCTGCCTTCTAACAACAAGTCCTTTTTTCTGTTCACACTTCTTGCTTTAC	136662

AL974314.21	1001	AAAACCTTTTTCTTTTTTCTCAGCTGCAACCAGAAGTTAACATTTAAGTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136663	AAAACCTTTTTCTTTTTTCTCAGCTGCAACCAGAAGTTAACATTTAAGTT	136712

AL974314.21	1051	AACATTTCTTGACTTTCAGCTCTTTTTATATAATATTAATTTAGATCTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136713	AACATTTCTTGACTTTCAGCTCTTTTTATATAATATTAATTTAGATCTTC	136762

AL974314.21	1101	TAAAAGACCTGAATCTAATGTAGTCATTAACTTGTAGTCATAAACTAGCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136763	TAAAAGACCTGAATCTAATGTAGTCATTAACTTGTAGTCATAAACTAGCA	136812

AL974314.21	1151	AAGCCACTAACGGTAATCATTCAATTTGATGCTCTTCTTGATCTTTCTCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136813	AAGCCACTAACGGTAATCATTCAATTTGATGCTCTTCTTGATCTTTCTCC	136862

AL974314.21	1201	ATCCTAAACAGTAGCTCTAACCATTTGAAAAGTTTAATATTTACATGTTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136863	ATCCTAAACAGTAGCTCTAACCATTTGAAAAGTTTAATATTTACATGTTA	136912

AL974314.21	1251	TATTCTAAGCTGGGTTCATGTTACAGGAGTTTTTGAATTCCAACTGGATA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136913	TATTCTAAGCTGGGTTCATGTTACAGGAGTTTTTGAATTCCAACTGGATA	136962

AL974314.21	1301	TTAAATCACTTTGCATCCCAAGCGAGAAAACCTGAAATTTCTGGTGCATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	136963	TTAAATCACTTTGCATCCCAAGCGAGAAAACCTGAAATTTCTGGTGCATC	137012

AL974314.21	1351	AAACATTACAAGATATTCTGATCGTCAGTCCAGAGGGAGTACTTCAAATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137013	AAACATTACAAGATATTCTGATCGTCAGTCCAGAGGGAGTACTTCAAATG	137062

AL974314.21	1401	CTCTAACACTAACAGCCTTCTTCTATTTAAAAGGCTAAACATCAAACATG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137063	CTCTAACACTAACAGCCTTCTTCTATTTAAAAGGCTAAACATCAAACATG	137112

AL974314.21	1451	CTTAATTTGAGGTTAAAATTGTGATTTGTAAACATTCATGCTGTATACTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137113	CTTAATTTGAGGTTAAAATTGTGATTTGTAAACATTCATGCTGTATACTA	137162

AL974314.21	1501	ATTTGAATATACAATGTTGAAGTCAGAATTATTAGCCCCCCTTTGAATTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137163	ATTTGAATATACAATGTTGAAGTCAGAATTATTAGCCCCCCTTTGAATTT	137212

AL974314.21	1551	TTTTTCTATTTTAAATGTTTTAGAAATGATGTTTAACAGAGCAAGGGAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137213	TTTTTCTATTTTAAATGTTTTAGAAATGATGTTTAACAGAGCAAGGGAAT	137262

AL974314.21	1601	TTTCACAGTATGTCTGATAATATTTTTTCTTCTGGAGAAAGTCTTATTTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137263	TTTCACAGTATGTCTGATAATATTTTTTCTTCTGGAGAAAGTCTTATTTG	137312

AL974314.21	1651	TTTTATTTTGGCTAGAACAAAAGCAGTTTTGAATCAATATTATTAGCCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137313	TTTTATTTTGGCTAGAACAAAAGCAGTTTTGAATCAATATTATTAGCCCC	137362

AL974314.21	1701	TTTAAGCTATATATTTTTTTGATAATCTACAGAACAAACCATCATTATGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137363	TTTAAGCTATATATTTTTTTGATAATCTACAGAACAAACCATCATTATGC	137412

AL974314.21	1751	AATAACTTGCCTAATTACCCTAATCTGCCTAGTTAACCTAATTAACCTAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137413	AATAACTTGCCTAATTACCCTAATCTGCCTAGTTAACCTAATTAACCTAG	137462

AL974314.21	1801	TTAAGCCTTTAAATGTCACTTTAAGCTGTATAGAAGTGTCTTGAAAAATA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137463	TTAAGCCTTTAAATGTCACTTTAAGCTGTATAGAAGTGTCTTGAAAAATA	137512

AL974314.21	1851	TCTAGTCAAATATGATTTACTGTCATCATGGCAAAGATAAAATAAATCAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137513	TCTAGTCAAATATGATTTACTGTCATCATGGCAAAGATAAAATAAATCAG	137562

AL974314.21	1901	TTATTAGAAATGAGTTATTAAAACTATTATGCTTAGTGATGTGTTAAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137563	TTATTAGAAATGAGTTATTAAAACTATTATGCTTAGTGATGTGTTAAAAA	137612

AL974314.21	1951	AAATCTTCTCCGTTAAACAGAAATTGGGGAAAAATAAATAAGGGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935048.7	137613	AAATCTTCTCCGTTAAACAGAAATTGGGGAAAAATAAATAAGGGGAATTC	137662

Overview

Query
AL974314.21 - 192510 bps
Hit
AL935048.7 - 137662 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100190420001200011356631376621
287.68403741108237108977-135076358301
383.051052347926379496135077353181
493.87261326107632107957-135830361551
587.82053493988140229-137028373631
684.51114234158408158641137139373641
788.741432265659656821-137143373641
891.221031481420814355137216373631
992.1677102159464159565137254373551
1089.86100147125197125343153256534031
1183.631052245659856821-155487557121
1292.65971362708127216164108642431
1383.991473076484665152165623659281
1488.72129195136439136633-167840680341
1581.383284161222161505-174581748741
1685.8115131116851995174773750751
1786.06100216168643168858174812750191
1897.769878270582791180663807491
1984.788187159064159250-11210241212061
2093.87132164161512161675-11265801267421
2189.94111179132505132683-11373461375241
2290.8213821816863316885011373761375931
Short-link