<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL805913.4	1	GGCCAAAATTCTTAGCTTCTTCCTTTCCCTCATGCAGCCCATGGATAGCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	93789	GGCCAAAATTCTTAGCTTCTTCCTTTCCCTCATGCAGCCCATGGATAGCC	93838

AL805913.4	51	AGCCCCAGAGGTAATGTCACAGGATGGGAAGTTTCCAGAGTGGGTGGGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	93839	AGCCCCAGAGGTAATGTCACAGGATGGGAAGTTTCCAGAGTGGGTGGGAG	93888

AL805913.4	101	GTGGGTGGTTAGAGAAAGGCAGCAGGGGCCTCCCTGTGGATGTCAAGAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	93889	GTGGGTGGTTAGAGAAAGGCAGCAGGGGCCTCCCTGTGGATGTCAAGAAT	93938

AL805913.4	151	CTTTTTTATTTATTTATTTATTTTGTCCCACAGTTTAATTGGGGCCGCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	93939	CTTTTTTATTTATTTATTTATTTTGTCCCACAGTTTAATTGGGGCCGCAG	93988

AL805913.4	201	TTTAACTGTTCCTTTGATGCATAGGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	93989	TTTAACTGTTCCTTTGATGCATAGGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	94038

AL805913.4	251	TGAGAGAGTCGGGGATCGGTAGTCTCCCTATAAGCATTTATTTTTCTGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94039	TGAGAGAGTCGGGGATCGGTAGTCTCCCTATAAGCATTTATTTTTCTGTG	94088

AL805913.4	301	GTTCTGACCTAACATTTCTTTATTTAGGATTATCACAAAATTATAAAACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94089	GTTCTGACCTAACATTTCTTTATTTAGGATTATCACAAAATTATAAAACA	94138

AL805913.4	351	GCCTATGGACATGGGTACTATTAAGAGGAGACTTGAAAACAATTATTATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94139	GCCTATGGACATGGGTACTATTAAGAGGAGACTTGAAAACAATTATTATT	94188

AL805913.4	401	GGGCTGCTTCAGAGTGTATGCAAGATTTTAATACCATGTTCACCAACTGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94189	GGGCTGCTTCAGAGTGTATGCAAGATTTTAATACCATGTTCACCAACTGT	94238

AL805913.4	451	TACATTTACAACAAGGTGAGTTTTTCTGTGTGTTCATTTAGTAGGTGGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94239	TACATTTACAACAAGGTGAGTTTTTCTGTGTGTTCATTTAGTAGGTGGGG	94288

AL805913.4	501	AGAAACAGTAATTTCTATTATTGCTGGATATGTTGTCTACATAAAGTTTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94289	AGAAACAGTAATTTCTATTATTGCTGGATATGTTGTCTACATAAAGTTTA	94338

AL805913.4	551	AATCCTTTGCTACTGAAGGTGTTATCCAGGTAGGGTAGTCGGAGTCTTAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94339	AATCCTTTGCTACTGAAGGTGTTATCCAGGTAGGGTAGTCGGAGTCTTAA	94388

AL805913.4	601	AAACCTGACTCTAGATGGTACTATTGAACACAGTGATGTGACTTCAGAGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94389	AAACCTGACTCTAGATGGTACTATTGAACACAGTGATGTGACTTCAGAGC	94438

AL805913.4	651	TCTAGTTGAAGGTTATTTAGAACACTTCATACTTGGGGGTGGTGGTCCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94439	TCTAGTTGAAGGTTATTTAGAACACTTCATACTTGGGGGTGGTGGTCCTG	94488

AL805913.4	701	TTTCTTAGAAATCACCAGAGACCTGAGTAGACCAGGGATCTGTTTTCTTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94489	TTTCTTAGAAATCACCAGAGACCTGAGTAGACCAGGGATCTGTTTTCTTG	94538

AL805913.4	751	TCAGCTCTCAAGTTTTTTCTTTCGAATTTTGGGAGACAGTTAGGAGAAAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94539	TCAGCTCTCAAGTTTTTTCTTTCGAATTTTGGGAGACAGTTAGGAGAAAG	94588

AL805913.4	801	TGGAAATTAGTAGTGGCCTGGAGTAGGAAATTTTCTTTAAGATTTGATGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94589	TGGAAATTAGTAGTGGCCTGGAGTAGGAAATTTTCTTTAAGATTTGATGA	94638

AL805913.4	851	CAAGATGACTGGTGGGGGTATGGTAATGGCCTAGGGCCTGAATGCCTCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94639	CAAGATGACTGGTGGGGGTATGGTAATGGCCTAGGGCCTGAATGCCTCTG	94688

AL805913.4	901	AGAAAGATGGTGTGTATCTATCTTCTGTTGGCATTTTTTAACTTTCTTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94689	AGAAAGATGGTGTGTATCTATCTTCTGTTGGCATTTTTTAACTTTCTTTA	94738

AL805913.4	951	TTGCTGTCTGTGTTCTCATAGCCCACTGATGATATTGTCCTAATGGCACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94739	TTGCTGTCTGTGTTCTCATAGCCCACTGATGATATTGTCCTAATGGCACA	94788

AL805913.4	1001	AACGCTGGAAAAGATATTCCTACAGAAGGTTGCATCAATGCCACAAGAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94789	AACGCTGGAAAAGATATTCCTACAGAAGGTTGCATCAATGCCACAAGAAG	94838

AL805913.4	1051	AACAAGAGCTGGTAGTGACCATCCCTAAGAACAGCCACAAGAAGGGGGCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94839	AACAAGAGCTGGTAGTGACCATCCCTAAGAACAGCCACAAGAAGGGGGCC	94888

AL805913.4	1101	AAGTTGGCAGGTAGGAAGAGTGGGAGTTTTGCAAATGGACAACTTAAAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94889	AAGTTGGCAGGTAGGAAGAGTGGGAGTTTTGCAAATGGACAACTTAAAGA	94938

AL805913.4	1151	TGGGGAAGAGAATCAAACTACACTTTTTTCCTTTTTTCTAGCGCTCCAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94939	TGGGGAAGAGAATCAAACTACACTTTTTTCCTTTTTTCTAGCGCTCCAGG	94988

AL805913.4	1201	GCAGTGTTACCAGTGCCCATCAGGTGCCTGCCGTCTCTTCTGTGTCACAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	94989	GCAGTGTTACCAGTGCCCATCAGGTGCCTGCCGTCTCTTCTGTGTCACAC	95038

AL805913.4	1251	ACAGCCCTGTATACTCCTCCACCTGAGATACCTACCACTGTCCTCAACAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95039	ACAGCCCTGTATACTCCTCCACCTGAGATACCTACCACTGTCCTCAACAT	95088

AL805913.4	1301	TCCCCACCCATCAGTCATTTCCTCTCCACTTCTCAAGTCCTTGCACTCTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95089	TCCCCACCCATCAGTCATTTCCTCTCCACTTCTCAAGTCCTTGCACTCTG	95138

AL805913.4	1351	CTGGACCCCCGCTCCTTGCTGTTACTGCAGCTCCTCCAGCCCAGCCCCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95139	CTGGACCCCCGCTCCTTGCTGTTACTGCAGCTCCTCCAGCCCAGCCCCTT	95188

AL805913.4	1401	GCCAAGGTATGATCTGTGGATTTCCTCTGGGCAGCAGGGAGGCAAGGGTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95189	GCCAAGGTATGATCTGTGGATTTCCTCTGGGCAGCAGGGAGGCAAGGGTC	95238

AL805913.4	1451	TTAAGTAAAGTGGGCTTGGAGTGACAGGTTCCCTATCTTGTTTCTTTCTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95239	TTAAGTAAAGTGGGCTTGGAGTGACAGGTTCCCTATCTTGTTTCTTTCTG	95288

AL805913.4	1501	CAGAAAAAAGGCGTAAAGCGGAAAGCAGATACTACCACCCCTACACCTAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95289	CAGAAAAAAGGCGTAAAGCGGAAAGCAGATACTACCACCCCTACACCTAC	95338

AL805913.4	1551	AGCCATCTTGGCTCCTGGTTCTCCAGCTAGCCCTCCTGGGAGTCTTGAGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95339	AGCCATCTTGGCTCCTGGTTCTCCAGCTAGCCCTCCTGGGAGTCTTGAGC	95388

AL805913.4	1601	CTAAGGCAGCACGGCTTCCCCCTATGCGTAGAGAGAGTGGTCGCCCCATC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95389	CTAAGGCAGCACGGCTTCCCCCTATGCGTAGAGAGAGTGGTCGCCCCATC	95438

AL805913.4	1651	AAGCCCCCACGCAAAGACTTGCCTGACTCTCAGCAACAACACCAGAGCTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95439	AAGCCCCCACGCAAAGACTTGCCTGACTCTCAGCAACAACACCAGAGCTC	95488

AL805913.4	1701	TAAGAAAGGAAAGCTTTCAGAACAGTTAAAACATTGCAATGGCATTTTGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95489	TAAGAAAGGAAAGCTTTCAGAACAGTTAAAACATTGCAATGGCATTTTGA	95538

AL805913.4	1751	AGGAGTTACTCTCTAAGAAGCATGCTGCCTATGCTTGGCCTTTCTATAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95539	AGGAGTTACTCTCTAAGAAGCATGCTGCCTATGCTTGGCCTTTCTATAAA	95588

AL805913.4	1801	CCAGTGGATGCTTCTGCACTTGGCCTGCATGACTACCATGACATCATTAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95589	CCAGTGGATGCTTCTGCACTTGGCCTGCATGACTACCATGACATCATTAA	95638

AL805913.4	1851	GCACCCCATGGACCTCAGCACTGTCAAGGTACCCACTGCATGGGGCAGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95639	GCACCCCATGGACCTCAGCACTGTCAAGGTACCCACTGCATGGGGCAGAT	95688

AL805913.4	1901	GGGATGCTCAGGCAGTGATGGGAGCCTAGGTGCAAAACAATAAGTCTCCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95689	GGGATGCTCAGGCAGTGATGGGAGCCTAGGTGCAAAACAATAAGTCTCCT	95738

AL805913.4	1951	TATGTGGGCACACAGCAGTCTTTGGTTCTTGGCATTTTACTTTTATAAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935042.6	95739	TATGTGGGCACACAGCAGTCTTTGGTTCTTGGCATTTTACTTTTATAAAA	95788

Overview

Query
AL805913.4 - 106728 bps
Hit
AL935042.6 - 95788 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link