<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL844853.23	1	GGCCAACATGGTGAAACCCCATTTCCACTCTGCTTCAGCCATGCTACAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	57837	GGCCAACATGGTGAAACCCCATTTCCACTCTGCTTCAGCCATGCTACAGA	57886

AL844853.23	51	AACCCAGGAGCTGCTTGGAGCTCTTTTGTCAGTGTTCGAGGAGTAAAATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	57887	AACCCAGGAGCTGCTTGGAGCTCTTTTGTCAGTGTTCGAGGAGTAAAATT	57936

AL844853.23	101	TCTACCCATTGGCCAGAGTCACAGCCGCAGGCTTTGTGGGGTACACCCAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	57937	TCTACCCATTGGCCAGAGTCACAGCCGCAGGCTTTGTGGGGTACACCCAA	57986

AL844853.23	151	ACCTGCACCAACAGAACTCATGGATGAAATTTGCATCTTTTGGGTTGTGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	57987	ACCTGCACCAACAGAACTCATGGATGAAATTTGCATCTTTTGGGTTGTGA	58036

AL844853.23	201	GGAAATTCTAGAGCCCAGAAATAACCTTAAAAACTTTTGGGGCTGGGTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58037	GGAAATTCTAGAGCCCAGAAATAACCTTAAAAACTTTTGGGGCTGGGTGC	58086

AL844853.23	251	AGTGTCTCATGCCTGTAATTCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAAGCAGGTGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58087	AGTGTCTCATGCCTGTAATTCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAAGCAGGTGGA	58136

AL844853.23	301	TCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGTCAACATGGCGAAACCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58137	TCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGTCAACATGGCGAAACCC	58186

AL844853.23	351	TGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAAGTGTGGTGGTGCACACCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58187	TGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAAGTGTGGTGGTGCACACCTG	58236

AL844853.23	401	TAATCCCAGATACTCTGATGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACCCAGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58237	TAATCCCAGATACTCTGATGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACCCAGG	58286

AL844853.23	451	AGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGAACCCCTGCACTCCAGCCTGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58287	AGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGAACCCCTGCACTCCAGCCTGGG	58336

AL844853.23	501	CAAAAGCATGAGACTCTGTCTCAAAAAAAACAAAACCAACAACTAGTGGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58337	CAAAAGCATGAGACTCTGTCTCAAAAAAAACAAAACCAACAACTAGTGGT	58386

AL844853.23	551	ACGTAATGTTTACATATTAGTTGTATGTAACATTAATATATGTTTACATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58387	ACGTAATGTTTACATATTAGTTGTATGTAACATTAATATATGTTTACATA	58436

AL844853.23	601	CTGGTAGTATGTAAGCATATGTAATGTGCCTGGCCTCTCATTTCTTATTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58437	CTGGTAGTATGTAAGCATATGTAATGTGCCTGGCCTCTCATTTCTTATTT	58486

AL844853.23	651	TTGCATGTCTGAAATATTTCTTAGTATCTTAAAAACATAGCTTGGGGGCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58487	TTGCATGTCTGAAATATTTCTTAGTATCTTAAAAACATAGCTTGGGGGCT	58536

AL844853.23	701	GGGTATGGTGACTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58537	GGGTATGGTGACTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTG	58586

AL844853.23	751	GGAGGATCACCTGAGCCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGTAATATTGCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58587	GGAGGATCACCTGAGCCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGTAATATTGCA	58636

AL844853.23	801	AGACACCATCTCTAAAAATAAAAACCAAAAAAAACAACAAAGATACACAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58637	AGACACCATCTCTAAAAATAAAAACCAAAAAAAACAACAAAGATACACAA	58686

AL844853.23	851	TAAACAAGATAAACAGCAGACCAACTAAATGAAGAATTAGTGAGTTGGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58687	TAAACAAGATAAACAGCAGACCAACTAAATGAAGAATTAGTGAGTTGGAG	58736

AL844853.23	901	GGAGAAATAATCCATAATGTGGAGCAGAGAAATCAGAGGTGATATGAAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58737	GGAGAAATAATCCATAATGTGGAGCAGAGAAATCAGAGGTGATATGAAAA	58786

AL844853.23	951	GGAAGTTTTGAAACATGAAGGATGGAATGAGATACTCCAACTCCAGAGCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58787	GGAAGTTTTGAAACATGAAGGATGGAATGAGATACTCCAACTCCAGAGCT	58836

AL844853.23	1001	GCTTTGTTTTTGTTTTTGAGATGGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58837	GCTTTGTTTTTGTTTTTGAGATGGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGG	58886

AL844853.23	1051	AGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTACGCCTCCCAGGTTCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58887	AGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTACGCCTCCCAGGTTCA	58936

AL844853.23	1101	AGCGATGCTCCTGACTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGGTGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58937	AGCGATGCTCCTGACTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGGTGC	58986

AL844853.23	1151	CACCACGTCTGGATAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	58987	CACCACGTCTGGATAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCG	59036

AL844853.23	1201	TGTTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATTCACCTGCCTCG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59037	TGTTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATTCACCTGCCTCG	59086

AL844853.23	1251	CCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59087	CCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAC	59136

AL844853.23	1301	TTTGTTTGTTACATGGATTTGTTACCTGCAGCCAGAACAGCCACAGAGCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59137	TTTGTTTGTTACATGGATTTGTTACCTGCAGCCAGAACAGCCACAGAGCC	59186

AL844853.23	1351	ATCATGAGCTCTGCTGCCCAATGGCGTACAGGGGTACCTGGTTTTTAGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59187	ATCATGAGCTCTGCTGCCCAATGGCGTACAGGGGTACCTGGTTTTTAGCA	59236

AL844853.23	1401	TCTCAGGCCCATCTGTTAGTTTGTTGATTGTAGTACTTTCTTTTCATTAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59237	TCTCAGGCCCATCTGTTAGTTTGTTGATTGTAGTACTTTCTTTTCATTAG	59286

AL844853.23	1451	CATTCTACTTTCCCATGACTTTTTTTGGGGGGGAGTGGGGTGGACAGGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59287	CATTCTACTTTCCCATGACTTTTTTTGGGGGGGAGTGGGGTGGACAGGGT	59336

AL844853.23	1501	CTCACTGTGTTGTCCAGGCTGTAGTGCACTGGAGCCATCTTGGCTCACTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59337	CTCACTGTGTTGTCCAGGCTGTAGTGCACTGGAGCCATCTTGGCTCACTG	59386

AL844853.23	1551	CAGCCTCTGCCTCCTGAGCCACCAAGCCTGGCTGTTTTTTTTTTTTTTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59387	CAGCCTCTGCCTCCTGAGCCACCAAGCCTGGCTGTTTTTTTTTTTTTTTT	59436

AL844853.23	1601	TTTTAATTCTTGTGTTATTTTCCAAAGACTATATAAAGAAACAAATTATC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59437	TTTTAATTCTTGTGTTATTTTCCAAAGACTATATAAAGAAACAAATTATC	59486

AL844853.23	1651	CTAAGGGTTAAAGTACCTGCTGACTCTTGAAATGTTAAACTTTATTGCCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59487	CTAAGGGTTAAAGTACCTGCTGACTCTTGAAATGTTAAACTTTATTGCCT	59536

AL844853.23	1701	CCAGTCAGGTGAACCTCAGGTGGAAGTGGGTCACATTCTAGGCTGGCTGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59537	CCAGTCAGGTGAACCTCAGGTGGAAGTGGGTCACATTCTAGGCTGGCTGT	59586

AL844853.23	1751	TGCCTGTCTTAAATTCTAAAGAATGTAGTGAAGATAAAGGTGTCAGCTGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59587	TGCCTGTCTTAAATTCTAAAGAATGTAGTGAAGATAAAGGTGTCAGCTGA	59636

AL844853.23	1801	TAATCCCCAGTTATTTACTGATGGCAGATAATAAACTGGGAAGGGGGAGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59637	TAATCCCCAGTTATTTACTGATGGCAGATAATAAACTGGGAAGGGGGAGC	59686

AL844853.23	1851	CTTCTTCAAAGGGCCTTGCAGCATTAGCTGGTACCACCTTGAAACAGGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59687	CTTCTTCAAAGGGCCTTGCAGCATTAGCTGGTACCACCTTGAAACAGGGA	59736

AL844853.23	1901	GCAAGTCCCATCTCCTAGTGCCACCCAGGGAATACCTGTGCTCCACACTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59737	GCAAGTCCCATCTCCTAGTGCCACCCAGGGAATACCTGTGCTCCACACTG	59786

AL844853.23	1951	GGTTGATTGCCTCTAAAAGAGGCAGAGGAACTGTTATAAAACAAAAAAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929592.8	59787	GGTTGATTGCCTCTAAAAGAGGCAGAGGAACTGTTATAAAACAAAAAAAA	59836

Overview

Query
AL844853.23 - 153464 bps
Hit
AL929592.8 - 59836 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link