<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX005029.13	1	ATTTACGACTTACGAGGATCCTCTTGATGAGCTTGGGGGATTTATTTATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	161867	ATTTACGACTTACGAGGATCCTCTTGATGAGCTTGGGGGATTTATTTATT	161916

BX005029.13	51	AATTTGTGTATTGTTTTTCTGTTGTAATGAGGGCTGACAGTTTTACCTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	161917	AATTTGTGTATTGTTTTTCTGTTGTAATGAGGGCTGACAGTTTTACCTTT	161966

BX005029.13	101	GCAAGGATTTGAACTTTGTCATTTTGAGGGTTATTTTCTCTGTAACCCCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	161967	GCAAGGATTTGAACTTTGTCATTTTGAGGGTTATTTTCTCTGTAACCCCC	162016

BX005029.13	151	CTGGAAAAAGCTACTGCGACAGAGACTCACCTATGATCTGCTTTAAGTAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162017	CTGGAAAAAGCTACTGCGACAGAGACTCACCTATGATCTGCTTTAAGTAT	162066

BX005029.13	201	CAGGACACCAGTAGGTAAGGTTCTGTTGAGAAATCAAAGATGAAATTGAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162067	CAGGACACCAGTAGGTAAGGTTCTGTTGAGAAATCAAAGATGAAATTGAA	162116

BX005029.13	251	ATGTAGAATTTATAAAAGCTTAGATTTATTTTAAGCTGGAATTTCAGATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162117	ATGTAGAATTTATAAAAGCTTAGATTTATTTTAAGCTGGAATTTCAGATT	162166

BX005029.13	301	TAGAAAAAACTTTGATTGAGTGCATTGATTTAATATTAATGAGCCTATTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162167	TAGAAAAAACTTTGATTGAGTGCATTGATTTAATATTAATGAGCCTATTA	162216

BX005029.13	351	ACTATATCTTACTTTAGCTGAACAGATGTCTGTATATCTAATATTTGCTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162217	ACTATATCTTACTTTAGCTGAACAGATGTCTGTATATCTAATATTTGCTT	162266

BX005029.13	401	GTCAAATTCATGTAGTGGAAGCCAAGCAGGTCCTATATCAGTCAATGGCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162267	GTCAAATTCATGTAGTGGAAGCCAAGCAGGTCCTATATCAGTCAATGGCA	162316

BX005029.13	451	ATGCAAATACTAATTCCTTTTAAATACAAAAACAAATTCAGTTCCACAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162317	ATGCAAATACTAATTCCTTTTAAATACAAAAACAAATTCAGTTCCACAGA	162366

BX005029.13	501	GATAGATTCTTTCATTTGTTTTTAGGACTGTACATGTATCATGTTTTTAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162367	GATAGATTCTTTCATTTGTTTTTAGGACTGTACATGTATCATGTTTTTAG	162416

BX005029.13	551	TTACGAAACAAGAATAAGGGGTCTGAATTTAGCTATACCGTCCCATTAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162417	TTACGAAACAAGAATAAGGGGTCTGAATTTAGCTATACCGTCCCATTAAT	162466

BX005029.13	601	CTGGTGTTATGGAAAGACTTCCGATTAATACTGTTCTTGTCATATTCATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162467	CTGGTGTTATGGAAAGACTTCCGATTAATACTGTTCTTGTCATATTCATA	162516

BX005029.13	651	GAAAGCATTTGAACTGAGGCTAGATATTTTTTGGCTTGGGGAAAGGGTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162517	GAAAGCATTTGAACTGAGGCTAGATATTTTTTGGCTTGGGGAAAGGGTCA	162566

BX005029.13	701	TATTTTACACACAAAAGGAAACTGCCAAGGGTCTTAACAGTAGCACATGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162567	TATTTTACACACAAAAGGAAACTGCCAAGGGTCTTAACAGTAGCACATGA	162616

BX005029.13	751	TATATTAGGCACAATAGAAATATTGGCTGGAAACTTTGCATTTGAGCTGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162617	TATATTAGGCACAATAGAAATATTGGCTGGAAACTTTGCATTTGAGCTGA	162666

BX005029.13	801	AATTTCCTAAAGAGCCACAGGGGAAATTGCTATCCTGTGTTGTTACATTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162667	AATTTCCTAAAGAGCCACAGGGGAAATTGCTATCCTGTGTTGTTACATTA	162716

BX005029.13	851	TTAAATAAGGAAAATCACTCTTGCTCATGTTGTATTGCATAATTTTATAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162717	TTAAATAAGGAAAATCACTCTTGCTCATGTTGTATTGCATAATTTTATAA	162766

BX005029.13	901	TAACAAAGTCTGCTACTGTTATTTAAGGTCATATCATTTTTGTGTTGTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162767	TAACAAAGTCTGCTACTGTTATTTAAGGTCATATCATTTTTGTGTTGTCA	162816

BX005029.13	951	CTAATAACCAGAATATTTAGGAACACTCTAATGCAACGGCCATGTGTATT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162817	CTAATAACCAGAATATTTAGGAACACTCTAATGCAACGGCCATGTGTATT	162866

BX005029.13	1001	TGTGCTGAAATCTCAGCTTCTGCTATTTTATTCTAACATAGCAAACTCTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162867	TGTGCTGAAATCTCAGCTTCTGCTATTTTATTCTAACATAGCAAACTCTT	162916

BX005029.13	1051	TATATAATTATATTATATAATTTATAATTCTGTATAACTATTTAGAATAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162917	TATATAATTATATTATATAATTTATAATTCTGTATAACTATTTAGAATAT	162966

BX005029.13	1101	TATACTATAATAAAAGCTAACAATACCAAAGCTAAAAATAGAATTTATGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	162967	TATACTATAATAAAAGCTAACAATACCAAAGCTAAAAATAGAATTTATGT	163016

BX005029.13	1151	AAAGGTGACATATTTTTGGCTTTGTCGTTTTGTGTGAGGCTTCCTCACGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163017	AAAGGTGACATATTTTTGGCTTTGTCGTTTTGTGTGAGGCTTCCTCACGA	163066

BX005029.13	1201	TTTCATTTGGGCATTCCAAATTAGATTTTCAGAATCCATACACTGCTCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163067	TTTCATTTGGGCATTCCAAATTAGATTTTCAGAATCCATACACTGCTCAG	163116

BX005029.13	1251	CACTGATAGAGGTCAGTGAGGCTAAACAAGAGATCAACTGAGTTCATTCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163117	CACTGATAGAGGTCAGTGAGGCTAAACAAGAGATCAACTGAGTTCATTCA	163166

BX005029.13	1301	CAGAATGGAATTTCTTGCTGTTGTATCTGCAAAAGTACTCCAGTATGTAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163167	CAGAATGGAATTTCTTGCTGTTGTATCTGCAAAAGTACTCCAGTATGTAA	163216

BX005029.13	1351	ATTGCATTTTTGCATGTGATATACTTTGCAAGCATTCATGTTATACTAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163217	ATTGCATTTTTGCATGTGATATACTTTGCAAGCATTCATGTTATACTAAT	163266

BX005029.13	1401	AATCATCAACAACAACAACAGCAGAATCTTTGCAAATTCTGGAAACAGAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163267	AATCATCAACAACAACAACAGCAGAATCTTTGCAAATTCTGGAAACAGAT	163316

BX005029.13	1451	TGCTACCGCTTCATTCTTTAGAAAGATTTTTAGGAATATTTTCTGAATAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163317	TGCTACCGCTTCATTCTTTAGAAAGATTTTTAGGAATATTTTCTGAATAG	163366

BX005029.13	1501	CTAATAGGCTTTGTTTATGTGTAAATAAGACAGTATGGACAGCCACTGGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163367	CTAATAGGCTTTGTTTATGTGTAAATAAGACAGTATGGACAGCCACTGGA	163416

BX005029.13	1551	TGTTAGAACTTTTTGAAACTAAAATCCATTTTTGCAGATTATCATAAATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163417	TGTTAGAACTTTTTGAAACTAAAATCCATTTTTGCAGATTATCATAAATA	163466

BX005029.13	1601	TCTGGAAATGCTGAATTCTGAAAGTAATTTGATTTCTGTGGTACATCTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163467	TCTGGAAATGCTGAATTCTGAAAGTAATTTGATTTCTGTGGTACATCTCT	163516

BX005029.13	1651	AAATACAATCCTCACATAAAACTTCATACATTTTCAAAAGAAAGAAAAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163517	AAATACAATCCTCACATAAAACTTCATACATTTTCAAAAGAAAGAAAAAA	163566

BX005029.13	1701	AATGTCCCCATGGGATTTTTTTCGTTTTATTCAAACCTTTACCAGGAAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163567	AATGTCCCCATGGGATTTTTTTCGTTTTATTCAAACCTTTACCAGGAAAA	163616

BX005029.13	1751	CACTGCAGAGAATCAAGACACATAAAAATAATCAATACAAAAACAATTAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163617	CACTGCAGAGAATCAAGACACATAAAAATAATCAATACAAAAACAATTAA	163666

BX005029.13	1801	ATAAATAGCAATCATAAGAATTGTACTGCCAAAACATAACCAGGGAACAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163667	ATAAATAGCAATCATAAGAATTGTACTGCCAAAACATAACCAGGGAACAA	163716

BX005029.13	1851	GTAAAATACGCAATAAAATGGCTAATTATTTCATAACATTATTATTACTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163717	GTAAAATACGCAATAAAATGGCTAATTATTTCATAACATTATTATTACTA	163766

BX005029.13	1901	TTATTATATCCAACAGTGGGAATACCTCAATCAAACGTGGCCATGAAATC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163767	TTATTATATCCAACAGTGGGAATACCTCAATCAAACGTGGCCATGAAATC	163816

BX005029.13	1951	ATCACTCACTTAACACCAAATGGGTTAAAAAGTTGGAATTTCACAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929590.15	163817	ATCACTCACTTAACACCAAATGGGTTAAAAAGTTGGAATTTCACAAGCTT	163866

Overview

Query
BX005029.13 - 128948 bps
Hit
AL929590.15 - 163866 bps
Total alignments
24
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100190220001200011618671638661
285.95921839956499746-122329225131
386.39841489901999166-122898230441
494.6489111017247373573131804329031
599.031982077366973875132904331101
688.95233361100969101329-136085364461
788.15721452753027674147886480371
887.111372256264562869154762549861
994.8349584191041967-156289563461
1089.21871366270362838-157726578641
1180812256251562739166659668781
1282.73216468126157126624-181066815341
1392.93581009012290221186493865911
1488.85152239111817112055-195967962081
1585.6716030710097410128011228601231731
1678.484254238552410811260261262751
1786.1913224110096910120911314731317111
1891.83133204119420119623-11380851382921
1987.19841676999670162-11419171420801
2086.4282164905559071811419171420781
2193.2884118852248534111419601420781
2287.7777140996079974611453421454801
2391.756496803538044811472691473651
2488.0458923647236563-11532471533381
Short-link