<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 787 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

  AL935192.10	191863	GAATTCTATGCCTGGCTATATATGAAGATTTCCATTTTCTGGCACCTTTT	191912
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	126123	GAATTCTATGCCTGGCTATATATGAAGATTTCCATTTTCTGGCACCTTTT	126074

  AL935192.10	191913	AGGCCCATTCTGAAGTGGCCAAATCTTCATCAGCTGAAAGAATCCCAATG	191962
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	126073	AGGCCCATTCTGAAGTGGCCAAATCTTCATCAGCTGAAAGAATCCCAATG	126024

  AL935192.10	191963	ATCGATAATATTTGCCAAGGAGCAAGTTGTGTGGACAAAGAACTGCTTCA	192012
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	126023	ATCGATAATATTTGCCAAGGAGCAAGTTGTGTGGACAAAGAACTGCTTCA	125974

  AL935192.10	192013	AAGTTAACTTCGGAGAAAGAAACATTGGGAAACATTAAGTTCATTGTTCC	192062
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125973	AAGTTAACTTCGGAGAAAGAAACATTGGGAAACATTAAGTTCATTGTTCC	125924

  AL935192.10	192063	AACTGAGGAAAGACTAAACAAAGTGTGTGCAGAAGTCAGTGAAAGTAGGA	192112
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125923	AACTGAGGAAAGACTAAACAAAGTGTGTGCAGAAGTCAGTGAAAGTAGGA	125874

  AL935192.10	192113	GGTGAAGTGTCATGAATTTGTGGATGACTTCTGCAGCAGAATTTGGCATC	192162
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125873	GGTGAAGTGTCATGAATTTGTGGATGACTTCTGCAGCAGAATTTGGCATC	125824

  AL935192.10	192163	TTTTACAGCTTCATGACAGAGAGAATATAAATGTTTATCAGAAGCTCCTT	192212
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125823	TTTTACAGCTTCATGACAGAGAGAATATAAATGTTTATCAGAAGCTCCTT	125774

  AL935192.10	192213	CAATAACGTGTGGTTCCGTCCCTGCATTCATCAGCCAGCAATTTGCATGC	192262
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125773	CAATAACGTGTGGTTCCGTCCCTGCATTCATCAGCCAGCAATTTGCATGC	125724

  AL935192.10	192263	AGGATATTTCTTACATGTACATTTAGTAATTTAGCAGATGCATTTGTTCC	192312
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125723	AGGATATTTCTTACATGTACATTTAGTAATTTAGCAGATGCATTTGTTCC	125674

  AL935192.10	192313	TAACAACTTACAATTGAGGCGGTATTCAGCGAGTCAACAAAAAGAAGGAA	192362
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125673	TAACAACTTACAATTGAGGCGGTATTCAGCGAGTCAACAAAAAGAAGGAA	125624

  AL935192.10	192363	TACTCAAAAGAAGTGATAATTATACAAAGGAGCTGCTTGTGCTCAGAGAA	192412
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125623	TACTCAAAAGAAGTGATAATTATACAAAGGAGCTGCTTGTGCTCAGAGAA	125574

  AL935192.10	192413	TTAAGTGCTAGAGTTCTACAGGTGGTTTGTCGAACCCATCCACCGGTGTG	192462
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125573	TTAAGTGCTAGAGTTCTACAGGTGGTTTGTCGAACCCATCCACCGGTGTG	125524

  AL935192.10	192463	AAGCTCACTTCATAGCTGCACAAGTTTTTTTTTATATACACTACCTGACA	192512
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125523	AAGCTCACTTCATAGCTGCACAAGTTTTTTTTTATATACACTACCTGACA	125474

  AL935192.10	192513	AAAGTCGTCGCCTATCCAAGTTTTAGGAACAACAAATAATAACTTCTAGT	192562
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125473	AAAGTCGTCGCCTATCCAAGTTTTAGGAACAACAAATAATAACTTCTAGT	125424

  AL935192.10	192563	TGATGATTTGGTATCAGAAAGGCAAAGGTCTCTAGATTACGCTTATTTTA	192612
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125423	TGATGATTTGGTATCAGAAAGGCAAAGGTCTCTAGATTACGCTTATTTTA	125374

  AL935192.10	192613	CCAAAATAAAATAATGTCGTGCCTTGATTTTGAATTC	192649
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL929116.4	125373	CCAAAATAAAATAATGTCGTGCCTTGATTTTGAATTC	125337

Overview

Query
AL935192.10 - 192649 bps
Hit
AL929116.4 - 126123 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 787 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110007871918631926491125337126123-1
Short-link