<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX928757.9	150156	AAGCTTAATATTTTGGCTAAGCCTACCCTTAAAGACAAAATCAAATGGAT	150205
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1	AAGCTTAATATTTTGGCTAAGCCTACCCTTAAAGACAAAATCAAATGGAT	50

BX928757.9	150206	GACTAAAATGCAAATTGACCTAAAGGTTAACTGGGCTTTTTTTTATATTT	150255
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	51	GACTAAAATGCAAATTGACCTAAAGGTTAACTGGGCTTTTTTTTATATTT	100

BX928757.9	150256	ACATCATCACTTAAAAGTTTGGGGGCAGCATGATAAATCATTTTCGGGAA	150305
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	101	ACATCATCACTTAAAAGTTTGGGGGCAGCATGATAAATCATTTTCGGGAA	150

BX928757.9	150306	AAAGGTCTATTGCAGCTCATCCAACCTGGATTTAATTGATCAAAAACACA	150355
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	151	AAAGGTCTATTGCAGCTCATCCAACCTGGATTTAATTGATCAAAAACACA	200

BX928757.9	150356	ACAAAAACAAAAGTATTTTGAAACCTTACTTACTATGCAGGGCTTGACCA	150405
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	201	ACAAAAACAAAAGTATTTTGAAACCTTACTTACTATGCAGGGCTTGACCA	250

BX928757.9	150406	TAAGGACTGCCTGATGGCCCGGGGCCACCGTGCGAAACGCTCGGGACAGT	150455
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	251	TAAGGACTGCCTGATGGCCCGGGGCCACCGTGCGAAACGCTCGGGACAGT	300

BX928757.9	150456	AGACAGCATAATTACCGGCCTGATTCGGCCAATGCTGCCTTGTGACTTAA	150505
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	301	AGACAGCATAATTACCGGCCTGATTCGGCCAATGCTGCCTTGTGACTTAA	350

BX928757.9	150506	TTAATTTGATTTCGACTGTTTGTCAATTGCGTGCAAATACAGTCTTGGGG	150555
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	351	TTAATTTGATTTCGACTGTTTGTCAATTGCGTGCAAATACAGTCTTGGGG	400

BX928757.9	150556	TGTTTTCACACCTACACGTTTGTTTCGGAACTTGTCTTGTTTGCCCAGTA	150605
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	401	TGTTTTCACACCTACACGTTTGTTTCGGAACTTGTCTTGTTTGCCCAGTA	450

BX928757.9	150606	AGCGTAGTTCATTTCACGTATTTGAATCCCGCAATCACACTTGGACCAAA	150655
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	451	AGCGTAGTTCATTTCACGTATTTGAATCCCGCAATCACACTTGGACCAAA	500

BX928757.9	150656	GCCAAATCAATCAGTTTGAGATCGCTTTAATGAGGTGGCCACGGCTAGAT	150705
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	501	GCCAAATCAATCAGTTTGAGATCGCTTTAATGAGGTGGCCACGGCTAGAT	550

BX928757.9	150706	TGAAACGAACACTGGAATTGATTGTAGTGAGAAAGCAAAACAATCCAACG	150755
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	551	TGAAACGAACACTGGAATTGATTGTAGTGAGAAAGCAAAACAATCCAACG	600

BX928757.9	150756	AACAGACGAACCAGGCTATATCACAGTGTATTATGTTTATGTAATAGCCA	150805
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	601	AACAGACGAACCAGGCTATATCACAGTGTATTATGTTTATGTAATAGCCA	650

BX928757.9	150806	TATACACAGCTGTATGAAGAGAAAATTATGATTAGGGCGGGATGTCATTC	150855
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	651	TATACACAGCTGTATGAAGAGAAAATTATGATTAGGGCGGGATGTCATTC	700

BX928757.9	150856	CTTCCAGCAAATGTGCATTTCATGTCAAATACAAAAGTGAAAGCATGCTG	150905
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	701	CTTCCAGCAAATGTGCATTTCATGTCAAATACAAAAGTGAAAGCATGCTG	750

BX928757.9	150906	AAATATTATTAACAGTTTATCTGTTAGGAGAATTGACAGAAATTACCATC	150955
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	751	AAATATTATTAACAGTTTATCTGTTAGGAGAATTGACAGAAATTACCATC	800

BX928757.9	150956	TGATCATTTTTCCATATTTTAATCTTTTGTATTAAGCCTATTGTTTTGTT	151005
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	801	TGATCATTTTTCCATATTTTAATCTTTTGTATTAAGCCTATTGTTTTGTT	850

BX928757.9	151006	CATTTCTGCACTGACAGCTCGAAAGAAAGATCAAAATTGATCTGCTTCAT	151055
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	851	CATTTCTGCACTGACAGCTCGAAAGAAAGATCAAAATTGATCTGCTTCAT	900

BX928757.9	151056	GATCTGACTTTACTCTTGGTTCATCTGTTATTTCTCTCTGTAATTTAAGC	151105
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	901	GATCTGACTTTACTCTTGGTTCATCTGTTATTTCTCTCTGTAATTTAAGC	950

BX928757.9	151106	ATATAATGCATAATTCTAACCAATGTTTTTTAATAGATTGATTAATTTAA	151155
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	951	ATATAATGCATAATTCTAACCAATGTTTTTTAATAGATTGATTAATTTAA	1000

BX928757.9	151156	AATATACTGTAGATTGTTACAAAACTTGACCACTGAAATAAGGCTATGCA	151205
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1001	AATATACTGTAGATTGTTACAAAACTTGACCACTGAAATAAGGCTATGCA	1050

BX928757.9	151206	TGAGAAAGTCTTACCTCTTTGATTTATACTTGGTGACAATGTACATATCC	151255
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1051	TGAGAAAGTCTTACCTCTTTGATTTATACTTGGTGACAATGTACATATCC	1100

BX928757.9	151256	ATTATATATATTCATTCATTTATTTTCTTTTCGGCTTAGTCCCTTTATTA	151305
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1101	ATTATATATATTCATTCATTTATTTTCTTTTCGGCTTAGTCCCTTTATTA	1150

BX928757.9	151306	ATCTGGAGTCGCCAGAGCAGATTGTTTGTTTTTTGACACATTATTTTAAA	151355
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1151	ATCTGGAGTCGCCAGAGCAGATTGTTTGTTTTTTGACACATTATTTTAAA	1200

BX928757.9	151356	AATGTGGCTAAGAAATAGCTATTAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGTGGG	151405
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1201	AATGTGGCTAAGAAATAGCTATTAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGTGGG	1250

BX928757.9	151406	GCCAGTGAAAATTTTGGCAGGGCAAGTACAAATCTGAACGGGCCAGTAGA	151455
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1251	GCCAGTGAAAATTTTGGCAGGGCAAGTACAAATCTGAACGGGCCAGTAGA	1300

BX928757.9	151456	AAAAATCATTTGTGTTGAATCCTGCTATGTAAAATATAATATATTCATTT	151505
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1301	AAAAATCATTTGTGTTGAATCCTGCTATGTAAAATATAATATATTCATTT	1350

BX928757.9	151506	TTAATGTACTTTAAAATGCAACTAATTAAAATCAGAATTTATAGCAGCGG	151555
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1351	TTAATGTACTTTAAAATGCAACTAATTAAAATCAGAATTTATAGCAGCGG	1400

BX928757.9	151556	ATGCTCTAGTCTTTGTAGAAATCATCATACTTTTTTGTGGCTTTGATAAA	151605
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1401	ATGCTCTAGTCTTTGTAGAAATCATCATACTTTTTTGTGGCTTTGATAAA	1450

BX928757.9	151606	AGGAATGATAAAAAAACAGCTTTTGTTTATTAAAAAAAAACAAAAAAAAG	151655
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1451	AGGAATGATAAAAAAACAGCTTTTGTTTATTAAAAAAAAACAAAAAAAAG	1500

BX928757.9	151656	ATTAAACATTTTTTTTTCATTTAAATTTTATATGTCCTTGTTGAATAAAA	151705
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1501	ATTAAACATTTTTTTTTCATTTAAATTTTATATGTCCTTGTTGAATAAAA	1550

BX928757.9	151706	TATAACTTACTTTCATAAATACATATGACAAAACAATACCGACCCCAAAT	151755
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1551	TATAACTTACTTTCATAAATACATATGACAAAACAATACCGACCCCAAAT	1600

BX928757.9	151756	ATCTAATTGGTACTGCTGCTTTGTTAGCTTGTCAAAAGCTAACTGCTTCG	151805
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1601	ATCTAATTGGTACTGCTGCTTTGTTAGCTTGTCAAAAGCTAACTGCTTCG	1650

BX928757.9	151806	TTTTTCATTAGAATTTTTTTTATTTGTTTTCAATTCAAAATTTAATCTGA	151855
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1651	TTTTTCATTAGAATTTTTTTTATTTGTTTTCAATTCAAAATTTAATCTGA	1700

BX928757.9	151856	ATCCAATTTTAAGCGACTGTCAAATTTAGATTGTATTTTTAATTATATAA	151905
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1701	ATCCAATTTTAAGCGACTGTCAAATTTAGATTGTATTTTTAATTATATAA	1750

BX928757.9	151906	ACGGATCACATTCTTCGTTTATGACTCAATTTAGAGTTTTTGATTAATAC	151955
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1751	ACGGATCACATTCTTCGTTTATGACTCAATTTAGAGTTTTTGATTAATAC	1800

BX928757.9	151956	CTGATCCCATACTCTACAGTTATACGTTGGGACCAAACGCCGCTTAGAGT	152005
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1801	CTGATCCCATACTCTACAGTTATACGTTGGGACCAAACGCCGCTTAGAGT	1850

BX928757.9	152006	TCCACACCCCAGGATTGCGTTTCTTCTCATGGACACTATTTTGACAATGA	152055
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1851	TCCACACCCCAGGATTGCGTTTCTTCTCATGGACACTATTTTGACAATGA	1900

BX928757.9	152056	AGTTACTCAGAGGATGTAGGGCTAACTAATACCCGAATTAGTCCACTTGC	152105
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1901	AGTTACTCAGAGGATGTAGGGCTAACTAATACCCGAATTAGTCCACTTGC	1950

BX928757.9	152106	TTCCTGCTCACTTCTACTCAAAAAGTAGTTAATTCAGTCATTTCCATACA	152155
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929038.13	1951	TTCCTGCTCACTTCTACTCAAAAAGTAGTTAATTCAGTCATTTCCATACA	2000

Overview

Query
BX928757.9 - 152155 bps
Hit
AL929038.13 - 213980 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100191720001501561521551120001
289.68851261101161102411664367681
3901251841704917232-110858110371
491.01129182122874123055110858110351
586.982023688690187268-130822311821
682.41323332261422946-130839311791
785.63861645158151744130839310051
889.511818477367919-131002311821
988.041332091742717635-174579747871
1087.5119193122483122675174596747871
1178.89984199368794105-11212211216511
1295.194405161712117636-11463771468961
1394.6642450712247912298511463911468961
1478.981073588642486781-11464501468201
1592.151401947726791911633991635891
1683.29155356226012295611633991637631
1788.78231377868918726711633991637721
1886.74951775156851744-11635861637661
1985.37176380868338721212131992135741
2089.581231907730791912132552134461
Short-link