<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX276082.6	1	TTGAACAGGATGTTGATATGCTTCTGACTGAAGGGAATCGATTTACTAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	194858	TTGAACAGGATGTTGATATGCTTCTGACTGAAGGGAATCGATTTACTAGG	194907

BX276082.6	51	TCGACTAAAAGTGACCTGTTAAACTGTAAACTCGCAGTGTAGCCTATGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	194908	TCGACTAAAAGTGACCTGTTAAACTGTAAACTCGCAGTGTAGCCTATGTG	194957

BX276082.6	101	ATGGTTTATTTTTATAAACTGCAGCTGGCGGTGATATTCCAGCAGCAACA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	194958	ATGGTTTATTTTTATAAACTGCAGCTGGCGGTGATATTCCAGCAGCAACA	195007

BX276082.6	151	CCAGAGGGCGCTATCAAGCCATTTTAAATGAGTTTGTGTGGCATACGGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195008	CCAGAGGGCGCTATCAAGCCATTTTAAATGAGTTTGTGTGGCATACGGAC	195057

BX276082.6	201	GGACTCAATGCAGTGCATTATAGCAGGTGAAAAGAGCTAAAAAAAACTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195058	GGACTCAATGCAGTGCATTATAGCAGGTGAAAAGAGCTAAAAAAAACTTG	195107

BX276082.6	251	TAAAAGTTAGTCATGTCAGCAAATACAGTTTGATCAAATCAATGTATCAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195108	TAAAAGTTAGTCATGTCAGCAAATACAGTTTGATCAAATCAATGTATCAT	195157

BX276082.6	301	TAAACCAATTAGCCAATGTAATTGCAGTATTTGAGACTTTCTACAAATGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195158	TAAACCAATTAGCCAATGTAATTGCAGTATTTGAGACTTTCTACAAATGG	195207

BX276082.6	351	TGTGTTTGGATATAGGGAAACAAACCTCGTTTACTTATGATGAATAGTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195208	TGTGTTTGGATATAGGGAAACAAACCTCGTTTACTTATGATGAATAGTTT	195257

BX276082.6	401	ACTGCCATGCAAGTATGCAAACATTAGAGGTTATCAAACGTTAAACAGTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195258	ACTGCCATGCAAGTATGCAAACATTAGAGGTTATCAAACGTTAAACAGTG	195307

BX276082.6	451	ACCTCAGCATTTCCAAATTGTTCCACAAACACATTCAAAATTGCCGCCTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195308	ACCTCAGCATTTCCAAATTGTTCCACAAACACATTCAAAATTGCCGCCTG	195357

BX276082.6	501	AACAAAAAGAGTTTTGCTTAACAAACTTCATACTTAATACATAGTTTTAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195358	AACAAAAAGAGTTTTGCTTAACAAACTTCATACTTAATACATAGTTTTAC	195407

BX276082.6	551	CTTCGAGTTGCATAATAGGTCCTTGTAGCTACTAGAATTTTTGTCTGCAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195408	CTTCGAGTTGCATAATAGGTCCTTGTAGCTACTAGAATTTTTGTCTGCAT	195457

BX276082.6	601	TATTTACCACTAAGCACTCTGTTTGCATGCTTTAAAGAAACAAAAAGGCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195458	TATTTACCACTAAGCACTCTGTTTGCATGCTTTAAAGAAACAAAAAGGCA	195507

BX276082.6	651	GATGCTGTTCTTATTCTTTTTAAGAGAGCATCATTTTTTAATTAGGACAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195508	GATGCTGTTCTTATTCTTTTTAAGAGAGCATCATTTTTTAATTAGGACAC	195557

BX276082.6	701	TGAAATGAACGTTGTCTCGAAAGAATTGAAGTATTTATATTTTACATACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195558	TGAAATGAACGTTGTCTCGAAAGAATTGAAGTATTTATATTTTACATACA	195607

BX276082.6	751	GCAAATGGACTTTAAAACCTTTGTGTCGCTAACTGCACAGAATGTTTTAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195608	GCAAATGGACTTTAAAACCTTTGTGTCGCTAACTGCACAGAATGTTTTAA	195657

BX276082.6	801	ACGCAGAAATGAATTCAAACCCCTATCAAACCTCTATAGTGTGTCTTTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195658	ACGCAGAAATGAATTCAAACCCCTATCAAACCTCTATAGTGTGTCTTTTT	195707

BX276082.6	851	CAGCTATTTGAAACCTGTACGTTGGTTGTGATATAATCTTATCCAATCTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195708	CAGCTATTTGAAACCTGTACGTTGGTTGTGATATAATCTTATCCAATCTT	195757

BX276082.6	901	ATTCAAATCATGTCTACATAGAAGAACATAGAAGACTTTTCTATTTAGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195758	ATTCAAATCATGTCTACATAGAAGAACATAGAAGACTTTTCTATTTAGAT	195807

BX276082.6	951	AAAATCCAGTCACACCCAGGTCTTTCCAAACATGTCTGACTTTTTTCTGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195808	AAAATCCAGTCACACCCAGGTCTTTCCAAACATGTCTGACTTTTTTCTGG	195857

BX276082.6	1001	AACATAAAATAAGATAATTTGAGACAGATGTACTTGAATTTAACCTTGAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195858	AACATAAAATAAGATAATTTGAGACAGATGTACTTGAATTTAACCTTGAT	195907

BX276082.6	1051	ATGGAATTTGACATTTATTTTAACTGTCAAATTCATGCCATGTGTAAGAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195908	ATGGAATTTGACATTTATTTTAACTGTCAAATTCATGCCATGTGTAAGAT	195957

BX276082.6	1101	GAAAGAAAGAGGTAGTATGTTCAAATAAATGAATAAATAAAAAAAGAGGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	195958	GAAAGAAAGAGGTAGTATGTTCAAATAAATGAATAAATAAAAAAAGAGGT	196007

BX276082.6	1151	AGAAAGATAAGACAACACTATTTTGAGGATTGTTGGATTTCAATCATCGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196008	AGAAAGATAAGACAACACTATTTTGAGGATTGTTGGATTTCAATCATCGA	196057

BX276082.6	1201	CTCTGCGCTTCTTAAATTATCATCAATTATGTTCCACAAAAGTGTGTTCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196058	CTCTGCGCTTCTTAAATTATCATCAATTATGTTCCACAAAAGTGTGTTCA	196107

BX276082.6	1251	TGTTCCAAATTGTTCAAAAATTAAAAAAAAAAACAATTGAAGCTTCAAAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196108	TGTTCCAAATTGTTCAAAAATTAAAAAAAAAAACAATTGAAGCTTCAAAT	196157

BX276082.6	1301	AACATTTTATATTTCACAACAGCAAAAAAAGCTTTGGAGTGACACAAGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196158	AACATTTTATATTTCACAACAGCAAAAAAAGCTTTGGAGTGACACAAGGG	196207

BX276082.6	1351	TGAGTAACTGATGACAAAATGTACATTTTGGATCATCCAGTGTGACATTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196208	TGAGTAACTGATGACAAAATGTACATTTTGGATCATCCAGTGTGACATTT	196257

BX276082.6	1401	GTAACATTTAATGTTTTTTATCTTAAGAAAACAGGAGACAAAAAAAATAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196258	GTAACATTTAATGTTTTTTATCTTAAGAAAACAGGAGACAAAAAAAATAT	196307

BX276082.6	1451	TTAAAAAAAACGCACATTACAAATGTATGAATTAGGTCACAGTAGGTCCG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196308	TTAAAAAAAACGCACATTACAAATGTATGAATTAGGTCACAGTAGGTCCG	196357

BX276082.6	1501	CTTATCACGGTAATCTATTACACAGCAGAGGAAGTCATGACTTACCTGCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196358	CTTATCACGGTAATCTATTACACAGCAGAGGAAGTCATGACTTACCTGCA	196407

BX276082.6	1551	TACTGGAGAAGACAGACAGAGAGCTGTAGCCTGAGAGAGAAGAATCACTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196408	TACTGGAGAAGACAGACAGAGAGCTGTAGCCTGAGAGAGAAGAATCACTC	196457

BX276082.6	1601	CGACTGTGCATTGAGCCTTATATAAGAGAACAAAATAGAAAAAGAAACAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196458	CGACTGTGCATTGAGCCTTATATAAGAGAACAAAATAGAAAAAGAAACAG	196507

BX276082.6	1651	ATTTTTCAAATGATATTATTTTCTAATCACTGCTTTTGTACTTAATGATA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196508	ATTTTTCAAATGATATTATTTTCTAATCACTGCTTTTGTACTTAATGATA	196557

BX276082.6	1701	TGGGCGATATTCTGTGTATAACAGTCATGACAATAAAGACCTTTGATGTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196558	TGGGCGATATTCTGTGTATAACAGTCATGACAATAAAGACCTTTGATGTT	196607

BX276082.6	1751	AGAATAAGGAGTAATATCAAACAGAATCAATTTATTATTTTATGTGGGGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196608	AGAATAAGGAGTAATATCAAACAGAATCAATTTATTATTTTATGTGGGGT	196657

BX276082.6	1801	TATTCCAGCTGTCGGTTGTTGGGTAAAGCTGCATGTGGATTAAAGACAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196658	TATTCCAGCTGTCGGTTGTTGGGTAAAGCTGCATGTGGATTAAAGACAAA	196707

BX276082.6	1851	AAGGTTTTTTCAAATCTCAAAACAAGAAAGGTGTAATATAAGTTTAATTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196708	AAGGTTTTTTCAAATCTCAAAACAAGAAAGGTGTAATATAAGTTTAATTT	196757

BX276082.6	1901	TCTTCTGTACATTAGAATGGGTCTGTTTGTGTTTCATTTATTTATTTGGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196758	TCTTCTGTACATTAGAATGGGTCTGTTTGTGTTTCATTTATTTATTTGGT	196807

BX276082.6	1951	AAAATAATGACTTTCATTCATCTTAACCATGGTTTACAGAAAATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928885.9	196808	AAAATAATGACTTTCATTCATCTTAACCATGGTTTACAGAAAATGAATTC	196857

Overview

Query
BX276082.6 - 75111 bps
Hit
AL928885.9 - 196857 bps
Total alignments
26
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100190920001200011948581968571
286.89951885606956256160007601891
3100537184928562-166999670691
4100537187128782-166999670691
5100537191749244-166999670691
684.56601405611756256180094802421
789.19901487076470911-180096802431
892.317410588308934180141802441
989.552323573181632172-11020481024011
1090.05240365663746673811020491024101
1192.142373234413744459-11020931024101
1283.81202821315313434-11021051023881
1391.11981354413744271-11247431248771
1485.9377135666046673811247431248771
1583.1957120594395955811306621307801
1692.685382594115949211317841318651
1785.521813596636766725-11442131445641
1885.23181359318203217811442131445641
1991.1582113123191243111442161443281
2084.08128276131521342711442211444901
2187.2595188560695625611482881484831
2283.17137300441414444011547421550381
2384.061783646636866731-11822801826431
2484.8177362318163217711822821826431
2577.9877273131521342411822911825671
2684.911433681727217639-11895771899341
Short-link