<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 675 bps / non-identical: 200 bps

Full alignment

AL928768.1	8814	GCCATGTCCCCC-GAGGCCTGTGAACCTTCACTCTGAGCCACTAAAACAT	8862
			|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	1	GCCATGTCACCCAGAGGCCTGTGAACCTTCACTCTGAGCCACTAAAACAT	50

AL928768.1	8863	TCAGGAGCTTTGAAAGCAGCCCCCGTCCTTGTCACTATGCGATGACTCTG	8912
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	51	TCAGGAGCTTTGAAAGCAGCCCCCGTCCTTGTCACTATGCGATGACTCTG	100

AL928768.1	8913	AGCATCACGCTGTCCCTGCTGGATCCACCCTCCAGCCCCAGCGAGGGAGG	8962
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	101	AGCATCACGCTGTCCCTGCTGGATCCACCCTCCAGCCCCAGCGAGGGAGG	150

AL928768.1	8963	CTGGGCCCCGGGCAGCAGGTGGTGAGGGCAGCGGGCACAGCCACCCTACA	9012
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	151	CTGGGCCCCGGGCAGCAGGTGGTGAGGGCAGCGGGCACAGCCACCCTACA	200

AL928768.1	9013	GCACACACAGGGTCTCAGGGACGCGTCCACCACAGCCCGTGCACAGGCTC	9062
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	201	GCACACACAGGGTCTCAGGGACGCGTCCACCACAGCCCGTGCACAGGCTC	250

AL928768.1	9063	CTCACGGCACTGAGTTCACCCGGGGCGCGGGCCGTTTGTCCTCAGGAGTC	9112
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	251	CTCACGGCACTGAGTTCACCCGGGGCGCGGGCCGTTTGTCCTCAGGAGTC	300

AL928768.1	9113	CCACTGTGCCCTCCGCCCCCAGCCCTGTCCTGCTGAGGCTGCAGCTGGGT	9162
			|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	301	CCGCTGTACCCTCCGCCCCCAGCCCTGTCCTGCTGAGGCTGCAGCTGGGT	350

AL928768.1	9163	CCCGGGGCACAGGGCGGCCCTGAGCACCTTGTCATGTTGGTCCCTGTCGG	9212
			||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
AL928762.2	351	CCCGGGGCACAGGGCGGCCCTGAGCACTTTGTCATCTTGGTCCCTGTCGG	400

AL928768.1	9213	GTGGGCTGCTGGCTCTCTGTGGAGCTGGCAGAGCCGCGGTTCAGCCTTGG	9262
			|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	401	GTGGGCTGCTGGCTGTCTGTGGAGCTGGCAGAGCCGCGGTTCAGCCTTGG	450

AL928768.1	9263	AGGCCGGTCCTGGGGCCCAGCAGCCGTGGGGAGCACTGCCCAGTCCCGTG	9312
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	451	AGGCCGGTCCTGGGGCCCAGCAGCCGTGGGGAGCACTGCCCAGTCCCGTG	500

AL928768.1	9313	CCCACAGGGAATCACCTGGGCTGAGGAAGGGCCCACACGCCGACGGGATC	9362
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	501	CCCACAGGGAATCACCTGGGCTGAGGAAGGGCCCACACGCCGACGGGATC	550

AL928768.1	9363	GGGGTCAGGCAGCGCACGCCTGGCACCGAGATCCCACGTCCCGAAGTGGG	9412
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	551	GGGGTCAGGCAGCGCACGCCTGGCACCGAGATCCCACGTCCCGAAGTGGG	600

AL928768.1	9413	GACACGGCCCAGGGGCACTGTTCCGGGAGGGTCTCAAGATGGGGTCTCCT	9462
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	601	GACACGGCCCAGGGGCACTGTTCCGGGAGGGTCTCAAGATGGGGTCTCCT	650

AL928768.1	9463	ATTTCAATCTTCACTCCTTCTGCACC	9488
			||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	651	ATTTCAATCTTCACTCCTTCTGCACC	676

Compact alignment

AL928768.1	8814	GCCATGTCCCCC-GAGGCCTGTGAACCTTCACTCTGAGCCACTAAAACAT	8862
			|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	1	GCCATGTCACCCAGAGGCCTGTGAACCTTCACTCTGAGCCACTAAAACAT	50

skip 250 bps 100% identity alignment

AL928768.1	9113	CCACTGTGCCCTCCGCCCCCAGCCCTGTCCTGCTGAGGCTGCAGCTGGGT	9162
			|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	301	CCGCTGTACCCTCCGCCCCCAGCCCTGTCCTGCTGAGGCTGCAGCTGGGT	350

AL928768.1	9163	CCCGGGGCACAGGGCGGCCCTGAGCACCTTGTCATGTTGGTCCCTGTCGG	9212
			||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
AL928762.2	351	CCCGGGGCACAGGGCGGCCCTGAGCACTTTGTCATCTTGGTCCCTGTCGG	400

AL928768.1	9213	GTGGGCTGCTGGCTCTCTGTGGAGCTGGCAGAGCCGCGGTTCAGCCTTGG	9262
			|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928762.2	401	GTGGGCTGCTGGCTGTCTGTGGAGCTGGCAGAGCCGCGGTTCAGCCTTGG	450

skip 226 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AL928768.1 - 9488 bps
Hit
AL928762.2 - 3183 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 675 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link