<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL713966.7	1	GAATTCAGCAATATTTCTCCCATTTGCTTTTGAAAGAAGAGAAATATGGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13328	GAATTCAGCAATATTTCTCCCATTTGCTTTTGAAAGAAGAGAAATATGGC	13377

AL713966.7	51	TCTGTTCTGCCTGGCTCACCGGCAGTCAGAGTTTAAGGTTATCTCTCTTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13378	TCTGTTCTGCCTGGCTCACCGGCAGTCAGAGTTTAAGGTTATCTCTCTTA	13427

AL713966.7	101	TTCCCTGAACAATTGCTGTTATCCTGTTCTTTTTTCAAGGTGCCCACATT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13428	TTCCCTGAACAATTGCTGTTATCCTGTTCTTTTTTCAAGGTGCCCACATT	13477

AL713966.7	151	TCATATTGCTCAAACACACATACTGTACAATTTGTGCAGTTAATGCAATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13478	TCATATTGCTCAAACACACATACTGTACAATTTGTGCAGTTAATGCAATT	13527

AL713966.7	201	ATCACATAGTCCTGAGGCGACGTACATCCTCCTCGGCTGATAGGATTAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13528	ATCACATAGTCCTGAGGCGACGTACATCCTCCTCGGCTGATAGGATTAAG	13577

AL713966.7	251	AGATTAAAGTAAAGGCAGGCATAGGAAATCACAAGGGTATTGATTGGGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13578	AGATTAAAGTAAAGGCAGGCATAGGAAATCACAAGGGTATTGATTGGGGA	13627

AL713966.7	301	AGTGATAAGTGTCCATGAAATCTTTACAATTTATGTTTAGAGATTGCAGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13628	AGTGATAAGTGTCCATGAAATCTTTACAATTTATGTTTAGAGATTGCAGT	13677

AL713966.7	351	AAAGACAGGCATAAGAAATTACAAAAGTATTAATTTGGGGAACTAATAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13678	AAAGACAGGCATAAGAAATTACAAAAGTATTAATTTGGGGAACTAATAAA	13727

AL713966.7	401	TGTGCATAAAATCTTCACAATCCACATTCTTCTGTTCTGGCTTCAGCCGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13728	TGTGCATAAAATCTTCACAATCCACATTCTTCTGTTCTGGCTTCAGCCGG	13777

AL713966.7	451	TCCCTCTGTTTGGGGTCCCTGACTTCCCGCAACATAATATTAATGGACTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13778	TCCCTCTGTTTGGGGTCCCTGACTTCCCGCAACATAATATTAATGGACTC	13827

AL713966.7	501	TCCTTGTAACCTCCCAGGAGCTTCCAATATGTTTAAATAAAACTTAATTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13828	TCCTTGTAACCTCCCAGGAGCTTCCAATATGTTTAAATAAAACTTAATTC	13877

AL713966.7	551	CTTACTATGGCCACCAAGGCCGAATATGATGCAGCTCCTGACTTTCTCTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13878	CTTACTATGGCCACCAAGGCCGAATATGATGCAGCTCCTGACTTTCTCTC	13927

AL713966.7	601	TCTCTTACCTCATCTTCTGCCACTCCACCCCTTGCTTTCCATCCTTCAGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13928	TCTCTTACCTCATCTTCTGCCACTCCACCCCTTGCTTTCCATCCTTCAGC	13977

AL713966.7	651	CCCTCTAACCTTCTTTCTGTCTCTTCAACACAGCACACGCCTTCCCATTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	13978	CCCTCTAACCTTCTTTCTGTCTCTTCAACACAGCACACGCCTTCCCATTC	14027

AL713966.7	701	CTTGGCCTTTCCCCTTTTCTGTCTGTCTGGAACACTTGTCCCTTAGATCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14028	CTTGGCCTTTCCCCTTTTCTGTCTGTCTGGAACACTTGTCCCTTAGATCT	14077

AL713966.7	751	TCACATGGCTGTCTTATTGTTCTTGTCTCAGCTAAATGTGAGCTCTCCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14078	TCACATGGCTGTCTTATTGTTCTTGTCTCAGCTAAATGTGAGCTCTCCTC	14127

AL713966.7	801	AGGGAGGGCTCCCAAACTACCTGTGAATCCAATGTGAAGTTGGGTGAATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14128	AGGGAGGGCTCCCAAACTACCTGTGAATCCAATGTGAAGTTGGGTGAATC	14177

AL713966.7	851	CAATTCTCTCTGTCCTATCACCCTGATGTCTTTTTTTAAAGGCATTATTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14178	CAATTCTCTCTGTCCTATCACCCTGATGTCTTTTTTTAAAGGCATTATTG	14227

AL713966.7	901	CTCTCTGAATTTTTCTTTTTTGTTAAATATTTATTGGGATATTGTCTGTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14228	CTCTCTGAATTTTTCTTTTTTGTTAAATATTTATTGGGATATTGTCTGTC	14277

AL713966.7	951	TCCTCTGGTATTGAGTTCCATGAGAGTAGGGATCTTTTTTATCCTATTCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14278	TCCTCTGGTATTGAGTTCCATGAGAGTAGGGATCTTTTTTATCCTATTCA	14327

AL713966.7	1001	AGTAGAAATCTCTGAGCCTAGAACAGAGACCAGAACAAAACTTTTGCTCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14328	AGTAGAAATCTCTGAGCCTAGAACAGAGACCAGAACAAAACTTTTGCTCA	14377

AL713966.7	1051	GAAACATACCTGTGGTCTAAATGAATAAACCGAAGTTCTGGGAACTGATC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14378	GAAACATACCTGTGGTCTAAATGAATAAACCGAAGTTCTGGGAACTGATC	14427

AL713966.7	1101	ACTCTGGGTATTCTAGAAAGCAGAAAAGGGCTCAAGCTCCTACACCCTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14428	ACTCTGGGTATTCTAGAAAGCAGAAAAGGGCTCAAGCTCCTACACCCTTT	14477

AL713966.7	1151	CATTCTAATGACATGCTATATCCCTTCTCCTCCCTGTGAGAAATTAAGGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14478	CATTCTAATGACATGCTATATCCCTTCTCCTCCCTGTGAGAAATTAAGGC	14527

AL713966.7	1201	AAACTTCTTTTCTCTCCTCTTTCTAGTTGGAAGAAGGATTCACAGATAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14528	AAACTTCTTTTCTCTCCTCTTTCTAGTTGGAAGAAGGATTCACAGATAAG	14577

AL713966.7	1251	GAAACAGTGATTGTAAGAAAGAAAAAAATTTTCATTAAGAATTACCTCTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14578	GAAACAGTGATTGTAAGAAAGAAAAAAATTTTCATTAAGAATTACCTCTT	14627

AL713966.7	1301	TTCTGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14628	TTCTGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGC	14677

AL713966.7	1351	TGAGGCAGGCGGATCATGAGGTAAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGCCAACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14678	TGAGGCAGGCGGATCATGAGGTAAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGCCAACA	14727

AL713966.7	1401	TGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTACCTGGGAGGTGGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14728	TGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTACCTGGGAGGTGGA	14777

AL713966.7	1451	GGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14778	GGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA	14827

AL713966.7	1501	GCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTATCGGTTTTTTTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14828	GCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTATCGGTTTTTTTTT	14877

AL713966.7	1551	TTTTAATAGTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTTGTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14878	TTTTAATAGTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTTGTT	14927

AL713966.7	1601	ACATATGTATACATGTGCCACGTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCTTCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14928	ACATATGTATACATGTGCCACGTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCTTCAT	14977

AL713966.7	1651	TTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTTCCTCCACCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	14978	TTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTTCCTCCACCCC	15027

AL713966.7	1701	ACAACAGGCCCCGGTGTGTAAAGTTCCCCTTCCTGTGTCCATGTGTTCTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	15028	ACAACAGGCCCCGGTGTGTAAAGTTCCCCTTCCTGTGTCCATGTGTTCTC	15077

AL713966.7	1751	ATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTTTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	15078	ATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTTTG	15127

AL713966.7	1801	TCCTTGCAATAGTTTGTTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	15128	TCCTTGCAATAGTTTGTTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCC	15177

AL713966.7	1851	CTGCAAAGGACACGAACTTATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	15178	CTGCAAAGGACACGAACTTATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATG	15227

AL713966.7	1901	GTGTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGCCTATCATTGTTGGACATTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	15228	GTGTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGCCTATCATTGTTGGACATTT	15277

AL713966.7	1951	GGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCACAATAAACATAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845554.2	15278	GGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCACAATAAACATAC	15327

Overview

Query
AL713966.7 - 124047 bps
Hit
AL845554.2 - 15327 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link