<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL669872.8	1	GAATTCCACACAAGGAACGCCACCTTGACCCCGGTGTGAAATTCCCTAAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8445	GAATTCCACACAAGGAACGCCACCTTGACCCCGGTGTGAAATTCCCTAAC	8494

AL669872.8	51	TCGACTAGATTTCGATTTTGATGGAAGTCTGAGAAAACGTCTGCCAGGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8495	TCGACTAGATTTCGATTTTGATGGAAGTCTGAGAAAACGTCTGCCAGGAG	8544

AL669872.8	101	TCTATGACTTGCATGAGCTACTTGGAGGGTTGCCTGGATAGGAAAAGGCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8545	TCTATGACTTGCATGAGCTACTTGGAGGGTTGCCTGGATAGGAAAAGGCT	8594

AL669872.8	151	CAGCAGCCCCAGTCATCCTGGCCTCTTTTCTTCTGAAGCCCTGGGCTGTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8595	CAGCAGCCCCAGTCATCCTGGCCTCTTTTCTTCTGAAGCCCTGGGCTGTC	8644

AL669872.8	201	TGCTACAGACACTGAACGTTCCTGAGAGGCTCAGGCCCAGGGTCTGCCAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8645	TGCTACAGACACTGAACGTTCCTGAGAGGCTCAGGCCCAGGGTCTGCCAG	8694

AL669872.8	251	AACTGATGTATTTTATTAAAAGATGAGAGTATCTTTTTGTCCTTGTTTCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8695	AACTGATGTATTTTATTAAAAGATGAGAGTATCTTTTTGTCCTTGTTTCA	8744

AL669872.8	301	AATAAGATATACCTAAAGAGTGGATGAGACTAAGAAATGTAAAACTACAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8745	AATAAGATATACCTAAAGAGTGGATGAGACTAAGAAATGTAAAACTACAG	8794

AL669872.8	351	AGCTGATTAATTGCTATTCTATCTCTGGGTTGGTGAGAGGCAAAGCTTAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8795	AGCTGATTAATTGCTATTCTATCTCTGGGTTGGTGAGAGGCAAAGCTTAT	8844

AL669872.8	401	AGGTTTCTAGACTAAGGGAAGTTTGGAGAAGCCATGTTTTCAGTCCTATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8845	AGGTTTCTAGACTAAGGGAAGTTTGGAGAAGCCATGTTTTCAGTCCTATT	8894

AL669872.8	451	TAGTTCTCAGGCCCCGGTGGAATCTGCTTCTTAGTATCTCTGGATAACTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8895	TAGTTCTCAGGCCCCGGTGGAATCTGCTTCTTAGTATCTCTGGATAACTC	8944

AL669872.8	501	TTCCTTCCTCCCCCTTCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCCTCCCCCTCCCCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8945	TTCCTTCCTCCCCCTTCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCCTCCCCCTCCCCTC	8994

AL669872.8	551	CCCTCCCTGCTCTGCCTCTTAAGCCTTGAAGTGTGTGCTCTGCACATCCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	8995	CCCTCCCTGCTCTGCCTCTTAAGCCTTGAAGTGTGTGCTCTGCACATCCA	9044

AL669872.8	601	CAGACCTAGCTCTTGTCTCTTGTCAGATGTACAGTGTCTTAGTCAGGGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9045	CAGACCTAGCTCTTGTCTCTTGTCAGATGTACAGTGTCTTAGTCAGGGTT	9094

AL669872.8	651	ACTATGGCTGAGAGGAAACACCAAGACCCAAGCAACCTGGGGAGGAAAGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9095	ACTATGGCTGAGAGGAAACACCAAGACCCAAGCAACCTGGGGAGGAAAGG	9144

AL669872.8	701	ATTTATTCTGCTTACATTTCCACATCACCAAAATCAGGACAGGAACTCTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9145	ATTTATTCTGCTTACATTTCCACATCACCAAAATCAGGACAGGAACTCTA	9194

AL669872.8	751	ACAGAGCAGAAATCTGATATTAGGAGCTGATATAGAAACCATGGAAGGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9195	ACAGAGCAGAAATCTGATATTAGGAGCTGATATAGAAACCATGGAAGGTC	9244

AL669872.8	801	ACTGCTTGCTGGCTTGCTCCCCATGGCTTGCTCTGCCTGCTTTCCTATAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9245	ACTGCTTGCTGGCTTGCTCCCCATGGCTTGCTCTGCCTGCTTTCCTATAG	9294

AL669872.8	851	AACGCTGGACAACCTGCCCAGGAGTGGCACCATCTACAATGGGCTGGGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9295	AACGCTGGACAACCTGCCCAGGAGTGGCACCATCTACAATGGGCTGGGCC	9344

AL669872.8	901	CTCCCCATCAACCACTAATTAAGAATGCCATACAGCTGGATCTTATGGGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9345	CTCCCCATCAACCACTAATTAAGAATGCCATACAGCTGGATCTTATGGGG	9394

AL669872.8	951	GCATTTTTCTCAATTGAGGTTCCCCCTTTCAGATGTCTCAAGTTGACCGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9395	GCATTTTTCTCAATTGAGGTTCCCCCTTTCAGATGTCTCAAGTTGACCGG	9444

AL669872.8	1001	AACCTAACTAGTACATGAAGGGAACTAACATTTTTACTGTGTCTACAACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9445	AACCTAACTAGTACATGAAGGGAACTAACATTTTTACTGTGTCTACAACA	9494

AL669872.8	1051	TGCACAATGCTGTGATATATCAGGAAAAAGATGCCAAGCCAAGAGAGTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9495	TGCACAATGCTGTGATATATCAGGAAAAAGATGCCAAGCCAAGAGAGTTT	9544

AL669872.8	1101	CTTAATGGACCTCAAATTCCCCTTGCTCTCTTAAACTCAAAAGCAATGCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9545	CTTAATGGACCTCAAATTCCCCTTGCTCTCTTAAACTCAAAAGCAATGCC	9594

AL669872.8	1151	TAAGCCTTTAAAAAGATGGCAATGGTAAAAATAAACGATTATTTTTAAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9595	TAAGCCTTTAAAAAGATGGCAATGGTAAAAATAAACGATTATTTTTAAAA	9644

AL669872.8	1201	GGTGATAACGGTGGCCACCAATGCCAATCACTAGGCAATCCAAAGTCTAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9645	GGTGATAACGGTGGCCACCAATGCCAATCACTAGGCAATCCAAAGTCTAA	9694

AL669872.8	1251	AGATGAAACTATGGGTGGGTGAGGAAGGTAGGTGGGTGGGTGGGTGAAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9695	AGATGAAACTATGGGTGGGTGAGGAAGGTAGGTGGGTGGGTGGGTGAAGG	9744

AL669872.8	1301	GAGCACCCTCTCAGAGACAAGGGAAGGGGGGATGGGGGGAATAACTCTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9745	GAGCACCCTCTCAGAGACAAGGGAAGGGGGGATGGGGGGAATAACTCTTG	9794

AL669872.8	1351	GAGGGGGAACCAGGAAGAGGGGCAGCATTTGGAATGTAAATAAATAACAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9795	GAGGGGGAACCAGGAAGAGGGGCAGCATTTGGAATGTAAATAAATAACAA	9844

AL669872.8	1401	AATTTAAAACAATTAAAAAAAATAAAAACAATTTTAAAAAATCAAACTAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9845	AATTTAAAACAATTAAAAAAAATAAAAACAATTTTAAAAAATCAAACTAA	9894

AL669872.8	1451	AAACATTATATATATATAATGTCATATAATAGATGAATATATTATATATG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9895	AAACATTATATATATATAATGTCATATAATAGATGAATATATTATATATG	9944

AL669872.8	1501	TATACATTACATAGCAATATGTATATATGTCAATATGTATATATATTTTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9945	TATACATTACATAGCAATATGTATATATGTCAATATGTATATATATTTTA	9994

AL669872.8	1551	TACTCATCTATTATATATGTAGTTAGTTTATTTTAACTTCTAGTTTTCAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	9995	TACTCATCTATTATATATGTAGTTAGTTTATTTTAACTTCTAGTTTTCAT	10044

AL669872.8	1601	GATCTTAATTTTCTAAATAAGTCCATTAAATTTTCCCTTTTGCCTTCAGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	10045	GATCTTAATTTTCTAAATAAGTCCATTAAATTTTCCCTTTTGCCTTCAGT	10094

AL669872.8	1651	CCCTTGCTATGTGTTGTTTGGGGACATTGCCCTGATTTTCTGAGGCTAGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	10095	CCCTTGCTATGTGTTGTTTGGGGACATTGCCCTGATTTTCTGAGGCTAGG	10144

AL669872.8	1701	AGAGCATGCTCAGTTGGCTTCTGCTTACGTTTTACTGAGAGATGCTTCCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	10145	AGAGCATGCTCAGTTGGCTTCTGCTTACGTTTTACTGAGAGATGCTTCCT	10194

AL669872.8	1751	TCAGTGCGTTCCTCAAAGTGTTGGTACCTCGGGTCCCCAGACAGCCACAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	10195	TCAGTGCGTTCCTCAAAGTGTTGGTACCTCGGGTCCCCAGACAGCCACAC	10244

AL669872.8	1801	TTCATCTGTGGTTTGCTCCTCACACCCATCCATTATGTCTGAGGAAGACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	10245	TTCATCTGTGGTTTGCTCCTCACACCCATCCATTATGTCTGAGGAAGACT	10294

AL669872.8	1851	CTGGGTGGCCATGGAGGCTGTTTCTACCTTGGCTAGAGGAATAAATGGTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	10295	CTGGGTGGCCATGGAGGCTGTTTCTACCTTGGCTAGAGGAATAAATGGTA	10344

AL669872.8	1901	CTTCTAACCTCTTATGGCTGCCTATAGGAGTCTCTCCGACGGGCACAAGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	10345	CTTCTAACCTCTTATGGCTGCCTATAGGAGTCTCTCCGACGGGCACAAGG	10394

AL669872.8	1951	CTTCGCTGGTGGGTACTAATTCTTTATCTCGTAACAGTGTCCAGAATACT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845553.5	10395	CTTCGCTGGTGGGTACTAATTCTTTATCTCGTAACAGTGTCCAGAATACT	10444

Overview

Query
AL669872.8 - 199673 bps
Hit
AL845553.5 - 10444 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link