<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL773535.8	1	GGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	5571	GGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTTGC	5620

AL773535.8	51	CTCCCAAAGTGCTGGGATTTCAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCACAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	5621	CTCCCAAAGTGCTGGGATTTCAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCACAAT	5670

AL773535.8	101	AAGTTTTTAATTACCAGAGTCAGTGGTTCCTGTCATTGATTGAGCTTACT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	5671	AAGTTTTTAATTACCAGAGTCAGTGGTTCCTGTCATTGATTGAGCTTACT	5720

AL773535.8	151	GACTGGACAATGAGAGGGTCATATGTGGCTGTCTCCAGCCATTACATTAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	5721	GACTGGACAATGAGAGGGTCATATGTGGCTGTCTCCAGCCATTACATTAA	5770

AL773535.8	201	GGTGACACTTGAGCATGACACGAGGTCTGCATTCTCTACAATCAACTGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	5771	GGTGACACTTGAGCATGACACGAGGTCTGCATTCTCTACAATCAACTGGA	5820

AL773535.8	251	TCTGTCCCACTGCTTCCCACCAGGAGCAGAAGCATGCTTGTGCCAGTTCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	5821	TCTGTCCCACTGCTTCCCACCAGGAGCAGAAGCATGCTTGTGCCAGTTCC	5870

AL773535.8	301	TAAACATCATCATTTCATTTTCAGCCCACAGCCCTCCCCTGCTCAGATTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	5871	TAAACATCATCATTTCATTTTCAGCCCACAGCCCTCCCCTGCTCAGATTT	5920

AL773535.8	351	CCCACCATCTAAGGCAGCAATCCTCAAATGCTAGTGTGCACAAGGATCTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	5921	CCCACCATCTAAGGCAGCAATCCTCAAATGCTAGTGTGCACAAGGATCTA	5970

AL773535.8	401	AGGCACTTGCCGAAAATGTAGATTCCTGCACCAACCCCAGAGAACCAGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	5971	AGGCACTTGCCGAAAATGTAGATTCCTGCACCAACCCCAGAGAACCAGAA	6020

AL773535.8	451	GCAATCCCTCTAGGGTAGAGCTTGAGAATTTGCTTTGAAAAAAGATCTTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6021	GCAATCCCTCTAGGGTAGAGCTTGAGAATTTGCTTTGAAAAAAGATCTTA	6070

AL773535.8	501	CATGTTTTTGGATAACACTTAAAGATGGTCCTAGAACAGTGCTTCTGGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6071	CATGTTTTTGGATAACACTTAAAGATGGTCCTAGAACAGTGCTTCTGGAA	6120

AL773535.8	551	ATTTTAATACGTAAGCAAATTAAGAGCAGCTTGTTAAAATGCAGACGTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6121	ATTTTAATACGTAAGCAAATTAAGAGCAGCTTGTTAAAATGCAGACGTTT	6170

AL773535.8	601	AAAAACTTGGTGCAGGCCTGAAATTCTGCACTCATATGTTCTCCCAGAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6171	AAAAACTTGGTGCAGGCCTGAAATTCTGCACTCATATGTTCTCCCAGAGA	6220

AL773535.8	651	AGCTAAAGCTGCTGGTCCTTTTGGCCACACTTTGAGTCACCAGAACCCAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6221	AGCTAAAGCTGCTGGTCCTTTTGGCCACACTTTGAGTCACCAGAACCCAA	6270

AL773535.8	701	AGGATTTCCGGCCTGTATCTGGGCCCAAGAGAGCAAAAGTGTCACAAACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6271	AGGATTTCCGGCCTGTATCTGGGCCCAAGAGAGCAAAAGTGTCACAAACA	6320

AL773535.8	751	CACACAGTTTTAACCTTCCCTGATTCTCTGTGGAGTAGAATCTTCTCCCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6321	CACACAGTTTTAACCTTCCCTGATTCTCTGTGGAGTAGAATCTTCTCCCT	6370

AL773535.8	801	TACTTCCAGTCAGACAGGTCCCCATGGATAAGGGGGTACTGCTCTGCCTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6371	TACTTCCAGTCAGACAGGTCCCCATGGATAAGGGGGTACTGCTCTGCCTT	6420

AL773535.8	851	GTGTGCCCTCAGTTTCCCTTTATGGAACTCTGTTCTGATCTCAAGCTTCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6421	GTGTGCCCTCAGTTTCCCTTTATGGAACTCTGTTCTGATCTCAAGCTTCC	6470

AL773535.8	901	ACTAGACCTGCTATTAGAAGTGCTGAACACTGATTTTCTGTGAGTATAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6471	ACTAGACCTGCTATTAGAAGTGCTGAACACTGATTTTCTGTGAGTATAAA	6520

AL773535.8	951	GTAGTTAAAAGAAAAAAGAAATATATGTAAGGCTGTAGAGTTTCCATCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6521	GTAGTTAAAAGAAAAAAGAAATATATGTAAGGCTGTAGAGTTTCCATCTG	6570

AL773535.8	1001	TAGATATCAAGAAATGAGTATGAACTGTTAGGCATTCCCCAAGATTGTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6571	TAGATATCAAGAAATGAGTATGAACTGTTAGGCATTCCCCAAGATTGTTG	6620

AL773535.8	1051	TTCAAAGATCCTCCCAAGTTTGAGACCTCAAATTCTTTCAGGTGATATTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6621	TTCAAAGATCCTCCCAAGTTTGAGACCTCAAATTCTTTCAGGTGATATTC	6670

AL773535.8	1101	ATATCATTTACTCTTTTTTTTTTTAAACTTAGAAAGTGAGTTGCAGCAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6671	ATATCATTTACTCTTTTTTTTTTTAAACTTAGAAAGTGAGTTGCAGCAAA	6720

AL773535.8	1151	TTTTCTCCTGAAAGAATTGCAAAGATGAACCGTGGCCTCTTTCTATATTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6721	TTTTCTCCTGAAAGAATTGCAAAGATGAACCGTGGCCTCTTTCTATATTC	6770

AL773535.8	1201	ATAATTTTTGTCTTAGGGTTAAAAAGACTCCCCCAAGGACAGAAAATTGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6771	ATAATTTTTGTCTTAGGGTTAAAAAGACTCCCCCAAGGACAGAAAATTGT	6820

AL773535.8	1251	ACCTAATGATACAGCCTAGAGCGCATGTTGTTCCTTTTGTCTACAGTACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6821	ACCTAATGATACAGCCTAGAGCGCATGTTGTTCCTTTTGTCTACAGTACC	6870

AL773535.8	1301	TTCTACCTCTGGCTCAAATGCACTCTGGTCACTGATGCACCTCCAGTTCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6871	TTCTACCTCTGGCTCAAATGCACTCTGGTCACTGATGCACCTCCAGTTCT	6920

AL773535.8	1351	CACAGCTTAGTAAATTATGGTGTAGTGATCACGTCTATGTCCCTACTTCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6921	CACAGCTTAGTAAATTATGGTGTAGTGATCACGTCTATGTCCCTACTTCC	6970

AL773535.8	1401	CCAACCAAATTTTCTGAGCTATGCCAGGGTGAGGATGTGGCCCTTTTCAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	6971	CCAACCAAATTTTCTGAGCTATGCCAGGGTGAGGATGTGGCCCTTTTCAT	7020

AL773535.8	1451	CTTGTAATTCCCAAAAGTCTGTGGTGGAGTGCAGAGATGACCACTAAATG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	7021	CTTGTAATTCCCAAAAGTCTGTGGTGGAGTGCAGAGATGACCACTAAATG	7070

AL773535.8	1501	AAAGAATCACTCGTACTGGTTGAAACAATACCAATAAATACCTTAGGTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	7071	AAAGAATCACTCGTACTGGTTGAAACAATACCAATAAATACCTTAGGTTC	7120

AL773535.8	1551	TGTGGTGAACACAGATCAGTAAATAAATGTTGGGCAATCTTCCAGTCTCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	7121	TGTGGTGAACACAGATCAGTAAATAAATGTTGGGCAATCTTCCAGTCTCT	7170

AL773535.8	1601	CAGTGTCCCACGGTATATCTGTTCCCCCATAGGGAGCACAGCTAGAGCTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	7171	CAGTGTCCCACGGTATATCTGTTCCCCCATAGGGAGCACAGCTAGAGCTC	7220

AL773535.8	1651	CTTTACCTACGCTGCGGGGACACTGATTTGCATGGGGAGGCCTGGTGCAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	7221	CTTTACCTACGCTGCGGGGACACTGATTTGCATGGGGAGGCCTGGTGCAA	7270

AL773535.8	1701	GGCCTCTGCTGGGTATGAGCAGCAGTACAAGCCTTTGAAGGCTGTGTGCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	7271	GGCCTCTGCTGGGTATGAGCAGCAGTACAAGCCTTTGAAGGCTGTGTGCT	7320

AL773535.8	1751	GTTCAGAACTTGGAGCTGGTTGGGGGCCTCCGATGCCCTGTGCTGACAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	7321	GTTCAGAACTTGGAGCTGGTTGGGGGCCTCCGATGCCCTGTGCTGACAAG	7370

AL773535.8	1801	CTGGCCTGGGGCTTCTCCCCACTAGAGTCTTCTCTATATCTCAAGGTATG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	7371	CTGGCCTGGGGCTTCTCCCCACTAGAGTCTTCTCTATATCTCAAGGTATG	7420

AL773535.8	1851	CACATCTCTTCCTGGGCACACAGGCAATGGGCTAGACAAGCATCTCTCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	7421	CACATCTCTTCCTGGGCACACAGGCAATGGGCTAGACAAGCATCTCTCTC	7470

AL773535.8	1901	CTCTAAGGCTTGTCACCAAGCATTCCTTCCTTCCAGGGGGTGGGGTTTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	7471	CTCTAAGGCTTGTCACCAAGCATTCCTTCCTTCCAGGGGGTGGGGTTTGG	7520

AL773535.8	1951	AAATTCCCACTTAATATAGCCCACCTTCTGTCATTTGACATTTTCTAACA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845452.3	7521	AAATTCCCACTTAATATAGCCCACCTTCTGTCATTTGACATTTTCTAACA	7570

Overview

Query
AL773535.8 - 88074 bps
Hit
AL845452.3 - 7570 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link