<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL844527.6	1	GGCCAGTTGGGCCAATGGGGCCCTTCTCACCCTGTGGGACAGGAGGAAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	91843	GGCCAGTTGGGCCAATGGGGCCCTTCTCACCCTGTGGGACAGGAGGAAGG	91892

AL844527.6	51	AGTCATGGCCTGGAGGTGACCCTCACCCTCAAACACCCCACAGGAAACTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	91893	AGTCATGGCCTGGAGGTGACCCTCACCCTCAAACACCCCACAGGAAACTT	91942

AL844527.6	101	GTCATAGCCCATCAACCCTAGGCTCACAGACCCCTCCCCAGTACCCCTCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	91943	GTCATAGCCCATCAACCCTAGGCTCACAGACCCCTCCCCAGTACCCCTCC	91992

AL844527.6	151	CCAAGACCCCCACACTCACTGGGACACCTTTCTCTCCTGCTGCTCCAGGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	91993	CCAAGACCCCCACACTCACTGGGACACCTTTCTCTCCTGCTGCTCCAGGG	92042

AL844527.6	201	GGACCCTGCGGGCCTGGGCGCCCTGGCGGACCAATGGGTCCCCCTGATCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92043	GGACCCTGCGGGCCTGGGCGCCCTGGCGGACCAATGGGTCCCCCTGATCC	92092

AL844527.6	251	TGCTGCACCTCGTTCCCCAGGGGAGCCCTGAGAAAGCAGATGGTCAGACC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92093	TGCTGCACCTCGTTCCCCAGGGGAGCCCTGAGAAAGCAGATGGTCAGACC	92142

AL844527.6	301	CCCAGGAAGGAGACACCAGCCCGCCCATACCAGAGAACCTCGGACCACAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92143	CCCAGGAAGGAGACACCAGCCCGCCCATACCAGAGAACCTCGGACCACAA	92192

AL844527.6	351	TTCCCAAAAGCTCCCAAAATCAGATGCATTCTGGCTGTCCCTGGACAGCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92193	TTCCCAAAAGCTCCCAAAATCAGATGCATTCTGGCTGTCCCTGGACAGCC	92242

AL844527.6	401	TCTGCCCAGCCCCACAGCCCCTGGTGGTATCAGAATGCCACTCCCACCCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92243	TCTGCCCAGCCCCACAGCCCCTGGTGGTATCAGAATGCCACTCCCACCCT	92292

AL844527.6	451	TCCTCACCCACCCCTTTCCCGGGTCCTTCCTACCACTTCCGGAACCCCAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92293	TCCTCACCCACCCCTTTCCCGGGTCCTTCCTACCACTTCCGGAACCCCAG	92342

AL844527.6	501	ACTCACTGCAGGGCCAGGGGGGCCAGACGGACCTTCATTCCCCTTCAAAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92343	ACTCACTGCAGGGCCAGGGGGGCCAGACGGACCTTCATTCCCCTTCAAAC	92392

AL844527.6	551	CAGGTCCACCCTATGAACCAGACATTTGGGGAAGATGAGACTTCACGAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92393	CAGGTCCACCCTATGAACCAGACATTTGGGGAAGATGAGACTTCACGAAA	92442

AL844527.6	601	AGAGAAGGGTGAGAGCTGGAGAGGGAAGACAGGCTCCAAAAGATGGAAGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92443	AGAGAAGGGTGAGAGCTGGAGAGGGAAGACAGGCTCCAAAAGATGGAAGT	92492

AL844527.6	651	GGGGAGTGACATGGAGGGGGTCAGGGACAGGGTCGGGGGGGGGACTCAGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92493	GGGGAGTGACATGGAGGGGGTCAGGGACAGGGTCGGGGGGGGGACTCAGG	92542

AL844527.6	701	ATGCTTGGTGCTTGTGACAGGCAGGGGTCTGGGAGTCACACTCACAGCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92543	ATGCTTGGTGCTTGTGACAGGCAGGGGTCTGGGAGTCACACTCACAGCAG	92592

AL844527.6	751	TGCCTGGGAGGCCTCTCTCTCCTGGGAATCCCCTCAGACCAGCAGGACCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92593	TGCCTGGGAGGCCTCTCTCTCCTGGGAATCCCCTCAGACCAGCAGGACCA	92642

AL844527.6	801	TCCTTCCCTGGGGCCCCAGGGGGACCAGGGTCACCCTAAAAGGAAAGGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92643	TCCTTCCCTGGGGCCCCAGGGGGACCAGGGTCACCCTAAAAGGAAAGGAG	92692

AL844527.6	851	AGGTGATGAGCCACAGCCATGCTCCCAAATTAAACAGAGAGCTCTCCAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92693	AGGTGATGAGCCACAGCCATGCTCCCAAATTAAACAGAGAGCTCTCCAGC	92742

AL844527.6	901	CCCCCCTCAAATCTCCAACTACCTGTTCCTTTCAGCACCCCAATCCCCAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92743	CCCCCCTCAAATCTCCAACTACCTGTTCCTTTCAGCACCCCAATCCCCAG	92792

AL844527.6	951	CTCCCCCACTTCCCCTCTGCCTGGCCCCTCACTGACCTTTGTTCCTTCTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92793	CTCCCCCACTTCCCCTCTGCCTGGCCCCTCACTGACCTTTGTTCCTTCTT	92842

AL844527.6	1001	TTCCAGCTGTCCCAGGTAGTCCCTGCTCTCCAGGGGGCCCCGGGGGGCCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92843	TTCCAGCTGTCCCAGGTAGTCCCTGCTCTCCAGGGGGCCCCGGGGGGCCT	92892

AL844527.6	1051	GGGTGACCTCTCTCCCCCATAGGGCCGGTTTCTCCTGCTGCTCCCTAGAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92893	GGGTGACCTCTCTCCCCCATAGGGCCGGTTTCTCCTGCTGCTCCCTAGAC	92942

AL844527.6	1101	AAAAGCAGAGAGAGTTCCTGCTCTCAGGCCCTTCATCTCGCTGTCTGCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92943	AAAAGCAGAGAGAGTTCCTGCTCTCAGGCCCTTCATCTCGCTGTCTGCCA	92992

AL844527.6	1151	GAAGAGCCCACCCTGGCCACCCTAAAACACTCCTTCAGAACCCCTTTATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	92993	GAAGAGCCCACCCTGGCCACCCTAAAACACTCCTTCAGAACCCCTTTATC	93042

AL844527.6	1201	CCTGCCCCAAAGCTCCTGGGAAATTCCCCGGCATTCCTGGGCCACTGCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93043	CCTGCCCCAAAGCTCCTGGGAAATTCCCCGGCATTCCTGGGCCACTGCTG	93092

AL844527.6	1251	GGTTTTCTCCTGCCCCATGTGGAGTAACTACACCACCTTGTGTCTCTGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93093	GGTTTTCTCCTGCCCCATGTGGAGTAACTACACCACCTTGTGTCTCTGTT	93142

AL844527.6	1301	GGGGAACTGCCTCTCCTGGGGGACAAGACGATGAGAATGCGCCCCAAAAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93143	GGGGAACTGCCTCTCCTGGGGGACAAGACGATGAGAATGCGCCCCAAAAC	93192

AL844527.6	1351	AGACTGAAGTTCAGGACCCCTGCCTGAAATCCCAGCCCCCACCATTGACC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93193	AGACTGAAGTTCAGGACCCCTGCCTGAAATCCCAGCCCCCACCATTGACC	93242

AL844527.6	1401	CCAGCCCCAGGAGTCTGGGTCAGGTGGACCGGGGCAGGGGCGTGTGACCG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93243	CCAGCCCCAGGAGTCTGGGTCAGGTGGACCGGGGCAGGGGCGTGTGACCG	93292

AL844527.6	1451	AGAGAAGAGGGGCAGACAGACTAATGCTAGGGTCAGGGGTCCATTCTCTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93293	AGAGAAGAGGGGCAGACAGACTAATGCTAGGGTCAGGGGTCCATTCTCTC	93342

AL844527.6	1501	CTAGGGACAAACCTACCTGAGGTCCCACCACTCCTGGAGGACCAGGGGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93343	CTAGGGACAAACCTACCTGAGGTCCCACCACTCCTGGAGGACCAGGGGGG	93392

AL844527.6	1551	CCGGTCTTCCCTTGGAAACCCTAGGCGAGGAAGAGAGGAGAATGCAGTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93393	CCGGTCTTCCCTTGGAAACCCTAGGCGAGGAAGAGAGGAGAATGCAGTGA	93442

AL844527.6	1601	AAGCAGGTGTGGGCGCTGTGGGGCAGATTCCCAGGAGGAAGGATCCCAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93443	AAGCAGGTGTGGGCGCTGTGGGGCAGATTCCCAGGAGGAAGGATCCCAGG	93492

AL844527.6	1651	CAGGATCACACCGAGCCCTGGGCCCTGGGTCTGAGCAGCACCAGGGCAGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93493	CAGGATCACACCGAGCCCTGGGCCCTGGGTCTGAGCAGCACCAGGGCAGG	93542

AL844527.6	1701	CTCCACTCTGCCAGGAGAACGTCCCTGTGGGCTTTCCAGACAGCTCTGGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93543	CTCCACTCTGCCAGGAGAACGTCCCTGTGGGCTTTCCAGACAGCTCTGGG	93592

AL844527.6	1751	GTTAAAGGGTCTGATGGAGCCCCCTGAGAATGGGTAGCCAGGAGCATCAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93593	GTTAAAGGGTCTGATGGAGCCCCCTGAGAATGGGTAGCCAGGAGCATCAC	93642

AL844527.6	1801	TCACCACTTCTCCTCTTTGGCCTGGGTGTCCCGGCAGCCCGTCCTTCCCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93643	TCACCACTTCTCCTCTTTGGCCTGGGTGTCCCGGCAGCCCGTCCTTCCCA	93692

AL844527.6	1851	GGGGGGCCCTGGAAGGGGTTCAGTTGTCAGGTGAACTCTCAGCTGGAAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93693	GGGGGGCCCTGGAAGGGGTTCAGTTGTCAGGTGAACTCTCAGCTGGAAAG	93742

AL844527.6	1901	CAGGTAGGGAAGAAGGACTCAGAGAAGCGAGGGGGGTCAGAGCTCGGGGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93743	CAGGTAGGGAAGAAGGACTCAGAGAAGCGAGGGGGGTCAGAGCTCGGGGT	93792

AL844527.6	1951	CAACTTACCGGGGGTCCTTTCGGTCCAGGAAACCCGTTGGGACCCTGAGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845446.7	93793	CAACTTACCGGGGGTCCTTTCGGTCCAGGAAACCCGTTGGGACCCTGAGG	93842

Overview

Query
AL844527.6 - 109523 bps
Hit
AL845446.7 - 93842 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link