<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX322644.8	1	TAATCCAGGTGAGGGCTGATCTAGACAGTGCTAGGAGGAAGATGGGTGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	72765	TAATCCAGGTGAGGGCTGATCTAGACAGTGCTAGGAGGAAGATGGGTGGA	72814

BX322644.8	51	GTCCTGTGGTAGGCGCTAACATCAAGGAGGTTGGGGCCTCAAGGACTGTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	72815	GTCCTGTGGTAGGCGCTAACATCAAGGAGGTTGGGGCCTCAAGGACTGTA	72864

BX322644.8	101	AGAATGAGGAAGAAGAAAGAGTTGAAGATAACACCTAGGTTGGGTGACTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	72865	AGAATGAGGAAGAAGAAAGAGTTGAAGATAACACCTAGGTTGGGTGACTG	72914

BX322644.8	151	TGTGGGGGTTGGTAGCAACAATGAGTATAAAACAGGCAGCAGGATCAGGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	72915	TGTGGGGGTTGGTAGCAACAATGAGTATAAAACAGGCAGCAGGATCAGGT	72964

BX322644.8	201	CTGGGAAGGGGGACAAGATGACTTCATGACCCCAGAGTTTCTATAGGAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	72965	CTGGGAAGGGGGACAAGATGACTTCATGACCCCAGAGTTTCTATAGGAAT	73014

BX322644.8	251	ATGCTTTGGGAGCTTGCAGACCCCTGGCTCCTCAAGGGGGCCACTCTGGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73015	ATGCTTTGGGAGCTTGCAGACCCCTGGCTCCTCAAGGGGGCCACTCTGGT	73064

BX322644.8	301	GGGGGAAGGGGCTCAGTACCGTGGATCTCCATCTCTTGACACTTGCCCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73065	GGGGGAAGGGGCTCAGTACCGTGGATCTCCATCTCTTGACACTTGCCCCA	73114

BX322644.8	351	GTTTTCACTGGATTTCCCCAGGAGTGGAGTGGCTCTTACTCTCCCTCCCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73115	GTTTTCACTGGATTTCCCCAGGAGTGGAGTGGCTCTTACTCTCCCTCCCT	73164

BX322644.8	401	AGGGAGCAGCTCTTCCACCCTCCTAATGACTTCTCCACTCCTGCCATGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73165	AGGGAGCAGCTCTTCCACCCTCCTAATGACTTCTCCACTCCTGCCATGCT	73214

BX322644.8	451	TTTTCCTCTTTTAGCTTTTGAAAACCATCTTTCTCCTTTCTCTGGTTTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73215	TTTTCCTCTTTTAGCTTTTGAAAACCATCTTTCTCCTTTCTCTGGTTTTC	73264

BX322644.8	501	CAAGCCAGATACTCAAATTTGACCCTCCCTGGAGAGTACACCCTCTATGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73265	CAAGCCAGATACTCAAATTTGACCCTCCCTGGAGAGTACACCCTCTATGC	73314

BX322644.8	551	TCACTATCTCTTTTCCCTTCTGCTCATCTTAGCATCCCCCAAGTGTTGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73315	TCACTATCTCTTTTCCCTTCTGCTCATCTTAGCATCCCCCAAGTGTTGCC	73364

BX322644.8	601	CTTGGCTCTTTTCCAATACCATTGTTTCTTTTTTATGTTCTCGCTTTCCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73365	CTTGGCTCTTTTCCAATACCATTGTTTCTTTTTTATGTTCTCGCTTTCCT	73414

BX322644.8	651	GTGGGTGACAGATTATGGAGTTGTGGGTTGAATTTTGTCTGCCAAGGACA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73415	GTGGGTGACAGATTATGGAGTTGTGGGTTGAATTTTGTCTGCCAAGGACA	73464

BX322644.8	701	TATTGAAGTCCTAGCCCCAGGTACCTACGTATGTGGCTTTATTCAAAAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73465	TATTGAAGTCCTAGCCCCAGGTACCTACGTATGTGGCTTTATTCAAAAAT	73514

BX322644.8	751	AGGGTCTTGGCCAGATGAGGTGGCTCACCCCTGTAATCCCAGCACTTTGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73515	AGGGTCTTGGCCAGATGAGGTGGCTCACCCCTGTAATCCCAGCACTTTGG	73564

BX322644.8	801	GAGACCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGACCAGACTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73565	GAGACCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGACCAGACTG	73614

BX322644.8	851	ATCAACATAGCAAAACCCTGTCCCTACAAAAAATACAAAAATTAGCCAGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73615	ATCAACATAGCAAAACCCTGTCCCTACAAAAAATACAAAAATTAGCCAGG	73664

BX322644.8	901	CATGGTGCTGTGTGCCTGTAGTCCCACATGCTGTGTGCCTGTAGTCCCAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73665	CATGGTGCTGTGTGCCTGTAGTCCCACATGCTGTGTGCCTGTAGTCCCAC	73714

BX322644.8	951	CTACTCGGGAGGCTGATGTGGGAAGATCACTTGAGCCAGTGAGGTGGAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73715	CTACTCGGGAGGCTGATGTGGGAAGATCACTTGAGCCAGTGAGGTGGAGG	73764

BX322644.8	1001	TTGCAGTAAGCCGAGATCATGCCACTGCACTGCAGCCTGGGTGATAGAGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73765	TTGCAGTAAGCCGAGATCATGCCACTGCACTGCAGCCTGGGTGATAGAGC	73814

BX322644.8	1051	CAGACCTTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73815	CAGACCTTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA	73864

BX322644.8	1101	AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAGAAAGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73865	AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAGAAAGG	73914

BX322644.8	1151	GAGGGAAAGAAGGAAGGAAGGAAGCAAGGAAAGAAGGAAGGAGGGAGGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73915	GAGGGAAAGAAGGAAGGAAGGAAGCAAGGAAAGAAGGAAGGAGGGAGGGA	73964

BX322644.8	1201	GGGAGGGAAGGAAAGAAGGAAAGAAAGAGAGAGAGAAAAAGAAAATAGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	73965	GGGAGGGAAGGAAAGAAGGAAAGAAAGAGAGAGAGAAAAAGAAAATAGGG	74014

BX322644.8	1251	TCTTTTCATCAAGTTCAGATGAGGTCATATTGGATCAGGGTGGGCCATTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74015	TCTTTTCATCAAGTTCAGATGAGGTCATATTGGATCAGGGTGGGCCATTA	74064

BX322644.8	1301	TAAGAGGAGGGAAATTTTGACACAGACACATGGGAGACGGCCATGTGAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74065	TAAGAGGAGGGAAATTTTGACACAGACACATGGGAGACGGCCATGTGAAA	74114

BX322644.8	1351	ATGCTGTCAGAGATTGGAGTGAGGCATCTACAAGCCAAAGAATGCCACGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74115	ATGCTGTCAGAGATTGGAGTGAGGCATCTACAAGCCAAAGAATGCCACGG	74164

BX322644.8	1401	ATTGCCAGCAAACACCAGGAGCTAGAAGAGGCAATGAAGCATTTTTTCCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74165	ATTGCCAGCAAACACCAGGAGCTAGAAGAGGCAATGAAGCATTTTTTCCT	74214

BX322644.8	1451	AGAGCCTTTGGAGAGAGCATGGCTCTGCTGACACCTTGACTTCAGACTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74215	AGAGCCTTTGGAGAGAGCATGGCTCTGCTGACACCTTGACTTCAGACTTC	74264

BX322644.8	1501	TTGCTTCCAAAACTGTAAGAGAATGTGTCATTGTTTCAAGCCACACAGTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74265	TTGCTTCCAAAACTGTAAGAGAATGTGTCATTGTTTCAAGCCACACAGTC	74314

BX322644.8	1551	TATGGTGATGTGTTATGGAAGCCCTAGGAAACTAATATAGCAGATAAGTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74315	TATGGTGATGTGTTATGGAAGCCCTAGGAAACTAATATAGCAGATAAGTT	74364

BX322644.8	1601	GTGTGTGTGTGTGTGCATGTATACGTGTGTGTGTGTCCGTCTGTGTAGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74365	GTGTGTGTGTGTGTGCATGTATACGTGTGTGTGTGTCCGTCTGTGTAGGG	74414

BX322644.8	1651	AAATACCGTGGAAAGTTACTATTTGTTATAGCCATTTTATCATATATTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74415	AAATACCGTGGAAAGTTACTATTTGTTATAGCCATTTTATCATATATTTT	74464

BX322644.8	1701	ATGAGATTTTATCTTTTCAAGTCAACTTTGCATGTGCTTTGTGTTGAAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74465	ATGAGATTTTATCTTTTCAAGTCAACTTTGCATGTGCTTTGTGTTGAAAG	74514

BX322644.8	1751	ACCTGAGTTTGAACATTCATACCATATTTGGAATATGGGAATGTAACCAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74515	ACCTGAGTTTGAACATTCATACCATATTTGGAATATGGGAATGTAACCAT	74564

BX322644.8	1801	ACCTAATTTAAGCAGTTGTGAGAAGCAAATGGAATAATGTATCTGAATCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74565	ACCTAATTTAAGCAGTTGTGAGAAGCAAATGGAATAATGTATCTGAATCC	74614

BX322644.8	1851	ATTTAATAAACTGTTCAACATTGTAAACATGCTGTTAGTAGTATCATAAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74615	ATTTAATAAACTGTTCAACATTGTAAACATGCTGTTAGTAGTATCATAAC	74664

BX322644.8	1901	TGTGTGAAGAGGCAGAAAACACTTTGGACTGGGGGATGGAAATCTTGGCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74665	TGTGTGAAGAGGCAGAAAACACTTTGGACTGGGGGATGGAAATCTTGGCC	74714

BX322644.8	1951	AGGGTTCAGTATTCACTTGACTTCCCGGCCATAACATCGAATGAATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845439.5	74715	AGGGTTCAGTATTCACTTGACTTCCCGGCCATAACATCGAATGAATGGCC	74764

Overview

Query
BX322644.8 - 52928 bps
Hit
AL845439.5 - 74764 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link