<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929139.7	68308	AAGCTTAAGTATTCATTCATATTTATTTATTTTTAAATCTTTAGGAAATA	68357
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1	AAGCTTAAGTATTCATTCATATTTATTTATTTTTAAATCTTTAGGAAATA	50

AL929139.7	68358	TTTTTGGTACATCAAAAAGTGTGGTTATGATGAGCACCCCCGACAAGCTA	68407
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	51	TTTTTGGTACATCAAAAAGTGTGGTTATGATGAGCACCCCCGACAAGCTA	100

AL929139.7	68408	ATTCAGCTAAAAATAGTACTTAAAATGGGTAAGGTCTATTATCGGATACG	68457
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	101	ATTCAGCTAAAAATAGTACTTAAAATGGGTAAGGTCTATTATCGGATACG	150

AL929139.7	68458	CGACCGGCGGGAAGTGTGATATGCACATTAATATAGCAGCATTTTTTATG	68507
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	151	CGACCGGCGGGAAGTGTGATATGCACATTAATATAGCAGCATTTTTTATG	200

AL929139.7	68508	ACACTGTATAACAATAATTTATATTTTCACAGTACTGTGATGGTTGGGTT	68557
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	201	ACACTGTATAACAATAATTTATATTTTCACAGTACTGTGATGGTTGGGTT	250

AL929139.7	68558	TAGGGTAGGGGGAGGGGGGATAGGCGTTAATAAAATACAATAGATGGGAA	68607
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	251	TAGGGTAGGGGGAGGGGGGATAGGCGTTAATAAAATACAATAGATGGGAA	300

AL929139.7	68608	ATTTAATAAATAATAGAAATAATTCTTGTTAACTTCCGGCCGCAACCATA	68657
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	301	ATTTAATAAATAATAGAAATAATTCTTGTTAACTTCCGGCCGCAACCATA	350

AL929139.7	68658	TCCGATCTAGCAACAACCTTTAAAATTTCACTAAAATTCAGTATTTAAAT	68707
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	351	TCCGATCTAGCAACAACCTTTAAAATTTCACTAAAATTCAGTATTTAAAT	400

AL929139.7	68708	CTCATAATTAAATAGAAAATGAGACAAATAACTGCAAAAAGGTCAATATT	68757
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	401	CTCATAATTAAATAGAAAATGAGACAAATAACTGCAAAAAGGTCAATATT	450

AL929139.7	68758	TTGAGAAAAAAATAACCACCCCTTTCACCACACTGGCTACAGGCCTGATA	68807
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	451	TTGAGAAAAAAATAACCACCCCTTTCACCACACTGGCTACAGGCCTGATA	500

AL929139.7	68808	TAAAGAGTAAATGCCTGTGTTTTACGAAATATTTAACAAAATCTGACAAA	68857
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	501	TAAAGAGTAAATGCCTGTGTTTTACGAAATATTTAACAAAATCTGACAAA	550

AL929139.7	68858	TGGCTTAAAGGTAGGGATCAGTTCCAGTGAATTTTCTATTTACTGTGTGT	68907
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	551	TGGCTTAAAGGTAGGGATCAGTTCCAGTGAATTTTCTATTTACTGTGTGT	600

AL929139.7	68908	AGCATATCGCAGTTGGTTTATGCTACAATAGCAGGTGTGCATCAAATGGG	68957
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	601	AGCATATCGCAGTTGGTTTATGCTACAATAGCAGGTGTGCATCAAATGGG	650

AL929139.7	68958	TCAGTAAACAGCAAATGCATTTATCAGAACACATTGACATGAATGAGACA	69007
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	651	TCAGTAAACAGCAAATGCATTTATCAGAACACATTGACATGAATGAGACA	700

AL929139.7	69008	TAACCTTTTAATGAGGCAAATGGACAGGGTTACTAGTCAATAAACACAAA	69057
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	701	TAACCTTTTAATGAGGCAAATGGACAGGGTTACTAGTCAATAAACACAAA	750

AL929139.7	69058	ACTGCTAAATATGAGCTGAATAATCAATCCAGCAATCCATCACCACTCTC	69107
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	751	ACTGCTAAATATGAGCTGAATAATCAATCCAGCAATCCATCACCACTCTC	800

AL929139.7	69108	CGCACAACACACAATCATTTATATACAAAACACACTCTGTCTTCTCAGTC	69157
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	801	CGCACAACACACAATCATTTATATACAAAACACACTCTGTCTTCTCAGTC	850

AL929139.7	69158	GCTGATGCTTTGTTCCTTCAATTTCACCCACACGCAAGGGTTCCCTTTTC	69207
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	851	GCTGATGCTTTGTTCCTTCAATTTCACCCACACGCAAGGGTTCCCTTTTC	900

AL929139.7	69208	TGTTGTTGTGCTATGATGAGTAAAAATAGCAGCAGTACTTTAGGGCAGTT	69257
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	901	TGTTGTTGTGCTATGATGAGTAAAAATAGCAGCAGTACTTTAGGGCAGTT	950

AL929139.7	69258	TGGCTGGCAGTGTTTTTGGGGAAAGCAGCTGAGTGTGGAGGATTAAAGCA	69307
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	951	TGGCTGGCAGTGTTTTTGGGGAAAGCAGCTGAGTGTGGAGGATTAAAGCA	1000

AL929139.7	69308	GGATCTTCTTTGATCAGAGTTGTATTTTTTTTTTAGAACTAGTCCAGCAC	69357
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1001	GGATCTTCTTTGATCAGAGTTGTATTTTTTTTTTAGAACTAGTCCAGCAC	1050

AL929139.7	69358	TCAGATTCACCGAATCCCTGTTGCCTCCTTGCTTGGGGCTCCCAGACAGG	69407
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1051	TCAGATTCACCGAATCCCTGTTGCCTCCTTGCTTGGGGCTCCCAGACAGG	1100

AL929139.7	69408	AGATGGCACTGTGACACAGACAGATGGGACTGCCTGGCACCAAAACAACT	69457
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1101	AGATGGCACTGTGACACAGACAGATGGGACTGCCTGGCACCAAAACAACT	1150

AL929139.7	69458	TAACATAAACACATATACTGTATATAGGCATAACAGCAGGGTCAAGCTTT	69507
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1151	TAACATAAACACATATACTGTATATAGGCATAACAGCAGGGTCAAGCTTT	1200

AL929139.7	69508	GGCTTTATTAGCTTTTTGGATAGGTTCCATAACTAAAAACTTAGCAAACA	69557
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1201	GGCTTTATTAGCTTTTTGGATAGGTTCCATAACTAAAAACTTAGCAAACA	1250

AL929139.7	69558	TAAGTGTCCTTATTCAGTTCAATTTATTCAATTCATCTTTATTTCTAAAG	69607
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1251	TAAGTGTCCTTATTCAGTTCAATTTATTCAATTCATCTTTATTTCTAAAG	1300

AL929139.7	69608	CGCTTTTAAATGTAGATTGTGTCAAAGCAGCTTAACATAGAAGTTCTAGT	69657
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1301	CGCTTTTAAATGTAGATTGTGTCAAAGCAGCTTAACATAGAAGTTCTAGT	1350

AL929139.7	69658	AAATTGAAACTGTTTCAGTCCAGATTTCAGAGTTGAAGTTCTGTTCAGTT	69707
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1351	AAATTGAAACTGTTTCAGTCCAGATTTCAGAGTTGAAGTTCTGTTCAGTT	1400

AL929139.7	69708	CAGTTCAGTGTGGTTTAGATTTCACTGCTGAAAGTCCAAACACAGAAGAG	69757
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1401	CAGTTCAGTGTGGTTTAGATTTCACTGCTGAAAGTCCAAACACAGAAGAG	1450

AL929139.7	69758	CAGATCCATCGATCCGCATTACAACTGCTTCCCAAGGCTGCATTTATTTG	69807
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1451	CAGATCCATCGATCCGCATTACAACTGCTTCCCAAGGCTGCATTTATTTG	1500

AL929139.7	69808	GCAAAAAAAATCTGTAAAAACAGTAATTTTGTGAAATATTTTTACACTTA	69857
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1501	GCAAAAAAAATCTGTAAAAACAGTAATTTTGTGAAATATTTTTACACTTA	1550

AL929139.7	69858	AATTTATGTTGAAATCTTTTAGAAATGTTTATCTTAAGTCAATGGGTTCT	69907
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1551	AATTTATGTTGAAATCTTTTAGAAATGTTTATCTTAAGTCAATGGGTTCT	1600

AL929139.7	69908	ATTTTTAAAGATTTAAATTCAATGGCGCAAAAGCACCAAGGGGGTATCAG	69957
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1601	ATTTTTAAAGATTTAAATTCAATGGCGCAAAAGCACCAAGGGGGTATCAG	1650

AL929139.7	69958	AATCCACTTTTGCTATTTTAAGGATGGATTATGGGTGTGTTTTGGGGATA	70007
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1651	AATCCACTTTTGCTATTTTAAGGATGGATTATGGGTGTGTTTTGGGGATA	1700

AL929139.7	70008	ACGTACATTAAACCAATCAGAAACTCACCCACTATGATCTTTAAGAGTCA	70057
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1701	ACGTACATTAAACCAATCAGAAACTCACCCACTATGATCTTTAAGAGTCA	1750

AL929139.7	70058	GTTGCATTGTGCCATGGCACATTCGCAATTTAAATGGCAGACTTTGTAAG	70107
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1751	GTTGCATTGTGCCATGGCACATTCGCAATTTAAATGGCAGACTTTGTAAG	1800

AL929139.7	70108	TGAAAAAACTGAATGCTTGCCTGGTAAGAAAATGGTTAAAGTCCATTTGC	70157
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1801	TGAAAAAACTGAATGCTTGCCTGGTAAGAAAATGGTTAAAGTCCATTTGC	1850

AL929139.7	70158	GCAAGATTAAAAACCTACTGAACAATTCTCTTCTATTCGGACTCTTCCTT	70207
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1851	GCAAGATTAAAAACCTACTGAACAATTCTCTTCTATTCGGACTCTTCCTT	1900

AL929139.7	70208	TCTGTAGTGACACTAACAATCTCTTTAAATAATAAATAAAAAACCCTGCG	70257
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1901	TCTGTAGTGACACTAACAATCTCTTTAAATAATAAATAAAAAACCCTGCG	1950

AL929139.7	70258	TCCTTAACTTTAGACTTTCAGGTGGCTCAAAATAGCAAAGCGCCAAAATT	70307
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845422.6	1951	TCCTTAACTTTAGACTTTCAGGTGGCTCAAAATAGCAAAGCGCCAAAATT	2000

Overview

Query
AL929139.7 - 70307 bps
Hit
AL845422.6 - 221136 bps
Total alignments
31
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001941200068308703071120001
298.9147932871428806113255133461
310042862847428559113266133511
410042862847428559-113272133571
510040832872428806-113277133591
689.7311318678318016-126048262321
789.61041722725027421126051262231
890.68801183482034937-145807459241
992.561963081348013787-185002853101
1090.32711241366213785-185188853111
1110045862847328558-11039841040691
121004185284752855911039841040681
131004082287252880611039841040651
1410040822872528806-11039861040671
1598.67437582938367-11078881079621
1684.62116246348203506511433691436151
1783.3446976696167057-11680981681931
1898.8842891191127911738231739111
1986.52971781263912816-11772321774091
2082.49912143484935062-11819591821751
2110041782873128808-11982201982971
2210037762847528550-11982221982971
231003776284752855011982221982971
241004178287312880811982221982991
2510040832872528807-12044402045221
261004083287242880612044402045221
2710046872847328559-12044462045321
2897.855193284742856612044502045421
2995.8940732874128813-12066162066881
3084.53901801264012819-12090452092251
3176.411337103595736666-12143642150751
Short-link