<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL773551.4	1	GGCCATTATCCTAAGCGGATTAACTCAGGAACAGAAAACCAAATACCACA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	128756	GGCCATTATCCTAAGCGGATTAACTCAGGAACAGAAAACCAAATACCACA	128805

AL773551.4	51	CATTCTCACTTATAAGTGGGAACCAAACATTGGGAACTCATGGACATAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	128806	CATTCTCACTTATAAGTGGGAACCAAACATTGGGAACTCATGGACATAAA	128855

AL773551.4	101	GATGGCAACAATAGCAACTTGAGACCAGTAGAAGAAGGACGGAGGGAGTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	128856	GATGGCAACAATAGCAACTTGAGACCAGTAGAAGAAGGACGGAGGGAGTA	128905

AL773551.4	151	AGGCAAAGGTTGAAACACTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTGGGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	128906	AGGCAAAGGTTGAAACACTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTGGGT	128955

AL773551.4	201	GACAGGATCATTCATACCCCAAACCTCAGCATCATGCAGTATACCTAGGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	128956	GACAGGATCATTCATACCCCAAACCTCAGCATCATGCAGTATACCTAGGT	129005

AL773551.4	251	AACAAACCTGCACATATACCCCAGAATTTAAAATAAAAGTTGGGGAGGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129006	AACAAACCTGCACATATACCCCAGAATTTAAAATAAAAGTTGGGGAGGGA	129055

AL773551.4	301	GGGAAGGATAGAAAGATTAAAAAAGTAATACACAATGGTGGGGCATGGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129056	GGGAAGGATAGAAAGATTAAAAAAGTAATACACAATGGTGGGGCATGGTG	129105

AL773551.4	351	GCTCTTGCCTGTAATCCTAGCATTTTGGGGGGCTAAGGTGGGAGGATCAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129106	GCTCTTGCCTGTAATCCTAGCATTTTGGGGGGCTAAGGTGGGAGGATCAC	129155

AL773551.4	401	TTGAGCTCAGGAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCTTGTCACTATAAAATA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129156	TTGAGCTCAGGAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCTTGTCACTATAAAATA	129205

AL773551.4	451	ACAACAACAACAACAACAATACACAATTAAATATTATTCAGCCATAAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129206	ACAACAACAACAACAACAATACACAATTAAATATTATTCAGCCATAAAAA	129255

AL773551.4	501	GAATGCAATCCTGGAAAAAAAGGAAAACATACCACGTACACCTACCAACA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129256	GAATGCAATCCTGGAAAAAAAGGAAAACATACCACGTACACCTACCAACA	129305

AL773551.4	551	CACATGTACACAGTAAAGGTGCAAAGACTGTATAGGGACAGTTCAGCAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129306	CACATGTACACAGTAAAGGTGCAAAGACTGTATAGGGACAGTTCAGCAAA	129355

AL773551.4	601	ACTACTCTCTTAGGAGCGTGCAGAAATATTCACATAAAGGCTGGTGCAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129356	ACTACTCTCTTAGGAGCGTGCAGAAATATTCACATAAAGGCTGGTGCAGA	129405

AL773551.4	651	GGGCCACAAATACAAAGGCAATAGGTTAGCAGCCACCCAGATTTGCCCCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129406	GGGCCACAAATACAAAGGCAATAGGTTAGCAGCCACCCAGATTTGCCCCT	129455

AL773551.4	701	TGCTGTAAGTCAAACAACCAAATTTATGGGACAAACATTCTAAATTGTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129456	TGCTGTAAGTCAAACAACCAAATTTATGGGACAAACATTCTAAATTGTGA	129505

AL773551.4	751	GACATTATACAAATGTTACAGTAATGGTAATTACTCAACTTAAAGCAGAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129506	GACATTATACAAATGTTACAGTAATGGTAATTACTCAACTTAAAGCAGAT	129555

AL773551.4	801	TCACATTTCCATAACTTCCTTACAGACAGCTGCTCATGGACACAGAATTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129556	TCACATTTCCATAACTTCCTTACAGACAGCTGCTCATGGACACAGAATTT	129605

AL773551.4	851	AACTTTTTTTTTTTGTTTTGAGACAGGATCTGGCTTTGTCGCCCAGGTTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129606	AACTTTTTTTTTTTGTTTTGAGACAGGATCTGGCTTTGTCGCCCAGGTTG	129655

AL773551.4	901	AAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCTTGGCTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129656	AAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCTTGGCTCA	129705

AL773551.4	951	AGCCATACTCCTACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGAGCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129706	AGCCATACTCCTACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGAGCA	129755

AL773551.4	1001	CCACCATGCCTGGCTAATATATATATATATATATATATATATATATATAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129756	CCACCATGCCTGGCTAATATATATATATATATATATATATATATATATAT	129805

AL773551.4	1051	AAAATTTTTTGTAGAGCCAGGGTTTTGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129806	AAAATTTTTTGTAGAGCCAGGGTTTTGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTG	129855

AL773551.4	1101	AACTCCTGAGCTCAACCAATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129856	AACTCCTGAGCTCAACCAATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGC	129905

AL773551.4	1151	AGCCACCGTGCAGAATTTAACATCTTTTGAGCATTCACCTGTTTCAGGCG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129906	AGCCACCGTGCAGAATTTAACATCTTTTGAGCATTCACCTGTTTCAGGCG	129955

AL773551.4	1201	CCCTCTGTTGAGGGTACTACTGTTGAGAGTCCTGAGGCTAGTTTCAGTAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	129956	CCCTCTGTTGAGGGTACTACTGTTGAGAGTCCTGAGGCTAGTTTCAGTAT	130005

AL773551.4	1251	AAGTGCTGTGCCATGCAGCTGCCTGAGGAAAGCCAGATAAAGCTGATACT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130006	AAGTGCTGTGCCATGCAGCTGCCTGAGGAAAGCCAGATAAAGCTGATACT	130055

AL773551.4	1301	CCAGCCATGAGGGCCTTACCCTCCGGCATGAGGAGGGAACCATGGCCAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130056	CCAGCCATGAGGGCCTTACCCTCCGGCATGAGGAGGGAACCATGGCCAGG	130105

AL773551.4	1351	AGAGCTCTCTATCTGTCTGTCTCTGTTGCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130106	AGAGCTCTCTATCTGTCTGTCTCTGTTGCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTT	130155

AL773551.4	1401	GTTATATTGAGTTTCTGCCTGAAGGAAAGGCAAGCTTTCTTGAAGATCCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130156	GTTATATTGAGTTTCTGCCTGAAGGAAAGGCAAGCTTTCTTGAAGATCCT	130205

AL773551.4	1451	AAGAAAGGCCAGGCACGGTGGTTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130206	AAGAAAGGCCAGGCACGGTGGTTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGCA	130255

AL773551.4	1501	GGCCGAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130256	GGCCGAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGT	130305

AL773551.4	1551	CAACATGGTGAAACCCTGTTTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAAGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130306	CAACATGGTGAAACCCTGTTTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAAGCA	130355

AL773551.4	1601	TGGTGGCGCATGTCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130356	TGGTGGCGCATGTCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA	130405

AL773551.4	1651	ATCGCTTGAACTCAGGAGGCAGAGGTTGCAGCAAGCTGAGAGCGTGCCAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130406	ATCGCTTGAACTCAGGAGGCAGAGGTTGCAGCAAGCTGAGAGCGTGCCAC	130455

AL773551.4	1701	TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAACAAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130456	TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAACAAGA	130505

AL773551.4	1751	ACAAAACAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAACCTAAGAAAACTGAAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130506	ACAAAACAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAACCTAAGAAAACTGAAGA	130555

AL773551.4	1801	CTAAGTGTTAAGGGGGGGACCCAAAAGAGCTAGTGTTCACATCTGTCCAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130556	CTAAGTGTTAAGGGGGGGACCCAAAAGAGCTAGTGTTCACATCTGTCCAA	130605

AL773551.4	1851	TCAATCAGGGGAGGCTTCATGGAAGAGTGGCACTGAAGGTGACCTTGAAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130606	TCAATCAGGGGAGGCTTCATGGAAGAGTGGCACTGAAGGTGACCTTGAAC	130655

AL773551.4	1901	AGTGGGTGGGATATGACAAATTCAGATGTGGAGGATGACTGTAAGAATGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130656	AGTGGGTGGGATATGACAAATTCAGATGTGGAGGATGACTGTAAGAATGG	130705

AL773551.4	1951	AATTAGCAAAGACCTTGAGCTGGAAAAGTACAGGATGTGTTTGGGGAATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845353.7	130706	AATTAGCAAAGACCTTGAGCTGGAAAAGTACAGGATGTGTTTGGGGAATC	130755

Overview

Query
AL773551.4 - 76225 bps
Hit
AL845353.7 - 130755 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link