<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL953883.5	1	TGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATCGGGAGATATACCTAATGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146408	TGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATCGGGAGATATACCTAATGCT	146457

AL953883.5	51	AGATGACGGGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCATGGCACATGTATACATA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146458	AGATGACGGGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCATGGCACATGTATACATA	146507

AL953883.5	101	TGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146508	TGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATGA	146557

AL953883.5	151	TTAAAAAAAAAAAAAGAATAAATGTCGGGGCTAAAGCCTCATTTTCTTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146558	TTAAAAAAAAAAAAAGAATAAATGTCGGGGCTAAAGCCTCATTTTCTTTT	146607

AL953883.5	201	CTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCTCTCTGTCGCCCAGGCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146608	CTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCTCTCTGTCGCCCAGGCTG	146657

AL953883.5	251	GAGTGCAGCGGTGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146658	GAGTGCAGCGGTGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTC	146707

AL953883.5	301	ATGCCATTCTCCTGCTTTGGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146708	ATGCCATTCTCCTGCTTTGGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCC	146757

AL953883.5	351	GCCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146758	GCCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCA	146807

AL953883.5	401	CCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTTCTGATCTCGTGATCTGCCTGCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146808	CCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTTCTGATCTCGTGATCTGCCTGCC	146857

AL953883.5	451	TTGGCCTCTCAAAAGAAGTGCTCTTACAATCTATGTTAATTCATCTTGCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146858	TTGGCCTCTCAAAAGAAGTGCTCTTACAATCTATGTTAATTCATCTTGCT	146907

AL953883.5	501	TTATCCCATGTTCAGAACTGAACTTTGAGTTGAGGTATGCCTAAAGCATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146908	TTATCCCATGTTCAGAACTGAACTTTGAGTTGAGGTATGCCTAAAGCATT	146957

AL953883.5	551	CTTTCTGAGCATCAGATGACTTGATATGGTTACAGCACAAATTGGCACCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	146958	CTTTCTGAGCATCAGATGACTTGATATGGTTACAGCACAAATTGGCACCA	147007

AL953883.5	601	AAGGACACAGCCCAGTAAGTCACAGGCTGTTGCCTTCTAACTCAGTATCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147008	AAGGACACAGCCCAGTAAGTCACAGGCTGTTGCCTTCTAACTCAGTATCA	147057

AL953883.5	651	TAGTTATGGAGACTTCTGTTGGGGTTTTAGGGTTAATGGAATGGAACAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147058	TAGTTATGGAGACTTCTGTTGGGGTTTTAGGGTTAATGGAATGGAACAGA	147107

AL953883.5	701	TGTAGGAGAGTCTATCACCTTTGATAGTATTGCTGGATGAAAGAATGAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147108	TGTAGGAGAGTCTATCACCTTTGATAGTATTGCTGGATGAAAGAATGAGG	147157

AL953883.5	751	TTGGAATGCTAGGTTGTGATGGTTAATTTTATGTATCAACTTGGCTGGGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147158	TTGGAATGCTAGGTTGTGATGGTTAATTTTATGTATCAACTTGGCTGGGC	147207

AL953883.5	801	CAACGGATGACCAGATAAACTAGTAGGACATTATTTTTGGGTGCATCTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147208	CAACGGATGACCAGATAAACTAGTAGGACATTATTTTTGGGTGCATCTAT	147257

AL953883.5	851	GAGGGTGTTCCTGGAAGATATTAACGTTTAGGTAGACTGAGTCAAGATCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147258	GAGGGTGTTCCTGGAAGATATTAACGTTTAGGTAGACTGAGTCAAGATCA	147307

AL953883.5	901	CCCTCAGCAATACGTGTGGGCACCATCCAATCTGTTGAGATCCTGAAGAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147308	CCCTCAGCAATACGTGTGGGCACCATCCAATCTGTTGAGATCCTGAAGAG	147357

AL953883.5	951	AACAAAAAGATGGAGGAAGGAAAAATCTGCTCTCTCCCTGAGCTGAGACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147358	AACAAAAAGATGGAGGAAGGAAAAATCTGCTCTCTCCCTGAGCTGAGACA	147407

AL953883.5	1001	CCAGCTCCTGCTCTCACCTGCACCTTCTCCTGCCCTCAGACATTGGTGCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147408	CCAGCTCCTGCTCTCACCTGCACCTTCTCCTGCCCTCAGACATTGGTGCT	147457

AL953883.5	1051	ACTGGTTCTCCAGCTTCTGACTCAGATGGAGACTTACATCATTGACTCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147458	ACTGGTTCTCCAGCTTCTGACTCAGATGGAGACTTACATCATTGACTCCC	147507

AL953883.5	1101	CAGGTTATGAGAGTTTTGAGTCTGGACTACAACCAGACCATCAGTTTTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147508	CAGGTTATGAGAGTTTTGAGTCTGGACTACAACCAGACCATCAGTTTTCC	147557

AL953883.5	1151	TGGGCCTGCAGCTTACAGAAAGCAGATGGTGAGACTTCTCAAACTCCATA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147558	TGGGCCTGCAGCTTACAGAAAGCAGATGGTGAGACTTCTCAAACTCCATA	147607

AL953883.5	1201	AGCACGTGAGCCAATTTCTCATAAATATCTTACTATACATCTCTGTTGTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147608	AGCACGTGAGCCAATTTCTCATAAATATCTTACTATACATCTCTGTTGTC	147657

AL953883.5	1251	AACCTAAAAAAAGACACTAGAGAAAATTTATTTCTATGGTATATTGAGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147658	AACCTAAAAAAAGACACTAGAGAAAATTTATTTCTATGGTATATTGAGTT	147707

AL953883.5	1301	TACTCAGGGGTAAGAATCAATTATTATAACTGGAATGCATGGCATGGTAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147708	TACTCAGGGGTAAGAATCAATTATTATAACTGGAATGCATGGCATGGTAA	147757

AL953883.5	1351	ACCACTAATGTATCTGTGAGGGAAGGGCAAAGGGAAGCTTTCATTAGCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147758	ACCACTAATGTATCTGTGAGGGAAGGGCAAAGGGAAGCTTTCATTAGCAA	147807

AL953883.5	1401	AAACAGAGAGTTTTATAGAAGTAGCTTAGAAATAGAATTCATTGGTTCCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147808	AAACAGAGAGTTTTATAGAAGTAGCTTAGAAATAGAATTCATTGGTTCCA	147857

AL953883.5	1451	GAGAGCTGTTGTCAGTTCACTGGTGGAGATGTCATTACTGGGCGAGTGTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147858	GAGAGCTGTTGTCAGTTCACTGGTGGAGATGTCATTACTGGGCGAGTGTT	147907

AL953883.5	1501	CTGAGATATCTTATCTGAATTACTGCAGTATTAAAGAATATCTAGTGATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147908	CTGAGATATCTTATCTGAATTACTGCAGTATTAAAGAATATCTAGTGATA	147957

AL953883.5	1551	AACCTTGTCAAAACAGGAGATGCATGAAGGATGCAAAAAGGTTTCTTGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	147958	AACCTTGTCAAAACAGGAGATGCATGAAGGATGCAAAAAGGTTTCTTGTG	148007

AL953883.5	1601	GGGTTTTTAGAAAGTCCCTGAAAGCAGTTTTTATCTCCCATATGTGAGCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	148008	GGGTTTTTAGAAAGTCCCTGAAAGCAGTTTTTATCTCCCATATGTGAGCA	148057

AL953883.5	1651	TGAGCCATCTCTCCTTCATACTATCCTGACTTTATTTTATCCAGGTCTGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	148058	TGAGCCATCTCTCCTTCATACTATCCTGACTTTATTTTATCCAGGTCTGA	148107

AL953883.5	1701	CAAAAGTGATTTTATCCTGGTATCTGAAACTTCTGACTAAAACATAAGAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	148108	CAAAAGTGATTTTATCCTGGTATCTGAAACTTCTGACTAAAACATAAGAC	148157

AL953883.5	1751	AAATACTTCTTTCTACTTATTCGGCACGTCCTAGTTTTGGGATAGTTGGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	148158	AAATACTTCTTTCTACTTATTCGGCACGTCCTAGTTTTGGGATAGTTGGT	148207

AL953883.5	1801	CCGAGAAACAGCCTTGGTTTACAGAACAGACCCTTTGAAGGCAGCCAGCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	148208	CCGAGAAACAGCCTTGGTTTACAGAACAGACCCTTTGAAGGCAGCCAGCT	148257

AL953883.5	1851	TCGAGAGAGGATGCTGCCTTGCTTGCTGGCTAACAGGGAGGGTGACTAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	148258	TCGAGAGAGGATGCTGCCTTGCTTGCTGGCTAACAGGGAGGGTGACTAAA	148307

AL953883.5	1901	CATGTATGAGGTGTTTCATTCATAAATCCTTAACTGCACTGAGTCAAGGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	148308	CATGTATGAGGTGTTTCATTCATAAATCCTTAACTGCACTGAGTCAAGGT	148357

AL953883.5	1951	ATGTCAACAGATGGATGCCAGATCCTTGTTACTGATTAATCAGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845311.9	148358	ATGTCAACAGATGGATGCCAGATCCTTGTTACTGATTAATCAGAGAATTC	148407

Overview

Query
AL953883.5 - 102894 bps
Hit
AL845311.9 - 148407 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link