<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671857.16	1	GAATTCTCACCTGAGGAATACTGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120357	GAATTCTCACCTGAGGAATACTGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAATG	120406

AL671857.16	51	TTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120407	TTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGAT	120456

AL671857.16	101	TCGACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATGAAAAATTCAGGTGACAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120457	TCGACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATGAAAAATTCAGGTGACAGC	120506

AL671857.16	151	AGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAATACTCCTCCATTGTTGGTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120507	AGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAATACTCCTCCATTGTTGGTG	120556

AL671857.16	201	GGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTCTCGGTTCCTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120557	GGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTCTCGGTTCCTCA	120606

AL671857.16	251	GAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCCCTCCTGGGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120607	GAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCCCTCCTGGGC	120656

AL671857.16	301	ATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120657	ATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTAT	120706

AL671857.16	351	GTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120707	GTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGAT	120756

AL671857.16	401	GCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120757	GCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATG	120806

AL671857.16	451	GAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120807	GAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAA	120856

AL671857.16	501	ATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120857	ATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAA	120906

AL671857.16	551	GGAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCCAAACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120907	GGAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCCAAACC	120956

AL671857.16	601	TAGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTGCTAAACACATGAAACTCAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	120957	TAGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTGCTAAACACATGAAACTCAAG	121006

AL671857.16	651	AAGAATGAAAACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCCCCTTAGAATTGGGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121007	AAGAATGAAAACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCCCCTTAGAATTGGGAA	121056

AL671857.16	701	CAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGATGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121057	CAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGATGA	121106

AL671857.16	751	AAGGATGGACCATGTAGAGACTGCCATATCCAGGCATCCACCCCATAATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121107	AAGGATGGACCATGTAGAGACTGCCATATCCAGGCATCCACCCCATAATC	121156

AL671857.16	801	AGCATCCAAACGCTGACAGCATTGCATACACTAGCAAGATTTTATTGAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121157	AGCATCCAAACGCTGACAGCATTGCATACACTAGCAAGATTTTATTGAAA	121206

AL671857.16	851	GGACCCAGATGTAGCTGTGTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCTAGCGAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121207	GGACCCAGATGTAGCTGTGTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCTAGCGAAC	121256

AL671857.16	901	ATAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGGATGGATCACAGGGCTCCCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121257	ATAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGGATGGATCACAGGGCTCCCA	121306

AL671857.16	951	ATGGAGGAGCTAGAGAAAGTAGCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121307	ATGGAGGAGCTAGAGAAAGTAGCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCT	121356

AL671857.16	1001	ATAGGTGGAACAACATTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121357	ATAGGTGGAACAACATTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTC	121406

AL671857.16	1051	TAGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121407	TAGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAG	121456

AL671857.16	1101	AGGCCCATTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACGCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121457	AGGCCCATTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACGCCA	121506

AL671857.16	1151	GGGCCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGATAGGGGAGTGGGGGTGGGTGGGCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121507	GGGCCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGATAGGGGAGTGGGGGTGGGTGGGCAT	121556

AL671857.16	1201	GGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGCTAAATACCTAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121557	GGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGCTAAATACCTAAT	121606

AL671857.16	1251	AAAAAATGGGGGAAAAAAAAAGAAGGAGGTCACGTGTTAAAGGGGGTGTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121607	AAAAAATGGGGGAAAAAAAAAGAAGGAGGTCACGTGTTAAAGGGGGTGTC	121656

AL671857.16	1301	ACTTTGAAAGTTGGACTTATCAACAGTGGGGGGAGGGTTCTCTTACTCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121657	ACTTTGAAAGTTGGACTTATCAACAGTGGGGGGAGGGTTCTCTTACTCAA	121706

AL671857.16	1351	AGGTTTTATTTTTCAAACTCTTAAAGTAGTCTTTCCTTTCTCTCTCTCTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121707	AGGTTTTATTTTTCAAACTCTTAAAGTAGTCTTTCCTTTCTCTCTCTCTC	121756

AL671857.16	1401	TCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCCCTCTCACTCACACACACACACAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121757	TCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCCCTCTCACTCACACACACACACAC	121806

AL671857.16	1451	ACACACACAATTATAGCTGACTAAGCAGTTGCTGAGTAAAAGATATGCAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121807	ACACACACAATTATAGCTGACTAAGCAGTTGCTGAGTAAAAGATATGCAA	121856

AL671857.16	1501	AGATAATTTACTTCTAAGTTTTCTGTGTTGGGGGACTTGATGCTGAGCAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121857	AGATAATTTACTTCTAAGTTTTCTGTGTTGGGGGACTTGATGCTGAGCAT	121906

AL671857.16	1551	CCTGTAAATATTGCATTGTATAAAACTTGCTGCTTCTCACTATGTAAATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121907	CCTGTAAATATTGCATTGTATAAAACTTGCTGCTTCTCACTATGTAAATA	121956

AL671857.16	1601	TTAACAGAAGTGAAAGGAGGGCAATGGGGAACCAGTGTGAGAAAGTACAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	121957	TTAACAGAAGTGAAAGGAGGGCAATGGGGAACCAGTGTGAGAAAGTACAA	122006

AL671857.16	1651	GATATGAAGAAAATGTCAGAAAATGTGGGCCAGACTGCACGGTTCACACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	122007	GATATGAAGAAAATGTCAGAAAATGTGGGCCAGACTGCACGGTTCACACA	122056

AL671857.16	1701	GTTAGATAGAAATTTTTAAATGTATATTTTCCCTTTTAAAACCCTTTAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	122057	GTTAGATAGAAATTTTTAAATGTATATTTTCCCTTTTAAAACCCTTTAAA	122106

AL671857.16	1751	ATGTTTTTATGGGCATGTGTTTATTGCATGTGGTGTGGGTTTCATAAAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	122107	ATGTTTTTATGGGCATGTGTTTATTGCATGTGGTGTGGGTTTCATAAAGA	122156

AL671857.16	1801	ATTTATTCCAGATGTTTACTTCCATATCTTTCCCTTTCCTTTCTCCCCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	122157	ATTTATTCCAGATGTTTACTTCCATATCTTTCCCTTTCCTTTCTCCCCTC	122206

AL671857.16	1851	CAAACCCATCAGCCTTTCCCCTCCTCCAGCTTCACTTCAGCTTCCACATC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	122207	CAAACCCATCAGCCTTTCCCCTCCTCCAGCTTCACTTCAGCTTCCACATC	122256

AL671857.16	1901	ATATATATGTTAATGGTTTGATATCATCCTATAAAATCTAGGATCTATGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	122257	ATATATATGTTAATGGTTTGATATCATCCTATAAAATCTAGGATCTATGA	122306

AL671857.16	1951	ATAAGAGAGCATGTGATATTTGTTTTCCTGAGTCTGGTTCTGGTTTGTTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845310.4	122307	ATAAGAGAGCATGTGATATTTGTTTTCCTGAGTCTGGTTCTGGTTTGTTT	122356

Overview

Query
AL671857.16 - 207354 bps
Hit
AL845310.4 - 122356 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link