<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929593.6	1	TCGCCTGGGTAGCCAGGACACCTGGGCCTCGTGGCCAGGCCAGAAGCCGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	151465	TCGCCTGGGTAGCCAGGACACCTGGGCCTCGTGGCCAGGCCAGAAGCCGT	151514

AL929593.6	51	CCCCACCCTCCCACCCGTGGAATCCCCGCAGCACTTCTTCCTGGGGTCTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	151515	CCCCACCCTCCCACCCGTGGAATCCCCGCAGCACTTCTTCCTGGGGTCTT	151564

AL929593.6	101	CGGGGGAAGACTGACTTCCTGGCTGCGTGACCTGGAGCTCTGAGCTTCAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	151565	CGGGGGAAGACTGACTTCCTGGCTGCGTGACCTGGAGCTCTGAGCTTCAG	151614

AL929593.6	151	TTTTCTCACTTGTAGAGTAACATACACAGAGTTCACCCTACAGGGTCGTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	151615	TTTTCTCACTTGTAGAGTAACATACACAGAGTTCACCCTACAGGGTCGTT	151664

AL929593.6	201	AGAAGGCTGAAGTGAGATAATTCATGTGCTGGTATAAACTTTGTGGAAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	151665	AGAAGGCTGAAGTGAGATAATTCATGTGCTGGTATAAACTTTGTGGAAAT	151714

AL929593.6	251	GTGAGGTGGGGAGAGGAGGTGGGGCTGTTTTGAGGAAGGAGATAAGTTAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	151715	GTGAGGTGGGGAGAGGAGGTGGGGCTGTTTTGAGGAAGGAGATAAGTTAT	151764

AL929593.6	301	TGGAGCCGCAAAAACAGGTTTGCTTGTGCCCTTCTAACATCGCCTTCCCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	151765	TGGAGCCGCAAAAACAGGTTTGCTTGTGCCCTTCTAACATCGCCTTCCCT	151814

AL929593.6	351	TTTCTGTTGCTGAAGTTTTCCTTGGGCAGCAAGATCAATGTGAAGGTGGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	151815	TTTCTGTTGCTGAAGTTTTCCTTGGGCAGCAAGATCAATGTGAAGGTGGG	151864

AL929593.6	401	AGGAAACAGCAAAGGAACCCTGAAGGTGAGGGCCAGGGAAGGGGTGGGGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	151865	AGGAAACAGCAAAGGAACCCTGAAGGTGAGGGCCAGGGAAGGGGTGGGGC	151914

AL929593.6	451	CAGGCACTGGTGGAGGAGAGGGTGTGGAGTGAGAGGCCTGTGGGCAGAGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	151915	CAGGCACTGGTGGAGGAGAGGGTGTGGAGTGAGAGGCCTGTGGGCAGAGG	151964

AL929593.6	501	CACATGGTCCGGGGAAGGAGGCAGACACCTCAGGGTTGGTGTCCCGTGCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	151965	CACATGGTCCGGGGAAGGAGGCAGACACCTCAGGGTTGGTGTCCCGTGCT	152014

AL929593.6	551	TCCGTCCTGGGTGTTTTTCCCCCTGCTTGCTTTCGCTTGCTCTCCCCATC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152015	TCCGTCCTGGGTGTTTTTCCCCCTGCTTGCTTTCGCTTGCTCTCCCCATC	152064

AL929593.6	601	TCTGGGTACCTGTTGTTTCCTTTACCCGCCTCAGTGCTGGTGGCTCCGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152065	TCTGGGTACCTGTTGTTTCCTTTACCCGCCTCAGTGCTGGTGGCTCCGAA	152114

AL929593.6	651	TCCCACTCCTCAGCCCAGGCCTCTTCCCTGAACCATGGGCCCCACTCGTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152115	TCCCACTCCTCAGCCCAGGCCTCTTCCCTGAACCATGGGCCCCACTCGTC	152164

AL929593.6	701	CCACTCCCACAGCACCTCAGACGAGGCATGTCCCAAAGCCCTTCTTCATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152165	CCACTCCCACAGCACCTCAGACGAGGCATGTCCCAAAGCCCTTCTTCATT	152214

AL929593.6	751	CTGTGTCTCTTGTCTGGCTGGTGGGAGCCCCTCCCAGCCAGGAGCCCAGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152215	CTGTGTCTCTTGTCTGGCTGGTGGGAGCCCCTCCCAGCCAGGAGCCCAGC	152264

AL929593.6	801	CACTACTCTAGAGGCCGTGTTAGTGGCCCCTCTCCCAAGCCTGTCCTTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152265	CACTACTCTAGAGGCCGTGTTAGTGGCCCCTCTCCCAAGCCTGTCCTTAT	152314

AL929593.6	851	GTCCCTAGTGACTCCTCCTCTGCTCCCCTGCTGCCTGTGGCCCTTGGTGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152315	GTCCCTAGTGACTCCTCCTCTGCTCCCCTGCTGCCTGTGGCCCTTGGTGC	152364

AL929593.6	901	TGCATCCTAGATTCTGTGCTGAGACGGCCTTCTCCCTACCTGGAACTTCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152365	TGCATCCTAGATTCTGTGCTGAGACGGCCTTCTCCCTACCTGGAACTTCT	152414

AL929593.6	951	CTCTACCTCCTGTCTCCCCTGTCTGATCCACTGTCCACACGGCAGTGACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152415	CTCTACCTCCTGTCTCCCCTGTCTGATCCACTGTCCACACGGCAGTGACA	152464

AL929593.6	1001	CTGACCTTCCAAAAGCCCCAGCCAGATCAGCCTTGGGGAAAAGTCACTCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152465	CTGACCTTCCAAAAGCCCCAGCCAGATCAGCCTTGGGGAAAAGTCACTCC	152514

AL929593.6	1051	CCGCTGCCCACGGCTCAGATGGCTGGGCCTCTGCCCACCCCTCCGGCCAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152515	CCGCTGCCCACGGCTCAGATGGCTGGGCCTCTGCCCACCCCTCCGGCCAG	152564

AL929593.6	1101	ACAGCTCTCCTTGTCTACACAGATCCCCTTGCCTTTCCTGTCCTTCCCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152565	ACAGCTCTCCTTGTCTACACAGATCCCCTTGCCTTTCCTGTCCTTCCCTG	152614

AL929593.6	1151	CTTCTTGGCCCACAGGACAAGCTCTTTCTTCTCCTTCAAGCCTTGGCCAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152615	CTTCTTGGCCCACAGGACAAGCTCTTTCTTCTCCTTCAAGCCTTGGCCAG	152664

AL929593.6	1201	AAGCCTTTCCTGAGCTTTTCAGTCCAGCCTCTTCCCAGCACAGTCTGGAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152665	AAGCCTTTCCTGAGCTTTTCAGTCCAGCCTCTTCCCAGCACAGTCTGGAG	152714

AL929593.6	1251	TGTTGGCCTCTGGGGGCAGGCCCCTGCTTCTTTACCTCTCTGTCTCGCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152715	TGTTGGCCTCTGGGGGCAGGCCCCTGCTTCTTTACCTCTCTGTCTCGCCT	152764

AL929593.6	1301	GACGCCTGTGGCGAATGTGGTGCCACTCGTGTGTGTGGACTGTGCAGTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152765	GACGCCTGTGGCGAATGTGGTGCCACTCGTGTGTGTGGACTGTGCAGTGA	152814

AL929593.6	1351	CGGGGAGGAAAAGGGGCTGAAGGCCTCAAATCCTGTAGCCCAGGGAGATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152815	CGGGGAGGAAAAGGGGCTGAAGGCCTCAAATCCTGTAGCCCAGGGAGATG	152864

AL929593.6	1401	CCCTTAGGTATGGCACCAGAGAGGTCTGTGGCCTCACATGTCCCACGTCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152865	CCCTTAGGTATGGCACCAGAGAGGTCTGTGGCCTCACATGTCCCACGTCC	152914

AL929593.6	1451	TCTCCCTGCCCCTTGCTGAGCCAGGTCCTTCGTACCTACAATGTCCTGGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152915	TCTCCCTGCCCCTTGCTGAGCCAGGTCCTTCGTACCTACAATGTCCTGGA	152964

AL929593.6	1501	CATGAAGAACACGACCTGCCAGGACCTACAGATAGAAGTGACAGTCAAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	152965	CATGAAGAACACGACCTGCCAGGACCTACAGATAGAAGTGACAGTCAAAG	153014

AL929593.6	1551	GCCACGTCGAGTACACGAGTGAGTGTGGGGGTTGGGAGGCCTTGGGGCCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	153015	GCCACGTCGAGTACACGAGTGAGTGTGGGGGTTGGGAGGCCTTGGGGCCA	153064

AL929593.6	1601	GGCAGGGGCTGGCGCAGGGAGCCGGGTGGCCATCCCAGCCCTCCTCACAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	153065	GGCAGGGGCTGGCGCAGGGAGCCGGGTGGCCATCCCAGCCCTCCTCACAA	153114

AL929593.6	1651	TGCTTCCCTGTGCAGTGGAAGCAAACGAGGACTATGAGGACTATGAGTAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	153115	TGCTTCCCTGTGCAGTGGAAGCAAACGAGGACTATGAGGACTATGAGTAC	153164

AL929593.6	1701	GATGAGCTTCCAGCCAAGGATGACCCAGATGCCCCTCTGCAGCCCGTGAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	153165	GATGAGCTTCCAGCCAAGGATGACCCAGATGCCCCTCTGCAGCCCGTGAC	153214

AL929593.6	1751	ACCCCTGCAGCTGTTTGAGGGTCGGAGGAACCGCCGCAGGAGGGAGGCGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	153215	ACCCCTGCAGCTGTTTGAGGGTCGGAGGAACCGCCGCAGGAGGGAGGCGC	153264

AL929593.6	1801	CCAAGGTGGTGGAGGAGCAGGAGTCCAGGGTGCACTACACCGTGTGCATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	153265	CCAAGGTGGTGGAGGAGCAGGAGTCCAGGGTGCACTACACCGTGTGCATC	153314

AL929593.6	1851	TGGTGGGCGCCGGGAGCTGCCCTGGGCCAGGGGAGGGAGGGCAGGACCCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	153315	TGGTGGGCGCCGGGAGCTGCCCTGGGCCAGGGGAGGGAGGGCAGGACCCA	153364

AL929593.6	1901	GGCTGGGGCTGGGCTTCTGGAGCCCGCGCAGGCAGAACCTGGACGACAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	153365	GGCTGGGGCTGGGCTTCTGGAGCCCGCGCAGGCAGAACCTGGACGACAGC	153414

AL929593.6	1951	TCACACGTCTCCACAGGCGGAACGGCAAGGTGGGGCTGTCTGGCATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844853.23	153415	TCACACGTCTCCACAGGCGGAACGGCAAGGTGGGGCTGTCTGGCATGGCC	153464

Overview

Query
AL929593.6 - 57339 bps
Hit
AL844853.23 - 153464 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link