<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX001005.6	1	CTGTCCCTCACTGAGAACTGGTGGGGAGATGTGGGGGAGGAGGGGAGATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117031	CTGTCCCTCACTGAGAACTGGTGGGGAGATGTGGGGGAGGAGGGGAGATT	117080

BX001005.6	51	TCTTTATGCTGTGTCAAAGCATGGAGACAGACCTCTCCTTCTCTCCTGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117081	TCTTTATGCTGTGTCAAAGCATGGAGACAGACCTCTCCTTCTCTCCTGAA	117130

BX001005.6	101	CCTCACACTATCCCTTCCCAGACACTTGAAATAAAACGCAGACCAGAAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117131	CCTCACACTATCCCTTCCCAGACACTTGAAATAAAACGCAGACCAGAAAT	117180

BX001005.6	151	GTCTATTTAAGAGTTAAATATCTATAGTATAAAATATGAAGACAGAGTAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117181	GTCTATTTAAGAGTTAAATATCTATAGTATAAAATATGAAGACAGAGTAG	117230

BX001005.6	201	AATGGGGTAATGCAGGAGAGCATGACAGAGATGACAGGACCTCAAGGTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117231	AATGGGGTAATGCAGGAGAGCATGACAGAGATGACAGGACCTCAAGGTGC	117280

BX001005.6	251	CAGGAAAGCTGGTGCTGGGCCAGGACCAAGGAGCCATCAGCAGGACACTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117281	CAGGAAAGCTGGTGCTGGGCCAGGACCAAGGAGCCATCAGCAGGACACTC	117330

BX001005.6	301	ACTCATAAAGCTCACCTATAATAATACAATTACTGCATATGTAATATATC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117331	ACTCATAAAGCTCACCTATAATAATACAATTACTGCATATGTAATATATC	117380

BX001005.6	351	AAAATATAATAAAATAACAAAATAACAAAAATAATATGGCACAGCTGCAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117381	AAAATATAATAAAATAACAAAATAACAAAAATAATATGGCACAGCTGCAA	117430

BX001005.6	401	ATACCCCATATATACTAACCCTTTTCATTCATCCAACCACAAGAAATAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117431	ATACCCCATATATACTAACCCTTTTCATTCATCCAACCACAAGAAATAAA	117480

BX001005.6	451	TGCTCGTAGTTTCCCCATGTCATAGATGAGGAAAATGAGGCACAAAGAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117481	TGCTCGTAGTTTCCCCATGTCATAGATGAGGAAAATGAGGCACAAAGAGA	117530

BX001005.6	501	GAACATGCTGGTGAGGCCTAGGCAAGGAGTTGAATCCAGACCGTCTGGCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117531	GAACATGCTGGTGAGGCCTAGGCAAGGAGTTGAATCCAGACCGTCTGGCT	117580

BX001005.6	551	GCAGAGTCTAGTTGCCCTCAGTGGAGCCAGCGAACCCAGGAGCTGACACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117581	GCAGAGTCTAGTTGCCCTCAGTGGAGCCAGCGAACCCAGGAGCTGACACC	117630

BX001005.6	601	AGAGACTGAGATCTCAGCTGTGCACTGCCCTGGTGGTCTCCTGTCCCAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117631	AGAGACTGAGATCTCAGCTGTGCACTGCCCTGGTGGTCTCCTGTCCCAAC	117680

BX001005.6	651	CAGGTGTTGACCCAGGCCTTGCAGGCTCACGCGCTCTGGAAAAAAGAGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117681	CAGGTGTTGACCCAGGCCTTGCAGGCTCACGCGCTCTGGAAAAAAGAGAG	117730

BX001005.6	701	AAACCAATAAATGCTCCCCTGGGTGCAGAGTGCTGCTTTTTATTTCCTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117731	AAACCAATAAATGCTCCCCTGGGTGCAGAGTGCTGCTTTTTATTTCCTGA	117780

BX001005.6	751	GGAGTTCTCCCTCCTCAGTCACTCCCAAATCAGATTTACCCTTTCTCTGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117781	GGAGTTCTCCCTCCTCAGTCACTCCCAAATCAGATTTACCCTTTCTCTGA	117830

BX001005.6	801	CGGAAGATGACGTCCCCACTTTTTTCTCCCTCCCATGGCACTTTTCCAGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117831	CGGAAGATGACGTCCCCACTTTTTTCTCCCTCCCATGGCACTTTTCCAGC	117880

BX001005.6	851	CCCTGCCAGTCCCCTCCCGTGACTCCATCAACATCAGCACCTGCCCTGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117881	CCCTGCCAGTCCCCTCCCGTGACTCCATCAACATCAGCACCTGCCCTGTG	117930

BX001005.6	901	TCCACCATCCATTGTGCAGTGAGTGAAAGGACCCAGGACTAAGGAACAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117931	TCCACCATCCATTGTGCAGTGAGTGAAAGGACCCAGGACTAAGGAACAAG	117980

BX001005.6	951	ACCCAAGAGGAAACTCAGTGCCCTTTCCTCCTCCTCTCAAGCCTGACCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	117981	ACCCAAGAGGAAACTCAGTGCCCTTTCCTCCTCCTCTCAAGCCTGACCAG	118030

BX001005.6	1001	CCCTGACACAGTGAGAGGCCTCCCCAAAGAGAGGCCCTGGCCCTGTCTCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118031	CCCTGACACAGTGAGAGGCCTCCCCAAAGAGAGGCCCTGGCCCTGTCTCC	118080

BX001005.6	1051	ATGTCCTTCCAGGTCTGGGCCAAGTCACACACAGTCCTTCTCTTCCTGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118081	ATGTCCTTCCAGGTCTGGGCCAAGTCACACACAGTCCTTCTCTTCCTGAG	118130

BX001005.6	1101	ACCCCAGGCCCTCTTCACCTGCAGAGGCACCTGCATACCAGGGCAGGCCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118131	ACCCCAGGCCCTCTTCACCTGCAGAGGCACCTGCATACCAGGGCAGGCCC	118180

BX001005.6	1151	TGCACACTGTGGGTTCTGCCCTCCACCAGCAGCTCACTGTTCCTCCCCTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118181	TGCACACTGTGGGTTCTGCCCTCCACCAGCAGCTCACTGTTCCTCCCCTC	118230

BX001005.6	1201	CCAGCTCTGAGCAGACAGCTCCTAACTAGAGATACCATCAGGAAGCCCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118231	CCAGCTCTGAGCAGACAGCTCCTAACTAGAGATACCATCAGGAAGCCCTG	118280

BX001005.6	1251	GGGCTCACAGGCCCTGCATGGAAATATGTGGCTGCCATGGAGTCTGCACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118281	GGGCTCACAGGCCCTGCATGGAAATATGTGGCTGCCATGGAGTCTGCACC	118330

BX001005.6	1301	TGACCTGATGCTGGGGACCCCCTTGCTCAAGGAGGCCCAGCCTGCCCTCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118331	TGACCTGATGCTGGGGACCCCCTTGCTCAAGGAGGCCCAGCCTGCCCTCC	118380

BX001005.6	1351	CCATAACCTGCATTTGGGCTGTGCTTGCTCCTGCCTGTCCACTCAACCCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118381	CCATAACCTGCATTTGGGCTGTGCTTGCTCCTGCCTGTCCACTCAACCCT	118430

BX001005.6	1401	GGAAATGCAGCTCCACCCCAGGGCTGCTGCTTGGTGAGGCTGCAAGCCCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118431	GGAAATGCAGCTCCACCCCAGGGCTGCTGCTTGGTGAGGCTGCAAGCCCT	118480

BX001005.6	1451	TCCTGTCCCATTCCTAACAGGGATTCCACCCAGGCCACTGCCATCGCAGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118481	TCCTGTCCCATTCCTAACAGGGATTCCACCCAGGCCACTGCCATCGCAGC	118530

BX001005.6	1501	TCACAGGGGATCTTCTTCGCCTGTGGAGTAGGGGGTTTCTTCAGACCCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118531	TCACAGGGGATCTTCTTCGCCTGTGGAGTAGGGGGTTTCTTCAGACCCCT	118580

BX001005.6	1551	CATCCTGAGGCTGCCTCTACGCACCCTCTGCACCTGGGGATTGCCACTGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118581	CATCCTGAGGCTGCCTCTACGCACCCTCTGCACCTGGGGATTGCCACTGC	118630

BX001005.6	1601	CACAGGCACTGTCTCCCACATGGACCCTCTGAGAAACGAAGCCCCAAATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118631	CACAGGCACTGTCTCCCACATGGACCCTCTGAGAAACGAAGCCCCAAATT	118680

BX001005.6	1651	TGACTTCCTGTTCTATTCAACATCCTTTACAACATCAGTGTTGGAGGAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118681	TGACTTCCTGTTCTATTCAACATCCTTTACAACATCAGTGTTGGAGGAAA	118730

BX001005.6	1701	TCCTATTAAGATTATCCAGCTGAAATTATGTTGATGTACACCAATACTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118731	TCCTATTAAGATTATCCAGCTGAAATTATGTTGATGTACACCAATACTTA	118780

BX001005.6	1751	AAGCAGGAATTTTGAGAAACTAACATGTAATTTTCATGCCCTTTTTCTAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118781	AAGCAGGAATTTTGAGAAACTAACATGTAATTTTCATGCCCTTTTTCTAG	118830

BX001005.6	1801	CCAATGTCCCAGTGACCTACGAGAAAACCATTCCTGCCTACAGGGAACCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118831	CCAATGTCCCAGTGACCTACGAGAAAACCATTCCTGCCTACAGGGAACCA	118880

BX001005.6	1851	GAACTGACAATCCCTCTATAGGAGACACCGCAGGTGAGAGCAGGAGCAAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118881	GAACTGACAATCCCTCTATAGGAGACACCGCAGGTGAGAGCAGGAGCAAC	118930

BX001005.6	1901	CACAGACCTGCACTGCCCGCGCTGTGGTTGCCTCCTGGACGGGGCCCTCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118931	CACAGACCTGCACTGCCCGCGCTGTGGTTGCCTCCTGGACGGGGCCCTCT	118980

BX001005.6	1951	TGCTGCAGGGCAGGGGATGAACCGTCCCATCTGCCCAGGCCTGAGTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844851.4	118981	TGCTGCAGGGCAGGGGATGAACCGTCCCATCTGCCCAGGCCTGAGTGGCC	119030

Overview

Query
BX001005.6 - 50174 bps
Hit
AL844851.4 - 119030 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link