<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
BX001005.6 1 CTGTCCCTCACTGAGAACTGGTGGGGAGATGTGGGGGAGGAGGGGAGATT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117031 CTGTCCCTCACTGAGAACTGGTGGGGAGATGTGGGGGAGGAGGGGAGATT 117080 BX001005.6 51 TCTTTATGCTGTGTCAAAGCATGGAGACAGACCTCTCCTTCTCTCCTGAA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117081 TCTTTATGCTGTGTCAAAGCATGGAGACAGACCTCTCCTTCTCTCCTGAA 117130 BX001005.6 101 CCTCACACTATCCCTTCCCAGACACTTGAAATAAAACGCAGACCAGAAAT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117131 CCTCACACTATCCCTTCCCAGACACTTGAAATAAAACGCAGACCAGAAAT 117180 BX001005.6 151 GTCTATTTAAGAGTTAAATATCTATAGTATAAAATATGAAGACAGAGTAG 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117181 GTCTATTTAAGAGTTAAATATCTATAGTATAAAATATGAAGACAGAGTAG 117230 BX001005.6 201 AATGGGGTAATGCAGGAGAGCATGACAGAGATGACAGGACCTCAAGGTGC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117231 AATGGGGTAATGCAGGAGAGCATGACAGAGATGACAGGACCTCAAGGTGC 117280 BX001005.6 251 CAGGAAAGCTGGTGCTGGGCCAGGACCAAGGAGCCATCAGCAGGACACTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117281 CAGGAAAGCTGGTGCTGGGCCAGGACCAAGGAGCCATCAGCAGGACACTC 117330 BX001005.6 301 ACTCATAAAGCTCACCTATAATAATACAATTACTGCATATGTAATATATC 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117331 ACTCATAAAGCTCACCTATAATAATACAATTACTGCATATGTAATATATC 117380 BX001005.6 351 AAAATATAATAAAATAACAAAATAACAAAAATAATATGGCACAGCTGCAA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117381 AAAATATAATAAAATAACAAAATAACAAAAATAATATGGCACAGCTGCAA 117430 BX001005.6 401 ATACCCCATATATACTAACCCTTTTCATTCATCCAACCACAAGAAATAAA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117431 ATACCCCATATATACTAACCCTTTTCATTCATCCAACCACAAGAAATAAA 117480 BX001005.6 451 TGCTCGTAGTTTCCCCATGTCATAGATGAGGAAAATGAGGCACAAAGAGA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117481 TGCTCGTAGTTTCCCCATGTCATAGATGAGGAAAATGAGGCACAAAGAGA 117530 BX001005.6 501 GAACATGCTGGTGAGGCCTAGGCAAGGAGTTGAATCCAGACCGTCTGGCT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117531 GAACATGCTGGTGAGGCCTAGGCAAGGAGTTGAATCCAGACCGTCTGGCT 117580 BX001005.6 551 GCAGAGTCTAGTTGCCCTCAGTGGAGCCAGCGAACCCAGGAGCTGACACC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117581 GCAGAGTCTAGTTGCCCTCAGTGGAGCCAGCGAACCCAGGAGCTGACACC 117630 BX001005.6 601 AGAGACTGAGATCTCAGCTGTGCACTGCCCTGGTGGTCTCCTGTCCCAAC 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117631 AGAGACTGAGATCTCAGCTGTGCACTGCCCTGGTGGTCTCCTGTCCCAAC 117680 BX001005.6 651 CAGGTGTTGACCCAGGCCTTGCAGGCTCACGCGCTCTGGAAAAAAGAGAG 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117681 CAGGTGTTGACCCAGGCCTTGCAGGCTCACGCGCTCTGGAAAAAAGAGAG 117730 BX001005.6 701 AAACCAATAAATGCTCCCCTGGGTGCAGAGTGCTGCTTTTTATTTCCTGA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117731 AAACCAATAAATGCTCCCCTGGGTGCAGAGTGCTGCTTTTTATTTCCTGA 117780 BX001005.6 751 GGAGTTCTCCCTCCTCAGTCACTCCCAAATCAGATTTACCCTTTCTCTGA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117781 GGAGTTCTCCCTCCTCAGTCACTCCCAAATCAGATTTACCCTTTCTCTGA 117830 BX001005.6 801 CGGAAGATGACGTCCCCACTTTTTTCTCCCTCCCATGGCACTTTTCCAGC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117831 CGGAAGATGACGTCCCCACTTTTTTCTCCCTCCCATGGCACTTTTCCAGC 117880 BX001005.6 851 CCCTGCCAGTCCCCTCCCGTGACTCCATCAACATCAGCACCTGCCCTGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117881 CCCTGCCAGTCCCCTCCCGTGACTCCATCAACATCAGCACCTGCCCTGTG 117930 BX001005.6 901 TCCACCATCCATTGTGCAGTGAGTGAAAGGACCCAGGACTAAGGAACAAG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117931 TCCACCATCCATTGTGCAGTGAGTGAAAGGACCCAGGACTAAGGAACAAG 117980 BX001005.6 951 ACCCAAGAGGAAACTCAGTGCCCTTTCCTCCTCCTCTCAAGCCTGACCAG 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 117981 ACCCAAGAGGAAACTCAGTGCCCTTTCCTCCTCCTCTCAAGCCTGACCAG 118030 BX001005.6 1001 CCCTGACACAGTGAGAGGCCTCCCCAAAGAGAGGCCCTGGCCCTGTCTCC 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118031 CCCTGACACAGTGAGAGGCCTCCCCAAAGAGAGGCCCTGGCCCTGTCTCC 118080 BX001005.6 1051 ATGTCCTTCCAGGTCTGGGCCAAGTCACACACAGTCCTTCTCTTCCTGAG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118081 ATGTCCTTCCAGGTCTGGGCCAAGTCACACACAGTCCTTCTCTTCCTGAG 118130 BX001005.6 1101 ACCCCAGGCCCTCTTCACCTGCAGAGGCACCTGCATACCAGGGCAGGCCC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118131 ACCCCAGGCCCTCTTCACCTGCAGAGGCACCTGCATACCAGGGCAGGCCC 118180 BX001005.6 1151 TGCACACTGTGGGTTCTGCCCTCCACCAGCAGCTCACTGTTCCTCCCCTC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118181 TGCACACTGTGGGTTCTGCCCTCCACCAGCAGCTCACTGTTCCTCCCCTC 118230 BX001005.6 1201 CCAGCTCTGAGCAGACAGCTCCTAACTAGAGATACCATCAGGAAGCCCTG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118231 CCAGCTCTGAGCAGACAGCTCCTAACTAGAGATACCATCAGGAAGCCCTG 118280 BX001005.6 1251 GGGCTCACAGGCCCTGCATGGAAATATGTGGCTGCCATGGAGTCTGCACC 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118281 GGGCTCACAGGCCCTGCATGGAAATATGTGGCTGCCATGGAGTCTGCACC 118330 BX001005.6 1301 TGACCTGATGCTGGGGACCCCCTTGCTCAAGGAGGCCCAGCCTGCCCTCC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118331 TGACCTGATGCTGGGGACCCCCTTGCTCAAGGAGGCCCAGCCTGCCCTCC 118380 BX001005.6 1351 CCATAACCTGCATTTGGGCTGTGCTTGCTCCTGCCTGTCCACTCAACCCT 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118381 CCATAACCTGCATTTGGGCTGTGCTTGCTCCTGCCTGTCCACTCAACCCT 118430 BX001005.6 1401 GGAAATGCAGCTCCACCCCAGGGCTGCTGCTTGGTGAGGCTGCAAGCCCT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118431 GGAAATGCAGCTCCACCCCAGGGCTGCTGCTTGGTGAGGCTGCAAGCCCT 118480 BX001005.6 1451 TCCTGTCCCATTCCTAACAGGGATTCCACCCAGGCCACTGCCATCGCAGC 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118481 TCCTGTCCCATTCCTAACAGGGATTCCACCCAGGCCACTGCCATCGCAGC 118530 BX001005.6 1501 TCACAGGGGATCTTCTTCGCCTGTGGAGTAGGGGGTTTCTTCAGACCCCT 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118531 TCACAGGGGATCTTCTTCGCCTGTGGAGTAGGGGGTTTCTTCAGACCCCT 118580 BX001005.6 1551 CATCCTGAGGCTGCCTCTACGCACCCTCTGCACCTGGGGATTGCCACTGC 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118581 CATCCTGAGGCTGCCTCTACGCACCCTCTGCACCTGGGGATTGCCACTGC 118630 BX001005.6 1601 CACAGGCACTGTCTCCCACATGGACCCTCTGAGAAACGAAGCCCCAAATT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118631 CACAGGCACTGTCTCCCACATGGACCCTCTGAGAAACGAAGCCCCAAATT 118680 BX001005.6 1651 TGACTTCCTGTTCTATTCAACATCCTTTACAACATCAGTGTTGGAGGAAA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118681 TGACTTCCTGTTCTATTCAACATCCTTTACAACATCAGTGTTGGAGGAAA 118730 BX001005.6 1701 TCCTATTAAGATTATCCAGCTGAAATTATGTTGATGTACACCAATACTTA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118731 TCCTATTAAGATTATCCAGCTGAAATTATGTTGATGTACACCAATACTTA 118780 BX001005.6 1751 AAGCAGGAATTTTGAGAAACTAACATGTAATTTTCATGCCCTTTTTCTAG 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118781 AAGCAGGAATTTTGAGAAACTAACATGTAATTTTCATGCCCTTTTTCTAG 118830 BX001005.6 1801 CCAATGTCCCAGTGACCTACGAGAAAACCATTCCTGCCTACAGGGAACCA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118831 CCAATGTCCCAGTGACCTACGAGAAAACCATTCCTGCCTACAGGGAACCA 118880 BX001005.6 1851 GAACTGACAATCCCTCTATAGGAGACACCGCAGGTGAGAGCAGGAGCAAC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118881 GAACTGACAATCCCTCTATAGGAGACACCGCAGGTGAGAGCAGGAGCAAC 118930 BX001005.6 1901 CACAGACCTGCACTGCCCGCGCTGTGGTTGCCTCCTGGACGGGGCCCTCT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118931 CACAGACCTGCACTGCCCGCGCTGTGGTTGCCTCCTGGACGGGGCCCTCT 118980 BX001005.6 1951 TGCTGCAGGGCAGGGGATGAACCGTCCCATCTGCCCAGGCCTGAGTGGCC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL844851.4 118981 TGCTGCAGGGCAGGGGATGAACCGTCCCATCTGCCCAGGCCTGAGTGGCC 119030