<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX000360.7	1	AGTTGCTCTACTGTCTGGAGAGTAGACTACTATGCTATCTTATCAATGAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96146	AGTTGCTCTACTGTCTGGAGAGTAGACTACTATGCTATCTTATCAATGAC	96195

BX000360.7	51	GGCTTTGGGTATGTTTCACATCTTACCCAACCAGGTAACTCTCAGGAATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96196	GGCTTTGGGTATGTTTCACATCTTACCCAACCAGGTAACTCTCAGGAATT	96245

BX000360.7	101	TGACAGGCATGCCAAGCCTCTGTATATTTTTGGGGTTGATTTTCTATCCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96246	TGACAGGCATGCCAAGCCTCTGTATATTTTTGGGGTTGATTTTCTATCCC	96295

BX000360.7	151	TCCTTCAGGCTGTCCAAAACAGTTTGTAGGATAGTCTCCAAATCTGTAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96296	TCCTTCAGGCTGTCCAAAACAGTTTGTAGGATAGTCTCCAAATCTGTAAG	96345

BX000360.7	201	AGACTCTAGGGTAGCATGTTATCATTAATATAGTGAAACAGGGAGACCAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96346	AGACTCTAGGGTAGCATGTTATCATTAATATAGTGAAACAGGGAGACCAA	96395

BX000360.7	251	GGCAGGCAAAGAGATTATAGACAGCTCCTGTGTAACCATACTGTGAGAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96396	GGCAGGCAAAGAGATTATAGACAGCTCCTGTGTAACCATACTGTGAGAGA	96445

BX000360.7	301	TGGCGGGGCTTTGCAGATGCCCCTGTGGTGACACCTGGAAAGTCCATTCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96446	TGGCGGGGCTTTGCAGATGCCCCTGTGGTGACACCTGGAAAGTCCATTCT	96495

BX000360.7	351	TGGTCCTCCTAAGTGTAGACCAACTGGTCTTGTGAATCTTCAGCTGAAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96496	TGGTCCTCCTAAGTGTAGACCAACTGGTCTTGTGAATCTTCAGCTGAAAG	96545

BX000360.7	401	AATACTGGAAAAGGTATTAATGCAGTCAGTCACAGAATGGATACTTCCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96546	AATACTGGAAAAGGTATTAATGCAGTCAGTCACAGAATGGATACTTCCCA	96595

BX000360.7	451	GCTTCGGTACTGCTTGCTCTAGCAGTTGAGCAATATTGGATACAGCTGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96596	GCTTCGGTACTGCTTGCTCTAGCAGTTGAGCAATATTGGATACAGCTGCA	96645

BX000360.7	501	TGTACAGGGCGTACCACTTTGTTCAGCTAGCGGTAATCCACCATCATCTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96646	TGTACAGGGCGTACCACTTTGTTCAGCTAGCGGTAATCCACCATCATCTT	96695

BX000360.7	551	CCAGGCATCACCTGGCTTCTTCACAGGCCAAACAAGGCTGCTGTAGGGGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96696	CCAGGCATCACCTGGCTTCTTCACAGGCCAAACAAGGCTGCTGTAGGGGC	96745

BX000360.7	601	TCTGGGCCAGTCTGACTATTTGTACCTTATGTACTTTCTGGATTGTTTGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96746	TCTGGGCCAGTCTGACTATTTGTACCTTATGTACTTTCTGGATTGTTTGG	96795

BX000360.7	651	GTGATTTCAGAGTGCCCCCCCAATAGCAGGAAGTATTGTTTCATGTTCAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96796	GTGATTTCAGAGTGCCCCCCCAATAGCAGGAAGTATTGTTTCATGTTCAT	96845

BX000360.7	701	TACCTGCAAGGATACAGGTGCATATTTGGCCTATCCCCTTTTTGCTTTCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96846	TACCTGCAAGGATACAGGTGCATATTTGGCCTATCCCCTTTTTGCTTTCT	96895

BX000360.7	751	CTGTGGACCTGATCGTTATTTTTATCCAGCTCACTGAGGTCTGCCAATGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96896	CTGTGGACCTGATCGTTATTTTTATCCAGCTCACTGAGGTCTGCCAATGC	96945

BX000360.7	801	TTCCCCCCATCACAGATTTCATTTCCCACTAAGAGGCTCAGAAGTGTTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96946	TTCCCCCCATCACAGATTTCATTTCCCACTAAGAGGCTCAGAAGTGTTGT	96995

BX000360.7	851	CTGAAATTGGTGGGTTCTATGGTCTCACTGACTTCAACAATGAAACCGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	96996	CTGAAATTGGTGGGTTCTATGGTCTCACTGACTTCAACAATGAAACCGCA	97045

BX000360.7	901	AACCCTCACAGAGAGTGTCACAGCTCTAAAGTTCGCGGGCGTGGAGTCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97046	AACCCTCACAGAGAGTGTCACAGCTCTAAAGTTCGCGGGCGTGGAGTCTG	97095

BX000360.7	951	TCCCTTCTGATGTTCAGATGTGTCCGCAGTTTCTTTTTTCTGGTGGGGTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97096	TCCCTTCTGATGTTCAGATGTGTCCGCAGTTTCTTTTTTCTGGTGGGGTC	97145

BX000360.7	1001	GTGGTCTTGCTAGCTCAGGAGTGAAGCTGCAAACCTTTGCAGTGAGTGTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97146	GTGGTCTTGCTAGCTCAGGAGTGAAGCTGCAAACCTTTGCAGTGAGTGTT	97195

BX000360.7	1051	ATACCTCATAAAAACAGCGTGGACCCAAAGAATGACCAGTTGGAAAATTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97196	ATACCTCATAAAAACAGCGTGGACCCAAAGAATGACCAGTTGGAAAATTT	97245

BX000360.7	1101	ATTGCGCATAGTGAAAAAAACAACGCTTTCACAGTGCAGAAGAGACAACC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97246	ATTGCGCATAGTGAAAAAAACAACGCTTTCACAGTGCAGAAGAGACAACC	97295

BX000360.7	1151	CAGCGGGTTGCTAATGCTGGTTCGGGCAGCCTGCTTTTATTCTTTTATCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97296	CAGCGGGTTGCTAATGCTGGTTCGGGCAGCCTGCTTTTATTCTTTTATCT	97345

BX000360.7	1201	GGCCCCACCCACATCCTGCTGATTGGTAGAGCCGAGTGGCCTGTTTTGTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97346	GGCCCCACCCACATCCTGCTGATTGGTAGAGCCGAGTGGCCTGTTTTGTC	97395

BX000360.7	1251	AGGGCGCTGACTGGTGCGTTTACAATCCCTGGGCTAGATACAAAGGTTCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97396	AGGGCGCTGACTGGTGCGTTTACAATCCCTGGGCTAGATACAAAGGTTCT	97445

BX000360.7	1301	CCTCGTCCCCATTAGATTAGTTAGATACAGAGTTTCCACATACAGGTTCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97446	CCTCGTCCCCATTAGATTAGTTAGATACAGAGTTTCCACATACAGGTTCT	97495

BX000360.7	1351	CCAAGGCCCCACCAGAGCAGCTAGATACAGAGTGTCGATTGGTGCACTCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97496	CCAAGGCCCCACCAGAGCAGCTAGATACAGAGTGTCGATTGGTGCACTCA	97545

BX000360.7	1401	CAAACCTTGAGCTAAACACAGGGTGCTGATTGGTGTGTTTACAATCCCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97546	CAAACCTTGAGCTAAACACAGGGTGCTGATTGGTGTGTTTACAATCCCTG	97595

BX000360.7	1451	AGCTAGATAAAAAGACTCTCCACGTCCCCACCAGACTCAGGAGCCCAGCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97596	AGCTAGATAAAAAGACTCTCCACGTCCCCACCAGACTCAGGAGCCCAGCT	97645

BX000360.7	1501	GGCTTCACCTAGTGGATTCCGCACTGGGGCTGCAGGTGGAGCTGCCTGCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97646	GGCTTCACCTAGTGGATTCCGCACTGGGGCTGCAGGTGGAGCTGCCTGCC	97695

BX000360.7	1551	AGTCCTGCGCCCTGCACTCGCATTCCTCAGCCCTTAGGTGGTCGATGGGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97696	AGTCCTGCGCCCTGCACTCGCATTCCTCAGCCCTTAGGTGGTCGATGGGA	97745

BX000360.7	1601	CTGGGTGCCGTGGAGCAGGGGGTGGCGCTCGTCCGGGAGGCTCGGGCCGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97746	CTGGGTGCCGTGGAGCAGGGGGTGGCGCTCGTCCGGGAGGCTCGGGCCGC	97795

BX000360.7	1651	ACAGGAGCCCACGGAGGGGGGTGGGAGGCTCAGGCATGGCGGGCTGCAGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97796	ACAGGAGCCCACGGAGGGGGGTGGGAGGCTCAGGCATGGCGGGCTGCAGG	97845

BX000360.7	1701	TCCCGAGCCCTGCCCCGTGGGAAGGCAGCCAAGGCCCGGCGAGAAATCGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97846	TCCCGAGCCCTGCCCCGTGGGAAGGCAGCCAAGGCCCGGCGAGAAATCGA	97895

BX000360.7	1751	GCACAGCGCCGGTGGGCCGGCACTGCTGGGGGACCCAGTACACCCTTCGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97896	GCACAGCGCCGGTGGGCCGGCACTGCTGGGGGACCCAGTACACCCTTCGC	97945

BX000360.7	1801	AGCCACTGGCCCGGGTGCTAAGTCCCCCATTGCCCGGGGCCAGCAGGGCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97946	AGCCACTGGCCCGGGTGCTAAGTCCCCCATTGCCCGGGGCCAGCAGGGCT	97995

BX000360.7	1851	GGCTGGCTGCTCCGAGTGCGGGGCCCACCAAGCCCACGCCCACCCGGAAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	97996	GGCTGGCTGCTCCGAGTGCGGGGCCCACCAAGCCCACGCCCACCCGGAAC	98045

BX000360.7	1901	TCCAGCTGGCCCGCAAGTGCGGCACACAGCCCTGGTTCCCGCTCGTGTCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	98046	TCCAGCTGGCCCGCAAGTGCGGCACACAGCCCTGGTTCCCGCTCGTGTCT	98095

BX000360.7	1951	CTCCCTCCACACCTCCCTGCAAGCTGAAGGAGTGGGCTCCGGCCTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844539.5	98096	CTCCCTCCACACCTCCCTGCAAGCTGAAGGAGTGGGCTCCGGCCTTGGCC	98145

Overview

Query
BX000360.7 - 44401 bps
Hit
AL844539.5 - 98145 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link