<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX000343.5	1	GCCTCATGCTTGGCAAGGGGGAGGGGAACAGGTCCACAAGATGATCCAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	107524	GCCTCATGCTTGGCAAGGGGGAGGGGAACAGGTCCACAAGATGATCCAGA	107573

BX000343.5	51	CACATTATCCAAAAAATCGCTTTCCTCTTTAATACCAACCCACCCCAGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	107574	CACATTATCCAAAAAATCGCTTTCCTCTTTAATACCAACCCACCCCAGGA	107623

BX000343.5	101	GACAGCTGTCCACCCCCAGTTGGGGAAGGGGCCACACTGCCCCCACCTCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	107624	GACAGCTGTCCACCCCCAGTTGGGGAAGGGGCCACACTGCCCCCACCTCC	107673

BX000343.5	151	TTGTTCCAGGGAACACTCATTTCCCTACAGGTGATCTTGGGGAGAGACTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	107674	TTGTTCCAGGGAACACTCATTTCCCTACAGGTGATCTTGGGGAGAGACTG	107723

BX000343.5	201	TTCCCAGGCAACCCTGGAGTCTGGCTCAGCGCACAAATCTGTCCAGGGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	107724	TTCCCAGGCAACCCTGGAGTCTGGCTCAGCGCACAAATCTGTCCAGGGCA	107773

BX000343.5	251	GATGGCCGGGCCCCCGTGGGCTTGGCCTTCGCCTCCTTATGATGCTGCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	107774	GATGGCCGGGCCCCCGTGGGCTTGGCCTTCGCCTCCTTATGATGCTGCTG	107823

BX000343.5	301	CTGAAGGCTCTGCCGGACCTTGTCCTGGGGACCGGAGACGGGGAGGACAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	107824	CTGAAGGCTCTGCCGGACCTTGTCCTGGGGACCGGAGACGGGGAGGACAC	107873

BX000343.5	351	AGGCACAGAGTGAGAAGTGGCAGGCTGACAAGGGCAGAGGCACAAGCAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	107874	AGGCACAGAGTGAGAAGTGGCAGGCTGACAAGGGCAGAGGCACAAGCAGG	107923

BX000343.5	401	AGGGTGCAGCCTGTGGAAGGCCCGGCCCATGCCAATGCTCATTTACCCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	107924	AGGGTGCAGCCTGTGGAAGGCCCGGCCCATGCCAATGCTCATTTACCCTG	107973

BX000343.5	451	TGTTCCTCATCCATGACCTTCCTCTTCCTCTTCACCAGGCTTGCCGTGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	107974	TGTTCCTCATCCATGACCTTCCTCTTCCTCTTCACCAGGCTTGCCGTGGA	108023

BX000343.5	501	GCTGCGGCCCTTCTGCTTTGGCTTTGGCTGGAAGGGAGCCTTAGCCTGCG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108024	GCTGCGGCCCTTCTGCTTTGGCTTTGGCTGGAAGGGAGCCTTAGCCTGCG	108073

BX000343.5	551	GGTCATAGCCCTGAGGGAGGGGACAGGAGTGATATCTGTTACAGCCTCGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108074	GGTCATAGCCCTGAGGGAGGGGACAGGAGTGATATCTGTTACAGCCTCGG	108123

BX000343.5	601	AGTCAGGGAACTGGCAGCACCCACCTGCTGGCCGCACTTCTGGGGACAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108124	AGTCAGGGAACTGGCAGCACCCACCTGCTGGCCGCACTTCTGGGGACAAG	108173

BX000343.5	651	CCATGGTGGGGAGAGGATGTGGGGGAGAAGACGGGCCTGGGCATTCAGGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108174	CCATGGTGGGGAGAGGATGTGGGGGAGAAGACGGGCCTGGGCATTCAGGG	108223

BX000343.5	701	GCCTGCTCCATACCAGCCTCTCTATCTGCTCCTTCTTTCCCTGCTCCAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108224	GCCTGCTCCATACCAGCCTCTCTATCTGCTCCTTCTTTCCCTGCTCCAGG	108273

BX000343.5	751	GAGATGACATCCACCTCGGCCAGGGCTCGTGGGTCCAGACAAATAAGCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108274	GAGATGACATCCACCTCGGCCAGGGCTCGTGGGTCCAGACAAATAAGCTC	108323

BX000343.5	801	TGCAGGTACCTGGGGGTGTCACAGAGGGACAGGACTCAGCAAGGAGCCAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108324	TGCAGGTACCTGGGGGTGTCACAGAGGGACAGGACTCAGCAAGGAGCCAC	108373

BX000343.5	851	AGGAGGGTAGCACCAAAAAGAGAAGCCAGGGAGGCTGCTGAACCCCTCTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108374	AGGAGGGTAGCACCAAAAAGAGAAGCCAGGGAGGCTGCTGAACCCCTCTA	108423

BX000343.5	901	CCCAAGACCCCCAGCATGAGACATCAGGAGAGCTTTCTCTACCTCCAACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108424	CCCAAGACCCCCAGCATGAGACATCAGGAGAGCTTTCTCTACCTCCAACC	108473

BX000343.5	951	CCAAACCACACCTTCCCCAGCAGCAGGGGCCTCACTCTCTGCAGCAGGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108474	CCAAACCACACCTTCCCCAGCAGCAGGGGCCTCACTCTCTGCAGCAGGGG	108523

BX000343.5	1001	AACCTCACCTCCAACAGGGGCAATCTCACCCTCTCCAGCAGGGGGGAACC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108524	AACCTCACCTCCAACAGGGGCAATCTCACCCTCTCCAGCAGGGGGGAACC	108573

BX000343.5	1051	TGACCCTCTCCAGGAGAGGGAATTTCACCCTCTCCAGCAGAGGGAAACCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108574	TGACCCTCTCCAGGAGAGGGAATTTCACCCTCTCCAGCAGAGGGAAACCT	108623

BX000343.5	1101	GACCCTCTCCAGCAGGGGGAATCTCACCCTCTCCAGCAGAGGGAAACCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108624	GACCCTCTCCAGCAGGGGGAATCTCACCCTCTCCAGCAGAGGGAAACCTG	108673

BX000343.5	1151	ACCCCGTCCAGGAGAGGGGAATCTCACCCTCTCCAGGAAGAGGAAACCTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108674	ACCCCGTCCAGGAGAGGGGAATCTCACCCTCTCCAGGAAGAGGAAACCTT	108723

BX000343.5	1201	ACCTTCTCCAGCAGGGGGGAACCTGACCTTCTCCAGCAGTGGGGAACCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108724	ACCTTCTCCAGCAGGGGGGAACCTGACCTTCTCCAGCAGTGGGGAACCTG	108773

BX000343.5	1251	ACCTTCTCCAGCAGGGGGGAACCTGACCTTCTCCAGGAAGGAGGAACCTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108774	ACCTTCTCCAGCAGGGGGGAACCTGACCTTCTCCAGGAAGGAGGAACCTC	108823

BX000343.5	1301	ACCCTCTCCAGGACGGGGGAACCTGACCCTCTCCAGCAATGGGGGGAATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108824	ACCCTCTCCAGGACGGGGGAACCTGACCCTCTCCAGCAATGGGGGGAATC	108873

BX000343.5	1351	TCACCCTCTCCAGCAGGGGAGCCTCACCTTCTCTAGCAGGGCCTTCACCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108874	TCACCCTCTCCAGCAGGGGAGCCTCACCTTCTCTAGCAGGGCCTTCACCT	108923

BX000343.5	1401	CCCACTCCTGGCGCTGCTTCCGGCTTCTGTATGGATTACTCTCCAGGCCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108924	CCCACTCCTGGCGCTGCTTCCGGCTTCTGTATGGATTACTCTCCAGGCCA	108973

BX000343.5	1451	TCGAAGTTGGGCTCACCGGCCCCTGAAGGGAGGGAGGGAGAAGCATGGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	108974	TCGAAGTTGGGCTCACCGGCCCCTGAAGGGAGGGAGGGAGAAGCATGGAG	109023

BX000343.5	1501	CCATAAGGAAGAACCTCAGTCCAACAGCTCCAGCCCAACTAAGCCCCCAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	109024	CCATAAGGAAGAACCTCAGTCCAACAGCTCCAGCCCAACTAAGCCCCCAG	109073

BX000343.5	1551	TTCCTGGATGTCTCTGGCCCAAACTTCCACCCAGAGTTCATTCACTTCAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	109074	TTCCTGGATGTCTCTGGCCCAAACTTCCACCCAGAGTTCATTCACTTCAA	109123

BX000343.5	1601	GCCCCATCCCCTGGCCCACTCACCAGGGACCAGCATGCTGGTGATGCCCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	109124	GCCCCATCCCCTGGCCCACTCACCAGGGACCAGCATGCTGGTGATGCCCC	109173

BX000343.5	1651	CAGTGTGCCCCACCCCCAGCACATCTTCAAAGGGGCAGAACTGAAGGCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	109174	CAGTGTGCCCCACCCCCAGCACATCTTCAAAGGGGCAGAACTGAAGGCCA	109223

BX000343.5	1701	TGCACAGGGCCTGAGAGCCGGTGGGTGAGGTAGGGCTGTTCAAGGGAGGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	109224	TGCACAGGGCCTGAGAGCCGGTGGGTGAGGTAGGGCTGTTCAAGGGAGGG	109273

BX000343.5	1751	TGGGCTGGCCTTGCCCTGCCCTGCCCAGATGTTGACAACGTCACCCATTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	109274	TGGGCTGGCCTTGCCCTGCCCTGCCCAGATGTTGACAACGTCACCCATTC	109323

BX000343.5	1801	CCGCCACCAGCAGTCCCCTCTGGGAGAAGGCCAGGTGCCCTGCTCCATGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	109324	CCGCCACCAGCAGTCCCCTCTGGGAGAAGGCCAGGTGCCCTGCTCCATGG	109373

BX000343.5	1851	GGCAGGGTCCGAGTGCTCAGAGGCTGGTACGTCCCTCGCAAGTCAAAGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	109374	GGCAGGGTCCGAGTGCTCAGAGGCTGGTACGTCCCTCGCAAGTCAAAGAT	109423

BX000343.5	1901	CTTCAGCTGGTGGTCTAGGCCAGAGGTGGCCATGTACCTGGTGAGAGAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	109424	CTTCAGCTGGTGGTCTAGGCCAGAGGTGGCCATGTACCTGGTGAGAGAAG	109473

BX000343.5	1951	AGGGATCAATTAATATGTCAGTAAATGGGTTTACCAAGCAAGCTGTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844527.6	109474	AGGGATCAATTAATATGTCAGTAAATGGGTTTACCAAGCAAGCTGTGGCC	109523

Overview

Query
BX000343.5 - 20343 bps
Hit
AL844527.6 - 109523 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link