<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845452.3	1	GTAAAATTCTCATTGCAGAGATTGTTTACCTCTTTGGCTAGCTGTATTCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150299	GTAAAATTCTCATTGCAGAGATTGTTTACCTCTTTGGCTAGCTGTATTCC	150348

AL845452.3	51	TAGGTATTTTATTCTTCTTGAGGCTACTGTGAATGAAACTGCATTCTTCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150349	TAGGTATTTTATTCTTCTTGAGGCTACTGTGAATGAAACTGCATTCTTCA	150398

AL845452.3	101	CTTGGTTCTCGGTTTAGATGTTATTGGTGTATAGAAATGCTACTGATTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150399	CTTGGTTCTCGGTTTAGATGTTATTGGTGTATAGAAATGCTACTGATTTT	150448

AL845452.3	151	TGTAAACTTATTTTGTATCCTGAAACTCTGCTGAAGTTCTTTTTCAGATC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150449	TGTAAACTTATTTTGTATCCTGAAACTCTGCTGAAGTTCTTTTTCAGATC	150498

AL845452.3	201	TAGAAGCCCTCAGGAAGAGACCATGGAGTTTTCTAGGTATAGAATCATTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150499	TAGAAGCCCTCAGGAAGAGACCATGGAGTTTTCTAGGTATAGAATCATTA	150548

AL845452.3	251	TCTATGAAGAGAGATAATTTGACTTCCTCTCTTCCTATTTGGATGCCTTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150549	TCTATGAAGAGAGATAATTTGACTTCCTCTCTTCCTATTTGGATGCCTTT	150598

AL845452.3	301	TATTTCTTTCTCTCACTTGACTGCTCCAAATAGAACTTCCAGTACTATGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150599	TATTTCTTTCTCTCACTTGACTGCTCCAAATAGAACTTCCAGTACTATGT	150648

AL845452.3	351	TGAATAGGAGTAGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTCCTAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150649	TGAATAGGAGTAGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTCCTAAA	150698

AL845452.3	401	GAGAATACTTCTAGCTTTTGCCAATTCAGTATTATGTTGGCTTTGGGTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150699	GAGAATACTTCTAGCTTTTGCCAATTCAGTATTATGTTGGCTTTGGGTTT	150748

AL845452.3	451	GTCAGAGATAGCTTTTATTATTTTGAGGACTATAACTTCAAACCTAGTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150749	GTCAGAGATAGCTTTTATTATTTTGAGGACTATAACTTCAAACCTAGTTT	150798

AL845452.3	501	GTTGAGGGTTTTTAACATGAATGAATGTTTAATTTTACCAAAAGCCTTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150799	GTTGAGGGTTTTTAACATGAATGAATGTTTAATTTTACCAAAAGCCTTTT	150848

AL845452.3	551	CTGCATCTATTAAGGTATCATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTCTTTATGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150849	CTGCATCTATTAAGGTATCATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTCTTTATGT	150898

AL845452.3	601	GATGAATCACATTTATTGATTTGGGTAAGTTGAGCCAACTCTGCACTCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150899	GATGAATCACATTTATTGATTTGGGTAAGTTGAGCCAACTCTGCACTCCA	150948

AL845452.3	651	GGGATAAAGCCTACTTGATCACAATGGATTAGCTTTTTGGTGTGTTGCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150949	GGGATAAAGCCTACTTGATCACAATGGATTAGCTTTTTGGTGTGTTGCTG	150998

AL845452.3	701	GATTTCATTTGGTAGTATTTTGTGGAGGATTTTTGCATATATGTTCATCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	150999	GATTTCATTTGGTAGTATTTTGTGGAGGATTTTTGCATATATGTTCATCA	151048

AL845452.3	751	GGGATATTGGCCTGAAGTTCTTTTTTTCTGTTGTGTCTCTGCCAGGTTCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151049	GGGATATTGGCCTGAAGTTCTTTTTTTCTGTTGTGTCTCTGCCAGGTTCT	151098

AL845452.3	801	GGTATCAGAATGATGCTGGTCTCACAGACTGAGTTAGGGAGGTGTCCCTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151099	GGTATCAGAATGATGCTGGTCTCACAGACTGAGTTAGGGAGGTGTCCCTC	151148

AL845452.3	851	TTTCTCAATTTTTTGGAATAGTTTCGGTAGGAATGATACCAGTTCTTCTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151149	TTTCTCAATTTTTTGGAATAGTTTCGGTAGGAATGATACCAGTTCTTCTT	151198

AL845452.3	901	TATATGTCTGGTAGAATTTGGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGACTTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151199	TATATGTCTGGTAGAATTTGGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGACTTTTT	151248

AL845452.3	951	CTGGTTAGTAGGCTTTTTATTACTGATTCAATTTTGGAACTTGTTATTGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151249	CTGGTTAGTAGGCTTTTTATTACTGATTCAATTTTGGAACTTGTTATTGG	151298

AL845452.3	1001	TCTGTTTGGGGTTTCAATTTCTGGTTCAATCTTGGGAGGTTGTATGTTCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151299	TCTGTTTGGGGTTTCAATTTCTGGTTCAATCTTGGGAGGTTGTATGTTCC	151348

AL845452.3	1051	CAGGAATTTATCCATTCTTCTAGGTTTTCTAGTTTGTGTGCAGAGGTGTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151349	CAGGAATTTATCCATTCTTCTAGGTTTTCTAGTTTGTGTGCAGAGGTGTT	151398

AL845452.3	1101	CATAATAGTCTCCAAGCGGTTTTTGTATTTTTGTGTGGTCAGTGACAACG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151399	CATAATAGTCTCCAAGCGGTTTTTGTATTTTTGTGTGGTCAGTGACAACG	151448

AL845452.3	1151	TCCCCTTTGTCATTCCTGATTGTGTTTATTTAGATTATCTCCCCCCTCCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151449	TCCCCTTTGTCATTCCTGATTGTGTTTATTTAGATTATCTCCCCCCTCCT	151498

AL845452.3	1201	TTTTTTATTAGTCTAGTTAGTGCCTATCAACCTTATTTATTCTTTCAAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151499	TTTTTTATTAGTCTAGTTAGTGCCTATCAACCTTATTTATTCTTTCAAAG	151548

AL845452.3	1251	AACCAACTTTTGCTTTCTTTGATTTTTTGTACGGTTTTTCTCATCTCCAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151549	AACCAACTTTTGCTTTCTTTGATTTTTTGTACGGTTTTTCTCATCTCCAT	151598

AL845452.3	1301	TTTGTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGGTATTCTCTTCTGCTAGCTTTGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151599	TTTGTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGGTATTCTCTTCTGCTAGCTTTGGG	151648

AL845452.3	1351	GTTGGTTTGCTCTTGTTTATTTAGTTCCTCTAGATGTGATGTTAGGTTGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151649	GTTGGTTTGCTCTTGTTTATTTAGTTCCTCTAGATGTGATGTTAGGTTGA	151698

AL845452.3	1401	GATCTATCTTTTTGATGTGGGCATTTAGCACTATAGTTTTCCCTTAACAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151699	GATCTATCTTTTTGATGTGGGCATTTAGCACTATAGTTTTCCCTTAACAC	151748

AL845452.3	1451	TGCTTTAGCTGTGTCCCAGATTCTGGTATGTTTTTATCTTTGTTTTCATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151749	TGCTTTAGCTGTGTCCCAGATTCTGGTATGTTTTTATCTTTGTTTTCATT	151798

AL845452.3	1501	AGTTGTAAACAATTTCTTGATTTCTGCCTTAATTTCTCTTTGTTTACCCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151799	AGTTGTAAACAATTTCTTGATTTCTGCCTTAATTTCTCTTTGTTTACCCA	151848

AL845452.3	1551	AGTCATTCAGGAGTAGATTAATTTCCACTTAATTATATGGTTTTGAGAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151849	AGTCATTCAGGAGTAGATTAATTTCCACTTAATTATATGGTTTTGAGAGA	151898

AL845452.3	1601	TCTTCTTGGTATTTATTTTTATGGCACTGTGGTCCAAGAGTGTGGTTGGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151899	TCTTCTTGGTATTTATTTTTATGGCACTGTGGTCCAAGAGTGTGGTTGGT	151948

AL845452.3	1651	ATTTCAGGGTTTTTTTGTTTTTTTGAGATGAGTCTCACTCTGTCAACCAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151949	ATTTCAGGGTTTTTTTGTTTTTTTGAGATGAGTCTCACTCTGTCAACCAG	151998

AL845452.3	1701	ACTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCTCCTCCCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	151999	ACTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCTCCTCCCAG	152048

AL845452.3	1751	GTTCAAGCAATTCTCGTGACTCAACCTCCAAAGTAGCTGGGATTACAGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	152049	GTTCAAGCAATTCTCGTGACTCAACCTCCAAAGTAGCTGGGATTACAGGC	152098

AL845452.3	1801	GCATGCCACCATGCACGGCTAATTTTTATATTTTTTAGAAGAGATGGGTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	152099	GCATGCCACCATGCACGGCTAATTTTTATATTTTTTAGAAGAGATGGGTT	152148

AL845452.3	1851	TTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGACCTCAAGTGATTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	152149	TTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGACCTCAAGTGATTTG	152198

AL845452.3	1901	CCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTACAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	152199	CCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTACAC	152248

AL845452.3	1951	CTGGCCGGTATTTCAGGTTTCTTGAATTTGTTGAGAATTGCTTTCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844220.3	152249	CTGGCCGGTATTTCAGGTTTCTTGAATTTGTTGAGAATTGCTTTCTGGCC	152298

Overview

Query
AL845452.3 - 7570 bps
Hit
AL844220.3 - 152298 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link