<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX000357.7	1	CCTTTATTTCTCTCTCTATATATATAGATATATATATACTTTTTATAATC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	95631	CCTTTATTTCTCTCTCTATATATATAGATATATATATACTTTTTATAATC	95680

BX000357.7	51	ATAAATATGTGTATGCATGCATATGTATGTATAAGAAAATATATATACAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	95681	ATAAATATGTGTATGCATGCATATGTATGTATAAGAAAATATATATACAT	95730

BX000357.7	101	ATAGACATAAAATTATGCATTTGTGCTAGGTACTTGTGATGGTTAATTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	95731	ATAGACATAAAATTATGCATTTGTGCTAGGTACTTGTGATGGTTAATTTT	95780

BX000357.7	151	ATTTGTCAACTTGGCTAAGCCATGGTATTCAGATATTTGGTCAAACATTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	95781	ATTTGTCAACTTGGCTAAGCCATGGTATTCAGATATTTGGTCAAACATTG	95830

BX000357.7	201	TGGATGGTTTTGTGAGGGTATTTTGGATGTTTCAAATTGGTGCATTTTGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	95831	TGGATGGTTTTGTGAGGGTATTTTGGATGTTTCAAATTGGTGCATTTTGA	95880

BX000357.7	251	ATAAAGCAGACTGCCCTCCACAATGTGAGTGGGCCTCATCCAATCATTCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	95881	ATAAAGCAGACTGCCCTCCACAATGTGAGTGGGCCTCATCCAATCATTCA	95930

BX000357.7	301	AAGGCCTAAGACAAAAAGACTGAGGTCCCTGAGGAAGAGGGAATTCTGCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	95931	AAGGCCTAAGACAAAAAGACTGAGGTCCCTGAGGAAGAGGGAATTCTGCC	95980

BX000357.7	351	TCCACACCGCCTTTGGACCTGAGCTGTAACATCAACTCTTTGCTGCTGGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	95981	TCCACACCGCCTTTGGACCTGAGCTGTAACATCAACTCTTTGCTGCTGGC	96030

BX000357.7	401	CTGCCTGCTCTGCAGATTTTGGATTTGCCAACCCCTATGATAGCATGAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96031	CTGCCTGCTCTGCAGATTTTGGATTTGCCAACCCCTATGATAGCATGAAA	96080

BX000357.7	451	CAGTTCTTTCATCTGATTGGTTCTAACTCTCTGGAACACCCTAACTAATA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96081	CAGTTCTTTCATCTGATTGGTTCTAACTCTCTGGAACACCCTAACTAATA	96130

BX000357.7	501	CAGTGCTGTTATAGGTACTGAGAATAGAGTGATCAACAGGGAAGAAAACG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96131	CAGTGCTGTTATAGGTACTGAGAATAGAGTGATCAACAGGGAAGAAAACG	96180

BX000357.7	551	TGCTGTCTTGGGGCCTTGCTGGCGGGTGGATGGTAGACACTCAATTGTGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96181	TGCTGTCTTGGGGCCTTGCTGGCGGGTGGATGGTAGACACTCAATTGTGT	96230

BX000357.7	601	GAGGCTCATTGGCCATAGAGGAACTCATGCAGGAGAAACTCACCTTGCCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96231	GAGGCTCATTGGCCATAGAGGAACTCATGCAGGAGAAACTCACCTTGCCT	96280

BX000357.7	651	AGGTTGAAAGGAGGGGAATCAGGCACATATTCCCCTCTGAGGAATATGTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96281	AGGTTGAAAGGAGGGGAATCAGGCACATATTCCCCTCTGAGGAATATGTC	96330

BX000357.7	701	AGCAGAGACTGGATGTGGCAAGACTACAGGTGGCGGGTAGGTGGGACAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96331	AGCAGAGACTGGATGTGGCAAGACTACAGGTGGCGGGTAGGTGGGACAGA	96380

BX000357.7	751	GTATTCCAGACCAGGGAACAAAAAGGGATAAAAGTCTTGGGGTGGAAAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96381	GTATTCCAGACCAGGGAACAAAAAGGGATAAAAGTCTTGGGGTGGAAAGG	96430

BX000357.7	801	ACATGTTTGAGAAACAGAAATAAGACCAGGTGCTGGGACCAGGAGTCCTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96431	ACATGTTTGAGAAACAGAAATAAGACCAGGTGCTGGGACCAGGAGTCCTA	96480

BX000357.7	851	CACTCATCACACTCAGTTACTCATGGGGTGACTTCAGAAGCCCTAAAAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96481	CACTCATCACACTCAGTTACTCATGGGGTGACTTCAGAAGCCCTAAAAGA	96530

BX000357.7	901	TTTTGTTTCCCAATTTTTTTTTTTTTTTTGACAAGATCTTGCTCTGTTGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96531	TTTTGTTTCCCAATTTTTTTTTTTTTTTTGACAAGATCTTGCTCTGTTGC	96580

BX000357.7	951	CCAGGCTAGAGTGCAGTGGCACGATCATAGCTCACAGCAGCCTCAATCTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96581	CCAGGCTAGAGTGCAGTGGCACGATCATAGCTCACAGCAGCCTCAATCTC	96630

BX000357.7	1001	TCGGGCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96631	TCGGGCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTAC	96680

BX000357.7	1051	AGATGAATGCATCATGCCCAGCCGATTTCTTTTGTTTGTTTGAGATGGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96681	AGATGAATGCATCATGCCCAGCCGATTTCTTTTGTTTGTTTGAGATGGAG	96730

BX000357.7	1101	TCTCGCTCTGTCACCCCGAGTGGAGTGCAGTGGCATAATCTTGGCTCACT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96731	TCTCGCTCTGTCACCCCGAGTGGAGTGCAGTGGCATAATCTTGGCTCACT	96780

BX000357.7	1151	GCAACCTCCACTTCCCAAGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96781	GCAACCTCCACTTCCCAAGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTA	96830

BX000357.7	1201	GTAGCTGGGATTACAGATGCCCACCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96831	GTAGCTGGGATTACAGATGCCCACCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATT	96880

BX000357.7	1251	TTGAGTAGGGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96881	TTGAGTAGGGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTAC	96930

BX000357.7	1301	TGACCTCAAGTGATAACGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96931	TGACCTCAAGTGATAACGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTAC	96980

BX000357.7	1351	AGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCCAATGCAATTTTAAGATGATTTTATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	96981	AGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCCAATGCAATTTTAAGATGATTTTATG	97030

BX000357.7	1401	TATATTGTAGGAGAGAAAAATAGGTAAATATATTAAGAGTATTAAGAGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97031	TATATTGTAGGAGAGAAAAATAGGTAAATATATTAAGAGTATTAAGAGCC	97080

BX000357.7	1451	AAGGCTTTCGATTGCCCTGATAAAAGATATACAAATACAAAGTCCAAGAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97081	AAGGCTTTCGATTGCCCTGATAAAAGATATACAAATACAAAGTCCAAGAA	97130

BX000357.7	1501	GAGGGAAAAACCTATAATGTACAATTTGAATTGGAAATACCAATATGAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97131	GAGGGAAAAACCTATAATGTACAATTTGAATTGGAAATACCAATATGAAT	97180

BX000357.7	1551	TCATGATTTTTTTTAAACCCTAAATGTGACTTAAAGCGATGACACCTCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97181	TCATGATTTTTTTTAAACCCTAAATGTGACTTAAAGCGATGACACCTCTG	97230

BX000357.7	1601	TAGCAACGAGCTCTCCCAGCACTAAAGACCATTCCTCACTAAAACGAATC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97231	TAGCAACGAGCTCTCCCAGCACTAAAGACCATTCCTCACTAAAACGAATC	97280

BX000357.7	1651	AATGTTCCTTAGAAAGATGGCTGATTTTGGCCGGGTGCAGTGGCTCACGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97281	AATGTTCCTTAGAAAGATGGCTGATTTTGGCCGGGTGCAGTGGCTCACGC	97330

BX000357.7	1701	CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97331	CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAG	97380

BX000357.7	1751	GAGATCGAGACCATCCTGGCGAACACAGTGAGACCCTGTCTCTACTAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97381	GAGATCGAGACCATCCTGGCGAACACAGTGAGACCCTGTCTCTACTAAAA	97430

BX000357.7	1801	ATACAAAAAAGTAGACAGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAGTCCCAGCTAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97431	ATACAAAAAAGTAGACAGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAGTCCCAGCTAC	97480

BX000357.7	1851	TTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCTGGGGACAGAGCTTGCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97481	TTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCTGGGGACAGAGCTTGCA	97530

BX000357.7	1901	GTGCGCTGAGATCACGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97531	GTGCGCTGAGATCACGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC	97580

BX000357.7	1951	TCGGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATGGCTGATTTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL844213.2	97581	TCGGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATGGCTGATTTTGGCC	97630

Overview

Query
BX000357.7 - 64172 bps
Hit
AL844213.2 - 97630 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link