<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL589722.17	1	GAATTCTTCCCCCACCTGATAGTCAATCAACTGATGTGCCAAAAAACGGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97031	GAATTCTTCCCCCACCTGATAGTCAATCAACTGATGTGCCAAAAAACGGG	97080

AL589722.17	51	TCATCGGGCCCTCGGTCCCAGGGCCCTCAAAGATATGGGAACCGGTTTGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97081	TCATCGGGCCCTCGGTCCCAGGGCCCTCAAAGATATGGGAACCGGTTTGT	97130

AL589722.17	101	CAGGACCCAGGAAGCAGTCAGAGAGGCGACCCAGGAAGACCCACAAGGGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97131	CAGGACCCAGGAAGCAGTCAGAGAGGCGACCCAGGAAGACCCACAAGGGT	97180

AL589722.17	151	GGACCTGCGTGCCGCCTCCGACTTCCTATTAATGCCTCAAATGAGTATTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97181	GGACCTGCGTGCCGCCTCCGACTTCCTATTAATGCCTCAAATGAGTATTC	97230

AL589722.17	201	AGCCGGTGCCAGTGGAGCCTATACCATCCTTGCCCCCGGGAACCATGGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97231	AGCCGGTGCCAGTGGAGCCTATACCATCCTTGCCCCCGGGAACCATGGGC	97280

AL589722.17	251	CTTATTCTCGGCCGGGGTTCACTCACCTTACAGGGCTTAGTAGTCCACCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97281	CTTATTCTCGGCCGGGGTTCACTCACCTTACAGGGCTTAGTAGTCCACCC	97330

AL589722.17	301	TGGAGTTATGGATTGTCAACATTCCCCTGAAATACAGGTCCTGTGCTCAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97331	TGGAGTTATGGATTGTCAACATTCCCCTGAAATACAGGTCCTGTGCTCAA	97380

AL589722.17	351	GCCCTAAGGGCGTTTTTTCTATTAGTAAAGGAGATAGGATAGCTCAGCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97381	GCCCTAAGGGCGTTTTTTCTATTAGTAAAGGAGATAGGATAGCTCAGCTG	97430

AL589722.17	401	CTGCTCCTCCCTGATAATACCAGGGAGAAATCTGCAGGACCTGAGATAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97431	CTGCTCCTCCCTGATAATACCAGGGAGAAATCTGCAGGACCTGAGATAAA	97480

AL589722.17	451	GAAAATGGGCTCCTCAGGAAATGATTCTGCCTATTTGGTTGTATCTTTAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97481	GAAAATGGGCTCCTCAGGAAATGATTCTGCCTATTTGGTTGTATCTTTAA	97530

AL589722.17	501	ATGATAGACCTAAGCTCCGCCTTAAGATTAACGGAAAAGAGTTTGAAGGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97531	ATGATAGACCTAAGCTCCGCCTTAAGATTAACGGAAAAGAGTTTGAAGGC	97580

AL589722.17	551	ATCCTTGATACCGGAGCAGATAAAAGTATAATCTCTACACATTGGTGGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97581	ATCCTTGATACCGGAGCAGATAAAAGTATAATCTCTACACATTGGTGGCC	97630

AL589722.17	601	CAAAGCATGGCCCACCACAGAGTCATCTCATTCATTACAGGGCCTAGGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97631	CAAAGCATGGCCCACCACAGAGTCATCTCATTCATTACAGGGCCTAGGTT	97680

AL589722.17	651	ATCAATCATGTCCCACTATAAGCTCCGTTGCCTTGACGTGGGAATCCTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97681	ATCAATCATGTCCCACTATAAGCTCCGTTGCCTTGACGTGGGAATCCTCT	97730

AL589722.17	701	GAAGGACAGCAAGGGAAATTCATACCTTATGTGCTCCCACTCCCGGTTAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97731	GAAGGACAGCAAGGGAAATTCATACCTTATGTGCTCCCACTCCCGGTTAA	97780

AL589722.17	751	CCTCTGGGGAAGGGATATTATGCAGCATTTGGGCCTTATTTTGTCCAATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97781	CCTCTGGGGAAGGGATATTATGCAGCATTTGGGCCTTATTTTGTCCAATG	97830

AL589722.17	801	AAAACGCCCCATCGGGAGGGTATTCAACTAAAGCAAAAAATATCATGGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97831	AAAACGCCCCATCGGGAGGGTATTCAACTAAAGCAAAAAATATCATGGCA	97880

AL589722.17	851	AAGATGGGTTATAAAGAAGGAAAAGGGTTAGGACATCAAGAACAGGGAAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97881	AAGATGGGTTATAAAGAAGGAAAAGGGTTAGGACATCAAGAACAGGGAAG	97930

AL589722.17	901	GATAGAGCCCATCTCACCTAATGGAAACCAAGACAGACAGGGTCTGGGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97931	GATAGAGCCCATCTCACCTAATGGAAACCAAGACAGACAGGGTCTGGGTT	97980

AL589722.17	951	TTTCCTTAGCGGCCATTGGGGCAGCACGACCCATACCATGGAAAACAGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	97981	TTTCCTTAGCGGCCATTGGGGCAGCACGACCCATACCATGGAAAACAGGG	98030

AL589722.17	1001	GACCCAGTGTGGGTTCCTCAATGGCACCTATCCTCTGAAAAACTAGAAGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98031	GACCCAGTGTGGGTTCCTCAATGGCACCTATCCTCTGAAAAACTAGAAGC	98080

AL589722.17	1051	TGTGATTCAACTGGTAGAGGAACAATTAAAACTAGGCCATATTGAACCCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98081	TGTGATTCAACTGGTAGAGGAACAATTAAAACTAGGCCATATTGAACCCT	98130

AL589722.17	1101	CTACCTCACCTTGGAATACTCCAATTTTTGTAATTAAGAAAAAGTCAGGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98131	CTACCTCACCTTGGAATACTCCAATTTTTGTAATTAAGAAAAAGTCAGGA	98180

AL589722.17	1151	AAGTGGAGACTGCTCCATGACCTCAGAGCCATTAATGAGCAAATGAACTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98181	AAGTGGAGACTGCTCCATGACCTCAGAGCCATTAATGAGCAAATGAACTT	98230

AL589722.17	1201	ATTTGGCCCAGTACAGAGGGGTCTCCCTGTACTTTCCGCCTTACCACGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98231	ATTTGGCCCAGTACAGAGGGGTCTCCCTGTACTTTCCGCCTTACCACGTG	98280

AL589722.17	1251	GCTGGAATTTAATTATTATAGATATTAAAGATTGTTTCTTTTCTATACCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98281	GCTGGAATTTAATTATTATAGATATTAAAGATTGTTTCTTTTCTATACCT	98330

AL589722.17	1301	TTGTGTCCAAGAGATAGGCCCAGATTTGCCTTTACCATCCCCTCTATTAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98331	TTGTGTCCAAGAGATAGGCCCAGATTTGCCTTTACCATCCCCTCTATTAA	98380

AL589722.17	1351	TCACATGGAACCTGATAAGAGGTATCAATGGAAGGTCTTACCACAGGGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98381	TCACATGGAACCTGATAAGAGGTATCAATGGAAGGTCTTACCACAGGGAA	98430

AL589722.17	1401	TGTCCAATAGTCCTACAATGTGCCAACTTTATGTGCAAGAAGCTCTTTTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98431	TGTCCAATAGTCCTACAATGTGCCAACTTTATGTGCAAGAAGCTCTTTTG	98480

AL589722.17	1451	CCAGTGAGGGAACAATTCCCCTCTTTAATTTTGCTCCTTTACATGGATGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98481	CCAGTGAGGGAACAATTCCCCTCTTTAATTTTGCTCCTTTACATGGATGA	98530

AL589722.17	1501	CATCCTCCTGTGCCATAAAGACCTTACCATGCTACAAAAGGCATATCCTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98531	CATCCTCCTGTGCCATAAAGACCTTACCATGCTACAAAAGGCATATCCTT	98580

AL589722.17	1551	TTCTACTTAAAACTTTAAGTCAGTGGGGTTTACAGATAGCCACAGAAAAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98581	TTCTACTTAAAACTTTAAGTCAGTGGGGTTTACAGATAGCCACAGAAAAG	98630

AL589722.17	1601	GTCCAAATTTCTGATACAGGACAATTCTTGGACTCTGTGGTGTCCCCAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98631	GTCCAAATTTCTGATACAGGACAATTCTTGGACTCTGTGGTGTCCCCAGA	98680

AL589722.17	1651	TAAGATTGTGCCCCAAAAGGTAGAGATAAGAAGAGATCACCTCCATACCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98681	TAAGATTGTGCCCCAAAAGGTAGAGATAAGAAGAGATCACCTCCATACCT	98730

AL589722.17	1701	TAAATGATTTTCAAAAGCTGTTGGGAGATATTAATTGGCTCAGACCTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98731	TAAATGATTTTCAAAAGCTGTTGGGAGATATTAATTGGCTCAGACCTTTT	98780

AL589722.17	1751	TTAAAGATTCCTTCCGCTGAGTTAAGGCCTTTGTTTGGTATTTTAGAAGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98781	TTAAAGATTCCTTCCGCTGAGTTAAGGCCTTTGTTTGGTATTTTAGAAGG	98830

AL589722.17	1801	AGATCCTCATATCTCCTCCCCTAGGACTCTTACTCTAGCTGCTAACCAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98831	AGATCCTCATATCTCCTCCCCTAGGACTCTTACTCTAGCTGCTAACCAGG	98880

AL589722.17	1851	CCTTACAAAAAGTGGAAAATGCCTTACAAAATGCACAATTACAACGTATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98881	CCTTACAAAAAGTGGAAAATGCCTTACAAAATGCACAATTACAACGTATT	98930

AL589722.17	1901	GAGGATTCGCAGCCTTTCAGTTTGTGTGTCTTTAAGACAGCACAATTGCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98931	GAGGATTCGCAGCCTTTCAGTTTGTGTGTCTTTAAGACAGCACAATTGCC	98980

AL589722.17	1951	AACTGCAGTTTTGTGGCAGAATGGGCCATTGTTGTGGATCCATCCAAACG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL837512.2	98981	AACTGCAGTTTTGTGGCAGAATGGGCCATTGTTGTGGATCCATCCAAACG	99030

Overview

Query
AL589722.17 - 200125 bps
Hit
AL837512.2 - 99030 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link