<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX571697.3	1	TAATGTTGCAATAAGATTGTAACTGTACTGTGCATTTACACAGTGGCCAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145112	TAATGTTGCAATAAGATTGTAACTGTACTGTGCATTTACACAGTGGCCAT	145161

BX571697.3	51	ATTCATCTACAAAAAAATAATAATAATTTGTGGATTTCCTTACTTCCGGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145162	ATTCATCTACAAAAAAATAATAATAATTTGTGGATTTCCTTACTTCCGGG	145211

BX571697.3	101	TGAAGCAATCCTGTTGTATGGTGGCTGGTGTATTCTGGGAAATTTTCTTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145212	TGAAGCAATCCTGTTGTATGGTGGCTGGTGTATTCTGGGAAATTTTCTTA	145261

BX571697.3	151	CCCCTTGGTTTCGAGTGTGGTCCTGAAAAAAGGGGCTATCTACCCCTTCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145262	CCCCTTGGTTTCGAGTGTGGTCCTGAAAAAAGGGGCTATCTACCCCTTCC	145311

BX571697.3	201	CTTTAGCCTTACACCTTCAAGCTAAAAATAATTGGGACAAATTGGGCCTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145312	CTTTAGCCTTACACCTTCAAGCTAAAAATAATTGGGACAAATTGGGCCTC	145361

BX571697.3	251	AGTGTCTCAAAAAAAGCCTTCTCCCCTGCTTGTGAAAATGAAAGTGAGGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145362	AGTGTCTCAAAAAAAGCCTTCTCCCCTGCTTGTGAAAATGAAAGTGAGGT	145411

BX571697.3	301	GCGGACATTCACGGGTTGTCTCGTAGCATAATTATACATTGATATGCTGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145412	GCGGACATTCACGGGTTGTCTCGTAGCATAATTATACATTGATATGCTGT	145461

BX571697.3	351	ATTACCAAAACATCTTATTTTTAATTATTAATAAAATAATTGTAGGGTAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145462	ATTACCAAAACATCTTATTTTTAATTATTAATAAAATAATTGTAGGGTAG	145511

BX571697.3	401	TGACTTCTAAAATGACTTTATTATCTCAATAGAAGATTTGAATATACATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145512	TGACTTCTAAAATGACTTTATTATCTCAATAGAAGATTTGAATATACATT	145561

BX571697.3	451	GGAAGTGACAATATGACATATTTAATGAGAATGGTCAGAATGGCGGCTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145562	GGAAGTGACAATATGACATATTTAATGAGAATGGTCAGAATGGCGGCTGT	145611

BX571697.3	501	GGTAGTTCAAGTAGTTCCAGTGTTAAGCTTAAATTTTTCAATATTGATGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145612	GGTAGTTCAAGTAGTTCCAGTGTTAAGCTTAAATTTTTCAATATTGATGA	145661

BX571697.3	551	TAATTGGAAAATGTTTATTGAGTATAAAATCAATGATCATCGTCAAATTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145662	TAATTGGAAAATGTTTATTGAGTATAAAATCAATGATCATCGTCAAATTC	145711

BX571697.3	601	TGCTTGGCCTTCAAATTAATACATTACATTTCTATTTTAATATACAATTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145712	TGCTTGGCCTTCAAATTAATACATTACATTTCTATTTTAATATACAATTA	145761

BX571697.3	651	AAAAGCATTTTGAATTGTAACAGTATAACAATATCACTGTCTTTTACACT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145762	AAAAGCATTTTGAATTGTAACAGTATAACAATATCACTGTCTTTTACACT	145811

BX571697.3	701	GTTTGATCAAATGACTTAACAAAAGAGTTATCTTCCAAAAACATTCAAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145812	GTTTGATCAAATGACTTAACAAAAGAGTTATCTTCCAAAAACATTCAAAT	145861

BX571697.3	751	AATCTCCCAGACCCCAATCTTTTCAGTAAAGTGCAATAACATTTTAAGTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145862	AATCTCCCAGACCCCAATCTTTTCAGTAAAGTGCAATAACATTTTAAGTT	145911

BX571697.3	801	AAATTTAAACTTTTGAATATGTTTATTTATTTATATATTAGCCATGATGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145912	AAATTTAAACTTTTGAATATGTTTATTTATTTATATATTAGCCATGATGG	145961

BX571697.3	851	GGGAATTCACCACATTGTTACAATCTGCCCTTCTCAGAGTGGCTGCCCAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	145962	GGGAATTCACCACATTGTTACAATCTGCCCTTCTCAGAGTGGCTGCCCAG	146011

BX571697.3	901	ATGCCCACTGTTCACTATGAGCTGCCTAATGGCTACAACTGTGACTTTGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146012	ATGCCCACTGTTCACTATGAGCTGCCTAATGGCTACAACTGTGACTTTGG	146061

BX571697.3	951	AGCGGAAAGACTTAAGATTCCTGAGGGTCTTTTTGACCCTTCAAATGCTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146062	AGCGGAAAGACTTAAGATTCCTGAGGGTCTTTTTGACCCTTCAAATGCTA	146111

BX571697.3	1001	AGGTGAGAAATATTATCCTTGAAGTATAGCACTAAATTTAATTTTAAAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146112	AGGTGAGAAATATTATCCTTGAAGTATAGCACTAAATTTAATTTTAAAAT	146161

BX571697.3	1051	TGCCAATGTTTTACCCTTTTTTTTTAAACTGTCCTAAAATGTTTTCACAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146162	TGCCAATGTTTTACCCTTTTTTTTTAAACTGTCCTAAAATGTTTTCACAG	146211

BX571697.3	1101	GGTCTATCAGGGAACACCATGTTAGGAGTCGGCCATGTTGTGACCACCAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146212	GGTCTATCAGGGAACACCATGTTAGGAGTCGGCCATGTTGTGACCACCAG	146261

BX571697.3	1151	CGTTGGCATGTGTGACATTGACATTCGACCGGTAAAACATTGCTTTTCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146262	CGTTGGCATGTGTGACATTGACATTCGACCGGTAAAACATTGCTTTTCAT	146311

BX571697.3	1201	ATCCTTTCTACATTATTTGTATCTTTGCTACCAAGGTGATTTAAAGGTCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146312	ATCCTTTCTACATTATTTGTATCTTTGCTACCAAGGTGATTTAAAGGTCA	146361

BX571697.3	1251	TGTGAAGACAGTAGCTCCTCCCCTTAAAACAATTTAAAAAAAAGTTTTTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146362	TGTGAAGACAGTAGCTCCTCCCCTTAAAACAATTTAAAAAAAAGTTTTTA	146411

BX571697.3	1301	TCACAGCTCTGTAAGTGAGAGGGGTTGAGATGAAGTGCATTAAATGAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146412	TCACAGCTCTGTAAGTGAGAGGGGTTGAGATGAAGTGCATTAAATGAAAA	146461

BX571697.3	1351	GCAAATGTGAAGTGTCTGTCAGATACTAGAGAGAATTTGATTGATCAAGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146462	GCAAATGTGAAGTGTCTGTCAGATACTAGAGAGAATTTGATTGATCAAGC	146511

BX571697.3	1401	TTTGATGAGATACTGAAGAATGTGACAAAAAATGTTGATCCATTTAGAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146512	TTTGATGAGATACTGAAGAATGTGACAAAAAATGTTGATCCATTTAGAAG	146561

BX571697.3	1451	CAAGTGGCAGACTACAAGCTTTGGATGTTTATATGAGTTTTATATTTTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146562	CAAGTGGCAGACTACAAGCTTTGGATGTTTATATGAGTTTTATATTTTTT	146611

BX571697.3	1501	CTAAAAGTGAATTTGTCACTGTTTTGGAGCACACTAACTTATCGGTATGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146612	CTAAAAGTGAATTTGTCACTGTTTTGGAGCACACTAACTTATCGGTATGC	146661

BX571697.3	1551	TTAAAATTGACAAACTGAAACGAATATCTAAAATTCTTCATTTTAATTTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146662	TTAAAATTGACAAACTGAAACGAATATCTAAAATTCTTCATTTTAATTTC	146711

BX571697.3	1601	ATGTAACCTTTAATCTTCTGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146712	ATGTAACCTTTAATCTTCTGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT	146761

BX571697.3	1651	TAAAACAGGGTCTGTATGGCAGTGTGGTAGTTACAGGAGGAAATACCCTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146762	TAAAACAGGGTCTGTATGGCAGTGTGGTAGTTACAGGAGGAAATACCCTC	146811

BX571697.3	1701	ATTCAAGGCTTTACAGACAGACTTAACAGAGAACTCTCGCAGAAGACACC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146812	ATTCAAGGCTTTACAGACAGACTTAACAGAGAACTCTCGCAGAAGACACC	146861

BX571697.3	1751	ACCTGTAAGTGGCACATCAGTTCGGATCTCTTAAGTGCTTTTTTTTTAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146862	ACCTGTAAGTGGCACATCAGTTCGGATCTCTTAAGTGCTTTTTTTTTAAT	146911

BX571697.3	1801	GGCAATGTTAATTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTCCTCTGCAGAGCATG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146912	GGCAATGTTAATTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTCCTCTGCAGAGCATG	146961

BX571697.3	1851	CGTCTTAAGCTAATAGCCAATAACACAACTGTGGAGCGCCGATTTAGCGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	146962	CGTCTTAAGCTAATAGCCAATAACACAACTGTGGAGCGCCGATTTAGCGC	147011

BX571697.3	1901	CTGGATTGGAGGATCCATCCTTGCATCCCTGGTAAGTAATGTTCACTACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	147012	CTGGATTGGAGGATCCATCCTTGCATCCCTGGTAAGTAATGTTCACTACA	147061

BX571697.3	1951	ACTGTCATTAACAGATTTTACTTGCATGATTGTTGAGGCCAAGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL808141.8	147062	ACTGTCATTAACAGATTTTACTTGCATGATTGTTGAGGCCAAGAGAATTC	147111

Overview

Query
BX571697.3 - 83282 bps
Hit
AL808141.8 - 147111 bps
Total alignments
9
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193720001200011451121471111
2100305431327313801314331961
382.0513734959471598191764179911
483.92631525966859819-111088112301
510043463541235457111635116801
683.23711616686767027-126438265921
794.23385385798631-11033161033671
887.861172322476424995-11206191208571
986.841963463119031535-11383411386821
Short-link