<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645544.16	1	GAATTCAAAGAGGACACCCATAAGCAGGAAGACAGCCTGTGTTTTGTGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	25552	GAATTCAAAGAGGACACCCATAAGCAGGAAGACAGCCTGTGTTTTGTGCT	25601

AL645544.16	51	AGAAGAATAAATCCCATAAAGACACCCATGGAATAACCAAAACAGCAGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	25602	AGAAGAATAAATCCCATAAAGACACCCATGGAATAACCAAAACAGCAGGC	25651

AL645544.16	101	TTGTGACATAAAAACAGACATGTAAACCAGTGCAACAGAATGGAGAGCCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	25652	TTGTGACATAAAAACAGACATGTAAACCAGTGCAACAGAATGGAGAGCCT	25701

AL645544.16	151	AGAAATAAACTCAGCCATGCTCTGTCAACTTAGTTTTGACAAAGGTGCTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	25702	AGAAATAAACTCAGCCATGCTCTGTCAACTTAGTTTTGACAAAGGTGCTA	25751

AL645544.16	201	AGATCAGGCATTGGCAAAGGACTATGTCCTCAAGAAACAGTGCTTTAAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	25752	AGATCAGGCATTGGCAAAGGACTATGTCCTCAAGAAACAGTGCTTTAAAA	25801

AL645544.16	251	CTAGATGTTCATTTGCAGAAAGATAAAGCTAGGCCTGCATTTCTACCCAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	25802	CTAGATGTTCATTTGCAGAAAGATAAAGCTAGGCCTGCATTTCTACCCAT	25851

AL645544.16	301	GTCAAAAAAAAATCAGTCGGTTCAAATTGATTGAAGACTTTGGGCTAAAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	25852	GTCAAAAAAAAATCAGTCGGTTCAAATTGATTGAAGACTTTGGGCTAAAG	25901

AL645544.16	351	AACTATAAAGCAACTAGACAAAACAAAACAAAAACCAACCAACCAACCAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	25902	AACTATAAAGCAACTAGACAAAACAAAACAAAAACCAACCAACCAACCAA	25951

AL645544.16	401	ACACACAAAGAAAAATAAAACCAATAGAGGACATGCTTCAAGATACCGGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	25952	ACACACAAAGAAAAATAAAACCAATAGAGGACATGCTTCAAGATACCGGA	26001

AL645544.16	451	ACTCGCAGGATTTGCTTGAATAAGAGCTCAAAGCACAGGTATGAAGAAGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26002	ACTCGCAGGATTTGCTTGAATAAGAGCTCAAAGCACAGGTATGAAGAAGC	26051

AL645544.16	501	AGGACTGGATACAGGGACTCACATCTAATCAGAAAGCTTCTGCCTAGCCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26052	AGGACTGGATACAGGGACTCACATCTAATCAGAAAGCTTCTGCCTAGCCA	26101

AL645544.16	551	GTGTCAGAGGGATGGTACTACCTACAAAGTGCTGCACAGGGTTACAGACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26102	GTGTCAGAGGGATGGTACTACCTACAAAGTGCTGCACAGGGTTACAGACA	26151

AL645544.16	601	TTCTCTCTCTTTAGGAGGCAATATACAGCATTTATGAGGAACTGAAAGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26152	TTCTCTCTCTTTAGGAGGCAATATACAGCATTTATGAGGAACTGAAAGAA	26201

AL645544.16	651	CAAAACCATCAACAGCAAAACTAGCCCCCAGACACCGGACCCATTGATGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26202	CAAAACCATCAACAGCAAAACTAGCCCCCAGACACCGGACCCATTGATGA	26251

AL645544.16	701	CAGATGTCAATAGACATCTCTCAAGAGGAGATATACAAACACTTGACATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26252	CAGATGTCAATAGACATCTCTCAAGAGGAGATATACAAACACTTGACATG	26301

AL645544.16	751	TTTATGAAAGAAACTCGGCATTACTTGTCATCAGTAATGCAAATGTAAAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26302	TTTATGAAAGAAACTCGGCATTACTTGTCATCAGTAATGCAAATGTAAAG	26351

AL645544.16	801	AACCTCACTTCAGGAAAAATGGTTCTAGGAACAACAAAAGGCAGCTGTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26352	AACCTCACTTCAGGAAAAATGGTTCTAGGAACAACAAAAGGCAGCTGTGT	26401

AL645544.16	851	TGATGAGGAAAACGAGGGAGAAGAAACGCTTGATACCATCATGGGGACTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26402	TGATGAGGAAAACGAGGGAGAAGAAACGCTTGATACCATCATGGGGACTG	26451

AL645544.16	901	GAAACCACAGTATGGAGGCACCTCAAAAAATTAAAGGTAGAATTTCTACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26452	GAAACCACAGTATGGAGGCACCTCAAAAAATTAAAGGTAGAATTTCTACC	26501

AL645544.16	951	CAATCTTATTGGCACTACCACCCTACTTGGCAAATATTCAAGGGATCCAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26502	CAATCTTATTGGCACTACCACCCTACTTGGCAAATATTCAAGGGATCCAA	26551

AL645544.16	1001	GTCAGTAGTTGAAGAAACTGTATCCTCTGCATCCTACAGCATTACCCATC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26552	GTCAGTAGTTGAAGAAACTGTATCCTCTGCATCCTACAGCATTACCCATC	26601

AL645544.16	1051	ACATCCAAGACAGAGGATCTATGTCACATGGTGCCCACTTTTACTGACTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26602	ACATCCAAGACAGAGGATCTATGTCACATGGTGCCCACTTTTACTGACTA	26651

AL645544.16	1101	TAACAATTCTTCCTGGATCTCAAAAGTAAGATTATCTCCAACTCAACGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26652	TAACAATTCTTCCTGGATCTCAAAAGTAAGATTATCTCCAACTCAACGAG	26701

AL645544.16	1151	TTTTCTATGATAAATACTGACTGTTGTAACTGACTCCTTGAAAGCCAAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26702	TTTTCTATGATAAATACTGACTGTTGTAACTGACTCCTTGAAAGCCAAAA	26751

AL645544.16	1201	AGTATTTTTTTGTCTTAATAGAATAAAACATTGAGATGGATTACTGGTCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26752	AGTATTTTTTTGTCTTAATAGAATAAAACATTGAGATGGATTACTGGTCA	26801

AL645544.16	1251	ACTATGAATTAACAATTACTATTGTTTAGTCAACGCACACTATTGTTCTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26802	ACTATGAATTAACAATTACTATTGTTTAGTCAACGCACACTATTGTTCTG	26851

AL645544.16	1301	GCTCCACCTCCCTGCCCCTGTTGGCCCCTATCGAGAGCTGGTGGATCTCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26852	GCTCCACCTCCCTGCCCCTGTTGGCCCCTATCGAGAGCTGGTGGATCTCT	26901

AL645544.16	1351	CGAGGGGACGTGGTACAGGAATGGCCGGGGGCAGAAGAGACCTCAGGCAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26902	CGAGGGGACGTGGTACAGGAATGGCCGGGGGCAGAAGAGACCTCAGGCAG	26951

AL645544.16	1401	AGATGAGCCTGCTGAGAACAGACTCTTGGGAGACTGTTTCATTGAGATAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	26952	AGATGAGCCTGCTGAGAACAGACTCTTGGGAGACTGTTTCATTGAGATAG	27001

AL645544.16	1451	CTAAGCTAGATGGGGGTGAGTATGAAAGGTACTTAGACCTTTGAGGGGTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	27002	CTAAGCTAGATGGGGGTGAGTATGAAAGGTACTTAGACCTTTGAGGGGTG	27051

AL645544.16	1501	AGTAGGGGCTTTGGAGATGAGTGTACATCATTGGCTGGGCCCAGGATGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	27052	AGTAGGGGCTTTGGAGATGAGTGTACATCATTGGCTGGGCCCAGGATGGT	27101

AL645544.16	1551	GGGGGTGGCTCATTTGCATAAGGAGGCTATCCAGGTGCTACATGACATGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	27102	GGGGGTGGCTCATTTGCATAAGGAGGCTATCCAGGTGCTACATGACATGA	27151

AL645544.16	1601	TCCTTTGATGGGAAAGGAAGGATAACCTGTCTACTAGGCTATGTGACTTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	27152	TCCTTTGATGGGAAAGGAAGGATAACCTGTCTACTAGGCTATGTGACTTC	27201

AL645544.16	1651	CTCTGGGGGTAAAGGTAGGGGTGCTGGGCTACCTGTGCTGGGTTATACAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	27202	CTCTGGGGGTAAAGGTAGGGGTGCTGGGCTACCTGTGCTGGGTTATACAG	27251

AL645544.16	1701	GCCTAGGGTGAGAAGGGAGTAATCCTACTTCTGCCAATCTCAGCATGAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	27252	GCCTAGGGTGAGAAGGGAGTAATCCTACTTCTGCCAATCTCAGCATGAGA	27301

AL645544.16	1751	TTTCTGGGGTTTGGACATGCTTCAACCCACTCTTGCTCTGGGCAAGCACC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	27302	TTTCTGGGGTTTGGACATGCTTCAACCCACTCTTGCTCTGGGCAAGCACC	27351

AL645544.16	1801	CTATAGCTCCACTGCTGCCTGGCCCCACAGCACCCCTCATGGTACCTGAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	27352	CTATAGCTCCACTGCTGCCTGGCCCCACAGCACCCCTCATGGTACCTGAC	27401

AL645544.16	1851	ATTTTCATCATACCTCTTAGAGTCTAGGCAGTTCAATAATAGTGGCCAGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	27402	ATTTTCATCATACCTCTTAGAGTCTAGGCAGTTCAATAATAGTGGCCAGT	27451

AL645544.16	1901	GTGATTGCCTACTGAAGTATTGGGAAACAAACAGGAAATCTCACAGCACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	27452	GTGATTGCCTACTGAAGTATTGGGAAACAAACAGGAAATCTCACAGCACA	27501

AL645544.16	1951	GGGGATGTTCATCCATCCAGCAGGCAAAAACAAGATAATGGAACCCAGGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807812.6	27502	GGGGATGTTCATCCATCCAGCAGGCAAAAACAAGATAATGGAACCCAGGT	27551

Overview

Query
AL645544.16 - 216046 bps
Hit
AL807812.6 - 27551 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link