<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL844216.3	1	TTATTAGGCCAGGCATGGTAGCTCAATCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97110	TTATTAGGCCAGGCATGGTAGCTCAATCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA	97159

AL844216.3	51	GGCCGAAGCAGGCGGATCACTTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97160	GGCCGAAGCAGGCGGATCACTTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGAC	97209

AL844216.3	101	TAACATGGAGAAATTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGTAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97210	TAACATGGAGAAATTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGTAT	97259

AL844216.3	151	GGTGGCACATGCCTCTAACCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97260	GGTGGCACATGCCTCTAACCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA	97309

AL844216.3	201	TCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGGCGCAGTGAGCCAAGATCACGCCATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97310	TCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGGCGCAGTGAGCCAAGATCACGCCATT	97359

AL844216.3	251	GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAGCTCTATCTCAAAAAAAAAATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97360	GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAGCTCTATCTCAAAAAAAAAATT	97409

AL844216.3	301	GTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGCCTTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97410	GTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGCCTTGA	97459

AL844216.3	351	TCTCTTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGTCTCCCAAAGTGTTAGGATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97460	TCTCTTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGTCTCCCAAAGTGTTAGGATT	97509

AL844216.3	401	ATAGGTGTGAGCCACCACGCCTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97510	ATAGGTGTGAGCCACCACGCCTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	97559

AL844216.3	451	TTTGGGATGGAGACTTGTTCTGTTGGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97560	TTTGGGATGGAGACTTGTTCTGTTGGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGA	97609

AL844216.3	501	TCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCCATC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97610	TCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCCATC	97659

AL844216.3	551	TCAGCCTCCTGAGTAGCTGGACTACAGGTGCCTGCCACCACGCCTGGCTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97660	TCAGCCTCCTGAGTAGCTGGACTACAGGTGCCTGCCACCACGCCTGGCTA	97709

AL844216.3	601	ACTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGAGACAGAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97710	ACTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGAGACAGAG	97759

AL844216.3	651	TCTCTCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCCCGGCTCACTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97760	TCTCTCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCCCGGCTCACTG	97809

AL844216.3	701	CAACCTCTGACTCCCTGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCTCGAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97810	CAACCTCTGACTCCCTGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCTCGAG	97859

AL844216.3	751	TAGCTAGGATTACAGGCATATGCCACCACGTCCAGCTAATTTTTGTATTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97860	TAGCTAGGATTACAGGCATATGCCACCACGTCCAGCTAATTTTTGTATTT	97909

AL844216.3	801	TTAGTGGAGCCGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATAGTCTCAATCTCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97910	TTAGTGGAGCCGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATAGTCTCAATCTCCT	97959

AL844216.3	851	GACCTCGTGATCTGCCCGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	97960	GACCTCGTGATCTGCCCGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT	98009

AL844216.3	901	GTGAGCCACAGCGCCCGGCCTCTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGGGGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98010	GTGAGCCACAGCGCCCGGCCTCTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGGGGT	98059

AL844216.3	951	TTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAGGTGATCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98060	TTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAGGTGATCCA	98109

AL844216.3	1001	CCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGCGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98110	CCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGCGC	98159

AL844216.3	1051	CTGGCCTCAATTTTTATACTTTCAGTAGAGATGAGGTTTCATCATGTTGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98160	CTGGCCTCAATTTTTATACTTTCAGTAGAGATGAGGTTTCATCATGTTGA	98209

AL844216.3	1101	CCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGGTCTGCTCGCCTTGGCCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98210	CCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGGTCTGCTCGCCTTGGCCT	98259

AL844216.3	1151	CCTAATGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCCATTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98260	CCTAATGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCCATTC	98309

AL844216.3	1201	TCTATGGGTCAGGGTGAGAGGCCTGGAAAGGGGCAGAGTAGGGTGGAGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98310	TCTATGGGTCAGGGTGAGAGGCCTGGAAAGGGGCAGAGTAGGGTGGAGGA	98359

AL844216.3	1251	TATTGTGGGCAGGGAAGCTTACAAAGTCTTCTGTTGGAAGAGCCCACCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98360	TATTGTGGGCAGGGAAGCTTACAAAGTCTTCTGTTGGAAGAGCCCACCAG	98409

AL844216.3	1301	ACTGTGGAGGGGAAGCCTCTCTTTGGGGCACAGGGACAGGGCCCCTCACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98410	ACTGTGGAGGGGAAGCCTCTCTTTGGGGCACAGGGACAGGGCCCCTCACT	98459

AL844216.3	1351	ACCTCCCTCCCATCCCTCTGGTCTGGCCCTTACTACAGCCTCCATCGATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98460	ACCTCCCTCCCATCCCTCTGGTCTGGCCCTTACTACAGCCTCCATCGATG	98509

AL844216.3	1401	CTTCTCCTGCCCTCTGTGCCCCTTCCACGGGCTGGGACATGCCTTGGATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98510	CTTCTCCTGCCCTCTGTGCCCCTTCCACGGGCTGGGACATGCCTTGGATT	98559

AL844216.3	1451	CTGATGCTGCTGCTCACAATGGGCCAGGGAGTTGTCATCCTGGCCCTCAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98560	CTGATGCTGCTGCTCACAATGGGCCAGGGAGTTGTCATCCTGGCCCTCAG	98609

AL844216.3	1501	CATCGTGCTCTGGAGGCAGAGGGTCCGTGGGGCTCCAGGCAGAGGTGAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98610	CATCGTGCTCTGGAGGCAGAGGGTCCGTGGGGCTCCAGGCAGAGGTGAGT	98659

AL844216.3	1551	CCCTCCCTCCCCGGGGAAAGAAGAGGGCACATGGGTGGGAGGCAAAGGGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98660	CCCTCCCTCCCCGGGGAAAGAAGAGGGCACATGGGTGGGAGGCAAAGGGC	98709

AL844216.3	1601	TAGGCTCACACCCTGCCTCTGTACCCCACCTCCTCTAGGGGAGGGGGCGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98710	TAGGCTCACACCCTGCCTCTGTACCCCACCTCCTCTAGGGGAGGGGGCGA	98759

AL844216.3	1651	GGAACACGGCTCTAAGTTGTCTGCTGACTTCTCTTCTGTATCCCTGATGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98760	GGAACACGGCTCTAAGTTGTCTGCTGACTTCTCTTCTGTATCCCTGATGG	98809

AL844216.3	1701	CTCCTTCTCCCCAGATGCCTCGATTCCTCAGTTCAAACCCGAAATCCAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98810	CTCCTTCTCCCCAGATGCCTCGATTCCTCAGTTCAAACCCGAAATCCAGG	98859

AL844216.3	1751	TCTATGAGAACATCCATTTGGCCCGTCTTGGGTGAGGAACAGCTAGGGAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98860	TCTATGAGAACATCCATTTGGCCCGTCTTGGGTGAGGAACAGCTAGGGAA	98909

AL844216.3	1801	CAGAGGCTTAAATCCTGGAGGGGACTGGGGATGGAGAGGAAACACGGGTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98910	CAGAGGCTTAAATCCTGGAGGGGACTGGGGATGGAGAGGAAACACGGGTT	98959

AL844216.3	1851	GGGTTGGGGATGGGCCCTCGTTCCTGAGGATGTGAAAAGTAGAGGTATCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	98960	GGGTTGGGGATGGGCCCTCGTTCCTGAGGATGTGAAAAGTAGAGGTATCC	99009

AL844216.3	1901	TTAATCTGTCTCTCTGGAAAACCCCACAGCCCACCTGCCCACAAGCCCAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	99010	TTAATCTGTCTCTCTGGAAAACCCCACAGCCCACCTGCCCACAAGCCCAG	99059

AL844216.3	1951	GTGATTTTGGTGACATCTGCTGGGAAGTGTGACCTGCTGTCTCGCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805934.3	99060	GTGATTTTGGTGACATCTGCTGGGAAGTGTGACCTGCTGTCTCGCTGGCC	99109

Overview

Query
AL844216.3 - 53125 bps
Hit
AL805934.3 - 99109 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link