<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL844216.3 1 TTATTAGGCCAGGCATGGTAGCTCAATCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97110 TTATTAGGCCAGGCATGGTAGCTCAATCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 97159 AL844216.3 51 GGCCGAAGCAGGCGGATCACTTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGAC 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97160 GGCCGAAGCAGGCGGATCACTTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGAC 97209 AL844216.3 101 TAACATGGAGAAATTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGTAT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97210 TAACATGGAGAAATTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGTAT 97259 AL844216.3 151 GGTGGCACATGCCTCTAACCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97260 GGTGGCACATGCCTCTAACCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 97309 AL844216.3 201 TCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGGCGCAGTGAGCCAAGATCACGCCATT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97310 TCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGGCGCAGTGAGCCAAGATCACGCCATT 97359 AL844216.3 251 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAGCTCTATCTCAAAAAAAAAATT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97360 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAGCTCTATCTCAAAAAAAAAATT 97409 AL844216.3 301 GTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGCCTTGA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97410 GTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGCCTTGA 97459 AL844216.3 351 TCTCTTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGTCTCCCAAAGTGTTAGGATT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97460 TCTCTTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGTCTCCCAAAGTGTTAGGATT 97509 AL844216.3 401 ATAGGTGTGAGCCACCACGCCTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97510 ATAGGTGTGAGCCACCACGCCTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 97559 AL844216.3 451 TTTGGGATGGAGACTTGTTCTGTTGGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97560 TTTGGGATGGAGACTTGTTCTGTTGGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGA 97609 AL844216.3 501 TCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCCATC 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97610 TCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCCATC 97659 AL844216.3 551 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGGACTACAGGTGCCTGCCACCACGCCTGGCTA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97660 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGGACTACAGGTGCCTGCCACCACGCCTGGCTA 97709 AL844216.3 601 ACTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGAGACAGAG 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97710 ACTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGAGACAGAG 97759 AL844216.3 651 TCTCTCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCCCGGCTCACTG 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97760 TCTCTCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCCCGGCTCACTG 97809 AL844216.3 701 CAACCTCTGACTCCCTGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCTCGAG 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97810 CAACCTCTGACTCCCTGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCTCGAG 97859 AL844216.3 751 TAGCTAGGATTACAGGCATATGCCACCACGTCCAGCTAATTTTTGTATTT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97860 TAGCTAGGATTACAGGCATATGCCACCACGTCCAGCTAATTTTTGTATTT 97909 AL844216.3 801 TTAGTGGAGCCGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATAGTCTCAATCTCCT 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97910 TTAGTGGAGCCGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATAGTCTCAATCTCCT 97959 AL844216.3 851 GACCTCGTGATCTGCCCGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 97960 GACCTCGTGATCTGCCCGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 98009 AL844216.3 901 GTGAGCCACAGCGCCCGGCCTCTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGGGGT 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98010 GTGAGCCACAGCGCCCGGCCTCTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGGGGT 98059 AL844216.3 951 TTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAGGTGATCCA 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98060 TTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAGGTGATCCA 98109 AL844216.3 1001 CCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGCGC 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98110 CCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGCGC 98159 AL844216.3 1051 CTGGCCTCAATTTTTATACTTTCAGTAGAGATGAGGTTTCATCATGTTGA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98160 CTGGCCTCAATTTTTATACTTTCAGTAGAGATGAGGTTTCATCATGTTGA 98209 AL844216.3 1101 CCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGGTCTGCTCGCCTTGGCCT 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98210 CCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGGTCTGCTCGCCTTGGCCT 98259 AL844216.3 1151 CCTAATGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCCATTC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98260 CCTAATGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCCATTC 98309 AL844216.3 1201 TCTATGGGTCAGGGTGAGAGGCCTGGAAAGGGGCAGAGTAGGGTGGAGGA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98310 TCTATGGGTCAGGGTGAGAGGCCTGGAAAGGGGCAGAGTAGGGTGGAGGA 98359 AL844216.3 1251 TATTGTGGGCAGGGAAGCTTACAAAGTCTTCTGTTGGAAGAGCCCACCAG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98360 TATTGTGGGCAGGGAAGCTTACAAAGTCTTCTGTTGGAAGAGCCCACCAG 98409 AL844216.3 1301 ACTGTGGAGGGGAAGCCTCTCTTTGGGGCACAGGGACAGGGCCCCTCACT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98410 ACTGTGGAGGGGAAGCCTCTCTTTGGGGCACAGGGACAGGGCCCCTCACT 98459 AL844216.3 1351 ACCTCCCTCCCATCCCTCTGGTCTGGCCCTTACTACAGCCTCCATCGATG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98460 ACCTCCCTCCCATCCCTCTGGTCTGGCCCTTACTACAGCCTCCATCGATG 98509 AL844216.3 1401 CTTCTCCTGCCCTCTGTGCCCCTTCCACGGGCTGGGACATGCCTTGGATT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98510 CTTCTCCTGCCCTCTGTGCCCCTTCCACGGGCTGGGACATGCCTTGGATT 98559 AL844216.3 1451 CTGATGCTGCTGCTCACAATGGGCCAGGGAGTTGTCATCCTGGCCCTCAG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98560 CTGATGCTGCTGCTCACAATGGGCCAGGGAGTTGTCATCCTGGCCCTCAG 98609 AL844216.3 1501 CATCGTGCTCTGGAGGCAGAGGGTCCGTGGGGCTCCAGGCAGAGGTGAGT 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98610 CATCGTGCTCTGGAGGCAGAGGGTCCGTGGGGCTCCAGGCAGAGGTGAGT 98659 AL844216.3 1551 CCCTCCCTCCCCGGGGAAAGAAGAGGGCACATGGGTGGGAGGCAAAGGGC 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98660 CCCTCCCTCCCCGGGGAAAGAAGAGGGCACATGGGTGGGAGGCAAAGGGC 98709 AL844216.3 1601 TAGGCTCACACCCTGCCTCTGTACCCCACCTCCTCTAGGGGAGGGGGCGA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98710 TAGGCTCACACCCTGCCTCTGTACCCCACCTCCTCTAGGGGAGGGGGCGA 98759 AL844216.3 1651 GGAACACGGCTCTAAGTTGTCTGCTGACTTCTCTTCTGTATCCCTGATGG 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98760 GGAACACGGCTCTAAGTTGTCTGCTGACTTCTCTTCTGTATCCCTGATGG 98809 AL844216.3 1701 CTCCTTCTCCCCAGATGCCTCGATTCCTCAGTTCAAACCCGAAATCCAGG 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98810 CTCCTTCTCCCCAGATGCCTCGATTCCTCAGTTCAAACCCGAAATCCAGG 98859 AL844216.3 1751 TCTATGAGAACATCCATTTGGCCCGTCTTGGGTGAGGAACAGCTAGGGAA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98860 TCTATGAGAACATCCATTTGGCCCGTCTTGGGTGAGGAACAGCTAGGGAA 98909 AL844216.3 1801 CAGAGGCTTAAATCCTGGAGGGGACTGGGGATGGAGAGGAAACACGGGTT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98910 CAGAGGCTTAAATCCTGGAGGGGACTGGGGATGGAGAGGAAACACGGGTT 98959 AL844216.3 1851 GGGTTGGGGATGGGCCCTCGTTCCTGAGGATGTGAAAAGTAGAGGTATCC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 98960 GGGTTGGGGATGGGCCCTCGTTCCTGAGGATGTGAAAAGTAGAGGTATCC 99009 AL844216.3 1901 TTAATCTGTCTCTCTGGAAAACCCCACAGCCCACCTGCCCACAAGCCCAG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 99010 TTAATCTGTCTCTCTGGAAAACCCCACAGCCCACCTGCCCACAAGCCCAG 99059 AL844216.3 1951 GTGATTTTGGTGACATCTGCTGGGAAGTGTGACCTGCTGTCTCGCTGGCC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL805934.3 99060 GTGATTTTGGTGACATCTGCTGGGAAGTGTGACCTGCTGTCTCGCTGGCC 99109