<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL773544.5	1	GGCCAGAAGAAAACAAAATAAAATAATTTAAAAAATAGAAAATAAGTAAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	83802	GGCCAGAAGAAAACAAAATAAAATAATTTAAAAAATAGAAAATAAGTAAT	83851

AL773544.5	51	AATAAAAGAAATAAAATAAGAGAAGCAATAAAAGAAAAGAAAAAGTCATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	83852	AATAAAAGAAATAAAATAAGAGAAGCAATAAAAGAAAAGAAAAAGTCATT	83901

AL773544.5	101	TAGGATTATGTAAAAGCCTGCCTATCGAACAGTAAGGCTTCCTGGTCCCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	83902	TAGGATTATGTAAAAGCCTGCCTATCGAACAGTAAGGCTTCCTGGTCCCC	83951

AL773544.5	151	TCCATGAAGTTGGTTCTGAGAACTCCAGCAGCCAGACTTGCCCCAGGCCG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	83952	TCCATGAAGTTGGTTCTGAGAACTCCAGCAGCCAGACTTGCCCCAGGCCG	84001

AL773544.5	201	ATTAATAGAGAAACCTTCTCTGGAGAAACTGACCAGACAAGGAAAAACAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84002	ATTAATAGAGAAACCTTCTCTGGAGAAACTGACCAGACAAGGAAAAACAC	84051

AL773544.5	251	CTAGGAACACAGGAGTAAGGGGGTTCTGACGGATATTAAGCTACTGTCAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84052	CTAGGAACACAGGAGTAAGGGGGTTCTGACGGATATTAAGCTACTGTCAC	84101

AL773544.5	301	TTGACTTCAAAACCCTCTTCCACTCTCTCCTTCCCAGCTGGCTCCCTCTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84102	TTGACTTCAAAACCCTCTTCCACTCTCTCCTTCCCAGCTGGCTCCCTCTT	84151

AL773544.5	351	AGGTGTAGAGGGAGGTGTCAGCACTGGAGGAAGAAGGGATCCCTTCCCTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84152	AGGTGTAGAGGGAGGTGTCAGCACTGGAGGAAGAAGGGATCCCTTCCCTT	84201

AL773544.5	401	GTTGGCCTCCCAATCCTGCCGGCATCACCACAGCCGAGGATCTTCAGCCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84202	GTTGGCCTCCCAATCCTGCCGGCATCACCACAGCCGAGGATCTTCAGCCC	84251

AL773544.5	451	TGTAGCAACAGCTGGTCCAGCAGCAGTAGCAAGTCCCAAACTGTGGTTCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84252	TGTAGCAACAGCTGGTCCAGCAGCAGTAGCAAGTCCCAAACTGTGGTTCT	84301

AL773544.5	501	TCCTCACTCCCGGCAAAGGCCTCTTCCCGTGGCCTCAGTGATACCAGCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84302	TCCTCACTCCCGGCAAAGGCCTCTTCCCGTGGCCTCAGTGATACCAGCTC	84351

AL773544.5	551	ACTGGCCAGGCTCCTCCTTAGGAAACTGAGTTCTAGCTCCGTGGGGCCAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84352	ACTGGCCAGGCTCCTCCTTAGGAAACTGAGTTCTAGCTCCGTGGGGCCAT	84401

AL773544.5	601	CCTCCCAGATTCTCCCATTGAATAATACTGACCTCTTCCCTCAGTTCCCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84402	CCTCCCAGATTCTCCCATTGAATAATACTGACCTCTTCCCTCAGTTCCCC	84451

AL773544.5	651	AAGACTGAGGGAGAGGCAGTTGCCCCATTCCTGATTCCCACGCGTTCTAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84452	AAGACTGAGGGAGAGGCAGTTGCCCCATTCCTGATTCCCACGCGTTCTAC	84501

AL773544.5	701	CTCTGCGGTATCTCAGTGCTCTTTTTGTCTTTTTAGATCTCAATATGTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84502	CTCTGCGGTATCTCAGTGCTCTTTTTGTCTTTTTAGATCTCAATATGTGG	84551

AL773544.5	751	TTAACAATCCTTTATATAAAATTACCTCTGTCTGGGCGCGGAGGCTCACG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84552	TTAACAATCCTTTATATAAAATTACCTCTGTCTGGGCGCGGAGGCTCACG	84601

AL773544.5	801	CTTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84602	CTTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGT	84651

AL773544.5	851	CAGGAGTTTGAGACCACCCTGGCCAATATGGTGAAACCCTGTCTCTACTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84652	CAGGAGTTTGAGACCACCCTGGCCAATATGGTGAAACCCTGTCTCTACTA	84701

AL773544.5	901	AAAATACAAAACTTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCACTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84702	AAAATACAAAACTTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCACTA	84751

AL773544.5	951	CTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCATTTGAACCCGGGAGACCGAGGTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84752	CTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCATTTGAACCCGGGAGACCGAGGTTG	84801

AL773544.5	1001	CAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84802	CAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAA	84851

AL773544.5	1051	ATTCCTTTTCAAATAGAATAAAATAAAACAAAATTACCTCTGTTTAAATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84852	ATTCCTTTTCAAATAGAATAAAATAAAACAAAATTACCTCTGTTTAAATA	84901

AL773544.5	1101	TTTGGATTTTTTTCTTTCACCTGACTAGACCCTAATACAAGGGTCTTCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84902	TTTGGATTTTTTTCTTTCACCTGACTAGACCCTAATACAAGGGTCTTCTG	84951

AL773544.5	1151	GAGAAACAGTTCAGCCCATTTGCACTATGGTGAAGCCCACTGAAACTTCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	84952	GAGAAACAGTTCAGCCCATTTGCACTATGGTGAAGCCCACTGAAACTTCC	85001

AL773544.5	1201	CCCCATCCCCACCACACACACCTGGAGTTTCCAAACAGCTTAAGATCTAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85002	CCCCATCCCCACCACACACACCTGGAGTTTCCAAACAGCTTAAGATCTAA	85051

AL773544.5	1251	CTAAGCCAAGGATTACTGTATCATTCACAAAGCCCAAGCCCCAATTTGAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85052	CTAAGCCAAGGATTACTGTATCATTCACAAAGCCCAAGCCCCAATTTGAG	85101

AL773544.5	1301	CAGAGAAAGTTTATTATTAGAAAGAATTATTGGCTGTAACAGGCTAAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85102	CAGAGAAAGTTTATTATTAGAAAGAATTATTGGCTGTAACAGGCTAAAAA	85151

AL773544.5	1351	GACGTGCAGAGAACTCCAAAGAATGCTGTAGGGCCGCGGGAGAGTACCCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85152	GACGTGCAGAGAACTCCAAAGAATGCTGTAGGGCCGCGGGAGAGTACCCA	85201

AL773544.5	1401	AAGAAGGACACACGTGGAAGCATCCCCACCCCAAAGCTGGATTCAGAACT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85202	AAGAAGGACACACGTGGAAGCATCCCCACCCCAAAGCTGGATTCAGAACT	85251

AL773544.5	1451	CAAGGCAGAAAGTGTGCATGTGCCCACCAGGTACCAGATTATTTCCCTGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85252	CAAGGCAGAAAGTGTGCATGTGCCCACCAGGTACCAGATTATTTCCCTGG	85301

AL773544.5	1501	GATGCCCAGGCCAAAGCCTGTGCACAGTCATGAGCAAGCAGGAAACTGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85302	GATGCCCAGGCCAAAGCCTGTGCACAGTCATGAGCAAGCAGGAAACTGGG	85351

AL773544.5	1551	GGGGTCGCGGCATCGGGAGCCCACTCACTGCATGCAAGGCCTGGGGCATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85352	GGGGTCGCGGCATCGGGAGCCCACTCACTGCATGCAAGGCCTGGGGCATG	85401

AL773544.5	1601	CAGGGTCCACGTCAGGGCCAGCTCGCTGGGGGAACGCATGCTGTCAGCAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85402	CAGGGTCCACGTCAGGGCCAGCTCGCTGGGGGAACGCATGCTGTCAGCAC	85451

AL773544.5	1651	GCAGCTAGGACAGAGACCACCGGATGTTCCCACCTGGCCACTGATGGGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85452	GCAGCTAGGACAGAGACCACCGGATGTTCCCACCTGGCCACTGATGGGCC	85501

AL773544.5	1701	CTGCCGCAGGAGCAACAAGAATCACAAACCATAGCTCCCGGAACCAGAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85502	CTGCCGCAGGAGCAACAAGAATCACAAACCATAGCTCCCGGAACCAGAGA	85551

AL773544.5	1751	TAAAAGAAATTCTTTCCTCTGGCAGTGTCCCTCCGGCGCCCTCTACTGAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85552	TAAAAGAAATTCTTTCCTCTGGCAGTGTCCCTCCGGCGCCCTCTACTGAG	85601

AL773544.5	1801	AAAGCTTAATATTGTGCTGGCTGCGAAGGAGAACCGCTTAATTCAATACA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85602	AAAGCTTAATATTGTGCTGGCTGCGAAGGAGAACCGCTTAATTCAATACA	85651

AL773544.5	1851	GATCAGTTAAGAGGATGGATTTACGGTTGAGAGGCAATACATTGATAAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85652	GATCAGTTAAGAGGATGGATTTACGGTTGAGAGGCAATACATTGATAAGA	85701

AL773544.5	1901	AACTAGTCATTATGGGATGAAAACCACTGACATGAAAGACAGGTATTGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85702	AACTAGTCATTATGGGATGAAAACCACTGACATGAAAGACAGGTATTGAA	85751

AL773544.5	1951	AACACAAGAATTAAGGAATATAAAGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805909.5	85752	AACACAAGAATTAAGGAATATAAAGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTA	85801

Overview

Query
AL773544.5 - 113388 bps
Hit
AL805909.5 - 85801 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link