<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL773541.6	1	GGCCACTTACGCCCGTCCCCCTCGAGGCCCGGGCCCCCCCACACCCGCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13169	GGCCACTTACGCCCGTCCCCCTCGAGGCCCGGGCCCCCCCACACCCGCCT	13218

AL773541.6	51	GGGCCAAACCCACCAACACCCAGGGTAAGCCCCTCTGCCCCTGGGCTCCG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13219	GGGCCAAACCCACCAACACCCAGGGTAAGCCCCTCTGCCCCTGGGCTCCG	13268

AL773541.6	101	CCAGGCTCCCCATACCTCTACTGGGGCAGGGAAAAGCCCTCACACCTTGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13269	CCAGGCTCCCCATACCTCTACTGGGGCAGGGAAAAGCCCTCACACCTTGC	13318

AL773541.6	151	ACTTCCTCCTCTCCCCACTGTGGCCTATTCTGCTCTCCTGAGCTCCCAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13319	ACTTCCTCCTCTCCCCACTGTGGCCTATTCTGCTCTCCTGAGCTCCCAAG	13368

AL773541.6	201	GAGGAAGCTCTTGTGCCCTTAGCTCATCTCTGCTGCTGCTTGCTCTTTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13369	GAGGAAGCTCTTGTGCCCTTAGCTCATCTCTGCTGCTGCTTGCTCTTTTT	13418

AL773541.6	251	TAAGGTCCCCCCCTTGAGCTGAGGAGTAGAAAGCTTACTGGTCCCCAGCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13419	TAAGGTCCCCCCCTTGAGCTGAGGAGTAGAAAGCTTACTGGTCCCCAGCT	13468

AL773541.6	301	CTTCTCCCTCCTCCTCTTCCACGCCATCTCTTCAGCTCTCCAGAGCTAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13469	CTTCTCCCTCCTCCTCTTCCACGCCATCTCTTCAGCTCTCCAGAGCTAGA	13518

AL773541.6	351	CAGGAGGTTGCTGTGGTGGCCCCAGACTATAGTAACTCCTCCTTTATTCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13519	CAGGAGGTTGCTGTGGTGGCCCCAGACTATAGTAACTCCTCCTTTATTCT	13568

AL773541.6	401	CCACTCTCTCTAGAGCTGCGAGGAGGAGGGCTCTCACCCCGGGCGCTTGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13569	CCACTCTCTCTAGAGCTGCGAGGAGGAGGGCTCTCACCCCGGGCGCTTGC	13618

AL773541.6	451	CCTTTCCCTCACATGTGTCCTCTCTCTGCAGTCCCAGAGGTGAAGGCTCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13619	CCTTTCCCTCACATGTGTCCTCTCTCTGCAGTCCCAGAGGTGAAGGCTCA	13668

AL773541.6	501	TGCCCCAACCCTTTCCATCTGCCCCTCTTCTCCTCAGTGTTGCCTTCTCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13669	TGCCCCAACCCTTTCCATCTGCCCCTCTTCTCCTCAGTGTTGCCTTCTCA	13718

AL773541.6	551	TTGTGGCCCCTTCCCCAGGGCTAAGAGGGGACAGCTCTGCTTCCTCTCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13719	TTGTGGCCCCTTCCCCAGGGCTAAGAGGGGACAGCTCTGCTTCCTCTCCT	13768

AL773541.6	601	GTCTGTAGACAACTTGTGTTGGGGCTGTGAGCAGCTGTTACCCTCCCTCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13769	GTCTGTAGACAACTTGTGTTGGGGCTGTGAGCAGCTGTTACCCTCCCTCC	13818

AL773541.6	651	TCTCTGTGTGCCTCTGTCTCTGCTTGTTGTTGAGCTTGGTGTGTTGGGTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13819	TCTCTGTGTGCCTCTGTCTCTGCTTGTTGTTGAGCTTGGTGTGTTGGGTT	13868

AL773541.6	701	GAAAGGGTTGGGAGGGCTTGGCCCCAGGGGGAGCCAGGCTGAAAGCCACG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13869	GAAAGGGTTGGGAGGGCTTGGCCCCAGGGGGAGCCAGGCTGAAAGCCACG	13918

AL773541.6	751	GGAGAGCAGCTAAGTGAAGGGGAGGGAGCTGTGGTGAACGGGACAAGGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13919	GGAGAGCAGCTAAGTGAAGGGGAGGGAGCTGTGGTGAACGGGACAAGGGT	13968

AL773541.6	801	TTGGAAGGTGGAGGGTGCCTGGATGCTGGGACCATCCTGAGGCGGGAGAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	13969	TTGGAAGGTGGAGGGTGCCTGGATGCTGGGACCATCCTGAGGCGGGAGAA	14018

AL773541.6	851	TTCCTGGGGAGGAATTCTTCTTCCAGCCAAGATTTATCTCACAGTCTCTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14019	TTCCTGGGGAGGAATTCTTCTTCCAGCCAAGATTTATCTCACAGTCTCTT	14068

AL773541.6	901	GAGAGACCCTAGGGAGGCCCTAAAAGAGTAAGACTTTATGACAGTTTTGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14069	GAGAGACCCTAGGGAGGCCCTAAAAGAGTAAGACTTTATGACAGTTTTGC	14118

AL773541.6	951	TCAACCATATTCATTGCCTTGAAAAGCTCTGGAATAGCTAACTCTCGTCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14119	TCAACCATATTCATTGCCTTGAAAAGCTCTGGAATAGCTAACTCTCGTCC	14168

AL773541.6	1001	CATGCCAGTGTCTTCCTGGTTTGAGGTTGGCGCATGGAATACTGGGAAGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14169	CATGCCAGTGTCTTCCTGGTTTGAGGTTGGCGCATGGAATACTGGGAAGA	14218

AL773541.6	1051	TACAGCATAGACCCAGTCTCTCACTCAACCGGGAGACACAGGGCCCTCCG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14219	TACAGCATAGACCCAGTCTCTCACTCAACCGGGAGACACAGGGCCCTCCG	14268

AL773541.6	1101	GGAGGCTGAGGTGTGGGGAACTATAGCTCTTGGGCTGTTCCTGATGCCTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14269	GGAGGCTGAGGTGTGGGGAACTATAGCTCTTGGGCTGTTCCTGATGCCTC	14318

AL773541.6	1151	GTCCTGTCTTCTTTCCCCTCACCCCTGCAGCCTACAGTGGGGACTATATG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14319	GTCCTGTCTTCTTTCCCCTCACCCCTGCAGCCTACAGTGGGGACTATATG	14368

AL773541.6	1201	GAGCCTGAGAAGCCAGGCGCCCCGCTTCTGCCCCCACCTCCCCAGAACAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14369	GAGCCTGAGAAGCCAGGCGCCCCGCTTCTGCCCCCACCTCCCCAGAACAG	14418

AL773541.6	1251	CGTCCCCCATTATGCCGAGGCTGACATTGTTACCCTGCAGGGCGTCACCG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14419	CGTCCCCCATTATGCCGAGGCTGACATTGTTACCCTGCAGGGCGTCACCG	14468

AL773541.6	1301	GGGGCAACACCTATGCTGTGCCTGCACTGCCCCCAGGGGCAGTCGGGGAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14469	GGGGCAACACCTATGCTGTGCCTGCACTGCCCCCAGGGGCAGTCGGGGAT	14518

AL773541.6	1351	GGGCCCCCCAGAGTGGATTTCCCTCGATCTCGACTCCGCTTCAAGGAGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14519	GGGCCCCCCAGAGTGGATTTCCCTCGATCTCGACTCCGCTTCAAGGAGAA	14568

AL773541.6	1401	GCTTGGCGAGGGCCAGTTTGGGGAGGTAAGGAGGGTGCCTACCCAGTGTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14569	GCTTGGCGAGGGCCAGTTTGGGGAGGTAAGGAGGGTGCCTACCCAGTGTC	14618

AL773541.6	1451	TGGCCCTATTGTGTGCTCTGATGCCATGCCTGTGCATCCCCCTAGCCAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14619	TGGCCCTATTGTGTGCTCTGATGCCATGCCTGTGCATCCCCCTAGCCAGG	14668

AL773541.6	1501	AACCTTAGTCATTTGTAACCGTGTTAATCCGTTTGACCCTGTGACCGCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14669	AACCTTAGTCATTTGTAACCGTGTTAATCCGTTTGACCCTGTGACCGCCT	14718

AL773541.6	1551	AGCAAACGAACTTCTTTCTCCAGGTGCACCTGTGTGAGGTCGACAGCCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14719	AGCAAACGAACTTCTTTCTCCAGGTGCACCTGTGTGAGGTCGACAGCCCT	14768

AL773541.6	1601	CAAGATCTGGTTAGTCTTGATTTCCCCCTTAATGTGCGTAAGGGACACCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14769	CAAGATCTGGTTAGTCTTGATTTCCCCCTTAATGTGCGTAAGGGACACCC	14818

AL773541.6	1651	TTTGCTGGTAGCTGTCAAGATCTTACGGCCAGATGCCACCAAGAATGCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14819	TTTGCTGGTAGCTGTCAAGATCTTACGGCCAGATGCCACCAAGAATGCCA	14868

AL773541.6	1701	GGTGAGGACCAGGGATGGCATCTGGAAGAAGGGAGGGGAGGCCGTGAAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14869	GGTGAGGACCAGGGATGGCATCTGGAAGAAGGGAGGGGAGGCCGTGAAGA	14918

AL773541.6	1751	GTGGGGAGCCATCTAGAGAGAACAATGGCAGAGCCCAACAGAGGGGTGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14919	GTGGGGAGCCATCTAGAGAGAACAATGGCAGAGCCCAACAGAGGGGTGGC	14968

AL773541.6	1801	ATCTCTGGGAGGGGATTTACATGTACGCTGGGGGTGGGGACGCCTGGTCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	14969	ATCTCTGGGAGGGGATTTACATGTACGCTGGGGGTGGGGACGCCTGGTCT	15018

AL773541.6	1851	GCCTGAGGTGGGGCAGGGGGGTGGGGGCGCGGGGGAAGGTGCAGGCCGCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	15019	GCCTGAGGTGGGGCAGGGGGGTGGGGGCGCGGGGGAAGGTGCAGGCCGCC	15068

AL773541.6	1901	CACTCGGCATTCCTCTTCAGCTTCTCCTTGTTCTCCAGGAATGATTTCCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	15069	CACTCGGCATTCCTCTTCAGCTTCTCCTTGTTCTCCAGGAATGATTTCCT	15118

AL773541.6	1951	GAAAGAGGTGAAGATCATGTCGAGGCTCAAGGACCCAAACATCATTCGGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773589.3	15119	GAAAGAGGTGAAGATCATGTCGAGGCTCAAGGACCCAAACATCATTCGGC	15168

Overview

Query
AL773541.6 - 103780 bps
Hit
AL773589.3 - 15168 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link