<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL773521.18	70555	AAGCTTTCTTTTGGAGTTCCCGTCGTGGCGCAGTGGTTGACGAATCTGAC	70604
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1	AAGCTTTCTTTTGGAGTTCCCGTCGTGGCGCAGTGGTTGACGAATCTGAC	50

AL773521.18	70605	TAGGAACCATGAGGTTACGGGTTTGGTCCCTGCCCTTGCTCAGTGGGTTA	70654
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	51	TAGGAACCATGAGGTTACGGGTTTGGTCCCTGCCCTTGCTCAGTGGGTTA	100

AL773521.18	70655	ACGATCCGGTGTTGCCCTGAGCTGTGGTGTAGGTTGCAGAGGCGGCTCAG	70704
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	101	ACGATCCGGTGTTGCCCTGAGCTGTGGTGTAGGTTGCAGAGGCGGCTCAG	150

AL773521.18	70705	ATCCCGCATTGCTGTGGCTCTGGTGTAGGCCGGTGGCTACAGCTCCGATT	70754
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	151	ATCCCGCATTGCTGTGGCTCTGGTGTAGGCCGGTGGCTACAGCTCCGATT	200

AL773521.18	70755	GGACCCCAGGCCTGGGAACCTCCATATGCCGTGGGAACGGCCCAAGAAAT	70804
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	201	GGACCCCAGGCCTGGGAACCTCCATATGCCGTGGGAACGGCCCAAGAAAT	250

AL773521.18	70805	AGCAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAGCTTTTTTTTGTAGATACAGACAAGC	70854
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	251	AGCAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAGCTTTTTTTTGTAGATACAGACAAGC	300

AL773521.18	70855	TGGTCCTAAAATGGAATAACTAAAACAAAAGTGAAAAATAATAATAATGA	70904
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	301	TGGTCCTAAAATGGAATAACTAAAACAAAAGTGAAAAATAATAATAATGA	350

AL773521.18	70905	AATGTTAAGATTTATTGTATAACTACTGTGTTAAGACTCATATATAGGAA	70954
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	351	AATGTTAAGATTTATTGTATAACTACTGTGTTAAGACTCATATATAGGAA	400

AL773521.18	70955	GAGAAATAGATTCATCTATCAATGGACTGTGACCATACGGAAAAAGACCC	71004
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	401	GAGAAATAGATTCATCTATCAATGGACTGTGACCATACGGAAAAAGACCC	450

AL773521.18	71005	ACACAAGTATTCCCAACTGATTTTTCACAAAGGTGCAAGACCAATTCAAA	71054
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	451	ACACAAGTATTCCCAACTGATTTTTCACAAAGGTGCAAGACCAATTCAAA	500

AL773521.18	71055	GGCGATTTTGGTATCCTTTGAAAACAGCATTTTCAATAAAGAGTATGACA	71104
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	501	GGCGATTTTGGTATCCTTTGAAAACAGCATTTTCAATAAAGAGTATGACA	550

AL773521.18	71105	AACAACTGGACTTCCACCCAACAAACAAAAAGCGCTTTAACCTCAACCTA	71154
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	551	AACAACTGGACTTCCACCCAACAAACAAAAAGCGCTTTAACCTCAACCTA	600

AL773521.18	71155	AATCTCACACTATATTTTTAAACATGAAGTCAAAATTAATCATAAATCTA	71204
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	601	AATCTCACACTATATTTTTAAACATGAAGTCAAAATTAATCATAAATCTA	650

AL773521.18	71205	AACATAAAATATAAACTCAAAACTTTTAAGACAAAAATAGGAGAGAAGTA	71254
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	651	AACATAAAATATAAACTCAAAACTTTTAAGACAAAAATAGGAGAGAAGTA	700

AL773521.18	71255	TTGTGACGTCAATGTAATACGAAAAGCACAATCCACAAAAGGAAAATTAG	71304
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	701	TTGTGACGTCAATGTAATACGAAAAGCACAATCCACAAAAGGAAAATTAG	750

AL773521.18	71305	ATAAACAGGACTCTATCAAAATTTAAGACTTTGATTTTCAAAACTCCCTG	71354
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	751	ATAAACAGGACTCTATCAAAATTTAAGACTTTGATTTTCAAAACTCCCTG	800

AL773521.18	71355	TAGAGGATGAACGTACACCCAATAGACGGGGAGAAACATCTGTGAAACAC	71404
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	801	TAGAGGATGAACGTACACCCAATAGACGGGGAGAAACATCTGTGAAACAC	850

AL773521.18	71405	ATATTCAACAAACGGCTTTTCTCCAGAATGTAATCAGGAACTCCCTAAAC	71454
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	851	ATATTCAACAAACGGCTTTTCTCCAGAATGTAATCAGGAACTCCCTAAAC	900

AL773521.18	71455	TCAGCATCAAGAAAACAAAACAATCCCAATAGAAAATGGGCAGGAGACCT	71504
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	901	TCAGCATCAAGAAAACAAAACAATCCCAATAGAAAATGGGCAGGAGACCT	950

AL773521.18	71505	GAACCAACATTTCACCAAAGAGGAAAGAGATGAAAAGACATATATCACCA	71554
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	951	GAACCAACATTTCACCAAAGAGGAAAGAGATGAAAAGACATATATCACCA	1000

AL773521.18	71555	TCAGACACTAAAAACACGCAATTCTAAATATAATTAGGTAACACTATAGA	71604
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1001	TCAGACACTAAAAACACGCAATTCTAAATATAATTAGGTAACACTATAGA	1050

AL773521.18	71605	GATCTACAAGCCGACTACAATGTAAAAGTACTGATAATACCAAGGGTTAC	71654
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1051	GATCTACAAGCCGACTACAATGTAAAAGTACTGATAATACCAAGGGTTAC	1100

AL773521.18	71655	AACCATTAGCAAGTGAATCTTTTATATATACATGGCTAGGGGAATCTAAA	71704
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1101	AACCATTAGCAAGTGAATCTTTTATATATACATGGCTAGGGGAATCTAAA	1150

AL773521.18	71705	ATAACACAGCAACTCTGGGAAAGAGTCTGTCAATTTCTTATGAAGTAAAA	71754
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1151	ATAACACAGCAACTCTGGGAAAGAGTCTGTCAATTTCTTATGAAGTAAAA	1200

AL773521.18	71755	CATGCACTGACCATATAACCTAGCTATCCTCATACTCCTGGATATTTATC	71804
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1201	CATGCACTGACCATATAACCTAGCTATCCTCATACTCCTGGATATTTATC	1250

AL773521.18	71805	CTAGAGAAATAAAACACGTCCACATGCACAGAGAAAAAACTGTACTGGAC	71854
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1251	CTAGAGAAATAAAACACGTCCACATGCACAGAGAAAAAACTGTACTGGAC	1300

AL773521.18	71855	TATTCATAAATTTCTTTTGTAACAGACTAAAGCAAGAAACACTCCAAATG	71904
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1301	TATTCATAAATTTCTTTTGTAACAGACTAAAGCAAGAAACACTCCAAATG	1350

AL773521.18	71905	TCCTTCAGCGAGCAAATGGGTAACAAAATGTGGCATATCCATATCCGTAT	71954
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1351	TCCTTCAGCGAGCAAATGGGTAACAAAATGTGGCATATCCATATCCGTAT	1400

AL773521.18	71955	CATGAAATATCATAAGCCATCAAAAAGGAACAAAATCCTGACCCACACAA	72004
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1401	CATGAAATATCATAAGCCATCAAAAAGGAACAAAATCCTGACCCACACAA	1450

AL773521.18	72005	TAACTTAGATGGACCTCCAGGGTGTTAGGATCTTTGACTCTCAAATGGTT	72054
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1451	TAACTTAGATGGACCTCCAGGGTGTTAGGATCTTTGACTCTCAAATGGTT	1500

AL773521.18	72055	ACATATTTGTAACACTCTTGAAATGCCATAACTATAGTGATGGAGAACGG	72104
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1501	ACATATTTGTAACACTCTTGAAATGCCATAACTATAGTGATGGAGAACGG	1550

AL773521.18	72105	TCGGTGGCTGGCGAGGGTTAAAGCTGGGGGGAAGCCTAACTAAAAAGACA	72154
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1551	TCGGTGGCTGGCGAGGGTTAAAGCTGGGGGGAAGCCTAACTAAAAAGACA	1600

AL773521.18	72155	CAGCATGAGTGAGATTCTTTTTGGTGATAAAACCATTTTGTATTCTGACA	72204
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1601	CAGCATGAGTGAGATTCTTTTTGGTGATAAAACCATTTTGTATTCTGACA	1650

AL773521.18	72205	TCGGTGGAAACTGCATACGTGATATGAAATTTCATAGTACTACAGATTCC	72254
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1651	TCGGTGGAAACTGCATACGTGATATGAAATTTCATAGTACTACAGATTCC	1700

AL773521.18	72255	CGAAAAAACTATGCAAAAACTGGTGAAATCTAAATAAGGTTAATAATAAT	72304
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1701	CGAAAAAACTATGCAAAAACTGGTGAAATCTAAATAAGGTTAATAATAAT	1750

AL773521.18	72305	ATTACACCAATGTGAGTTTCCTGGTTTTGAAAAATGTATGATTATGTAAA	72354
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1751	ATTACACCAATGTGAGTTTCCTGGTTTTGAAAAATGTATGATTATGTAAA	1800

AL773521.18	72355	ATGTTATCATTGGGGAAAGATGGGTGAAGAACACTTTGGGGGTGGGGGGG	72404
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1801	ATGTTATCATTGGGGAAAGATGGGTGAAGAACACTTTGGGGGTGGGGGGG	1850

AL773521.18	72405	CTGGGGGCTTGATGGCTTGTTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTT	72454
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1851	CTGGGGGCTTGATGGCTTGTTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTT	1900

AL773521.18	72455	GCCATTCTTTTGGCTGCCTCTTTGTTCTGGCTACACTATTTTCGCCACTA	72504
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1901	GCCATTCTTTTGGCTGCCTCTTTGTTCTGGCTACACTATTTTCGCCACTA	1950

AL773521.18	72505	CTTGTGGGTCTTAATGCAAAATAAACAGGTTTTAAGAAGAAAGGGAGGGA	72554
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773562.15	1951	CTTGTGGGTCTTAATGCAAAATAAACAGGTTTTAAGAAGAAAGGGAGGGA	2000

Overview

Query
AL773521.18 - 72554 bps
Hit
AL773562.15 - 127265 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001948200070555725541120001
298.331035011015224263344011110151
393.12144188311533021307932671
497.559190100673338243448110867209211
598.06915797984365953456122730325371
690.6519827930663344-126212264891
793.7214627565388356638132670354131
897.327117805667857457138171389541
992.3121228530653349140800410851
1089.61862774713147407-140801410791
1187.2215826241254386154763550281
1291.251922634714647408-154764550261
1392.3420827530663340154765550381
1490.461852622243822699154765550261
1590.081822627056770828154765550261
1687.131622735858658858-188906891771
1789.6318227330663338188908891771
1892.9921327130663336-11015481018181
1988.56177271471384740811015491018191
2090.461862622243822699-11015571018181
2190.081832627056770828-11015571018181
2291.1419627230663337-11029201031901
2388.0116226341274389-11029241031901
Short-link